RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000459758.5

TTLL3-222, Transcript of tubulin tyrosine ligase like 3, human

TSL 4

Gene TTLL3, Length 555 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TTLL3-222	ENST00000459758	AP3S2	P59780	193 aa		10.49	□□□□□ -0.73
TTLL3-222	ENST00000459758	CSTF1	Q05048	431 aa	Known RBP	10.49	□□□□□ -0.73
TTLL3-222	ENST00000459758	C17orf67	Q0P5P2	114 aa		10.49	□□□□□ -0.73
TTLL3-222	ENST00000459758	FAM69A	Q5T7M9	428 aa		10.49	□□□□□ -0.73
TTLL3-222	ENST00000459758	LYSMD4	Q5XG99	296 aa		10.49	□□□□□ -0.73
TTLL3-222	ENST00000459758	UNQ9370/PRO34162	Q6UXP9	181 aa		10.49	□□□□□ -0.73
TTLL3-222	ENST00000459758	FAM122B	Q7Z309	247 aa		10.49	□□□□□ -0.73
TTLL3-222	ENST00000459758	HDDC2	Q7Z4H3	204 aa		10.49	□□□□□ -0.73
TTLL3-222	ENST00000459758	DEFB119	Q8N690	84 aa		10.49	□□□□□ -0.73
TTLL3-222	ENST00000459758	OR4D9	Q8NGE8	314 aa		10.49	□□□□□ -0.73
TTLL3-222	ENST00000459758	RPS4Y2	Q8TD47	263 aa		10.49	□□□□□ -0.73
TTLL3-222	ENST00000459758	TTC9	Q92623	222 aa		10.49	□□□□□ -0.73
TTLL3-222	ENST00000459758	CLIP3	Q96DZ5	547 aa		10.49	□□□□□ -0.73
TTLL3-222	ENST00000459758	PELI1	Q96FA3	418 aa		10.49	□□□□□ -0.73
TTLL3-222	ENST00000459758	NMNAT3	Q96T66	252 aa		10.49	□□□□□ -0.73
TTLL3-222	ENST00000459758	DDO	Q99489	341 aa		10.49	□□□□□ -0.73
TTLL3-222	ENST00000459758	NUDT9	Q9BW91	350 aa		10.49	□□□□□ -0.73
TTLL3-222	ENST00000459758	FOXQ1	Q9C009	403 aa		10.49	□□□□□ -0.73
TTLL3-222	ENST00000459758	ACTR6	Q9GZN1	396 aa		10.49	□□□□□ -0.73
TTLL3-222	ENST00000459758	RNF32	Q9H0A6	362 aa		10.49	□□□□□ -0.73
TTLL3-222	ENST00000459758	HDHD2	Q9H0R4	259 aa		10.49	□□□□□ -0.73
TTLL3-222	ENST00000459758	WDR76	Q9H967	626 aa		10.49	□□□□□ -0.73
TTLL3-222	ENST00000459758	NXT1	Q9UKK6	140 aa	Known RBP	10.49	□□□□□ -0.73
TTLL3-222	ENST00000459758	RARRES3	Q9UL19	164 aa		10.49	□□□□□ -0.73
TTLL3-222	ENST00000459758	MKL2	Q9ULH7	1088 aa		10.49	□□□□□ -0.73
TTLL3-222	ENST00000459758	ZMIZ1	Q9ULJ6	1067 aa		10.49	□□□□□ -0.73
TTLL3-222	ENST00000459758	SPATA2	Q9UM82	520 aa		10.49	□□□□□ -0.73
TTLL3-222	ENST00000459758	SIT1	Q9Y3P8	196 aa		10.49	□□□□□ -0.73
TTLL3-222	ENST00000459758	ETV7	Q9Y603	341 aa		10.49	□□□□□ -0.73
TTLL3-222	ENST00000459758	FKBP7	Q9Y680	259 aa		10.49	□□□□□ -0.73
TTLL3-222	ENST00000459758	PI4KA	P42356	2102 aa		10.48	□□□□□ -0.73
TTLL3-222	ENST00000459758	IGKV1D-42	A0A075B6H8	117 aa		10.48	□□□□□ -0.73
