RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000574217.1

PRPF8-210, Transcript of pre-mRNA processing factor 8, humanhuman

TSL 2

Gene PRPF8, Length 310 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF8-210ENST00000574217 GABRA1P14867 456 aa5.99□□□□□ -1.45
PRPF8-210ENST00000574217 ZNF26P17031 533 aaPredicted RBP5.99□□□□□ -1.45
PRPF8-210ENST00000574217 ENPP1P22413 925 aa5.99□□□□□ -1.45
PRPF8-210ENST00000574217 AHCYP23526 432 aa5.99□□□□□ -1.45
PRPF8-210ENST00000574217 UQCRC1P31930 480 aa5.99□□□□□ -1.45
PRPF8-210ENST00000574217 VHLP40337 213 aa5.99□□□□□ -1.45
PRPF8-210ENST00000574217 AGFG1P52594 562 aaKnown RBP5.99□□□□□ -1.45
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PRPF8-210ENST00000574217 H3F3AP84243 136 aa5.99□□□□□ -1.45
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PRPF8-210ENST00000574217 SF3B4Q15427 424 aaKnown RBP eCLIP5.99□□□□□ -1.457e-14■■■■■ 46.4
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PRPF8-210ENST00000574217 Q6ZPB1 254 aaPredicted RBP5.99□□□□□ -1.45
PRPF8-210ENST00000574217 H1FNTQ75WM6 255 aaPredicted RBP5.99□□□□□ -1.45
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PRPF8-210ENST00000574217 SLC29A1Q99808 456 aa5.99□□□□□ -1.45
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PRPF8-210ENST00000574217 OR52D1Q9H346 318 aa5.99□□□□□ -1.45
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PRPF8-210ENST00000574217 SMPD3Q9NY59 655 aaPredicted RBP5.99□□□□□ -1.45
PRPF8-210ENST00000574217 IL20Q9NYY1 176 aa5.99□□□□□ -1.45
PRPF8-210ENST00000574217 SEC14L4Q9UDX3 406 aa5.99□□□□□ -1.45
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PRPF8-210ENST00000574217 MCTS1Q9ULC4 181 aaKnown RBP5.99□□□□□ -1.45
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PRPF8-210ENST00000574217 HIF3AQ9Y2N7 669 aa5.99□□□□□ -1.45
PRPF8-210ENST00000574217 CDH10Q9Y6N8 788 aa5.99□□□□□ -1.45
PRPF8-210ENST00000574217 KIAA1549Q9HCM3 1950 aa5.98□□□□□ -1.45
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PRPF8-210ENST00000574217 H0YJX3 145 aa5.98□□□□□ -1.45
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PRPF8-210ENST00000574217 SMAD9O15198 467 aaKnown RBP5.98□□□□□ -1.45
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PRPF8-210ENST00000574217 PTP4A3O75365 173 aa5.98□□□□□ -1.45
PRPF8-210ENST00000574217 NDUFB2O95178 105 aa5.98□□□□□ -1.45
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PRPF8-210ENST00000574217 F13BP05160 661 aa5.98□□□□□ -1.45
PRPF8-210ENST00000574217 HOXD4P09016 255 aaPredicted RBP5.98□□□□□ -1.45
PRPF8-210ENST00000574217 TSPAN19P0C672 248 aa5.98□□□□□ -1.45
PRPF8-210ENST00000574217 KLK2P20151 261 aa5.98□□□□□ -1.45
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PRPF8-210ENST00000574217 CA7P43166 264 aa5.98□□□□□ -1.45
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PRPF8-210ENST00000574217 FHL1Q13642 323 aa5.98□□□□□ -1.45
PRPF8-210ENST00000574217 C1DQ13901 141 aaKnown RBP5.98□□□□□ -1.45
PRPF8-210ENST00000574217 ACSF3Q4G176 576 aaPredicted RBP5.98□□□□□ -1.45
PRPF8-210ENST00000574217 C4orf17Q53FE4 359 aa5.98□□□□□ -1.45
PRPF8-210ENST00000574217 ABLIM2Q6H8Q1 611 aa5.98□□□□□ -1.45
PRPF8-210ENST00000574217 ZNF585AQ6P3V2 769 aa5.98□□□□□ -1.45
PRPF8-210ENST00000574217 C3P1Q6ZMU1 363 aa5.98□□□□□ -1.45
PRPF8-210ENST00000574217 NCCRP1Q6ZVX7 275 aaPredicted RBP5.98□□□□□ -1.45
PRPF8-210ENST00000574217 FCRLAQ7L513 359 aa5.98□□□□□ -1.45
PRPF8-210ENST00000574217 P4HA3Q7Z4N8 544 aa5.98□□□□□ -1.45
PRPF8-210ENST00000574217 GPAT4Q86UL3 456 aa5.98□□□□□ -1.45
PRPF8-210ENST00000574217 FJX1Q86VR8 437 aa5.98□□□□□ -1.45
PRPF8-210ENST00000574217 KIF18BQ86Y91 864 aa5.98□□□□□ -1.45
PRPF8-210ENST00000574217 CCDC103Q8IW40 242 aa5.98□□□□□ -1.45
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