RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000436066.3

PLEKHF1-201, Transcript of pleckstrin homology and FYVE domain containing 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PLEKHF1, Length 2,084 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLEKHF1-201ENST00000436066 PLA2G10O15496 165 aa22.96■■□□□ 1.27
PLEKHF1-201ENST00000436066 SCO2O43819 266 aa22.96■■□□□ 1.27
PLEKHF1-201ENST00000436066 EDNRAP25101 427 aa22.96■■□□□ 1.27
PLEKHF1-201ENST00000436066 EPHA8P29322 1005 aaPredicted RBP22.96■■□□□ 1.27
PLEKHF1-201ENST00000436066 THBS2P35442 1172 aa22.96■■□□□ 1.27
PLEKHF1-201ENST00000436066 RPL22L1Q6P5R6 122 aaKnown RBP22.96■■□□□ 1.27
PLEKHF1-201ENST00000436066 UBQLNLQ8IYU4 475 aa22.96■■□□□ 1.27
PLEKHF1-201ENST00000436066 ZNF511Q8NB15 262 aa22.96■■□□□ 1.27
PLEKHF1-201ENST00000436066 MMP28Q9H239 520 aa22.96■■□□□ 1.27
PLEKHF1-201ENST00000436066 B3GAT2Q9NPZ5 323 aa22.96■■□□□ 1.27
PLEKHF1-201ENST00000436066 EXTL2Q9UBQ6 330 aa22.96■■□□□ 1.27
PLEKHF1-201ENST00000436066 ZNF346Q9UL40 294 aaKnown RBP22.96■■□□□ 1.27
PLEKHF1-201ENST00000436066 PGCP20142 388 aa22.96■■□□□ 1.27
PLEKHF1-201ENST00000436066 PSMB10P40306 273 aa22.96■■□□□ 1.27
PLEKHF1-201ENST00000436066 SLC25A1P53007 311 aa22.96■■□□□ 1.27
PLEKHF1-201ENST00000436066 Q7L0L9 218 aa22.96■■□□□ 1.27
PLEKHF1-201ENST00000436066 NUP54Q7Z3B4 507 aa22.96■■□□□ 1.27
PLEKHF1-201ENST00000436066 TEX19Q8NA77 164 aa22.96■■□□□ 1.27
PLEKHF1-201ENST00000436066 C19orf18Q8NEA5 215 aa22.96■■□□□ 1.27
PLEKHF1-201ENST00000436066 KCTD12Q96CX2 325 aaKnown RBP22.96■■□□□ 1.27
PLEKHF1-201ENST00000436066 MRPL48Q96GC5 212 aaKnown RBP22.96■■□□□ 1.27
PLEKHF1-201ENST00000436066 FKRPQ9H9S5 495 aa22.96■■□□□ 1.27
PLEKHF1-201ENST00000436066 A0A0G2JK05 382 aa22.95■■□□□ 1.26
PLEKHF1-201ENST00000436066 TFECO14948 347 aaPredicted RBP22.95■■□□□ 1.26
PLEKHF1-201ENST00000436066 CDC40O60508 579 aaKnown RBP eCLIP22.95■■□□□ 1.26
PLEKHF1-201ENST00000436066 SLC38A9Q8NBW4 561 aa22.95■■□□□ 1.26
PLEKHF1-201ENST00000436066 TSPAN32Q96QS1 320 aa22.95■■□□□ 1.26
PLEKHF1-201ENST00000436066 SMAD5Q99717 465 aaKnown RBP22.95■■□□□ 1.26
PLEKHF1-201ENST00000436066 TTYH2Q9BSA4 534 aa22.95■■□□□ 1.26
PLEKHF1-201ENST00000436066 DUSP23Q9BVJ7 150 aa22.95■■□□□ 1.26
