RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000440825.6

FAAP20-210, Transcript of FA core complex associated protein 20, humanhuman

TSL 3

Gene FAAP20, Length 855 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAAP20-210ENST00000440825 CDH11P55287 796 aa24.35■■□□□ 1.49
FAAP20-210ENST00000440825 COQ5Q5HYK3 327 aa24.35■■□□□ 1.49
FAAP20-210ENST00000440825 KLHL24Q6TFL4 600 aa24.35■■□□□ 1.49
FAAP20-210ENST00000440825 TMEM108Q6UXF1 575 aa24.35■■□□□ 1.49
FAAP20-210ENST00000440825 H1FNTQ75WM6 255 aaPredicted RBP24.35■■□□□ 1.49
FAAP20-210ENST00000440825 YTHDF3Q7Z739 585 aaKnown RBP24.35■■□□□ 1.49
FAAP20-210ENST00000440825 POU5F2Q8N7G0 328 aa24.35■■□□□ 1.49
FAAP20-210ENST00000440825 PCYOX1LQ8NBM8 494 aa24.35■■□□□ 1.49
FAAP20-210ENST00000440825 OR8J3Q8NGG0 315 aa24.35■■□□□ 1.49
FAAP20-210ENST00000440825 C10orf82Q8WW14 230 aa24.35■■□□□ 1.49
FAAP20-210ENST00000440825 OXGR1Q96P68 337 aa24.35■■□□□ 1.49
FAAP20-210ENST00000440825 GID8Q9NWU2 228 aa24.35■■□□□ 1.49
FAAP20-210ENST00000440825 POU2F3Q9UKI9 436 aa24.35■■□□□ 1.49
FAAP20-210ENST00000440825 USP22Q9UPT9 525 aa24.35■■□□□ 1.49
FAAP20-210ENST00000440825 C8BP07358 591 aa24.34■■□□□ 1.49
FAAP20-210ENST00000440825 CD247P20963 164 aa24.34■■□□□ 1.49
FAAP20-210ENST00000440825 NPTX1Q15818 432 aa24.34■■□□□ 1.49
FAAP20-210ENST00000440825 ENTPD8Q5MY95 495 aa24.34■■□□□ 1.49
FAAP20-210ENST00000440825 SMAP2Q8WU79 429 aaPredicted RBP24.34■■□□□ 1.49
FAAP20-210ENST00000440825 Q96MF0 132 aa24.34■■□□□ 1.49
FAAP20-210ENST00000440825 SLC17A5Q9NRA2 495 aa24.34■■□□□ 1.49
FAAP20-210ENST00000440825 FLNAP21333 2647 aaKnown RBP24.33■■□□□ 1.49
FAAP20-210ENST00000440825 NPPAP01160 153 aa24.33■■□□□ 1.49
FAAP20-210ENST00000440825 RPS4XP62701 263 aaKnown RBP24.33■■□□□ 1.49
FAAP20-210ENST00000440825 SPOCK1Q08629 439 aa24.33■■□□□ 1.49
FAAP20-210ENST00000440825 HIKESHIQ53FT3 197 aa24.33■■□□□ 1.49
FAAP20-210ENST00000440825 ZNF613Q6PF04 617 aa24.33■■□□□ 1.49
FAAP20-210ENST00000440825 SLC22A25Q6T423 547 aa24.33■■□□□ 1.49
FAAP20-210ENST00000440825 WDR31Q8NA23 367 aa24.33■■□□□ 1.49
FAAP20-210ENST00000440825 C1orf162Q8NEQ5 155 aaPredicted RBP24.33■■□□□ 1.49
FAAP20-210ENST00000440825 OR4D11Q8NGI4 311 aa24.33■■□□□ 1.49
FAAP20-210ENST00000440825 ASPNQ9BXN1 380 aa24.33■■□□□ 1.49
FAAP20-210ENST00000440825 CISD1Q9NZ45 108 aaKnown RBP24.33■■□□□ 1.49
FAAP20-210ENST00000440825 B3GALT5Q9Y2C3 310 aa24.33■■□□□ 1.49
FAAP20-210ENST00000440825 AMDHD2Q9Y303 409 aa24.33■■□□□ 1.49
FAAP20-210ENST00000440825 SHISA9B4DS77 424 aa24.32■■□□□ 1.48
FAAP20-210ENST00000440825 LRRN3E7EW58 273 aa24.32■■□□□ 1.48
FAAP20-210ENST00000440825 UPK3AO75631 287 aa24.32■■□□□ 1.48
FAAP20-210ENST00000440825 SOD3P08294 240 aa24.32■■□□□ 1.48
FAAP20-210ENST00000440825 ATP5J2P56134 94 aa24.32■■□□□ 1.48
FAAP20-210ENST00000440825 SLC25A3Q00325 362 aa24.32■■□□□ 1.48
FAAP20-210ENST00000440825 CALHM3Q86XJ0 350 aa24.32■■□□□ 1.48
FAAP20-210ENST00000440825 C17orf78Q8N4C9 275 aa24.32■■□□□ 1.48
FAAP20-210ENST00000440825 ADAMTS16Q8TE57 1224 aa24.32■■□□□ 1.48
FAAP20-210ENST00000440825 GTPBP3Q969Y2 492 aaKnown RBP24.32■■□□□ 1.48
FAAP20-210ENST00000440825 RCN3Q96D15 328 aa24.32■■□□□ 1.48
FAAP20-210ENST00000440825 ZNF317Q96PQ6 595 aaPredicted RBP24.32■■□□□ 1.48
FAAP20-210ENST00000440825 GSX2Q9BZM3 304 aa24.32■■□□□ 1.48
