RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000382723.4

MSX1-201, Transcript of msh homeobox 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene MSX1, Length 1,939 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSX1-201ENST00000382723 SDR9C7Q8NEX9 313 aa24.12■■□□□ 1.45
MSX1-201ENST00000382723 SCMH1Q96GD3 660 aa24.12■■□□□ 1.45
MSX1-201ENST00000382723 Q96M85 177 aa24.12■■□□□ 1.45
MSX1-201ENST00000382723 SFXN2Q96NB2 322 aa24.12■■□□□ 1.45
MSX1-201ENST00000382723 OR2B2Q9GZK3 357 aa24.12■■□□□ 1.45
MSX1-201ENST00000382723 ALKBH4Q9NXW9 302 aa24.12■■□□□ 1.45
MSX1-201ENST00000382723 SLC6A5Q9Y345 797 aa24.12■■□□□ 1.45
MSX1-201ENST00000382723 SNX5Q9Y5X3 404 aa24.12■■□□□ 1.45
MSX1-201ENST00000382723 CNTRLQ7Z7A1 2325 aa24.11■■□□□ 1.45
MSX1-201ENST00000382723 TEX13CA0A0J9YWL9 993 aa24.11■■□□□ 1.45
MSX1-201ENST00000382723 RGS10O43665 173 aa24.11■■□□□ 1.45
MSX1-201ENST00000382723 CLK1P49759 484 aaKnown RBP24.11■■□□□ 1.45
MSX1-201ENST00000382723 ITGADQ13349 1161 aa24.11■■□□□ 1.45
MSX1-201ENST00000382723 AADACL4Q5VUY2 407 aa24.11■■□□□ 1.45
MSX1-201ENST00000382723 SPARTQ8N0X7 666 aa24.11■■□□□ 1.45
MSX1-201ENST00000382723 GHDCQ8N2G8 530 aa24.11■■□□□ 1.45
MSX1-201ENST00000382723 TMEM178AQ8NBL3 297 aa24.11■■□□□ 1.45
MSX1-201ENST00000382723 DTNBP1Q96EV8 351 aa24.11■■□□□ 1.45
MSX1-201ENST00000382723 HCAR1Q9BXC0 346 aa24.11■■□□□ 1.45
MSX1-201ENST00000382723 INIPQ9NRY2 104 aa24.11■■□□□ 1.45
MSX1-201ENST00000382723 H2AFY2Q9P0M6 372 aaPredicted RBP24.11■■□□□ 1.45
MSX1-201ENST00000382723 SSUH2Q9Y2M2 353 aa24.11■■□□□ 1.45
MSX1-201ENST00000382723 MRPS18CQ9Y3D5 142 aaKnown RBP24.11■■□□□ 1.45
MSX1-201ENST00000382723 HDGFL3Q9Y3E1 203 aa24.11■■□□□ 1.45
MSX1-201ENST00000382723 RPL36Q9Y3U8 105 aaKnown RBP24.11■■□□□ 1.45
MSX1-201ENST00000382723 PRR23D1E9PI22 279 aaPredicted RBP24.1■■□□□ 1.45
MSX1-201ENST00000382723 ARPC3O15145 178 aa24.1■■□□□ 1.45
MSX1-201ENST00000382723 PRODHO43272 600 aa24.1■■□□□ 1.45
MSX1-201ENST00000382723 CELA3AP09093 270 aa24.1■■□□□ 1.45
MSX1-201ENST00000382723 PRR23D2P0DMB1 279 aaPredicted RBP24.1■■□□□ 1.45
MSX1-201ENST00000382723 DBTP11182 482 aaKnown RBP24.1■■□□□ 1.45
MSX1-201ENST00000382723 MAGEA5P43359 124 aa24.1■■□□□ 1.45
MSX1-201ENST00000382723 TLE3Q04726 772 aa24.1■■□□□ 1.45
MSX1-201ENST00000382723 KHDRBS1Q07666 443 aaKnown RBP eCLIP24.1■■□□□ 1.45
MSX1-201ENST00000382723 KCTD8Q6ZWB6 473 aa24.1■■□□□ 1.45
MSX1-201ENST00000382723 H1FNTQ75WM6 255 aaPredicted RBP24.1■■□□□ 1.45
MSX1-201ENST00000382723 SLC37A3Q8NCC5 494 aa24.1■■□□□ 1.45
MSX1-201ENST00000382723 LSM14AQ8ND56 463 aaKnown RBP24.1■■□□□ 1.45
MSX1-201ENST00000382723 FN3KQ9H479 309 aa24.1■■□□□ 1.45
MSX1-201ENST00000382723 CCNB1IP1Q9NPC3 277 aa24.1■■□□□ 1.45
MSX1-201ENST00000382723 CHST11Q9NPF2 352 aa24.1■■□□□ 1.45
MSX1-201ENST00000382723 FKBP14Q9NWM8 211 aa24.1■■□□□ 1.45
MSX1-201ENST00000382723 GRHPRQ9UBQ7 328 aa24.1■■□□□ 1.45
MSX1-201ENST00000382723 TRIM64CA6NLI5 447 aa24.1■■□□□ 1.45
MSX1-201ENST00000382723 LOC400499M0QZD8 3231 aa24.1■■□□□ 1.45
MSX1-201ENST00000382723 MT-ND2P03891 347 aa24.1■■□□□ 1.45
MSX1-201ENST00000382723 STSP08842 583 aa24.1■■□□□ 1.45
MSX1-201ENST00000382723 DIO1P49895 249 aa24.1■■□□□ 1.45
