RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000507277.1

UBE2B-206, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 B, humanhuman

TSL 5

Gene UBE2B, Length 644 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2B-206ENST00000507277 CLEC6AQ6EIG7 209 aa7.3□□□□□ -1.24
UBE2B-206ENST00000507277 GTF2H2CQ6P1K8 395 aa7.3□□□□□ -1.24
UBE2B-206ENST00000507277 FRRS1Q6ZNA5 592 aa7.3□□□□□ -1.24
UBE2B-206ENST00000507277 LINGO2Q7L985 606 aa7.3□□□□□ -1.24
UBE2B-206ENST00000507277 C1orf52Q8N6N3 182 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
UBE2B-206ENST00000507277 ZIC4Q8N9L1 334 aa7.3□□□□□ -1.24
UBE2B-206ENST00000507277 OR5W2Q8NH69 310 aa7.3□□□□□ -1.24
UBE2B-206ENST00000507277 SLC25A43Q8WUT9 341 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
UBE2B-206ENST00000507277 ATP6V1E2Q96A05 226 aa7.3□□□□□ -1.24
UBE2B-206ENST00000507277 ELP4Q96EB1 424 aa7.3□□□□□ -1.24
UBE2B-206ENST00000507277 NEURL3Q96EH8 262 aa7.3□□□□□ -1.24
UBE2B-206ENST00000507277 ELMOD3Q96FG2 381 aa7.3□□□□□ -1.24
UBE2B-206ENST00000507277 TSPAN32Q96QS1 320 aa7.3□□□□□ -1.24
UBE2B-206ENST00000507277 DCLRE1CQ96SD1 692 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
UBE2B-206ENST00000507277 KRTAP4-8Q9BYQ9 185 aa7.3□□□□□ -1.24
UBE2B-206ENST00000507277 RNF14Q9UBS8 474 aa7.3□□□□□ -1.24
UBE2B-206ENST00000507277 FBLN5Q9UBX5 448 aa7.3□□□□□ -1.24
UBE2B-206ENST00000507277 NIPSNAP3AQ9UFN0 247 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
UBE2B-206ENST00000507277 GRID1Q9ULK0 1009 aa7.3□□□□□ -1.24
UBE2B-206ENST00000507277 SIGLEC9Q9Y336 463 aa7.3□□□□□ -1.24
UBE2B-206ENST00000507277 KIAA1109Q2LD37 5005 aa7.3□□□□□ -1.24
UBE2B-206ENST00000507277 DSPPQ9NZW4 1301 aa7.29□□□□□ -1.24
UBE2B-206ENST00000507277 FRAS1Q86XX4 4008 aa7.29□□□□□ -1.24
UBE2B-206ENST00000507277 H3BNH8 94 aa7.29□□□□□ -1.24
UBE2B-206ENST00000507277 RSL1D1O76021 490 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
UBE2B-206ENST00000507277 ZFPL1O95159 310 aa7.29□□□□□ -1.24
UBE2B-206ENST00000507277 TGDSO95455 350 aa7.29□□□□□ -1.24
UBE2B-206ENST00000507277 TPM3P06753 285 aa7.29□□□□□ -1.24
UBE2B-206ENST00000507277 PRPS2P11908 318 aa7.29□□□□□ -1.24
UBE2B-206ENST00000507277 LMO1P25800 156 aa7.29□□□□□ -1.24
UBE2B-206ENST00000507277 GABRA5P31644 462 aa7.29□□□□□ -1.24
UBE2B-206ENST00000507277 RPL4P36578 427 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
UBE2B-206ENST00000507277 MAP3K8P41279 467 aa7.29□□□□□ -1.24
UBE2B-206ENST00000507277 SESN3P58005 492 aa7.29□□□□□ -1.24
UBE2B-206ENST00000507277 SELENOVP59797 346 aa7.29□□□□□ -1.24
UBE2B-206ENST00000507277 ARF1P84077 181 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
UBE2B-206ENST00000507277 PAX2Q02962 417 aa7.29□□□□□ -1.24
UBE2B-206ENST00000507277 IFT88Q13099 833 aa7.29□□□□□ -1.24
UBE2B-206ENST00000507277 CBFBQ13951 182 aa7.29□□□□□ -1.24
UBE2B-206ENST00000507277 HEPACAMQ14CZ8 416 aa7.29□□□□□ -1.24
UBE2B-206ENST00000507277 PRSS53Q2L4Q9 553 aa7.29□□□□□ -1.24
UBE2B-206ENST00000507277 TTMPQ5BVD1 217 aa7.29□□□□□ -1.24
UBE2B-206ENST00000507277 CBLL1Q75N03 491 aa7.29□□□□□ -1.24
UBE2B-206ENST00000507277 GOLGA7Q7Z5G4 137 aa7.29□□□□□ -1.24
UBE2B-206ENST00000507277 IGDCC3Q8IVU1 814 aa7.29□□□□□ -1.24
UBE2B-206ENST00000507277 SPICQ8N5J4 248 aa7.29□□□□□ -1.24
UBE2B-206ENST00000507277 Q8NFD4 153 aa7.29□□□□□ -1.24
UBE2B-206ENST00000507277 RAB40AQ8WXH6 277 aa7.29□□□□□ -1.24
UBE2B-206ENST00000507277 NAA11Q9BSU3 229 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
