RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462363.6

PTPRC-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PTPRC, Length 926 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-210ENST00000462363 TMEM221A6NGB7 291 aa5.11□□□□□ -1.59
PTPRC-210ENST00000462363 ANKRD61A6NGH8 418 aa5.11□□□□□ -1.59
PTPRC-210ENST00000462363 ELOA3DA6NLF2 546 aaPredicted RBP5.11□□□□□ -1.59
PTPRC-210ENST00000462363 B4E171 279 aa5.11□□□□□ -1.59
PTPRC-210ENST00000462363 M0R296 226 aa5.11□□□□□ -1.59
PTPRC-210ENST00000462363 MEN1O00255 615 aa5.11□□□□□ -1.59
PTPRC-210ENST00000462363 DCTN6O00399 190 aa5.11□□□□□ -1.59
PTPRC-210ENST00000462363 GNB5O14775 395 aa5.11□□□□□ -1.59
PTPRC-210ENST00000462363 RNF13O43567 381 aa5.11□□□□□ -1.59
PTPRC-210ENST00000462363 HCRTR2O43614 444 aa5.11□□□□□ -1.59
PTPRC-210ENST00000462363 NDUFB5O43674 189 aa5.11□□□□□ -1.59
PTPRC-210ENST00000462363 EFNA2O43921 213 aa5.11□□□□□ -1.59
PTPRC-210ENST00000462363 CBFA2T3O75081 653 aa5.11□□□□□ -1.59
PTPRC-210ENST00000462363 GLCEO94923 617 aa5.11□□□□□ -1.59
PTPRC-210ENST00000462363 CDRT1O95170 752 aa5.11□□□□□ -1.59
PTPRC-210ENST00000462363 MT-ATP6P00846 226 aa5.11□□□□□ -1.59
PTPRC-210ENST00000462363 IFNGP01579 166 aa5.11□□□□□ -1.59
PTPRC-210ENST00000462363 HLA-DQB1P01920 261 aa5.11□□□□□ -1.59
PTPRC-210ENST00000462363 MT-ND5P03915 603 aa5.11□□□□□ -1.59
PTPRC-210ENST00000462363 HLA-DPB1P04440 258 aa5.11□□□□□ -1.59
PTPRC-210ENST00000462363 GYPBP06028 91 aa5.11□□□□□ -1.59
PTPRC-210ENST00000462363 GP1BAP07359 652 aa5.11□□□□□ -1.59
PTPRC-210ENST00000462363 FBXO45P0C2W1 286 aa5.11□□□□□ -1.59
PTPRC-210ENST00000462363 OR2T7P0C7T2 308 aa5.11□□□□□ -1.59
PTPRC-210ENST00000462363 SP9P0CG40 484 aa5.11□□□□□ -1.59
PTPRC-210ENST00000462363 PSKH1P11801 424 aa5.11□□□□□ -1.59
PTPRC-210ENST00000462363 PRKCAP17252 672 aa5.11□□□□□ -1.59
PTPRC-210ENST00000462363 SDHAP31040 664 aa5.11□□□□□ -1.59
PTPRC-210ENST00000462363 CCKBRP32239 447 aa5.11□□□□□ -1.59
PTPRC-210ENST00000462363 SDC2P34741 201 aa5.11□□□□□ -1.59
PTPRC-210ENST00000462363 TSPAN7P41732 249 aa5.11□□□□□ -1.59
PTPRC-210ENST00000462363 RORCP51449 518 aa5.11□□□□□ -1.59
PTPRC-210ENST00000462363 EMP2P54851 167 aa5.11□□□□□ -1.59
PTPRC-210ENST00000462363 SUMO3P55854 103 aaPredicted RBP5.11□□□□□ -1.59
PTPRC-210ENST00000462363 COPZ1P61923 177 aa5.11□□□□□ -1.59
PTPRC-210ENST00000462363 ERVK-25P63136 954 aa5.11□□□□□ -1.59
PTPRC-210ENST00000462363 HSF2Q03933 536 aa5.11□□□□□ -1.59
PTPRC-210ENST00000462363 EFR3AQ14156 821 aa5.11□□□□□ -1.59
PTPRC-210ENST00000462363 INSL4Q14641 139 aa5.11□□□□□ -1.59
PTPRC-210ENST00000462363 QPRTQ15274 297 aa5.11□□□□□ -1.59
PTPRC-210ENST00000462363 SGCBQ16585 318 aa5.11□□□□□ -1.59
PTPRC-210ENST00000462363 ZNF239Q16600 458 aaKnown RBP5.11□□□□□ -1.59
PTPRC-210ENST00000462363 ZNF181Q2M3W8 571 aa5.11□□□□□ -1.59
PTPRC-210ENST00000462363 RGS21Q2M5E4 152 aa5.11□□□□□ -1.59
PTPRC-210ENST00000462363 ELOA3BQ3SY89 546 aa5.11□□□□□ -1.59
PTPRC-210ENST00000462363 TRIM61Q5EBN2 209 aa5.11□□□□□ -1.59
PTPRC-210ENST00000462363 EEF1A1P5Q5VTE0 462 aa5.11□□□□□ -1.59
PTPRC-210ENST00000462363 STEAP3Q658P3 488 aa5.11□□□□□ -1.59
PTPRC-210ENST00000462363 GPR139Q6DWJ6 353 aa5.11□□□□□ -1.59
PTPRC-210ENST00000462363 PAPD4Q6PIY7 484 aaKnown RBP5.11□□□□□ -1.59
