RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000475726.5

MYH9-208, Transcript of myosin heavy chain 9, human

TSL 3

Gene MYH9, Length 768 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MYH9-208	ENST00000475726	CLNS1A	P54105	237 aa	Known RBP	13.42	□□□□□ -0.26
MYH9-208	ENST00000475726	HILS1	P60008	231 aa		13.42	□□□□□ -0.26
MYH9-208	ENST00000475726	ROR2	Q01974	943 aa	Known RBP	13.42	□□□□□ -0.26
MYH9-208	ENST00000475726	BNIP2	Q12982	314 aa		13.42	□□□□□ -0.26
MYH9-208	ENST00000475726	SNTB2	Q13425	540 aa	Known RBP	13.42	□□□□□ -0.26
MYH9-208	ENST00000475726	MSMP	Q1L6U9	139 aa		13.42	□□□□□ -0.26
MYH9-208	ENST00000475726	DPY19L1	Q2PZI1	675 aa		13.42	□□□□□ -0.26
MYH9-208	ENST00000475726	ELFN2	Q5R3F8	820 aa		13.42	□□□□□ -0.26
MYH9-208	ENST00000475726	MRPL2	Q5T653	305 aa	Known RBP	13.42	□□□□□ -0.26
MYH9-208	ENST00000475726	ANXA8L1	Q5VT79	327 aa		13.42	□□□□□ -0.26
MYH9-208	ENST00000475726	LRRC34	Q8IZ02	419 aa		13.42	□□□□□ -0.26
MYH9-208	ENST00000475726	ZNF418	Q8TF45	676 aa	Predicted RBP	13.42	□□□□□ -0.26
MYH9-208	ENST00000475726	FAM216A	Q8WUB2	273 aa		13.42	□□□□□ -0.26
MYH9-208	ENST00000475726	GCDH	Q92947	438 aa	Predicted RBP	13.42	□□□□□ -0.26
MYH9-208	ENST00000475726	LINC00470	Q9BZP3	86 aa		13.42	□□□□□ -0.26
MYH9-208	ENST00000475726	NARFL	Q9H6Q4	476 aa		13.42	□□□□□ -0.26
MYH9-208	ENST00000475726	MOV10	Q9HCE1	1003 aa	Known RBP	13.42	□□□□□ -0.26
MYH9-208	ENST00000475726	HIF1AN	Q9NWT6	349 aa		13.42	□□□□□ -0.26
MYH9-208	ENST00000475726	MARCO	Q9UEW3	520 aa	Predicted RBP	13.42	□□□□□ -0.26
MYH9-208	ENST00000475726	WNT9B	O14905	357 aa		13.41	□□□□□ -0.26
MYH9-208	ENST00000475726	ERLIN1	O75477	346 aa		13.41	□□□□□ -0.26
MYH9-208	ENST00000475726	MSMB	P08118	114 aa		13.41	□□□□□ -0.26
MYH9-208	ENST00000475726	HOXB1	P14653	301 aa	Predicted RBP	13.41	□□□□□ -0.26
MYH9-208	ENST00000475726	LBP	P18428	481 aa		13.41	□□□□□ -0.26
MYH9-208	ENST00000475726	CXCR1	P25024	350 aa		13.41	□□□□□ -0.26
MYH9-208	ENST00000475726	SH3BGR	P55822	239 aa	Predicted RBP	13.41	□□□□□ -0.26
MYH9-208	ENST00000475726	ARF1	P84077	181 aa	Known RBP	13.41	□□□□□ -0.26
MYH9-208	ENST00000475726	POU3F1	Q03052	451 aa	Predicted RBP	13.41	□□□□□ -0.26
MYH9-208	ENST00000475726	NPRL3	Q12980	569 aa		13.41	□□□□□ -0.26
MYH9-208	ENST00000475726	PRAMEF8	Q5VWM4	474 aa		13.41	□□□□□ -0.26
MYH9-208	ENST00000475726	PRAMEF7	Q5VXH5	474 aa		13.41	□□□□□ -0.26
