RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550857.5

PTPRB-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRB, Length 5,839 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-209ENST00000550857 PLA1AQ53H76 456 aa7.41□□□□□ -1.22
PTPRB-209ENST00000550857 ACTBL2Q562R1 376 aa7.41□□□□□ -1.22
PTPRB-209ENST00000550857 Q8IYB0 196 aa7.41□□□□□ -1.22
PTPRB-209ENST00000550857 OR52H1Q8NGJ2 320 aa7.41□□□□□ -1.22
PTPRB-209ENST00000550857 SLC7A13Q8TCU3 470 aa7.41□□□□□ -1.22
PTPRB-209ENST00000550857 STON2Q8WXE9 905 aa7.41□□□□□ -1.22
PTPRB-209ENST00000550857 KCNA7Q96RP8 456 aa7.41□□□□□ -1.22
PTPRB-209ENST00000550857 WWTR1Q9GZV5 400 aa7.41□□□□□ -1.22
PTPRB-209ENST00000550857 METTL8Q9H825 291 aaKnown RBP7.41□□□□□ -1.22
PTPRB-209ENST00000550857 MMP25Q9NPA2 562 aa7.41□□□□□ -1.22
PTPRB-209ENST00000550857 MED11Q9P086 117 aa7.41□□□□□ -1.22
PTPRB-209ENST00000550857 SLAMF8Q9P0V8 285 aa7.41□□□□□ -1.22
PTPRB-209ENST00000550857 GPR45Q9Y5Y3 372 aa7.41□□□□□ -1.22
PTPRB-209ENST00000550857 BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 106 aa7.41□□□□□ -1.22
PTPRB-209ENST00000550857 ANKRD61A6NGH8 418 aa7.41□□□□□ -1.22
PTPRB-209ENST00000550857 ORC5O43913 435 aa7.41□□□□□ -1.22
PTPRB-209ENST00000550857 SMPD2O60906 423 aa7.41□□□□□ -1.22
PTPRB-209ENST00000550857 CTXN2P0C2S0 81 aa7.41□□□□□ -1.22
PTPRB-209ENST00000550857 NCK1P16333 377 aa7.41□□□□□ -1.22
PTPRB-209ENST00000550857 MAOAP21397 527 aa7.41□□□□□ -1.22
PTPRB-209ENST00000550857 PEX2P28328 305 aa7.41□□□□□ -1.22
PTPRB-209ENST00000550857 ADARB1P78563 741 aaKnown RBP7.41□□□□□ -1.22
PTPRB-209ENST00000550857 AQP6Q13520 282 aa7.41□□□□□ -1.22
PTPRB-209ENST00000550857 KCNAB1Q14722 419 aa7.41□□□□□ -1.22
PTPRB-209ENST00000550857 MRPL2Q5T653 305 aaKnown RBP7.41□□□□□ -1.22
PTPRB-209ENST00000550857 PRAMEF17Q5VTA0 474 aa7.41□□□□□ -1.22
PTPRB-209ENST00000550857 OGFOD3Q6PK18 319 aa7.41□□□□□ -1.22
PTPRB-209ENST00000550857 PIGCQ92535 297 aa7.41□□□□□ -1.22
PTPRB-209ENST00000550857 FBXW5Q969U6 566 aa7.41□□□□□ -1.22
PTPRB-209ENST00000550857 TXLNGYQ9BZA5 131 aa7.41□□□□□ -1.22
PTPRB-209ENST00000550857 SEMA4CQ9C0C4 833 aa7.41□□□□□ -1.22
PTPRB-209ENST00000550857 B3GNT2Q9NY97 397 aa7.41□□□□□ -1.22
PTPRB-209ENST00000550857 CLEC4AQ9UMR7 237 aa7.41□□□□□ -1.22
PTPRB-209ENST00000550857 IER3IP1Q9Y5U9 82 aa7.41□□□□□ -1.22
PTPRB-209ENST00000550857 KCNMB2Q9Y691 235 aa7.41□□□□□ -1.22
PTPRB-209ENST00000550857 HYAL3O43820 417 aaPredicted RBP7.4□□□□□ -1.22
PTPRB-209ENST00000550857 OR2J2O76002 312 aa7.4□□□□□ -1.22
PTPRB-209ENST00000550857 AQP8O94778 261 aa7.4□□□□□ -1.22
PTPRB-209ENST00000550857 HSD17B1P14061 328 aa7.4□□□□□ -1.22
PTPRB-209ENST00000550857 ABCD3P28288 659 aa7.4□□□□□ -1.22
PTPRB-209ENST00000550857 BIDP55957 195 aa7.4□□□□□ -1.22
PTPRB-209ENST00000550857 CLVS2Q5SYC1 327 aa7.4□□□□□ -1.22
PTPRB-209ENST00000550857 ZNF534Q76KX8 674 aa7.4□□□□□ -1.22
PTPRB-209ENST00000550857 MUC20Q8N307 709 aaPredicted RBP7.4□□□□□ -1.22
PTPRB-209ENST00000550857 WDSUB1Q8N9V3 476 aa7.4□□□□□ -1.22
PTPRB-209ENST00000550857 OR4D6Q8NGJ1 314 aa7.4□□□□□ -1.22
PTPRB-209ENST00000550857 PHYHIPQ92561 330 aa7.4□□□□□ -1.22
PTPRB-209ENST00000550857 A4GALTQ9NPC4 353 aa7.4□□□□□ -1.22
PTPRB-209ENST00000550857 LPAR3Q9UBY5 353 aa7.4□□□□□ -1.22
