Protein–RNA interactions for Protein: Q05020

Apoc2, Apolipoprotein C-II, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoc2Q05020 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
Apoc2Q05020 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC30.32■■■□□ 2.44
Apoc2Q05020 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
Apoc2Q05020 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Apoc2Q05020 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
Apoc2Q05020 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Apoc2Q05020 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Apoc2Q05020 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Apoc2Q05020 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Apoc2Q05020 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Apoc2Q05020 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Apoc2Q05020 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Apoc2Q05020 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Apoc2Q05020 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Apoc2Q05020 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Apoc2Q05020 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
Apoc2Q05020 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Apoc2Q05020 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
Apoc2Q05020 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Apoc2Q05020 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Apoc2Q05020 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Apoc2Q05020 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Apoc2Q05020 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Apoc2Q05020 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Apoc2Q05020 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
Apoc2Q05020 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Apoc2Q05020 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
Apoc2Q05020 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Apoc2Q05020 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Apoc2Q05020 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
Apoc2Q05020 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Apoc2Q05020 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
Apoc2Q05020 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Apoc2Q05020 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Apoc2Q05020 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Apoc2Q05020 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Apoc2Q05020 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Apoc2Q05020 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Apoc2Q05020 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Apoc2Q05020 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
Apoc2Q05020 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Apoc2Q05020 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Apoc2Q05020 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
Apoc2Q05020 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
Apoc2Q05020 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Apoc2Q05020 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Apoc2Q05020 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Apoc2Q05020 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Apoc2Q05020 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Apoc2Q05020 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Apoc2Q05020 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Apoc2Q05020 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Apoc2Q05020 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Apoc2Q05020 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Apoc2Q05020 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Apoc2Q05020 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Apoc2Q05020 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Apoc2Q05020 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Apoc2Q05020 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Apoc2Q05020 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Apoc2Q05020 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Apoc2Q05020 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Apoc2Q05020 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Apoc2Q05020 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Apoc2Q05020 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Apoc2Q05020 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Apoc2Q05020 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Apoc2Q05020 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Apoc2Q05020 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Apoc2Q05020 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Apoc2Q05020 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Apoc2Q05020 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Apoc2Q05020 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Apoc2Q05020 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Apoc2Q05020 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Apoc2Q05020 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Apoc2Q05020 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Apoc2Q05020 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Apoc2Q05020 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Apoc2Q05020 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Apoc2Q05020 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Apoc2Q05020 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Apoc2Q05020 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Apoc2Q05020 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Apoc2Q05020 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Apoc2Q05020 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Apoc2Q05020 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Apoc2Q05020 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Apoc2Q05020 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Apoc2Q05020 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Apoc2Q05020 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Apoc2Q05020 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Apoc2Q05020 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Apoc2Q05020 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Apoc2Q05020 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Apoc2Q05020 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Apoc2Q05020 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Apoc2Q05020 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Apoc2Q05020 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Apoc2Q05020 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.3 ms