PLEKHF1-201ENST00000436066 SRA1Q9HD15 236 aaKnown RBP22.95■■□□□ 1.26
PLEKHF1-201ENST00000436066 RXFP3Q9NSD7 469 aa22.95■■□□□ 1.26
PLEKHF1-201ENST00000436066 COLQQ9Y215 455 aaPredicted RBP22.95■■□□□ 1.26
PLEKHF1-201ENST00000436066 H7C1C5 153 aa22.94■■□□□ 1.26
PLEKHF1-201ENST00000436066 PSMD9O00233 223 aa22.94■■□□□ 1.26
PLEKHF1-201ENST00000436066 WISP1O95388 367 aa22.94■■□□□ 1.26
PLEKHF1-201ENST00000436066 TXNDC12O95881 172 aa22.94■■□□□ 1.26
PLEKHF1-201ENST00000436066 HLA-DQB1P01920 261 aa22.94■■□□□ 1.26
PLEKHF1-201ENST00000436066 EVI2BP34910 448 aa22.94■■□□□ 1.26
PLEKHF1-201ENST00000436066 LCN6P62502 163 aa22.94■■□□□ 1.26
PLEKHF1-201ENST00000436066 HSF2Q03933 536 aa22.94■■□□□ 1.26
PLEKHF1-201ENST00000436066 RIN1Q13671 783 aa22.94■■□□□ 1.26
PLEKHF1-201ENST00000436066 CBFBQ13951 182 aa22.94■■□□□ 1.26
PLEKHF1-201ENST00000436066 C1QL3Q5VWW1 255 aa22.94■■□□□ 1.26
PLEKHF1-201ENST00000436066 PAMR1Q6UXH9 720 aa22.94■■□□□ 1.26
PLEKHF1-201ENST00000436066 EXD3Q8N9H8 876 aa22.94■■□□□ 1.26
PLEKHF1-201ENST00000436066 OR6C1Q96RD1 312 aa22.94■■□□□ 1.26
PLEKHF1-201ENST00000436066 TGIF2Q9GZN2 237 aa22.94■■□□□ 1.26
PLEKHF1-201ENST00000436066 FSCN3Q9NQT6 498 aa22.94■■□□□ 1.26
PLEKHF1-201ENST00000436066 TIAF1O95411 115 aa22.94■■□□□ 1.26
PLEKHF1-201ENST00000436066 GP1BBP13224 206 aa22.94■■□□□ 1.26
PLEKHF1-201ENST00000436066 RAB3BP20337 219 aa22.94■■□□□ 1.26
PLEKHF1-201ENST00000436066 HTR3AP46098 478 aa22.94■■□□□ 1.26
PLEKHF1-201ENST00000436066 ACY1Q03154 408 aa22.94■■□□□ 1.26
PLEKHF1-201ENST00000436066 NR0B2Q15466 257 aa22.94■■□□□ 1.26
PLEKHF1-201ENST00000436066 SLC25A35Q3KQZ1 300 aa22.94■■□□□ 1.26
PLEKHF1-201ENST00000436066 CCDC58Q4VC31 144 aa22.94■■□□□ 1.26
PLEKHF1-201ENST00000436066 MESTQ5EB52 335 aa22.94■■□□□ 1.26
PLEKHF1-201ENST00000436066 RABEPKQ7Z6M1 372 aa22.94■■□□□ 1.26
PLEKHF1-201ENST00000436066 LRRC28Q86X40 367 aaPredicted RBP22.94■■□□□ 1.26
PLEKHF1-201ENST00000436066 SAMD12Q8N8I0 201 aa22.94■■□□□ 1.26
PLEKHF1-201ENST00000436066 FAM210AQ96ND0 272 aa22.94■■□□□ 1.26
PLEKHF1-201ENST00000436066 PDCD1LG2Q9BQ51 273 aa22.94■■□□□ 1.26
PLEKHF1-201ENST00000436066 MESP1Q9BRJ9 268 aa22.94■■□□□ 1.26
PLEKHF1-201ENST00000436066 MOKQ9UQ07 419 aa22.94■■□□□ 1.26
PLEKHF1-201ENST00000436066 FADS1O60427 444 aa22.93■■□□□ 1.26
