RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000426333.6

EFTUD2-202, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene EFTUD2, Length 4,548 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-202ENST00000426333 BSCL2Q96G97 398 aaPredicted RBP10.22□□□□□ -0.77
EFTUD2-202ENST00000426333 TRBV4-1A0A0J9YWV2 114 aa10.22□□□□□ -0.77
EFTUD2-202ENST00000426333 RAB19A4D1S5 217 aa10.22□□□□□ -0.77
EFTUD2-202ENST00000426333 MBLAC1A4D2B0 266 aaPredicted RBP10.22□□□□□ -0.77
EFTUD2-202ENST00000426333 TMEM212A6NML5 194 aa10.22□□□□□ -0.77
EFTUD2-202ENST00000426333 OR7A17O14581 309 aa10.22□□□□□ -0.77
EFTUD2-202ENST00000426333 ZNF264O43296 627 aa10.22□□□□□ -0.77
EFTUD2-202ENST00000426333 DDAH2O95865 285 aa10.22□□□□□ -0.77
EFTUD2-202ENST00000426333 MAKP20794 623 aa10.22□□□□□ -0.77
EFTUD2-202ENST00000426333 DRD1P21728 446 aa10.22□□□□□ -0.77
EFTUD2-202ENST00000426333 OMGP23515 440 aa10.22□□□□□ -0.77
EFTUD2-202ENST00000426333 DPP4P27487 766 aa10.22□□□□□ -0.77
EFTUD2-202ENST00000426333 SFRP5Q5T4F7 317 aa10.22□□□□□ -0.77
EFTUD2-202ENST00000426333 B3GLCTQ6Y288 498 aa10.22□□□□□ -0.77
EFTUD2-202ENST00000426333 NDUFAF7Q7L592 441 aa10.22□□□□□ -0.77
EFTUD2-202ENST00000426333 SLC46A3Q7Z3Q1 461 aa10.22□□□□□ -0.77
EFTUD2-202ENST00000426333 SLC30A7Q8NEW0 376 aa10.22□□□□□ -0.77
EFTUD2-202ENST00000426333 SLC38A5Q8WUX1 472 aa10.22□□□□□ -0.77
EFTUD2-202ENST00000426333 ALG12Q9BV10 488 aa10.22□□□□□ -0.77
EFTUD2-202ENST00000426333 METTL9Q9H1A3 318 aa10.22□□□□□ -0.77
EFTUD2-202ENST00000426333 C1orf198Q9H425 327 aa10.22□□□□□ -0.77
EFTUD2-202ENST00000426333 PRSS21Q9Y6M0 314 aa10.22□□□□□ -0.77
EFTUD2-202ENST00000426333 A0A0B4J2A0 478 aa10.22□□□□□ -0.77
EFTUD2-202ENST00000426333 H0YIV9 168 aa10.22□□□□□ -0.77
EFTUD2-202ENST00000426333 GASTP01350 101 aa10.22□□□□□ -0.77
EFTUD2-202ENST00000426333 CTBSQ01459 385 aa10.22□□□□□ -0.77
EFTUD2-202ENST00000426333 ILKQ13418 452 aa10.22□□□□□ -0.77
EFTUD2-202ENST00000426333 LILRA2Q8N149 483 aa10.22□□□□□ -0.77
EFTUD2-202ENST00000426333 RAB3CQ96E17 227 aa10.22□□□□□ -0.77
EFTUD2-202ENST00000426333 HRASLS5Q96KN8 279 aa10.22□□□□□ -0.77
EFTUD2-202ENST00000426333 SMIM14Q96QK8 99 aa10.22□□□□□ -0.77
EFTUD2-202ENST00000426333 CCNL2Q96S94 520 aaPredicted RBP10.22□□□□□ -0.77