UBE2B-206ENST00000507277 THUMPD3Q9BV44 507 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
UBE2B-206ENST00000507277 TRIM5Q9C035 493 aa7.29□□□□□ -1.24
UBE2B-206ENST00000507277 GLIPR2Q9H4G4 154 aa7.29□□□□□ -1.24
UBE2B-206ENST00000507277 FARSBQ9NSD9 589 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
UBE2B-206ENST00000507277 GIN1Q9NXP7 522 aa7.29□□□□□ -1.24
UBE2B-206ENST00000507277 ADAM30Q9UKF2 790 aa7.29□□□□□ -1.24
UBE2B-206ENST00000507277 HDGFL3Q9Y3E1 203 aa7.29□□□□□ -1.24
UBE2B-206ENST00000507277 NPTNQ9Y639 398 aa7.29□□□□□ -1.24
UBE2B-206ENST00000507277 USH1CQ9Y6N9 552 aa7.29□□□□□ -1.24
UBE2B-206ENST00000507277 EIF1BO60739 113 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
UBE2B-206ENST00000507277 UPK3AO75631 287 aa7.28□□□□□ -1.24
UBE2B-206ENST00000507277 UBOX5O94941 541 aa7.28□□□□□ -1.24
UBE2B-206ENST00000507277 IGHV2-70P01814 119 aa7.28□□□□□ -1.24
UBE2B-206ENST00000507277 UROSP10746 265 aa7.28□□□□□ -1.24
UBE2B-206ENST00000507277 ACP2P11117 423 aa7.28□□□□□ -1.24
UBE2B-206ENST00000507277 IVDP26440 423 aa7.28□□□□□ -1.24
UBE2B-206ENST00000507277 HOXD3P31249 432 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
UBE2B-206ENST00000507277 TGFBR2P37173 567 aa7.28□□□□□ -1.24
UBE2B-206ENST00000507277 ETV4P43268 484 aa7.28□□□□□ -1.24
UBE2B-206ENST00000507277 SELENOPP49908 381 aa7.28□□□□□ -1.24
UBE2B-206ENST00000507277 PRKAG1P54619 331 aa7.28□□□□□ -1.24
UBE2B-206ENST00000507277 GNB2P62879 340 aa7.28□□□□□ -1.24
UBE2B-206ENST00000507277 ROR2Q01974 943 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
UBE2B-206ENST00000507277 HNRNPA0Q13151 305 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
UBE2B-206ENST00000507277 KLHL26Q53HC5 615 aa7.28□□□□□ -1.24
UBE2B-206ENST00000507277 RGS7BPQ6MZT1 257 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
UBE2B-206ENST00000507277 C6orf89Q6UWU4 347 aa7.28□□□□□ -1.24
UBE2B-206ENST00000507277 ISCA2Q86U28 154 aa7.28□□□□□ -1.24
UBE2B-206ENST00000507277 CMIPQ8IY22 773 aa7.28□□□□□ -1.24
UBE2B-206ENST00000507277 KLHDC1Q8N7A1 406 aa7.28□□□□□ -1.24
UBE2B-206ENST00000507277 NAT8LQ8N9F0 302 aa7.28□□□□□ -1.24
UBE2B-206ENST00000507277 CDRT4Q8N9R6 151 aa7.28□□□□□ -1.24
UBE2B-206ENST00000507277 KIF18AQ8NI77 898 aa7.28□□□□□ -1.24
UBE2B-206ENST00000507277 MGARPQ8TDB4 240 aa7.28□□□□□ -1.24
UBE2B-206ENST00000507277 LRTOMTQ8WZ04 291 aa7.28□□□□□ -1.24
UBE2B-206ENST00000507277 HOXB13Q92826 284 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
UBE2B-206ENST00000507277 ZG16BQ96DA0 208 aa7.28□□□□□ -1.24
UBE2B-206ENST00000507277 OTUB1Q96FW1 271 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
UBE2B-206ENST00000507277 CFAP36Q96G28 342 aa7.28□□□□□ -1.24
UBE2B-206ENST00000507277 UBXN10Q96LJ8 280 aa7.28□□□□□ -1.24
UBE2B-206ENST00000507277 ATOH8Q96SQ7 321 aa7.28□□□□□ -1.24
UBE2B-206ENST00000507277 ASCL2Q99929 193 aa7.28□□□□□ -1.24
UBE2B-206ENST00000507277 NAT9Q9BTE0 207 aa7.28□□□□□ -1.24
UBE2B-206ENST00000507277 OR11A1Q9GZK7 315 aa7.28□□□□□ -1.24
UBE2B-206ENST00000507277 DPAGT1Q9H3H5 408 aa7.28□□□□□ -1.24
UBE2B-206ENST00000507277 ELOVL6Q9H5J4 265 aa7.28□□□□□ -1.24
UBE2B-206ENST00000507277 NOL11Q9H8H0 719 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
UBE2B-206ENST00000507277 GRHL1Q9NZI5 618 aa7.28□□□□□ -1.24
UBE2B-206ENST00000507277 TMEM181Q9P2C4 612 aa7.28□□□□□ -1.24
UBE2B-206ENST00000507277 TRAPPC4Q9Y296 219 aa7.28□□□□□ -1.24
UBE2B-206ENST00000507277 MTO1Q9Y2Z2 717 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.5 ms