TTLL3-222	ENST00000459758	MSANTD3-TMEFF1	A0A0A6YYJ0	341 aa		10.48	□□□□□ -0.73
TTLL3-222	ENST00000459758	TEX13C	A0A0J9YWL9	993 aa		10.48	□□□□□ -0.73
TTLL3-222	ENST00000459758	TMEM212	A6NML5	194 aa		10.48	□□□□□ -0.73
TTLL3-222	ENST00000459758	FAM47E-STBD1	D6RA91	191 aa		10.48	□□□□□ -0.73
TTLL3-222	ENST00000459758	LRRN3	E7EW58	273 aa		10.48	□□□□□ -0.73
TTLL3-222	ENST00000459758	ARHGEF9	O43307	516 aa		10.48	□□□□□ -0.73
TTLL3-222	ENST00000459758	SDC3	O75056	442 aa		10.48	□□□□□ -0.73
TTLL3-222	ENST00000459758	ADAM11	O75078	769 aa		10.48	□□□□□ -0.73
TTLL3-222	ENST00000459758	ICOSLG	O75144	302 aa		10.48	□□□□□ -0.73
TTLL3-222	ENST00000459758	SNAPC5	O75971	98 aa		10.48	□□□□□ -0.73
TTLL3-222	ENST00000459758	ECD	O95905	644 aa	Predicted RBP	10.48	□□□□□ -0.73
TTLL3-222	ENST00000459758	DHFR	P00374	187 aa		10.48	□□□□□ -0.73
TTLL3-222	ENST00000459758	HEXB	P07686	556 aa		10.48	□□□□□ -0.73
TTLL3-222	ENST00000459758	CTSB	P07858	339 aa		10.48	□□□□□ -0.73
TTLL3-222	ENST00000459758	CD63	P08962	238 aa		10.48	□□□□□ -0.73
TTLL3-222	ENST00000459758	RAB40AL	P0C0E4	278 aa		10.48	□□□□□ -0.73
TTLL3-222	ENST00000459758	CALCB	P10092	127 aa		10.48	□□□□□ -0.73
TTLL3-222	ENST00000459758	CRABP1	P29762	137 aa		10.48	□□□□□ -0.73
TTLL3-222	ENST00000459758	EVI2B	P34910	448 aa		10.48	□□□□□ -0.73
TTLL3-222	ENST00000459758	HOXD12	P35452	270 aa		10.48	□□□□□ -0.73
TTLL3-222	ENST00000459758	APOBEC1	P41238	236 aa	Known RBP	10.48	□□□□□ -0.73
TTLL3-222	ENST00000459758	ERVK-25	P63136	954 aa		10.48	□□□□□ -0.73
TTLL3-222	ENST00000459758	SELENBP1	Q13228	472 aa		10.48	□□□□□ -0.73
TTLL3-222	ENST00000459758	ZFP69	Q49AA0	526 aa		10.48	□□□□□ -0.73
TTLL3-222	ENST00000459758	UBE2NL	Q5JXB2	153 aa		10.48	□□□□□ -0.73
TTLL3-222	ENST00000459758	NKAIN2	Q5VXU1	208 aa		10.48	□□□□□ -0.73
TTLL3-222	ENST00000459758	SLC22A10	Q63ZE4	541 aa		10.48	□□□□□ -0.73
TTLL3-222	ENST00000459758	ZNF57	Q68EA5	555 aa	Predicted RBP	10.48	□□□□□ -0.73
TTLL3-222	ENST00000459758	KCTD18	Q6PI47	426 aa	Predicted RBP	10.48	□□□□□ -0.73
TTLL3-222	ENST00000459758	SAMD12	Q8N8I0	201 aa		10.48	□□□□□ -0.73
TTLL3-222	ENST00000459758	ZNF441	Q8N8Z8	693 aa		10.48	□□□□□ -0.73
TTLL3-222	ENST00000459758	ZNF454	Q8N9F8	522 aa		10.48	□□□□□ -0.73
TTLL3-222	ENST00000459758	LRRC75A	Q8NAA5	344 aa		10.48	□□□□□ -0.73
TTLL3-222	ENST00000459758	LSM14A	Q8ND56	463 aa	Known RBP	10.48	□□□□□ -0.73