MYH9-208	ENST00000475726	KRT80	Q6KB66	452 aa		13.41	□□□□□ -0.26
MYH9-208	ENST00000475726	SHQ1	Q6PI26	577 aa	Known RBP	13.41	□□□□□ -0.26
MYH9-208	ENST00000475726	THSD4	Q6ZMP0	1018 aa		13.41	□□□□□ -0.26
MYH9-208	ENST00000475726	PEG10	Q86TG7	708 aa	Known RBP	13.41	□□□□□ -0.26
MYH9-208	ENST00000475726	ANKRD42	Q8N9B4	389 aa		13.41	□□□□□ -0.26
MYH9-208	ENST00000475726	SLC35A5	Q9BS91	424 aa		13.41	□□□□□ -0.26
MYH9-208	ENST00000475726	TAPBPL	Q9BX59	468 aa		13.41	□□□□□ -0.26
MYH9-208	ENST00000475726	NUF2	Q9BZD4	464 aa		13.41	□□□□□ -0.26
MYH9-208	ENST00000475726	RACGAP1	Q9H0H5	632 aa		13.41	□□□□□ -0.26
MYH9-208	ENST00000475726	NOX3	Q9HBY0	568 aa		13.41	□□□□□ -0.26
MYH9-208	ENST00000475726	PRSS51	A0A1B0GVH4	220 aa		13.4	□□□□□ -0.26
MYH9-208	ENST00000475726	VSTM5	A8MXK1	200 aa		13.4	□□□□□ -0.26
MYH9-208	ENST00000475726	TMEM229A	B2RXF0	380 aa		13.4	□□□□□ -0.26
MYH9-208	ENST00000475726	VAMP5	O95183	116 aa		13.4	□□□□□ -0.26
MYH9-208	ENST00000475726	GKN3P	P0CG01	181 aa		13.4	□□□□□ -0.26
MYH9-208	ENST00000475726	UQCRB	P14927	111 aa		13.4	□□□□□ -0.26
MYH9-208	ENST00000475726	CHI3L1	P36222	383 aa	Predicted RBP	13.4	□□□□□ -0.26
MYH9-208	ENST00000475726	GPR6	P46095	362 aa	Predicted RBP	13.4	□□□□□ -0.26
MYH9-208	ENST00000475726	ARFIP2	P53365	341 aa		13.4	□□□□□ -0.26
MYH9-208	ENST00000475726	DAG1	Q14118	895 aa		13.4	□□□□□ -0.26
MYH9-208	ENST00000475726	CASP8	Q14790	479 aa		13.4	□□□□□ -0.26
MYH9-208	ENST00000475726	GSTA3	Q16772	222 aa		13.4	□□□□□ -0.26
MYH9-208	ENST00000475726	MDP1	Q86V88	176 aa		13.4	□□□□□ -0.26
MYH9-208	ENST00000475726	RNF130	Q86XS8	419 aa		13.4	□□□□□ -0.26
MYH9-208	ENST00000475726	TESC	Q96BS2	214 aa		13.4	□□□□□ -0.26
MYH9-208	ENST00000475726	TRNT1	Q96Q11	434 aa	Known RBP	13.4	□□□□□ -0.26
MYH9-208	ENST00000475726	LRRC37B	Q96QE4	947 aa		13.4	□□□□□ -0.26
MYH9-208	ENST00000475726	SORT1	Q99523	831 aa		13.4	□□□□□ -0.26
MYH9-208	ENST00000475726	MRPL37	Q9BZE1	423 aa	Known RBP	13.4	□□□□□ -0.26
MYH9-208	ENST00000475726	RLIM	Q9NVW2	624 aa		13.4	□□□□□ -0.26
MYH9-208	ENST00000475726	HAO1	Q9UJM8	370 aa		13.4	□□□□□ -0.26
MYH9-208	ENST00000475726	PCDHB10	Q9UN67	800 aa		13.4	□□□□□ -0.26
MYH9-208	ENST00000475726	GRIP1	Q9Y3R0	1128 aa		13.4	□□□□□ -0.26
MYH9-208	ENST00000475726		A8MVM7	634 aa		13.39	□□□□□ -0.27
MYH9-208	ENST00000475726	RPL36A-HNRNPH2	H7BZ11	118 aa		13.39	□□□□□ -0.27
