RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000602511.1

KDM5B-210, Transcript of lysine demethylase 5B, humanhuman

TSL 5

Gene KDM5B, Length 542 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5B-210ENST00000602511 PAQR6Q6TCH4 344 aa7.36□□□□□ -1.23
KDM5B-210ENST00000602511 TMPPEQ6ZT21 453 aa7.36□□□□□ -1.23
KDM5B-210ENST00000602511 H1FNTQ75WM6 255 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
KDM5B-210ENST00000602511 HDDC2Q7Z4H3 204 aa7.36□□□□□ -1.23
KDM5B-210ENST00000602511 PNPLA5Q7Z6Z6 429 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
KDM5B-210ENST00000602511 OR8D4Q8NGM9 314 aa7.36□□□□□ -1.23
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KDM5B-210ENST00000602511 PNPLA2Q96AD5 504 aa7.36□□□□□ -1.23
KDM5B-210ENST00000602511 ZHX1-C8orf76Q96EF9 292 aa7.36□□□□□ -1.23
KDM5B-210ENST00000602511 ARL5BQ96KC2 179 aa7.36□□□□□ -1.23
KDM5B-210ENST00000602511 CNBD2Q96M20 576 aa7.36□□□□□ -1.23
KDM5B-210ENST00000602511 KLHL15Q96M94 604 aa7.36□□□□□ -1.23
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KDM5B-210ENST00000602511 CHST11Q9NPF2 352 aa7.36□□□□□ -1.23
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KDM5B-210ENST00000602511 KLHL21Q9UJP4 597 aa7.36□□□□□ -1.23
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KDM5B-210ENST00000602511 B3GNT3Q9Y2A9 372 aa7.36□□□□□ -1.23
KDM5B-210ENST00000602511 COL12A1Q99715 3063 aa7.36□□□□□ -1.23
KDM5B-210ENST00000602511 TRAV27A0A087WT01 109 aa7.35□□□□□ -1.23
KDM5B-210ENST00000602511 SNTNA6NMZ2 147 aa7.35□□□□□ -1.23
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KDM5B-210ENST00000602511 H3BML4 177 aa7.35□□□□□ -1.23
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KDM5B-210ENST00000602511 TRAPPC6AO75865 159 aa7.35□□□□□ -1.23
KDM5B-210ENST00000602511 OR6A2O95222 327 aa7.35□□□□□ -1.23
KDM5B-210ENST00000602511 TNFAIP8O95379 198 aa7.35□□□□□ -1.23
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KDM5B-210ENST00000602511 CRYABP02511 175 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
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KDM5B-210ENST00000602511 SFTPCP11686 197 aa7.35□□□□□ -1.23
KDM5B-210ENST00000602511 IMPDH2P12268 514 aa7.35□□□□□ -1.23
KDM5B-210ENST00000602511 ZNF24P17028 368 aa7.35□□□□□ -1.23
KDM5B-210ENST00000602511 GABRB1P18505 474 aa7.35□□□□□ -1.23
KDM5B-210ENST00000602511 POU3F2P20265 443 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
KDM5B-210ENST00000602511 POU1F1P28069 291 aa7.35□□□□□ -1.23
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KDM5B-210ENST00000602511 SDHAP31040 664 aa7.35□□□□□ -1.23
KDM5B-210ENST00000602511 POLR2IP36954 125 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
KDM5B-210ENST00000602511 MAGEA5P43359 124 aa7.35□□□□□ -1.23
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KDM5B-210ENST00000602511 DIO1P49895 249 aa7.35□□□□□ -1.23
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KDM5B-210ENST00000602511 KCTD21Q4G0X4 260 aa7.35□□□□□ -1.23
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KDM5B-210ENST00000602511 WIPI1Q5MNZ9 446 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
KDM5B-210ENST00000602511 RBM48Q5RL73 367 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
KDM5B-210ENST00000602511 SLC6A19Q695T7 634 aa7.35□□□□□ -1.23
KDM5B-210ENST00000602511 PXKQ7Z7A4 578 aa7.35□□□□□ -1.23
KDM5B-210ENST00000602511 YRDCQ86U90 279 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
KDM5B-210ENST00000602511 GGNQ86UU5 652 aa7.35□□□□□ -1.23
KDM5B-210ENST00000602511 ENTHD1Q8IYW4 607 aa7.35□□□□□ -1.23
KDM5B-210ENST00000602511 FAM26EQ8N5C1 309 aa7.35□□□□□ -1.23
KDM5B-210ENST00000602511 C10orf53Q8N6V4 93 aa7.35□□□□□ -1.23
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KDM5B-210ENST00000602511 OR51A7Q8NH64 312 aa7.35□□□□□ -1.23
KDM5B-210ENST00000602511 RHOXF1Q8NHV9 184 aa7.35□□□□□ -1.23
KDM5B-210ENST00000602511 C9orf43Q8TAL5 461 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
KDM5B-210ENST00000602511 NEIL3Q8TAT5 605 aa7.35□□□□□ -1.23
KDM5B-210ENST00000602511 TMEM163Q8TC26 289 aa7.35□□□□□ -1.23
KDM5B-210ENST00000602511 HDAC2Q92769 488 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
KDM5B-210ENST00000602511 CPNE4Q96A23 557 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
KDM5B-210ENST00000602511 ABHD17AQ96GS6 310 aa7.35□□□□□ -1.23
KDM5B-210ENST00000602511 ADGRG7Q96K78 797 aa7.35□□□□□ -1.23
KDM5B-210ENST00000602511 SAMD8Q96LT4 415 aa7.35□□□□□ -1.23
KDM5B-210ENST00000602511 TNFRSF13CQ96RJ3 184 aa7.35□□□□□ -1.23
KDM5B-210ENST00000602511 NAA11Q9BSU3 229 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
KDM5B-210ENST00000602511 SF3B5Q9BWJ5 86 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
KDM5B-210ENST00000602511 PLA2G12AQ9BZM1 189 aa7.35□□□□□ -1.23
KDM5B-210ENST00000602511 TIGARQ9NQ88 270 aa7.35□□□□□ -1.23
KDM5B-210ENST00000602511 CMC2Q9NRP2 79 aa7.35□□□□□ -1.23
KDM5B-210ENST00000602511 PLCXD1Q9NUJ7 323 aa7.35□□□□□ -1.23
KDM5B-210ENST00000602511 RASD1Q9Y272 281 aa7.35□□□□□ -1.23
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