RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000529895.1

BBS1-216, Transcript of Bardet-Biedl syndrome 1, human

TSL 2

Gene BBS1, Length 560 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
BBS1-216	ENST00000529895	GIPC3	Q8TF64	312 aa		13.59	□□□□□ -0.23
BBS1-216	ENST00000529895	RND1	Q92730	232 aa		13.59	□□□□□ -0.23
BBS1-216	ENST00000529895	STMN2	Q93045	179 aa		13.59	□□□□□ -0.23
BBS1-216	ENST00000529895	CCDC120	Q96HB5	630 aa		13.59	□□□□□ -0.23
BBS1-216	ENST00000529895	TNFRSF13C	Q96RJ3	184 aa		13.59	□□□□□ -0.23
BBS1-216	ENST00000529895	PSD2	Q9BQI7	771 aa		13.59	□□□□□ -0.23
BBS1-216	ENST00000529895	BDH2	Q9BUT1	245 aa		13.59	□□□□□ -0.23
BBS1-216	ENST00000529895	PDP1	Q9P0J1	537 aa	Predicted RBP	13.59	□□□□□ -0.23
BBS1-216	ENST00000529895	RASD1	Q9Y272	281 aa		13.59	□□□□□ -0.23
BBS1-216	ENST00000529895	SLC5A6	Q9Y289	635 aa		13.59	□□□□□ -0.23
BBS1-216	ENST00000529895	BLOC1S5-TXNDC5	H3BN57	136 aa		13.58	□□□□□ -0.24
BBS1-216	ENST00000529895	SS18L1	O75177	396 aa	Predicted RBP	13.58	□□□□□ -0.24
BBS1-216	ENST00000529895	PTP4A3	O75365	173 aa		13.58	□□□□□ -0.24
BBS1-216	ENST00000529895	OR6A2	O95222	327 aa		13.58	□□□□□ -0.24
BBS1-216	ENST00000529895	PLG	P00747	810 aa	Predicted RBP	13.58	□□□□□ -0.24
BBS1-216	ENST00000529895	ADORA3	P0DMS8	318 aa		13.58	□□□□□ -0.24
BBS1-216	ENST00000529895	POU2F1	P14859	743 aa		13.58	□□□□□ -0.24
BBS1-216	ENST00000529895	AQP2	P41181	271 aa		13.58	□□□□□ -0.24
BBS1-216	ENST00000529895	KIR2DL2	P43627	348 aa	Predicted RBP	13.58	□□□□□ -0.24
BBS1-216	ENST00000529895	GSS	P48637	474 aa		13.58	□□□□□ -0.24
BBS1-216	ENST00000529895	ZP4	Q12836	540 aa		13.58	□□□□□ -0.24
BBS1-216	ENST00000529895	FHL1	Q13642	323 aa		13.58	□□□□□ -0.24
BBS1-216	ENST00000529895	PDK3	Q15120	406 aa		13.58	□□□□□ -0.24
BBS1-216	ENST00000529895	ANKRD34A	Q69YU3	496 aa		13.58	□□□□□ -0.24
BBS1-216	ENST00000529895	SHQ1	Q6PI26	577 aa	Known RBP	13.58	□□□□□ -0.24
BBS1-216	ENST00000529895	NANOGNB	Q7Z5D8	188 aa		13.58	□□□□□ -0.24
BBS1-216	ENST00000529895	OAF	Q86UD1	273 aa		13.58	□□□□□ -0.24
BBS1-216	ENST00000529895	GPAT4	Q86UL3	456 aa		13.58	□□□□□ -0.24
BBS1-216	ENST00000529895	TUSC5	Q8IXB3	177 aa		13.58	□□□□□ -0.24
BBS1-216	ENST00000529895	AQP11	Q8NBQ7	271 aa		13.58	□□□□□ -0.24
BBS1-216	ENST00000529895	OR51A7	Q8NH64	312 aa		13.58	□□□□□ -0.24
BBS1-216	ENST00000529895	OR5K1	Q8NHB7	308 aa		13.58	□□□□□ -0.24
