RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511747.5

SH3BP2-221, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BP2, Length 2,351 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-221ENST00000511747 KRT33AO76009 404 aa24.74■■□□□ 1.55
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SH3BP2-221ENST00000511747 METTL11BQ5VVY1 283 aa24.72■■□□□ 1.55
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SH3BP2-221ENST00000511747 I3L1I5 382 aaPredicted RBP24.71■■□□□ 1.55
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SH3BP2-221ENST00000511747 UBE2IP63279 158 aaKnown RBP24.7■■□□□ 1.54
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SH3BP2-221ENST00000511747 FAAP20Q6NZ36 180 aa24.7■■□□□ 1.54
SH3BP2-221ENST00000511747 FAM71CQ8NEG0 241 aa24.7■■□□□ 1.54
SH3BP2-221ENST00000511747 RAB40AQ8WXH6 277 aa24.7■■□□□ 1.54
SH3BP2-221ENST00000511747 TMEM106CQ9BVX2 250 aa24.7■■□□□ 1.54
SH3BP2-221ENST00000511747 IGKV1D-42A0A075B6H8 117 aa24.69■■□□□ 1.54
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