RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000569899.5

GDE1-205, Transcript of glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, humanhuman

TSL 4

Gene GDE1, Length 1,618 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDE1-205ENST00000569899 ZBED5Q49AG3 693 aa9□□□□□ -0.97
GDE1-205ENST00000569899 GALNTL5Q7Z4T8 443 aa9□□□□□ -0.97
GDE1-205ENST00000569899 IGFN1Q86VF2 1251 aa9□□□□□ -0.97
GDE1-205ENST00000569899 GTPBP8Q8N3Z3 284 aaPredicted RBP9□□□□□ -0.97
GDE1-205ENST00000569899 OR52L1Q8NGH7 329 aa9□□□□□ -0.97
GDE1-205ENST00000569899 C5orf34Q96MH7 638 aa9□□□□□ -0.97
GDE1-205ENST00000569899 CSTF2TQ9H0L4 616 aaKnown RBP eCLIP9□□□□□ -0.97
GDE1-205ENST00000569899 ADNPQ9H2P0 1102 aa9□□□□□ -0.97
GDE1-205ENST00000569899 UBQLN3Q9H347 655 aa9□□□□□ -0.97
GDE1-205ENST00000569899 ZNF703Q9H7S9 590 aaPredicted RBP9□□□□□ -0.97
GDE1-205ENST00000569899 FKRPQ9H9S5 495 aa9□□□□□ -0.97
GDE1-205ENST00000569899 ZFP64Q9NPA5 681 aa9□□□□□ -0.97
GDE1-205ENST00000569899 NANSQ9NR45 359 aa9□□□□□ -0.97
GDE1-205ENST00000569899 TVP23BQ9NYZ1 205 aa9□□□□□ -0.97
GDE1-205ENST00000569899 DKK4Q9UBT3 224 aa9□□□□□ -0.97
GDE1-205ENST00000569899 BOKQ9UMX3 212 aaPredicted RBP9□□□□□ -0.97
GDE1-205ENST00000569899 KLF13Q9Y2Y9 288 aaPredicted RBP9□□□□□ -0.97
GDE1-205ENST00000569899 ZNF337Q9Y3M9 751 aa9□□□□□ -0.97
GDE1-205ENST00000569899 HSPE1-MOB4S4R3N1 261 aa9□□□□□ -0.97
GDE1-205ENST00000569899 CFAP47Q6ZTR5 3102 aa9□□□□□ -0.97
GDE1-205ENST00000569899 OR2M5A3KFT3 312 aa8.99□□□□□ -0.97
GDE1-205ENST00000569899 MCIDASD6RGH6 385 aa8.99□□□□□ -0.97
GDE1-205ENST00000569899 FTCDNL1E5RQL4 147 aa8.99□□□□□ -0.97
GDE1-205ENST00000569899 SLC1A7O00341 560 aa8.99□□□□□ -0.97
GDE1-205ENST00000569899 BHLHE40O14503 412 aa8.99□□□□□ -0.97
GDE1-205ENST00000569899 ZNF208O43345 1280 aa8.99□□□□□ -0.97
GDE1-205ENST00000569899 PRKYO43930 277 aa8.99□□□□□ -0.97
GDE1-205ENST00000569899 ZIC3O60481 467 aa8.99□□□□□ -0.97
GDE1-205ENST00000569899 CBR3O75828 277 aa8.99□□□□□ -0.97
GDE1-205ENST00000569899 RCBTB2O95199 551 aa8.99□□□□□ -0.97
GDE1-205ENST00000569899 PPP1R3DO95685 299 aa8.99□□□□□ -0.97
GDE1-205ENST00000569899 SP1P08047 785 aa8.99□□□□□ -0.97
GDE1-205ENST00000569899 SMIM18P0DKX4 95 aa8.99□□□□□ -0.97
GDE1-205ENST00000569899 TFPIP10646 304 aa8.99□□□□□ -0.97
GDE1-205ENST00000569899 UQCRC1P31930 480 aa8.99□□□□□ -0.97
GDE1-205ENST00000569899 SFTPDP35247 375 aa8.99□□□□□ -0.97
GDE1-205ENST00000569899 EIF1P41567 113 aaKnown RBP8.99□□□□□ -0.97
GDE1-205ENST00000569899 CD97P48960 835 aa8.99□□□□□ -0.97
GDE1-205ENST00000569899 MEOX1P50221 254 aa8.99□□□□□ -0.97
GDE1-205ENST00000569899 SYT14P1Q58G82 188 aa8.99□□□□□ -0.97
GDE1-205ENST00000569899 C6orf141Q5SZD1 244 aa8.99□□□□□ -0.97
GDE1-205ENST00000569899 FAM69AQ5T7M9 428 aa8.99□□□□□ -0.97
GDE1-205ENST00000569899 SLC25A25Q6KCM7 469 aa8.99□□□□□ -0.97
GDE1-205ENST00000569899 RPL13AP3Q6NVV1 102 aa8.99□□□□□ -0.97
GDE1-205ENST00000569899 IGFL2Q6UWQ7 119 aa8.99□□□□□ -0.97
GDE1-205ENST00000569899 CASP12Q6UXS9 341 aa8.99□□□□□ -0.97
GDE1-205ENST00000569899 NANOGNBQ7Z5D8 188 aa8.99□□□□□ -0.97
GDE1-205ENST00000569899 YRDCQ86U90 279 aaKnown RBP8.99□□□□□ -0.97
GDE1-205ENST00000569899 FAM83FQ8NEG4 500 aaPredicted RBP8.99□□□□□ -0.97