MYH9-208	ENST00000475726	TRIM77	I1YAP6	450 aa		13.39	□□□□□ -0.27
MYH9-208	ENST00000475726	NPIPB7	O75200	414 aa		13.39	□□□□□ -0.27
MYH9-208	ENST00000475726	ZNF432	O94892	652 aa		13.39	□□□□□ -0.27
MYH9-208	ENST00000475726	HPX	P02790	462 aa		13.39	□□□□□ -0.27
MYH9-208	ENST00000475726	SAG	P10523	405 aa	Predicted RBP	13.39	□□□□□ -0.27
MYH9-208	ENST00000475726	IL7R	P16871	459 aa		13.39	□□□□□ -0.27
MYH9-208	ENST00000475726	ARR3	P36575	388 aa		13.39	□□□□□ -0.27
MYH9-208	ENST00000475726	ACAA2	P42765	397 aa	Known RBP	13.39	□□□□□ -0.27
MYH9-208	ENST00000475726	SCGB2A2	Q13296	93 aa		13.39	□□□□□ -0.27
MYH9-208	ENST00000475726	TNFAIP8L3	Q5GJ75	292 aa		13.39	□□□□□ -0.27
MYH9-208	ENST00000475726	C1orf140	Q5VVS0	124 aa		13.39	□□□□□ -0.27
MYH9-208	ENST00000475726	ATG16L1	Q676U5	607 aa		13.39	□□□□□ -0.27
MYH9-208	ENST00000475726	LRRC74B	Q6ZQY2	392 aa		13.39	□□□□□ -0.27
MYH9-208	ENST00000475726	C1orf229	Q6ZS94	237 aa	Predicted RBP	13.39	□□□□□ -0.27
MYH9-208	ENST00000475726	USP43	Q70EL4	1123 aa		13.39	□□□□□ -0.27
MYH9-208	ENST00000475726	KDM8	Q8N371	416 aa		13.39	□□□□□ -0.27
MYH9-208	ENST00000475726	CADM2	Q8N3J6	435 aa		13.39	□□□□□ -0.27
MYH9-208	ENST00000475726	MRPL24	Q96A35	216 aa	Known RBP	13.39	□□□□□ -0.27
MYH9-208	ENST00000475726	ZNF837	Q96EG3	531 aa	Predicted RBP	13.39	□□□□□ -0.27
MYH9-208	ENST00000475726	RBM4	Q9BWF3	364 aa	Known RBP	13.39	□□□□□ -0.27
MYH9-208	ENST00000475726	C20orf27	Q9GZN8	174 aa		13.39	□□□□□ -0.27
MYH9-208	ENST00000475726	MEAF6	Q9HAF1	191 aa		13.39	□□□□□ -0.27
MYH9-208	ENST00000475726	CRLF2	Q9HC73	371 aa		13.39	□□□□□ -0.27
MYH9-208	ENST00000475726	USP22	Q9UPT9	525 aa		13.39	□□□□□ -0.27
MYH9-208	ENST00000475726	RASD1	Q9Y272	281 aa		13.39	□□□□□ -0.27
MYH9-208	ENST00000475726	PKD1L1	Q8TDX9	2849 aa		13.38	□□□□□ -0.27
MYH9-208	ENST00000475726	CDHR4	A6H8M9	788 aa		13.38	□□□□□ -0.27
MYH9-208	ENST00000475726	TRPC5OS	A6NMA1	111 aa		13.38	□□□□□ -0.27
MYH9-208	ENST00000475726	FTCDNL1	E5RQL4	147 aa		13.38	□□□□□ -0.27
MYH9-208	ENST00000475726		M0R233	179 aa		13.38	□□□□□ -0.27
MYH9-208	ENST00000475726	SYNGR3	O43761	229 aa		13.38	□□□□□ -0.27
MYH9-208	ENST00000475726	SEC14L2	O76054	403 aa		13.38	□□□□□ -0.27
MYH9-208	ENST00000475726	TF	P02787	698 aa		13.38	□□□□□ -0.27
MYH9-208	ENST00000475726	DBI	P07108	87 aa	Known RBP	13.38	□□□□□ -0.27

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