BBS1-216	ENST00000529895	MOSPD2	Q8NHP6	518 aa		13.58	□□□□□ -0.24
BBS1-216	ENST00000529895	CENPN	Q96H22	339 aa	Predicted RBP	13.58	□□□□□ -0.24
BBS1-216	ENST00000529895	GMPPA	Q96IJ6	420 aa	Predicted RBP	13.58	□□□□□ -0.24
BBS1-216	ENST00000529895	OXGR1	Q96P68	337 aa		13.58	□□□□□ -0.24
BBS1-216	ENST00000529895	KRCC1	Q9NPI7	259 aa	Predicted RBP	13.58	□□□□□ -0.24
BBS1-216	ENST00000529895	GLRX2	Q9NS18	164 aa		13.58	□□□□□ -0.24
BBS1-216	ENST00000529895	KLHL9	Q9P2J3	617 aa		13.58	□□□□□ -0.24
BBS1-216	ENST00000529895	B3GAT1	Q9P2W7	334 aa		13.58	□□□□□ -0.24
BBS1-216	ENST00000529895	ERRFI1	Q9UJM3	462 aa	Predicted RBP	13.58	□□□□□ -0.24
BBS1-216	ENST00000529895	ARHGAP21	Q5T5U3	1957 aa		13.58	□□□□□ -0.24
BBS1-216	ENST00000529895	IGKV3D-15	A0A087WSY6	115 aa		13.57	□□□□□ -0.24
BBS1-216	ENST00000529895	TRAV27	A0A087WT01	109 aa		13.57	□□□□□ -0.24
BBS1-216	ENST00000529895		A0A1W2PNV4	684 aa		13.57	□□□□□ -0.24
BBS1-216	ENST00000529895	UNC119B	A6NIH7	251 aa		13.57	□□□□□ -0.24
BBS1-216	ENST00000529895	HSPB2	A8KAH6	182 aa		13.57	□□□□□ -0.24
BBS1-216	ENST00000529895	C11orf98	E9PRG8	122 aa		13.57	□□□□□ -0.24
BBS1-216	ENST00000529895	VAMP5	O95183	116 aa		13.57	□□□□□ -0.24
BBS1-216	ENST00000529895	BAG2	O95816	211 aa		13.57	□□□□□ -0.24
BBS1-216	ENST00000529895	YES1	P07947	543 aa		13.57	□□□□□ -0.24
BBS1-216	ENST00000529895	TSPAN19	P0C672	248 aa		13.57	□□□□□ -0.24
BBS1-216	ENST00000529895	HLA-DOB	P13765	273 aa		13.57	□□□□□ -0.24
BBS1-216	ENST00000529895	AHCY	P23526	432 aa		13.57	□□□□□ -0.24
BBS1-216	ENST00000529895	CTSS	P25774	331 aa		13.57	□□□□□ -0.24
BBS1-216	ENST00000529895	NTF4	P34130	210 aa		13.57	□□□□□ -0.24
BBS1-216	ENST00000529895	SLC9A3	P48764	834 aa		13.57	□□□□□ -0.24
BBS1-216	ENST00000529895	SLC16A1	P53985	500 aa		13.57	□□□□□ -0.24
BBS1-216	ENST00000529895	SIRPA	P78324	504 aa		13.57	□□□□□ -0.24
BBS1-216	ENST00000529895	IL1RL1	Q01638	556 aa		13.57	□□□□□ -0.24
BBS1-216	ENST00000529895	PUDP	Q08623	228 aa		13.57	□□□□□ -0.24
BBS1-216	ENST00000529895	TSPAN31	Q12999	210 aa		13.57	□□□□□ -0.24
BBS1-216	ENST00000529895	GUSBP1	Q15486	140 aa		13.57	□□□□□ -0.24
BBS1-216	ENST00000529895	HSPB2	Q16082	182 aa		13.57	□□□□□ -0.24
BBS1-216	ENST00000529895	ZBED5	Q49AG3	693 aa		13.57	□□□□□ -0.24
BBS1-216	ENST00000529895	NHLRC1	Q6VVB1	395 aa		13.57	□□□□□ -0.24
BBS1-216	ENST00000529895	CREB3L2	Q70SY1	520 aa		13.57	□□□□□ -0.24