EFTUD2-202ENST00000426333 TIMM29Q9BSF4 260 aa10.22□□□□□ -0.77
EFTUD2-202ENST00000426333 C20orf27Q9GZN8 174 aa10.22□□□□□ -0.77
EFTUD2-202ENST00000426333 GFOD1Q9NXC2 390 aa10.22□□□□□ -0.77
EFTUD2-202ENST00000426333 GHRLQ9UBU3 117 aa10.22□□□□□ -0.77
EFTUD2-202ENST00000426333 SHPKQ9UHJ6 478 aa10.22□□□□□ -0.77
EFTUD2-202ENST00000426333 ADAM29Q9UKF5 820 aa10.22□□□□□ -0.77
EFTUD2-202ENST00000426333 MYADML2A6NDP7 307 aa10.21□□□□□ -0.77
EFTUD2-202ENST00000426333 F3P13726 295 aa10.21□□□□□ -0.77
EFTUD2-202ENST00000426333 PSMB5P28074 263 aa10.21□□□□□ -0.77
EFTUD2-202ENST00000426333 HOXC13P31276 330 aa10.21□□□□□ -0.77
EFTUD2-202ENST00000426333 MTCP1P56278 107 aa10.21□□□□□ -0.77
EFTUD2-202ENST00000426333 HSD17B7P56937 341 aa10.21□□□□□ -0.77
EFTUD2-202ENST00000426333 RNF4P78317 190 aa10.21□□□□□ -0.77
EFTUD2-202ENST00000426333 AARDQ4LEZ3 155 aa10.21□□□□□ -0.77
EFTUD2-202ENST00000426333 MOB3CQ70IA8 216 aa10.21□□□□□ -0.77
EFTUD2-202ENST00000426333 SLC35D2Q76EJ3 337 aa10.21□□□□□ -0.77
EFTUD2-202ENST00000426333 KCNG3Q8TAE7 436 aa10.21□□□□□ -0.77
EFTUD2-202ENST00000426333 FAM213BQ8TBF2 198 aa10.21□□□□□ -0.77
EFTUD2-202ENST00000426333 LGALS14Q8TCE9 139 aa10.21□□□□□ -0.77
EFTUD2-202ENST00000426333 CENPOQ9BU64 300 aa10.21□□□□□ -0.77
EFTUD2-202ENST00000426333 SLC19A3Q9BZV2 496 aa10.21□□□□□ -0.77
EFTUD2-202ENST00000426333 NIPAL2Q9H841 368 aa10.21□□□□□ -0.77
EFTUD2-202ENST00000426333 PATZ1Q9HBE1 687 aaKnown RBP10.21□□□□□ -0.77
EFTUD2-202ENST00000426333 PPP1R14DQ9NXH3 145 aa10.21□□□□□ -0.77
EFTUD2-202ENST00000426333 GPR160Q9UJ42 338 aa10.21□□□□□ -0.77
EFTUD2-202ENST00000426333 ZNF318Q5VUA4 2279 aa10.21□□□□□ -0.77
EFTUD2-202ENST00000426333 SLC43A1O75387 559 aa10.21□□□□□ -0.77
EFTUD2-202ENST00000426333 CR2P20023 1033 aa10.21□□□□□ -0.77
EFTUD2-202ENST00000426333 POU3F2P20265 443 aaPredicted RBP10.21□□□□□ -0.77
EFTUD2-202ENST00000426333 SHC1P29353 583 aa10.21□□□□□ -0.77
EFTUD2-202ENST00000426333 SERPINF1P36955 418 aa10.21□□□□□ -0.77
EFTUD2-202ENST00000426333 DEFB133Q30KQ1 61 aa10.21□□□□□ -0.77
EFTUD2-202ENST00000426333 UBE2NLQ5JXB2 153 aa10.21□□□□□ -0.77
EFTUD2-202ENST00000426333 CLLU1OSQ5K130 101 aa10.21□□□□□ -0.77
EFTUD2-202ENST00000426333 BRICD5Q6PL45 260 aa10.21□□□□□ -0.77
