RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533686.5

PACSIN3-210, Transcript of protein kinase C and casein kinase substrate in neurons 3, humanhuman

TSL 3

Gene PACSIN3, Length 443 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3-210ENST00000533686 IFI30P13284 250 aa14.63□□□□□ -0.07
PACSIN3-210ENST00000533686 NQO1P15559 274 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
PACSIN3-210ENST00000533686 FUT1P19526 365 aa14.63□□□□□ -0.07
PACSIN3-210ENST00000533686 CBLP22681 906 aa14.63□□□□□ -0.07
PACSIN3-210ENST00000533686 LIMS1P48059 325 aa14.63□□□□□ -0.07
PACSIN3-210ENST00000533686 SIRPAP78324 504 aa14.63□□□□□ -0.07
PACSIN3-210ENST00000533686 LSM11P83369 360 aaKnown RBP eCLIP14.63□□□□□ -0.07
PACSIN3-210ENST00000533686 ZP4Q12836 540 aa14.63□□□□□ -0.07
PACSIN3-210ENST00000533686 PMS2P3Q13401 168 aa14.63□□□□□ -0.07
PACSIN3-210ENST00000533686 CDSNQ15517 529 aa14.63□□□□□ -0.07
PACSIN3-210ENST00000533686 VWA1Q6PCB0 445 aa14.63□□□□□ -0.07
PACSIN3-210ENST00000533686 TBPL2Q6SJ96 375 aa14.63□□□□□ -0.07
PACSIN3-210ENST00000533686 HIST3H2AQ7L7L0 130 aa14.63□□□□□ -0.07
PACSIN3-210ENST00000533686 GALNT5Q7Z7M9 940 aa14.63□□□□□ -0.07
PACSIN3-210ENST00000533686 CDK20Q8IZL9 346 aa14.63□□□□□ -0.07
PACSIN3-210ENST00000533686 OR9K2Q8NGE7 335 aa14.63□□□□□ -0.07
PACSIN3-210ENST00000533686 OR52J3Q8NH60 311 aa14.63□□□□□ -0.07
PACSIN3-210ENST00000533686 HIST1H2ACQ93077 130 aa14.63□□□□□ -0.07
PACSIN3-210ENST00000533686 SLCO4A1Q96BD0 722 aa14.63□□□□□ -0.07
PACSIN3-210ENST00000533686 OXGR1Q96P68 337 aa14.63□□□□□ -0.07
PACSIN3-210ENST00000533686 ALPK1Q96QP1 1244 aa14.63□□□□□ -0.07
PACSIN3-210ENST00000533686 KRCC1Q9NPI7 259 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
PACSIN3-210ENST00000533686 KCNJ16Q9NPI9 418 aa14.63□□□□□ -0.07
PACSIN3-210ENST00000533686 SEC14L4Q9UDX3 406 aa14.63□□□□□ -0.07
PACSIN3-210ENST00000533686 TMCC3Q9ULS5 477 aa14.63□□□□□ -0.07
PACSIN3-210ENST00000533686 TMEM5Q9Y2B1 443 aa14.63□□□□□ -0.07
PACSIN3-210ENST00000533686 FLVCR1Q9Y5Y0 555 aa14.63□□□□□ -0.07
PACSIN3-210ENST00000533686 LYVE1Q9Y5Y7 322 aa14.63□□□□□ -0.07
PACSIN3-210ENST00000533686 MS4A18H0YCH9 400 aa14.62□□□□□ -0.07
PACSIN3-210ENST00000533686 TNFRSF11BO00300 401 aa14.62□□□□□ -0.07
PACSIN3-210ENST00000533686 CST1P01037 141 aa14.62□□□□□ -0.07
PACSIN3-210ENST00000533686 TSPAN19P0C672 248 aa14.62□□□□□ -0.07
PACSIN3-210ENST00000533686 ACTR3P61158 418 aa14.62□□□□□ -0.07
PACSIN3-210ENST00000533686 SEC23BQ15437 767 aa14.62□□□□□ -0.07
PACSIN3-210ENST00000533686 MS4A18Q3C1V0 323 aa14.62□□□□□ -0.07
PACSIN3-210ENST00000533686 FBXL19-AS1Q494R0 122 aa14.62□□□□□ -0.07
PACSIN3-210ENST00000533686 ANKDD1AQ495B1 522 aa14.62□□□□□ -0.07
PACSIN3-210ENST00000533686 TENM4Q6N022 2769 aa14.62□□□□□ -0.07
PACSIN3-210ENST00000533686 TMPRSS11FQ6ZWK6 438 aa14.62□□□□□ -0.07
PACSIN3-210ENST00000533686 GPAT4Q86UL3 456 aa14.62□□□□□ -0.07
PACSIN3-210ENST00000533686 LINC00471Q8N535 108 aa14.62□□□□□ -0.07
PACSIN3-210ENST00000533686 LRRC17Q8N6Y2 441 aa14.62□□□□□ -0.07
PACSIN3-210ENST00000533686 OR4K5Q8NGD3 323 aa14.62□□□□□ -0.07
PACSIN3-210ENST00000533686 OR4C15Q8NGM1 316 aa14.62□□□□□ -0.07
PACSIN3-210ENST00000533686 TMEM45BQ96B21 275 aa14.62□□□□□ -0.07
PACSIN3-210ENST00000533686 UCK2Q9BZX2 261 aa14.62□□□□□ -0.07
PACSIN3-210ENST00000533686 ARMC1Q9NVT9 282 aa14.62□□□□□ -0.07
PACSIN3-210ENST00000533686 B3GAT1Q9P2W7 334 aa14.62□□□□□ -0.07
PACSIN3-210ENST00000533686 PROCRQ9UNN8 238 aa14.62□□□□□ -0.07
PACSIN3-210ENST00000533686 KLF2Q9Y5W3 355 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