BBS1-216	ENST00000529895	NUFIP2	Q7Z417	695 aa	Known RBP	13.57	□□□□□ -0.24
BBS1-216	ENST00000529895	EPHX4	Q8IUS5	362 aa		13.57	□□□□□ -0.24
BBS1-216	ENST00000529895	LIX1L	Q8IVB5	337 aa		13.57	□□□□□ -0.24
BBS1-216	ENST00000529895	CNEP1R1	Q8N9A8	125 aa		13.57	□□□□□ -0.24
BBS1-216	ENST00000529895	ZIC4	Q8N9L1	334 aa		13.57	□□□□□ -0.24
BBS1-216	ENST00000529895	OR9K2	Q8NGE7	335 aa		13.57	□□□□□ -0.24
BBS1-216	ENST00000529895	GTPBP3	Q969Y2	492 aa	Known RBP	13.57	□□□□□ -0.24
BBS1-216	ENST00000529895	NRBF2	Q96F24	287 aa		13.57	□□□□□ -0.24
BBS1-216	ENST00000529895	ZFP3	Q96NJ6	502 aa		13.57	□□□□□ -0.24
BBS1-216	ENST00000529895	FEV	Q99581	238 aa		13.57	□□□□□ -0.24
BBS1-216	ENST00000529895	SF3B5	Q9BWJ5	86 aa	Known RBP	13.57	□□□□□ -0.24
BBS1-216	ENST00000529895	BCO1	Q9HAY6	547 aa		13.57	□□□□□ -0.24
BBS1-216	ENST00000529895	MGAT4B	Q9UQ53	548 aa		13.57	□□□□□ -0.24
BBS1-216	ENST00000529895	RNF6	Q9Y252	685 aa		13.57	□□□□□ -0.24
BBS1-216	ENST00000529895	HIF3A	Q9Y2N7	669 aa		13.57	□□□□□ -0.24
BBS1-216	ENST00000529895	PHF3	Q92576	2039 aa	Known RBP	13.57	□□□□□ -0.24
BBS1-216	ENST00000529895	UBR5	O95071	2799 aa	Predicted RBP	13.57	□□□□□ -0.24
BBS1-216	ENST00000529895	LOC102725191	A0A1B0GVB3	256 aa		13.56	□□□□□ -0.24
BBS1-216	ENST00000529895	ZNF724	A8MTY0	619 aa		13.56	□□□□□ -0.24
BBS1-216	ENST00000529895		G3V2T6	193 aa		13.56	□□□□□ -0.24
BBS1-216	ENST00000529895	TNFSF13	O75888	250 aa		13.56	□□□□□ -0.24
BBS1-216	ENST00000529895	CRH	P06850	196 aa		13.56	□□□□□ -0.24
BBS1-216	ENST00000529895	ZNF26	P17031	533 aa	Predicted RBP	13.56	□□□□□ -0.24
BBS1-216	ENST00000529895	FPR3	P25089	353 aa		13.56	□□□□□ -0.24
BBS1-216	ENST00000529895	AGTR1	P30556	359 aa		13.56	□□□□□ -0.24
BBS1-216	ENST00000529895	UQCRC1	P31930	480 aa		13.56	□□□□□ -0.24
BBS1-216	ENST00000529895	ARHGDIA	P52565	204 aa		13.56	□□□□□ -0.24
BBS1-216	ENST00000529895	RPL18	Q07020	188 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
BBS1-216	ENST00000529895	SRSF1	Q07955	248 aa	Known RBP eCLIP	13.56	□□□□□ -0.24
BBS1-216	ENST00000529895	POU4F3	Q15319	338 aa		13.56	□□□□□ -0.24
BBS1-216	ENST00000529895	TMEM201	Q5SNT2	666 aa		13.56	□□□□□ -0.24
BBS1-216	ENST00000529895	MTFR2	Q6P444	385 aa		13.56	□□□□□ -0.24
BBS1-216	ENST00000529895	MYO7B	Q6PIF6	2116 aa		13.56	□□□□□ -0.24

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.7 ms