EFTUD2-202ENST00000426333 RBMS3Q6XE24 437 aaKnown RBP10.21□□□□□ -0.77
EFTUD2-202ENST00000426333 LIN28BQ6ZN17 250 aaKnown RBP eCLIP10.21□□□□□ -0.775e-7■■■□□ 19.2
EFTUD2-202ENST00000426333 LINC01599Q8WXQ3 324 aa10.21□□□□□ -0.77
EFTUD2-202ENST00000426333 BADQ92934 168 aa10.21□□□□□ -0.77
EFTUD2-202ENST00000426333 BTF3L4Q96K17 158 aa10.21□□□□□ -0.77
EFTUD2-202ENST00000426333 KLF16Q9BXK1 252 aaPredicted RBP10.21□□□□□ -0.77
EFTUD2-202ENST00000426333 SELENOIQ9C0D9 397 aa10.21□□□□□ -0.77
EFTUD2-202ENST00000426333 GDE1Q9NZC3 331 aa10.21□□□□□ -0.77
EFTUD2-202ENST00000426333 MOKQ9UQ07 419 aa10.21□□□□□ -0.77
EFTUD2-202ENST00000426333 CDC14CA4D256 554 aa10.21□□□□□ -0.78
EFTUD2-202ENST00000426333 MCRIP1C9JLW8 97 aa10.21□□□□□ -0.78
EFTUD2-202ENST00000426333 BET1O15155 118 aa10.21□□□□□ -0.78
EFTUD2-202ENST00000426333 NCR1O76036 304 aa10.21□□□□□ -0.78
EFTUD2-202ENST00000426333 TCRBP04435 133 aa10.21□□□□□ -0.78
EFTUD2-202ENST00000426333 HTR2CP28335 458 aa10.21□□□□□ -0.78
EFTUD2-202ENST00000426333 GCAP28676 217 aa10.21□□□□□ -0.78
EFTUD2-202ENST00000426333 OR1D4P47884 311 aa10.21□□□□□ -0.78
EFTUD2-202ENST00000426333 CSNK1DP48730 415 aa10.21□□□□□ -0.78
EFTUD2-202ENST00000426333 VASPP50552 380 aaPredicted RBP10.21□□□□□ -0.78
EFTUD2-202ENST00000426333 DAPP51397 102 aa10.21□□□□□ -0.78
EFTUD2-202ENST00000426333 CRMP1Q14194 572 aa10.21□□□□□ -0.78
EFTUD2-202ENST00000426333 HABP2Q14520 560 aaPredicted RBP10.21□□□□□ -0.78
EFTUD2-202ENST00000426333 LRRC26Q2I0M4 334 aa10.21□□□□□ -0.78
EFTUD2-202ENST00000426333 Q499Y3 187 aa10.21□□□□□ -0.78
EFTUD2-202ENST00000426333 NHSL2Q5HYW2 709 aa10.21□□□□□ -0.78
EFTUD2-202ENST00000426333 SFXN4Q6P4A7 337 aa10.21□□□□□ -0.78
EFTUD2-202ENST00000426333 HTR3DQ70Z44 454 aa10.21□□□□□ -0.78
EFTUD2-202ENST00000426333 FAM122BQ7Z309 247 aa10.21□□□□□ -0.78
EFTUD2-202ENST00000426333 PCNPQ8WW12 178 aaKnown RBP10.21□□□□□ -0.78
EFTUD2-202ENST00000426333 ZNF845Q96IR2 970 aaPredicted RBP10.21□□□□□ -0.78
EFTUD2-202ENST00000426333 NRIP3Q9NQ35 241 aa10.21□□□□□ -0.78
EFTUD2-202ENST00000426333 HIF1ANQ9NWT6 349 aa10.21□□□□□ -0.78
EFTUD2-202ENST00000426333 CEP350Q5VT06 3117 aa10.21□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.1 ms