FAAP20-210ENST00000440825 AMBRA1Q9C0C7 1298 aa24.32■■□□□ 1.48
FAAP20-210ENST00000440825 B3GAT1Q9P2W7 334 aa24.32■■□□□ 1.48
FAAP20-210ENST00000440825 ARID1AO14497 2285 aa24.32■■□□□ 1.48
FAAP20-210ENST00000440825 FMO6PO60774 539 aa24.31■■□□□ 1.48
FAAP20-210ENST00000440825 BGLAPP02818 100 aa24.31■■□□□ 1.48
FAAP20-210ENST00000440825 PTAFRP25105 342 aa24.31■■□□□ 1.48
FAAP20-210ENST00000440825 CD40P25942 277 aa24.31■■□□□ 1.48
FAAP20-210ENST00000440825 LTBQ06643 244 aa24.31■■□□□ 1.48
FAAP20-210ENST00000440825 PMS2P3Q13401 168 aa24.31■■□□□ 1.48
FAAP20-210ENST00000440825 MFSD13AQ14CX5 517 aa24.31■■□□□ 1.48
FAAP20-210ENST00000440825 SWT1Q5T5J6 900 aaKnown RBP24.31■■□□□ 1.48
FAAP20-210ENST00000440825 HMBOX1Q6NT76 420 aa24.31■■□□□ 1.48
FAAP20-210ENST00000440825 UEVLDQ8IX04 471 aa24.31■■□□□ 1.48
FAAP20-210ENST00000440825 RASSF5Q8WWW0 418 aa24.31■■□□□ 1.48
FAAP20-210ENST00000440825 IGFBPL1Q8WX77 278 aa24.31■■□□□ 1.48
FAAP20-210ENST00000440825 PROX1Q92786 737 aa24.31■■□□□ 1.48
FAAP20-210ENST00000440825 MOGAT1Q96PD6 335 aa24.31■■□□□ 1.48
FAAP20-210ENST00000440825 GSX1Q9H4S2 264 aaPredicted RBP24.31■■□□□ 1.48
FAAP20-210ENST00000440825 DLL4Q9NR61 685 aa24.31■■□□□ 1.48
FAAP20-210ENST00000440825 SLC7A7Q9UM01 511 aa24.31■■□□□ 1.48
FAAP20-210ENST00000440825 MGAT4BQ9UQ53 548 aa24.31■■□□□ 1.48
FAAP20-210ENST00000440825 MAGED1Q9Y5V3 778 aaPredicted RBP24.31■■□□□ 1.48
FAAP20-210ENST00000440825 ACANP16112 2415 aa24.3■■□□□ 1.48
FAAP20-210ENST00000440825 OR6C65A6NJZ3 312 aa24.3■■□□□ 1.48
FAAP20-210ENST00000440825 KPNA4O00629 521 aaPredicted RBP24.3■■□□□ 1.48
FAAP20-210ENST00000440825 CHP2O43745 196 aa24.3■■□□□ 1.48
FAAP20-210ENST00000440825 SLC43A1O75387 559 aa24.3■■□□□ 1.48
FAAP20-210ENST00000440825 SERPINI2O75830 405 aa24.3■■□□□ 1.48
FAAP20-210ENST00000440825 TNFRSF1BP20333 461 aa24.3■■□□□ 1.48
FAAP20-210ENST00000440825 PRPS1P60891 318 aa24.3■■□□□ 1.48
FAAP20-210ENST00000440825 CARD17Q5XLA6 110 aa24.3■■□□□ 1.48
FAAP20-210ENST00000440825 CCDC80Q76M96 950 aa24.3■■□□□ 1.48
FAAP20-210ENST00000440825 LINGO2Q7L985 606 aa24.3■■□□□ 1.48
FAAP20-210ENST00000440825 GPR137CQ8N3F9 429 aa24.3■■□□□ 1.48
FAAP20-210ENST00000440825 TMEM43Q9BTV4 400 aa24.3■■□□□ 1.48
FAAP20-210ENST00000440825 ALG2Q9H553 416 aa24.3■■□□□ 1.48
FAAP20-210ENST00000440825 SH3GLB1Q9Y371 365 aa24.3■■□□□ 1.48
FAAP20-210ENST00000440825 CORINQ9Y5Q5 1042 aa24.3■■□□□ 1.48
FAAP20-210ENST00000440825 A0A096LPE4 126 aa24.29■■□□□ 1.48
FAAP20-210ENST00000440825 A0A1W2PPZ6 126 aa24.29■■□□□ 1.48
FAAP20-210ENST00000440825 WNT11O96014 354 aa24.29■■□□□ 1.48
FAAP20-210ENST00000440825 HPRP00739 348 aa24.29■■□□□ 1.48
FAAP20-210ENST00000440825 AHCYP23526 432 aa24.29■■□□□ 1.48
FAAP20-210ENST00000440825 CDKN1AP38936 164 aa24.29■■□□□ 1.48
FAAP20-210ENST00000440825 CRYBA2P53672 197 aa24.29■■□□□ 1.48
FAAP20-210ENST00000440825 ROR2Q01974 943 aaKnown RBP24.29■■□□□ 1.48
FAAP20-210ENST00000440825 LRRC23Q53EV4 343 aaPredicted RBP24.29■■□□□ 1.48
FAAP20-210ENST00000440825 ERICH5Q6P6B1 374 aa24.29■■□□□ 1.48
FAAP20-210ENST00000440825 TTC33Q6PID6 262 aaPredicted RBP24.29■■□□□ 1.48
FAAP20-210ENST00000440825 DEPDC4Q8N2C3 294 aa24.29■■□□□ 1.48
FAAP20-210ENST00000440825 OR1K1Q8NGR3 316 aa24.29■■□□□ 1.48
FAAP20-210ENST00000440825 C18orf12Q96KH6 178 aa24.29■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 46.2 ms