PACSIN3-210ENST00000533686 GCN1Q92616 2671 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
PACSIN3-210ENST00000533686 FAM90A27PA6NNH2 459 aa14.61□□□□□ -0.07
PACSIN3-210ENST00000533686 A8MXE2 369 aa14.61□□□□□ -0.07
PACSIN3-210ENST00000533686 OR6A2O95222 327 aa14.61□□□□□ -0.07
PACSIN3-210ENST00000533686 ZNF43P17038 809 aa14.61□□□□□ -0.07
PACSIN3-210ENST00000533686 MAKP20794 623 aa14.61□□□□□ -0.07
PACSIN3-210ENST00000533686 IFNGR2P38484 337 aa14.61□□□□□ -0.07
PACSIN3-210ENST00000533686 OMPP47874 163 aa14.61□□□□□ -0.07
PACSIN3-210ENST00000533686 SLC9A3P48764 834 aa14.61□□□□□ -0.07
PACSIN3-210ENST00000533686 ERFP50548 548 aa14.61□□□□□ -0.07
PACSIN3-210ENST00000533686 ASCL1P50553 236 aa14.61□□□□□ -0.07
PACSIN3-210ENST00000533686 PUDPQ08623 228 aa14.61□□□□□ -0.07
PACSIN3-210ENST00000533686 CREB3L2Q70SY1 520 aa14.61□□□□□ -0.07
PACSIN3-210ENST00000533686 NUFIP2Q7Z417 695 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
PACSIN3-210ENST00000533686 NANOGNBQ7Z5D8 188 aa14.61□□□□□ -0.07
PACSIN3-210ENST00000533686 PXKQ7Z7A4 578 aa14.61□□□□□ -0.07
PACSIN3-210ENST00000533686 EPHX4Q8IUS5 362 aa14.61□□□□□ -0.07
PACSIN3-210ENST00000533686 C10orf67Q8IYJ2 551 aa14.61□□□□□ -0.07
PACSIN3-210ENST00000533686 KDM8Q8N371 416 aa14.61□□□□□ -0.07
PACSIN3-210ENST00000533686 ZIC4Q8N9L1 334 aa14.61□□□□□ -0.07
PACSIN3-210ENST00000533686 REEP1Q9H902 201 aa14.61□□□□□ -0.07
PACSIN3-210ENST00000533686 PARPBPQ9NWS1 579 aa14.61□□□□□ -0.07
PACSIN3-210ENST00000533686 TAS2R5Q9NYW4 299 aa14.61□□□□□ -0.07
PACSIN3-210ENST00000533686 NOSIPQ9Y314 301 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
PACSIN3-210ENST00000533686 NOX1Q9Y5S8 564 aa14.61□□□□□ -0.07
PACSIN3-210ENST00000533686 LRRK2Q5S007 2527 aa14.61□□□□□ -0.07
PACSIN3-210ENST00000533686 EFCAB9A8MZ26 197 aa14.6□□□□□ -0.07
PACSIN3-210ENST00000533686 ADORA3P0DMS8 318 aa14.6□□□□□ -0.07
PACSIN3-210ENST00000533686 OR3A2P47893 321 aa14.6□□□□□ -0.07
PACSIN3-210ENST00000533686 PCYT1AP49585 367 aa14.6□□□□□ -0.07
PACSIN3-210ENST00000533686 KPNB1Q14974 876 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
PACSIN3-210ENST00000533686 EXOC3L2Q2M3D2 409 aa14.6□□□□□ -0.07
PACSIN3-210ENST00000533686 NHLRC1Q6VVB1 395 aa14.6□□□□□ -0.07
PACSIN3-210ENST00000533686 UEVLDQ8IX04 471 aa14.6□□□□□ -0.07
PACSIN3-210ENST00000533686 ZNF775Q96BV0 537 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
PACSIN3-210ENST00000533686 LRRC46Q96FV0 321 aa14.6□□□□□ -0.07
PACSIN3-210ENST00000533686 DNAJB9Q9UBS3 223 aa14.6□□□□□ -0.07
PACSIN3-210ENST00000533686 FOXD3Q9UJU5 478 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
PACSIN3-210ENST00000533686 HIF3AQ9Y2N7 669 aa14.6□□□□□ -0.07
PACSIN3-210ENST00000533686 SAMHD1Q9Y3Z3 626 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
PACSIN3-210ENST00000533686 AP4S1Q9Y587 144 aa14.6□□□□□ -0.07
PACSIN3-210ENST00000533686 INTS1Q8N201 2190 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
PACSIN3-210ENST00000533686 EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 151 aa14.59□□□□□ -0.07
PACSIN3-210ENST00000533686 BLOC1S5-TXNDC5H3BN57 136 aa14.59□□□□□ -0.07
PACSIN3-210ENST00000533686 GNGT2O14610 69 aa14.59□□□□□ -0.07
PACSIN3-210ENST00000533686 EEF1E1O43324 174 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
PACSIN3-210ENST00000533686 HNRNPRO43390 633 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
PACSIN3-210ENST00000533686 KLF4O43474 513 aa14.59□□□□□ -0.07
PACSIN3-210ENST00000533686 OR10H3O60404 316 aa14.59□□□□□ -0.07
PACSIN3-210ENST00000533686 MRPL33O75394 65 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
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