RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000419445.5

PGGT1B-203, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PGGT1B, Length 9,545 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-203ENST00000419445 RBM18Q96H35 190 aaKnown RBP3.3□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 Q96M85 177 aa3.3□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 SEC22CQ9BRL7 303 aa3.3□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 FAM60AQ9NP50 221 aa3.3□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 POLE3Q9NRF9 147 aa3.3□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 KIF25Q9UIL4 384 aa3.3□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 GSTK1Q9Y2Q3 226 aa3.3□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 SCN2AQ99250 2005 aa3.3□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 MYO7BQ6PIF6 2116 aa3.3□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 USF3Q68DE3 2245 aa3.3□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 EP300Q09472 2414 aaPredicted RBP3.3□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 LOC390937A0A1W2PQ73 354 aa3.3□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 MPTX1A8MV57 137 aa3.3□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 SNRPGP15A8MWD9 76 aa3.3□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 CCL16O15467 120 aa3.3□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 MT-ND4P03905 459 aa3.3□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 RAB3BP20337 219 aa3.3□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 IFNA8P32881 189 aa3.3□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 PPP1CAP62136 330 aa3.3□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 INSM1Q01101 510 aaPredicted RBP3.3□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 IL18Q14116 193 aa3.3□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 NKAIN2Q5VXU1 208 aa3.3□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 FAM109BQ6ICB4 259 aaPredicted RBP3.3□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 CBLN3Q6UW01 205 aa3.3□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 TMEM151BQ8IW70 566 aa3.3□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 OR4N5Q8IXE1 308 aa3.3□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 SDR9C7Q8NEX9 313 aa3.3□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 TTLQ8NG68 377 aa3.3□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 OR6M1Q8NGM8 313 aa3.3□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 OR51A7Q8NH64 312 aa3.3□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 CXorf58Q96LI9 332 aa3.3□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 C4orf45Q96LM5 186 aa3.3□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 GSDMCQ9BYG8 508 aa3.3□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 PTGFRNQ9P2B2 879 aa3.3□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 TDRD6O60522 2096 aaKnown RBP3.3□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 OR2W5A6NFC9 320 aa3.3□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 C5orf58C9J3I9 102 aa3.3□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 RAB27BO00194 218 aa3.3□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 MT-ND5P03915 603 aa3.3□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 IFI30P13284 250 aa3.3□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 DNASE1P24855 282 aa3.3□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 VEGFCP49767 419 aa3.3□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 MST1LQ2TV78 715 aa3.3□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 RTL4Q6ZR62 310 aa3.3□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 ATOH1Q92858 354 aaPredicted RBP3.3□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 SEH1LQ96EE3 360 aa3.3□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 BMFQ96LC9 184 aa3.3□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 PTDSS2Q9BVG9 487 aa3.3□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 C20orf85Q9H1P6 137 aa3.3□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 LYRM4Q9HD34 91 aa3.3□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 MMP25Q9NPA2 562 aa3.3□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 MRPL22Q9NWU5 206 aaKnown RBP3.3□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 OBP2AQ9NY56 170 aa3.3□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 PLA2G2EQ9NZK7 142 aa3.3□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 TMEM184BQ9Y519 407 aaPredicted RBP3.3□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 B3GALT1Q9Y5Z6 326 aa3.3□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 URB1O60287 2271 aaKnown RBP3.29□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 NPIPA5A0A0B4J1W7 369 aa3.29□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 TCRBV16S1A1N1A0A5B0 115 aa3.29□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 FOXI3A8MTJ6 420 aaPredicted RBP3.29□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 NPIPA7E9PJI5 369 aa3.29□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 GPR75O95800 540 aa3.29□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 IGKV3-11P04433 115 aa3.29□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 ITGB2P05107 769 aa3.29□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 FAM157CP0CG43 387 aa3.29□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 NPIPA8P0DM63 369 aa3.29□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 ZP3P21754 424 aa3.29□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 SLC25A1P53007 311 aa3.29□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 SNTB2Q13425 540 aaKnown RBP3.29□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 DEFB134Q4QY38 66 aa3.29□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 ZCCHC12Q6PEW1 402 aa3.29□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 STAC2Q6ZMT1 411 aa3.29□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 OR6V1Q8N148 313 aa3.29□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 POMGNT2Q8NAT1 580 aa3.29□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 OR4A4PQ8NGN8 299 aa3.29□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 PNPLA2Q96AD5 504 aa3.29□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 ZNF436Q9C0F3 470 aaPredicted RBP3.29□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 EGLN1Q9GZT9 426 aa3.29□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 RERGLQ9H628 205 aa3.29□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 ING3Q9NXR8 418 aa3.29□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 RASL12Q9NYN1 266 aa3.29□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 LINC01553A4QN01 128 aa3.29□□□□□ -1.88
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PGGT1B-203ENST00000419445 A8MUA0 341 aa3.29□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 FTCDNL1E5RQL4 147 aa3.29□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 SULT1B1O43704 296 aa3.29□□□□□ -1.88
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PGGT1B-203ENST00000419445 TP53I3Q53FA7 332 aa3.29□□□□□ -1.88
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PGGT1B-203ENST00000419445 C17orf82Q86X59 251 aaPredicted RBP3.29□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 RCBTB1Q8NDN9 531 aa3.29□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 NSMAFQ92636 917 aa3.29□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 CAPNS2Q96L46 248 aa3.29□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 SLC19A3Q9BZV2 496 aa3.29□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 ADAM19Q9H013 955 aa3.29□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 CD93Q9NPY3 652 aa3.29□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 CALML5Q9NZT1 146 aa3.29□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 HCN3Q9P1Z3 774 aa3.29□□□□□ -1.88
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