PTPRB-209ENST00000550857 B3GNT3Q9Y2A9 372 aa7.4□□□□□ -1.22
PTPRB-209ENST00000550857 TSC22D4Q9Y3Q8 395 aa7.4□□□□□ -1.22
PTPRB-209ENST00000550857 FER1L6Q2WGJ9 1857 aa7.4□□□□□ -1.22
PTPRB-209ENST00000550857 PRSS44E7EML9 344 aa7.4□□□□□ -1.22
PTPRB-209ENST00000550857 TSPAN4O14817 238 aa7.4□□□□□ -1.22
PTPRB-209ENST00000550857 IDH3GP51553 393 aaPredicted RBP7.4□□□□□ -1.22
PTPRB-209ENST00000550857 RAC1P63000 192 aa7.4□□□□□ -1.22
PTPRB-209ENST00000550857 MAP4K2Q12851 820 aa7.4□□□□□ -1.22
PTPRB-209ENST00000550857 SRSF5Q13243 272 aaKnown RBP7.4□□□□□ -1.22
PTPRB-209ENST00000550857 OLIG2Q13516 323 aa7.4□□□□□ -1.22
PTPRB-209ENST00000550857 HES1Q14469 280 aa7.4□□□□□ -1.22
PTPRB-209ENST00000550857 STEAP3Q658P3 488 aa7.4□□□□□ -1.22
PTPRB-209ENST00000550857 AWAT2Q6E213 333 aa7.4□□□□□ -1.22
PTPRB-209ENST00000550857 ZNF782Q6ZMW2 699 aaPredicted RBP7.4□□□□□ -1.22
PTPRB-209ENST00000550857 ANKRD37Q7Z713 158 aa7.4□□□□□ -1.22
PTPRB-209ENST00000550857 MEX3DQ86XN8 651 aaKnown RBP7.4□□□□□ -1.22
PTPRB-209ENST00000550857 PNPLA1Q8N8W4 532 aa7.4□□□□□ -1.22
PTPRB-209ENST00000550857 CXorf21Q9HAI6 301 aa7.4□□□□□ -1.22
PTPRB-209ENST00000550857 ZNF286AQ9HBT8 521 aa7.4□□□□□ -1.22
PTPRB-209ENST00000550857 CRLF2Q9HC73 371 aa7.4□□□□□ -1.22
PTPRB-209ENST00000550857 AASSQ9UDR5 926 aa7.4□□□□□ -1.22
PTPRB-209ENST00000550857 B3GALT1Q9Y5Z6 326 aa7.4□□□□□ -1.22
PTPRB-209ENST00000550857 FOCADQ5VW36 1801 aa7.4□□□□□ -1.22
PTPRB-209ENST00000550857 G3V3Y1 287 aa7.4□□□□□ -1.22
PTPRB-209ENST00000550857 AURKAO14965 403 aa7.4□□□□□ -1.22
PTPRB-209ENST00000550857 ATP6V1G2O95670 118 aa7.4□□□□□ -1.22
PTPRB-209ENST00000550857 IFNA1P01562 189 aa7.4□□□□□ -1.22
PTPRB-209ENST00000550857 SERPINE2P07093 398 aa7.4□□□□□ -1.22
PTPRB-209ENST00000550857 FGF3P11487 239 aaPredicted RBP7.4□□□□□ -1.22
PTPRB-209ENST00000550857 TAS2R31P59538 309 aa7.4□□□□□ -1.22
PTPRB-209ENST00000550857 IKZF1Q13422 519 aa7.4□□□□□ -1.22
PTPRB-209ENST00000550857 SMIM21Q3B7S5 101 aa7.4□□□□□ -1.22
PTPRB-209ENST00000550857 ACSM5Q6NUN0 579 aa7.4□□□□□ -1.22
PTPRB-209ENST00000550857 CPNE8Q86YQ8 564 aa7.4□□□□□ -1.22
PTPRB-209ENST00000550857 OR1L3Q8NH93 324 aa7.4□□□□□ -1.22
PTPRB-209ENST00000550857 TM4SF18Q96CE8 201 aa7.4□□□□□ -1.22
PTPRB-209ENST00000550857 FAM46AQ96IP4 442 aaKnown RBP7.4□□□□□ -1.22
PTPRB-209ENST00000550857 FAM71F1Q96KD3 344 aaPredicted RBP7.4□□□□□ -1.22
PTPRB-209ENST00000550857 ACPTQ9BZG2 426 aa7.4□□□□□ -1.22
PTPRB-209ENST00000550857 DNAJC15Q9Y5T4 150 aa7.4□□□□□ -1.22
PTPRB-209ENST00000550857 OR14I1A6ND48 311 aa7.4□□□□□ -1.23
PTPRB-209ENST00000550857 ZNF99A8MXY4 864 aaPredicted RBP7.4□□□□□ -1.23
PTPRB-209ENST00000550857 ACOT8O14734 319 aa7.4□□□□□ -1.23
PTPRB-209ENST00000550857 GPR137BO60478 399 aa7.4□□□□□ -1.23
PTPRB-209ENST00000550857 DOK2O60496 412 aa7.4□□□□□ -1.23
PTPRB-209ENST00000550857 ARRB2P32121 409 aa7.4□□□□□ -1.23
PTPRB-209ENST00000550857 PIGAP37287 484 aa7.4□□□□□ -1.23
PTPRB-209ENST00000550857 TCTN3Q6NUS6 607 aa7.4□□□□□ -1.23
PTPRB-209ENST00000550857 LETMD1Q6P1Q0 360 aa7.4□□□□□ -1.23
PTPRB-209ENST00000550857 TRAT1Q6PIZ9 186 aa7.4□□□□□ -1.23
PTPRB-209ENST00000550857 LSM14AQ8ND56 463 aaKnown RBP7.4□□□□□ -1.23
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.1 ms