GDE1-205ENST00000569899 OR2T33Q8NG76 320 aa8.99□□□□□ -0.97
GDE1-205ENST00000569899 MOSPD2Q8NHP6 518 aa8.99□□□□□ -0.97
GDE1-205ENST00000569899 LIPHQ8WWY8 451 aa8.99□□□□□ -0.97
GDE1-205ENST00000569899 HAS2Q92819 552 aa8.99□□□□□ -0.97
GDE1-205ENST00000569899 SLC25A36Q96CQ1 311 aa8.99□□□□□ -0.97
GDE1-205ENST00000569899 DDIT4LQ96D03 193 aa8.99□□□□□ -0.97
GDE1-205ENST00000569899 SCMH1Q96GD3 660 aa8.99□□□□□ -0.97
GDE1-205ENST00000569899 IL4I1Q96RQ9 567 aa8.99□□□□□ -0.97
GDE1-205ENST00000569899 RHNO1Q9BSD3 238 aa8.99□□□□□ -0.97
GDE1-205ENST00000569899 TTTY12Q9BZ98 90 aa8.99□□□□□ -0.97
GDE1-205ENST00000569899 ZNF696Q9H7X3 374 aa8.99□□□□□ -0.97
GDE1-205ENST00000569899 ZNF229Q9UJW7 825 aa8.99□□□□□ -0.97
GDE1-205ENST00000569899 MYRFQ9Y2G1 1151 aa8.99□□□□□ -0.97
GDE1-205ENST00000569899 IGF2RP11717 2491 aa8.99□□□□□ -0.97
GDE1-205ENST00000569899 HTR3EA5X5Y0 456 aa8.98□□□□□ -0.97
GDE1-205ENST00000569899 MAGEA13PA6NCF6 341 aa8.98□□□□□ -0.97
GDE1-205ENST00000569899 FAM166BA8MTA8 275 aa8.98□□□□□ -0.97
GDE1-205ENST00000569899 BLOC1S5-TXNDC5H3BN57 136 aa8.98□□□□□ -0.97
GDE1-205ENST00000569899 XPNPEP2O43895 674 aa8.98□□□□□ -0.97
GDE1-205ENST00000569899 NDUFB2O95178 105 aa8.98□□□□□ -0.97
GDE1-205ENST00000569899 SLC2A10O95528 541 aa8.98□□□□□ -0.97
GDE1-205ENST00000569899 ZNF17P17021 662 aa8.98□□□□□ -0.97
GDE1-205ENST00000569899 BMP7P18075 431 aa8.98□□□□□ -0.97
GDE1-205ENST00000569899 GRPRP30550 384 aa8.98□□□□□ -0.97
GDE1-205ENST00000569899 SLC6A6P31641 620 aa8.98□□□□□ -0.97
GDE1-205ENST00000569899 IDUAP35475 653 aa8.98□□□□□ -0.97
GDE1-205ENST00000569899 AQP2P41181 271 aa8.98□□□□□ -0.97
GDE1-205ENST00000569899 PCYT1AP49585 367 aa8.98□□□□□ -0.97
GDE1-205ENST00000569899 TNFSF10P50591 281 aa8.98□□□□□ -0.97
GDE1-205ENST00000569899 NUDT6P53370 316 aa8.98□□□□□ -0.97
GDE1-205ENST00000569899 CDH15P55291 814 aa8.98□□□□□ -0.97
GDE1-205ENST00000569899 B3GALT5-AS1P59052 145 aa8.98□□□□□ -0.97
GDE1-205ENST00000569899 TLE3Q04726 772 aa8.98□□□□□ -0.97
GDE1-205ENST00000569899 RPL18Q07020 188 aaKnown RBP8.98□□□□□ -0.97
GDE1-205ENST00000569899 OR7A5Q15622 319 aa8.98□□□□□ -0.97
GDE1-205ENST00000569899 ZNF766Q5HY98 468 aa8.98□□□□□ -0.97
GDE1-205ENST00000569899 C5orf46Q6UWT4 87 aa8.98□□□□□ -0.97
GDE1-205ENST00000569899 PTCHD4Q6ZW05 846 aa8.98□□□□□ -0.97
GDE1-205ENST00000569899 FAM214BQ7L5A3 538 aa8.98□□□□□ -0.97
GDE1-205ENST00000569899 BCDIN3DQ7Z5W3 292 aaKnown RBP8.98□□□□□ -0.97
GDE1-205ENST00000569899 TCEANCQ8N8B7 351 aa8.98□□□□□ -0.97
GDE1-205ENST00000569899 OR14L1PQ8NHC6 308 aa8.98□□□□□ -0.97
GDE1-205ENST00000569899 RHOXF1Q8NHV9 184 aa8.98□□□□□ -0.97
GDE1-205ENST00000569899 SMPDL3BQ92485 455 aa8.98□□□□□ -0.97
GDE1-205ENST00000569899 SGCDQ92629 289 aa8.98□□□□□ -0.97
GDE1-205ENST00000569899 HDAC2Q92769 488 aaKnown RBP8.98□□□□□ -0.97
GDE1-205ENST00000569899 IFT27Q9BW83 186 aa8.98□□□□□ -0.97
GDE1-205ENST00000569899 POLDIP3Q9BY77 421 aaKnown RBP8.98□□□□□ -0.97
GDE1-205ENST00000569899 OR2B2Q9GZK3 357 aa8.98□□□□□ -0.97
GDE1-205ENST00000569899 SERINC1Q9NRX5 453 aa8.98□□□□□ -0.97
GDE1-205ENST00000569899 DNAJC27Q9NZQ0 273 aa8.98□□□□□ -0.97
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.7 ms