Protein–RNA interactions for Protein: Q05020

Apoc2, Apolipoprotein C-II, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoc2Q05020 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,88■■■□□ 2,53
Apoc2Q05020 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC30,32■■■□□ 2,44
Apoc2Q05020 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,75■■■□□ 2,35
Apoc2Q05020 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,71■■■□□ 2,35
Apoc2Q05020 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC28,98■■■□□ 2,23
Apoc2Q05020 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,77■■■□□ 2,2
Apoc2Q05020 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,37■■■□□ 2,13
Apoc2Q05020 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,24■■■□□ 2,11
Apoc2Q05020 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,02■■■□□ 2,08
Apoc2Q05020 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC27,69■■■□□ 2,02
Apoc2Q05020 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,65■■■□□ 2,02
Apoc2Q05020 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,63■■■□□ 2,01
Apoc2Q05020 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,6■■■□□ 2,01
Apoc2Q05020 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,59■■■□□ 2,01
Apoc2Q05020 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,45■■□□□ 1,98
Apoc2Q05020 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC27,25■■□□□ 1,95
Apoc2Q05020 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,24■■□□□ 1,95
Apoc2Q05020 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC27,21■■□□□ 1,95
Apoc2Q05020 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,2■■□□□ 1,95
Apoc2Q05020 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,1■■□□□ 1,93
Apoc2Q05020 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,97■■□□□ 1,91
Apoc2Q05020 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC26,88■■□□□ 1,89
Apoc2Q05020 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,82■■□□□ 1,88
Apoc2Q05020 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC26,76■■□□□ 1,87
Apoc2Q05020 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC26,68■■□□□ 1,86
Apoc2Q05020 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,61■■□□□ 1,85
Apoc2Q05020 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,58■■□□□ 1,84
Apoc2Q05020 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,48■■□□□ 1,83
Apoc2Q05020 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC26,38■■□□□ 1,81
Apoc2Q05020 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC26,34■■□□□ 1,81
Apoc2Q05020 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26,34■■□□□ 1,81
Apoc2Q05020 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,33■■□□□ 1,8
Apoc2Q05020 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC26,29■■□□□ 1,8
Apoc2Q05020 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,25■■□□□ 1,79
Apoc2Q05020 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,24■■□□□ 1,79
Apoc2Q05020 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,24■■□□□ 1,79
Apoc2Q05020 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,15■■□□□ 1,78
Apoc2Q05020 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC26,11■■□□□ 1,77
Apoc2Q05020 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,11■■□□□ 1,77
Apoc2Q05020 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC26,08■■□□□ 1,77
Apoc2Q05020 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,04■■□□□ 1,76
Apoc2Q05020 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1,75
Apoc2Q05020 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC25,93■■□□□ 1,74
Apoc2Q05020 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC25,93■■□□□ 1,74
Apoc2Q05020 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,92■■□□□ 1,74
Apoc2Q05020 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,88■■□□□ 1,73
Apoc2Q05020 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC25,82■■□□□ 1,72
Apoc2Q05020 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,8■■□□□ 1,72
Apoc2Q05020 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC25,76■■□□□ 1,71
Apoc2Q05020 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25,69■■□□□ 1,7
Apoc2Q05020 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,65■■□□□ 1,7
Apoc2Q05020 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,63■■□□□ 1,69
Apoc2Q05020 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC25,61■■□□□ 1,69
Apoc2Q05020 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,6■■□□□ 1,69
Apoc2Q05020 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,54■■□□□ 1,68
Apoc2Q05020 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,53■■□□□ 1,68
Apoc2Q05020 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC25,46■■□□□ 1,67
Apoc2Q05020 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,4■■□□□ 1,66
Apoc2Q05020 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,34■■□□□ 1,65
Apoc2Q05020 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,34■■□□□ 1,65
Apoc2Q05020 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,32■■□□□ 1,64
Apoc2Q05020 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,29■■□□□ 1,64
Apoc2Q05020 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25,29■■□□□ 1,64
Apoc2Q05020 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,28■■□□□ 1,64
Apoc2Q05020 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,28■■□□□ 1,64
Apoc2Q05020 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC25,27■■□□□ 1,64
Apoc2Q05020 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,27■■□□□ 1,64
Apoc2Q05020 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25,26■■□□□ 1,63
Apoc2Q05020 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,2■■□□□ 1,63
Apoc2Q05020 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,11■■□□□ 1,61
Apoc2Q05020 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,08■■□□□ 1,6
Apoc2Q05020 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,06■■□□□ 1,6
Apoc2Q05020 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,99■■□□□ 1,59
Apoc2Q05020 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC24,98■■□□□ 1,59
Apoc2Q05020 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC24,97■■□□□ 1,59
Apoc2Q05020 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24,96■■□□□ 1,59
Apoc2Q05020 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24,93■■□□□ 1,58
Apoc2Q05020 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,91■■□□□ 1,58
Apoc2Q05020 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24,9■■□□□ 1,58
Apoc2Q05020 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC24,89■■□□□ 1,57
Apoc2Q05020 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24,83■■□□□ 1,57
Apoc2Q05020 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,83■■□□□ 1,56
Apoc2Q05020 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24,78■■□□□ 1,56
Apoc2Q05020 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC24,76■■□□□ 1,55
Apoc2Q05020 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC24,74■■□□□ 1,55
Apoc2Q05020 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,66■■□□□ 1,54
Apoc2Q05020 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24,63■■□□□ 1,53
Apoc2Q05020 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,62■■□□□ 1,53
Apoc2Q05020 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC24,59■■□□□ 1,53
Apoc2Q05020 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24,56■■□□□ 1,52
Apoc2Q05020 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,55■■□□□ 1,52
Apoc2Q05020 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,54■■□□□ 1,52
Apoc2Q05020 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,51■■□□□ 1,51
Apoc2Q05020 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,51■■□□□ 1,51
Apoc2Q05020 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24,49■■□□□ 1,51
Apoc2Q05020 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,48■■□□□ 1,51
Apoc2Q05020 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,47■■□□□ 1,51
Apoc2Q05020 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24,4■■□□□ 1,5
Apoc2Q05020 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24,4■■□□□ 1,5
Apoc2Q05020 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24,35■■□□□ 1,49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11,6 ms