PLEKHF1-201ENST00000436066 SLC25A12O75746 678 aa22.93■■□□□ 1.26
PLEKHF1-201ENST00000436066 PNLIPP16233 465 aa22.93■■□□□ 1.26
PLEKHF1-201ENST00000436066 RPS11P62280 158 aaKnown RBP eCLIP22.93■■□□□ 1.26
PLEKHF1-201ENST00000436066 RNF4P78317 190 aa22.93■■□□□ 1.26
PLEKHF1-201ENST00000436066 EMC4Q5J8M3 183 aa22.93■■□□□ 1.26
PLEKHF1-201ENST00000436066 KANSL1Q7Z3B3 1105 aa22.93■■□□□ 1.26
PLEKHF1-201ENST00000436066 NDEL1Q9GZM8 345 aa22.93■■□□□ 1.26
PLEKHF1-201ENST00000436066 TRAV36DV7A0A075B6V5 113 aa22.93■■□□□ 1.26
PLEKHF1-201ENST00000436066 IDSB3KWA1 339 aa22.93■■□□□ 1.26
PLEKHF1-201ENST00000436066 DCTN6O00399 190 aa22.93■■□□□ 1.26
PLEKHF1-201ENST00000436066 BGLAPP02818 100 aa22.93■■□□□ 1.26
PLEKHF1-201ENST00000436066 TMED10P49755 219 aaKnown RBP22.93■■□□□ 1.26
PLEKHF1-201ENST00000436066 P2RX1P51575 399 aa22.93■■□□□ 1.26
PLEKHF1-201ENST00000436066 ZNF544Q6NX49 715 aa22.93■■□□□ 1.26
PLEKHF1-201ENST00000436066 C16orf47Q6ZP98 133 aaPredicted RBP22.93■■□□□ 1.26
PLEKHF1-201ENST00000436066 UBL7Q96S82 380 aaPredicted RBP22.93■■□□□ 1.26
PLEKHF1-201ENST00000436066 SYNDIG1Q9H7V2 258 aa22.93■■□□□ 1.26
PLEKHF1-201ENST00000436066 INIPQ9NRY2 104 aa22.93■■□□□ 1.26
PLEKHF1-201ENST00000436066 CYSLTR2Q9NS75 346 aa22.93■■□□□ 1.26
PLEKHF1-201ENST00000436066 NPAP1Q9NZP6 1156 aa22.93■■□□□ 1.26
PLEKHF1-201ENST00000436066 A0A1W2PQM1 296 aa22.92■■□□□ 1.26
PLEKHF1-201ENST00000436066 PAHP00439 452 aa22.92■■□□□ 1.26
PLEKHF1-201ENST00000436066 EIF4EP06730 217 aaKnown RBP22.92■■□□□ 1.26
PLEKHF1-201ENST00000436066 CCL7P80098 99 aa22.92■■□□□ 1.26
PLEKHF1-201ENST00000436066 SLC16A9Q7RTY1 509 aa22.92■■□□□ 1.26
PLEKHF1-201ENST00000436066 TRMT10AQ8TBZ6 339 aaKnown RBP22.92■■□□□ 1.26
PLEKHF1-201ENST00000436066 OR14A2Q96R54 314 aa22.92■■□□□ 1.26
PLEKHF1-201ENST00000436066 TRAV1-2A0A0B4J238 106 aa22.91■■□□□ 1.26
PLEKHF1-201ENST00000436066 LY6G6EA0A0G2JKS1 128 aa22.91■■□□□ 1.26
PLEKHF1-201ENST00000436066 A0A0G2JMP0 313 aa22.91■■□□□ 1.26
PLEKHF1-201ENST00000436066 A0A0X1KG70 313 aa22.91■■□□□ 1.26
PLEKHF1-201ENST00000436066 PRR32B1ATL7 298 aa22.91■■□□□ 1.26
PLEKHF1-201ENST00000436066 SIGLEC6O43699 453 aa22.91■■□□□ 1.26
PLEKHF1-201ENST00000436066 CCNKO75909 580 aa22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.9 ms