PTPRC-210ENST00000462363 UNQ9370/PRO34162Q6UXP9 181 aa5.11□□□□□ -1.59
PTPRC-210ENST00000462363 TMPRSS11AQ6ZMR5 421 aa5.11□□□□□ -1.59
PTPRC-210ENST00000462363 C16orf47Q6ZP98 133 aaPredicted RBP5.11□□□□□ -1.59
PTPRC-210ENST00000462363 PLEKHG7Q6ZR37 379 aa5.11□□□□□ -1.59
PTPRC-210ENST00000462363 SHISA6Q6ZSJ9 500 aa5.11□□□□□ -1.59
PTPRC-210ENST00000462363 TRILQ7L0X0 811 aa5.11□□□□□ -1.59
PTPRC-210ENST00000462363 GRINAQ7Z429 371 aa5.11□□□□□ -1.59
PTPRC-210ENST00000462363 CPEB2Q7Z5Q1 589 aaKnown RBP5.11□□□□□ -1.59
PTPRC-210ENST00000462363 PPP1R3BQ86XI6 285 aa5.11□□□□□ -1.59
PTPRC-210ENST00000462363 KLBQ86Z14 1044 aa5.11□□□□□ -1.59
PTPRC-210ENST00000462363 SNX29P2Q8IUI4 249 aa5.11□□□□□ -1.59
PTPRC-210ENST00000462363 LAX1Q8IWV1 398 aa5.11□□□□□ -1.59
PTPRC-210ENST00000462363 GPALPP1Q8IXQ4 340 aa5.11□□□□□ -1.59
PTPRC-210ENST00000462363 PRSS58Q8IYP2 241 aa5.11□□□□□ -1.59
PTPRC-210ENST00000462363 TMCO5AQ8N6Q1 288 aa5.11□□□□□ -1.59
PTPRC-210ENST00000462363 ZFP41Q8N8Y5 198 aa5.11□□□□□ -1.59
PTPRC-210ENST00000462363 SDR9C7Q8NEX9 313 aa5.11□□□□□ -1.59
PTPRC-210ENST00000462363 ELOA3Q8NG57 546 aa5.11□□□□□ -1.59
PTPRC-210ENST00000462363 OR52E2Q8NGJ4 325 aa5.11□□□□□ -1.59
PTPRC-210ENST00000462363 OR2T27Q8NH04 317 aa5.11□□□□□ -1.59
PTPRC-210ENST00000462363 OR5J2Q8NH18 312 aa5.11□□□□□ -1.59
PTPRC-210ENST00000462363 PRR7Q8TB68 274 aa5.11□□□□□ -1.59
PTPRC-210ENST00000462363 STK35Q8TDR2 534 aa5.11□□□□□ -1.59
PTPRC-210ENST00000462363 ST8SIA1Q92185 356 aa5.11□□□□□ -1.59
PTPRC-210ENST00000462363 RGP1Q92546 391 aaPredicted RBP5.11□□□□□ -1.59
PTPRC-210ENST00000462363 PPP1R14BQ96C90 147 aa5.11□□□□□ -1.59
PTPRC-210ENST00000462363 RASD2Q96D21 266 aa5.11□□□□□ -1.59
PTPRC-210ENST00000462363 CLIP3Q96DZ5 547 aa5.11□□□□□ -1.59
PTPRC-210ENST00000462363 MAP6Q96JE9 813 aa5.11□□□□□ -1.59
PTPRC-210ENST00000462363 KCTD7Q96MP8 289 aa5.11□□□□□ -1.59
PTPRC-210ENST00000462363 GFM1Q96RP9 751 aaKnown RBP5.11□□□□□ -1.59
PTPRC-210ENST00000462363 UBL7Q96S82 380 aaPredicted RBP5.11□□□□□ -1.59
PTPRC-210ENST00000462363 NMNAT3Q96T66 252 aa5.11□□□□□ -1.59
PTPRC-210ENST00000462363 ATF6BQ99941 703 aa5.11□□□□□ -1.59
PTPRC-210ENST00000462363 CCDC32Q9BV29 185 aa5.11□□□□□ -1.59
PTPRC-210ENST00000462363 YIPF2Q9BWQ6 316 aa5.11□□□□□ -1.59
PTPRC-210ENST00000462363 SRRQ9GZT4 340 aa5.11□□□□□ -1.59
PTPRC-210ENST00000462363 ZNF700Q9H0M5 742 aa5.11□□□□□ -1.59
PTPRC-210ENST00000462363 PPP1R3EQ9H7J1 279 aa5.11□□□□□ -1.59
PTPRC-210ENST00000462363 SH2D2AQ9NP31 389 aa5.11□□□□□ -1.59
PTPRC-210ENST00000462363 GALNT8Q9NY28 637 aa5.11□□□□□ -1.59
PTPRC-210ENST00000462363 VSX1Q9NZR4 365 aaPredicted RBP5.11□□□□□ -1.59
PTPRC-210ENST00000462363 KLHL13Q9P2N7 655 aa5.11□□□□□ -1.59
PTPRC-210ENST00000462363 NCDNQ9UBB6 729 aa5.11□□□□□ -1.59
PTPRC-210ENST00000462363 KLHDC2Q9Y2U9 406 aa5.11□□□□□ -1.59
PTPRC-210ENST00000462363 DOCK10Q96BY6 2186 aa5.11□□□□□ -1.59
PTPRC-210ENST00000462363 WDFY4Q6ZS81 3184 aa5.1□□□□□ -1.59
PTPRC-210ENST00000462363 TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 330 aa5.1□□□□□ -1.59
PTPRC-210ENST00000462363 TMED7-TICAM2A0A0A6YYA0 188 aa5.1□□□□□ -1.59
PTPRC-210ENST00000462363 IGLV1-36A0A0B4J1U3 117 aa5.1□□□□□ -1.59
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38 ms