MSX1-201ENST00000382723 RAC1P63000 192 aa24.1■■□□□ 1.45
MSX1-201ENST00000382723 MVKQ03426 396 aa24.1■■□□□ 1.45
MSX1-201ENST00000382723 ST3GAL4Q11206 333 aa24.1■■□□□ 1.45
MSX1-201ENST00000382723 FAM122BQ7Z309 247 aa24.1■■□□□ 1.45
MSX1-201ENST00000382723 SCAIQ8N9R8 606 aa24.1■■□□□ 1.45
MSX1-201ENST00000382723 MYDGFQ969H8 173 aa24.1■■□□□ 1.45
MSX1-201ENST00000382723 TSPAN32Q96QS1 320 aa24.1■■□□□ 1.45
MSX1-201ENST00000382723 BATF3Q9NR55 127 aa24.1■■□□□ 1.45
MSX1-201ENST00000382723 KLHL21Q9UJP4 597 aa24.1■■□□□ 1.45
MSX1-201ENST00000382723 CEP295Q9C0D2 2601 aa24.09■■□□□ 1.45
MSX1-201ENST00000382723 DPPA5A6NC42 116 aa24.09■■□□□ 1.45
MSX1-201ENST00000382723 EFCAB10A6NFE3 127 aa24.09■■□□□ 1.45
MSX1-201ENST00000382723 SULT2B1O00204 365 aa24.09■■□□□ 1.45
MSX1-201ENST00000382723 IDH3BO43837 385 aa24.09■■□□□ 1.45
MSX1-201ENST00000382723 ACVR2AP27037 513 aa24.09■■□□□ 1.45
MSX1-201ENST00000382723 CD97P48960 835 aa24.09■■□□□ 1.45
MSX1-201ENST00000382723 CDH11P55287 796 aa24.09■■□□□ 1.45
MSX1-201ENST00000382723 PUDPQ08623 228 aa24.09■■□□□ 1.45
MSX1-201ENST00000382723 NXNL2Q5VZ03 156 aa24.09■■□□□ 1.45
MSX1-201ENST00000382723 STX19Q8N4C7 294 aa24.09■■□□□ 1.45
MSX1-201ENST00000382723 TMEM251Q8N6I4 163 aa24.09■■□□□ 1.45
MSX1-201ENST00000382723 NMNAT3Q96T66 252 aa24.09■■□□□ 1.45
MSX1-201ENST00000382723 SMAD5Q99717 465 aaKnown RBP24.09■■□□□ 1.45
MSX1-201ENST00000382723 ZNF346Q9UL40 294 aaKnown RBP24.09■■□□□ 1.45
MSX1-201ENST00000382723 SPTBN4Q9H254 2564 aa24.08■■□□□ 1.45
MSX1-201ENST00000382723 MS4A18H0YCH9 400 aa24.08■■□□□ 1.45
MSX1-201ENST00000382723 RRP8O43159 456 aaKnown RBP24.08■■□□□ 1.45
MSX1-201ENST00000382723 C21orf33P30042 268 aaPredicted RBP24.08■■□□□ 1.45
MSX1-201ENST00000382723 SDHAP31040 664 aa24.08■■□□□ 1.45
MSX1-201ENST00000382723 SLC15A1P46059 708 aa24.08■■□□□ 1.45
MSX1-201ENST00000382723 RPL5P46777 297 aaKnown RBP24.08■■□□□ 1.45
MSX1-201ENST00000382723 NR1H2P55055 460 aa24.08■■□□□ 1.45
MSX1-201ENST00000382723 NEDD8Q15843 81 aa24.08■■□□□ 1.45
MSX1-201ENST00000382723 MS4A18Q3C1V0 323 aa24.08■■□□□ 1.45
MSX1-201ENST00000382723 TMPPEQ6ZT21 453 aa24.08■■□□□ 1.45
MSX1-201ENST00000382723 PTP4A1Q93096 173 aa24.08■■□□□ 1.45
MSX1-201ENST00000382723 RFKQ969G6 155 aa24.08■■□□□ 1.45
MSX1-201ENST00000382723 SNTNA6NMZ2 147 aa24.08■■□□□ 1.44
MSX1-201ENST00000382723 GLSO94925 669 aaPredicted RBP24.08■■□□□ 1.44
MSX1-201ENST00000382723 CDK1P06493 297 aa24.08■■□□□ 1.44
MSX1-201ENST00000382723 APEHP13798 732 aaKnown RBP24.08■■□□□ 1.44
MSX1-201ENST00000382723 PAICSP22234 425 aaKnown RBP24.08■■□□□ 1.44
MSX1-201ENST00000382723 PPIAP62937 165 aaKnown RBP24.08■■□□□ 1.44
MSX1-201ENST00000382723 KLHL12Q53G59 568 aa24.08■■□□□ 1.44
MSX1-201ENST00000382723 TMEM99Q8N816 258 aa24.08■■□□□ 1.44
MSX1-201ENST00000382723 MIB2Q96AX9 1013 aa24.08■■□□□ 1.44
MSX1-201ENST00000382723 OR51V1Q9H2C8 321 aa24.08■■□□□ 1.44
MSX1-201ENST00000382723 CNOT2Q9NZN8 540 aaKnown RBP24.08■■□□□ 1.44
MSX1-201ENST00000382723 DKK4Q9UBT3 224 aa24.08■■□□□ 1.44
MSX1-201ENST00000382723 AKAP8LQ9ULX6 646 aaKnown RBP eCLIP24.08■■□□□ 1.44
MSX1-201ENST00000382723 FRYQ5TBA9 3013 aa24.08■■□□□ 1.44
MSX1-201ENST00000382723 H0YC42 278 aa24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29 ms