TTLL3-222	ENST00000459758	OR5J2	Q8NH18	312 aa		10.48	□□□□□ -0.73
TTLL3-222	ENST00000459758	TRMT10A	Q8TBZ6	339 aa	Known RBP	10.48	□□□□□ -0.73
TTLL3-222	ENST00000459758	RAB40A	Q8WXH6	277 aa		10.48	□□□□□ -0.73
TTLL3-222	ENST00000459758	ADAD1	Q96M93	576 aa	Known RBP	10.48	□□□□□ -0.73
TTLL3-222	ENST00000459758	TIMP4	Q99727	224 aa		10.48	□□□□□ -0.73
TTLL3-222	ENST00000459758	SEMA4C	Q9C0C4	833 aa		10.48	□□□□□ -0.73
TTLL3-222	ENST00000459758	VN1R1	Q9GZP7	353 aa		10.48	□□□□□ -0.73
TTLL3-222	ENST00000459758	PRO3102	Q9H379	93 aa		10.48	□□□□□ -0.73
TTLL3-222	ENST00000459758	LRRN3	Q9H3W5	708 aa		10.48	□□□□□ -0.73
TTLL3-222	ENST00000459758	MARCH7	Q9H992	704 aa		10.48	□□□□□ -0.73
TTLL3-222	ENST00000459758	INIP	Q9NRY2	104 aa		10.48	□□□□□ -0.73
TTLL3-222	ENST00000459758	UCKL1	Q9NWZ5	548 aa		10.48	□□□□□ -0.73
TTLL3-222	ENST00000459758	ING3	Q9NXR8	418 aa		10.48	□□□□□ -0.73
TTLL3-222	ENST00000459758	TAS2R10	Q9NYW0	307 aa		10.48	□□□□□ -0.73
TTLL3-222	ENST00000459758	LAMP5	Q9UJQ1	280 aa		10.48	□□□□□ -0.73
TTLL3-222	ENST00000459758	PPIE	Q9UNP9	301 aa	Known RBP	10.48	□□□□□ -0.73
TTLL3-222	ENST00000459758	CAMK2A	Q9UQM7	478 aa		10.48	□□□□□ -0.73
TTLL3-222	ENST00000459758	TMEM184B	Q9Y519	407 aa	Predicted RBP	10.48	□□□□□ -0.73
TTLL3-222	ENST00000459758	FER1L5	A0AVI2	2057 aa		10.48	□□□□□ -0.73
TTLL3-222	ENST00000459758	ABCA7	Q8IZY2	2146 aa		10.48	□□□□□ -0.73
TTLL3-222	ENST00000459758	RALGAPA1	Q6GYQ0	2036 aa		10.47	□□□□□ -0.73
TTLL3-222	ENST00000459758		A0A1W2PRG6	482 aa		10.47	□□□□□ -0.73
TTLL3-222	ENST00000459758	FAM172BP	A6NC97	362 aa		10.47	□□□□□ -0.73
TTLL3-222	ENST00000459758	OR6C68	A6NDL8	312 aa		10.47	□□□□□ -0.73
TTLL3-222	ENST00000459758	NAP1L6	A6NFF2	107 aa		10.47	□□□□□ -0.73
TTLL3-222	ENST00000459758		A8MUA0	341 aa		10.47	□□□□□ -0.73
TTLL3-222	ENST00000459758	GNB5	O14775	395 aa		10.47	□□□□□ -0.73
TTLL3-222	ENST00000459758	FZD7	O75084	574 aa		10.47	□□□□□ -0.73
TTLL3-222	ENST00000459758	LDOC1	O95751	146 aa	Predicted RBP	10.47	□□□□□ -0.73
TTLL3-222	ENST00000459758	GYPB	P06028	91 aa		10.47	□□□□□ -0.73
TTLL3-222	ENST00000459758	GSTT2B	P0CG30	244 aa		10.47	□□□□□ -0.73
TTLL3-222	ENST00000459758	IL9	P15248	144 aa		10.47	□□□□□ -0.73
TTLL3-222	ENST00000459758	PRKCA	P17252	672 aa		10.47	□□□□□ -0.73
TTLL3-222	ENST00000459758	PTN	P21246	168 aa		10.47	□□□□□ -0.73

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.8 ms