RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000319942.7

RABGGTB-201, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RABGGTB, Length 1,496 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-201ENST00000319942 CBR3O75828 277 aa9.15□□□□□ -0.95
RABGGTB-201ENST00000319942 SLC2A10O95528 541 aa9.15□□□□□ -0.95
RABGGTB-201ENST00000319942 BGLAPP02818 100 aa9.15□□□□□ -0.95
RABGGTB-201ENST00000319942 MASP1P48740 699 aa9.15□□□□□ -0.95
RABGGTB-201ENST00000319942 CLK1P49759 484 aaKnown RBP9.15□□□□□ -0.95
RABGGTB-201ENST00000319942 CTXN1P60606 82 aa9.15□□□□□ -0.95
RABGGTB-201ENST00000319942 RPS7P62081 194 aaKnown RBP9.15□□□□□ -0.95
RABGGTB-201ENST00000319942 AIMP2Q13155 320 aaKnown RBP9.15□□□□□ -0.95
RABGGTB-201ENST00000319942 PON3Q15166 354 aa9.15□□□□□ -0.95
RABGGTB-201ENST00000319942 SPHARQ15513 63 aa9.15□□□□□ -0.95
RABGGTB-201ENST00000319942 KLHL12Q53G59 568 aa9.15□□□□□ -0.95
RABGGTB-201ENST00000319942 EMC4Q5J8M3 183 aa9.15□□□□□ -0.95
RABGGTB-201ENST00000319942 ABHD17BQ5VST6 288 aa9.15□□□□□ -0.95
RABGGTB-201ENST00000319942 PRAMEF20Q5VT98 475 aa9.15□□□□□ -0.95
RABGGTB-201ENST00000319942 FCRLBQ6BAA4 426 aa9.15□□□□□ -0.95
RABGGTB-201ENST00000319942 GPR139Q6DWJ6 353 aa9.15□□□□□ -0.95
RABGGTB-201ENST00000319942 ARSKQ6UWY0 536 aa9.15□□□□□ -0.95
RABGGTB-201ENST00000319942 ZNF367Q7RTV3 350 aa9.15□□□□□ -0.95
RABGGTB-201ENST00000319942 ANKRD13BQ86YJ7 626 aa9.15□□□□□ -0.95
RABGGTB-201ENST00000319942 NANOGP1Q8N7R0 232 aa9.15□□□□□ -0.95
RABGGTB-201ENST00000319942 PSD4Q8NDX1 1056 aa9.15□□□□□ -0.95
RABGGTB-201ENST00000319942 OR2M3Q8NG83 312 aa9.15□□□□□ -0.95
RABGGTB-201ENST00000319942 OR52E2Q8NGJ4 325 aa9.15□□□□□ -0.95
RABGGTB-201ENST00000319942 OR52I1Q8NGK6 324 aa9.15□□□□□ -0.95
RABGGTB-201ENST00000319942 OR1J4Q8NGS1 313 aa9.15□□□□□ -0.95
RABGGTB-201ENST00000319942 OR5J2Q8NH18 312 aa9.15□□□□□ -0.95
RABGGTB-201ENST00000319942 PTP4A1Q93096 173 aa9.15□□□□□ -0.95
RABGGTB-201ENST00000319942 ZBTB8AQ96BR9 441 aa9.15□□□□□ -0.95
RABGGTB-201ENST00000319942 ZNF524Q96C55 264 aa9.15□□□□□ -0.95
RABGGTB-201ENST00000319942 C12orf43Q96C57 262 aaKnown RBP9.15□□□□□ -0.95
RABGGTB-201ENST00000319942 MOGAT1Q96PD6 335 aa9.15□□□□□ -0.95
RABGGTB-201ENST00000319942 GPX7Q96SL4 187 aaPredicted RBP9.15□□□□□ -0.95
RABGGTB-201ENST00000319942 TEAD3Q99594 435 aa9.15□□□□□ -0.95
RABGGTB-201ENST00000319942 FUNDC2Q9BWH2 189 aa9.15□□□□□ -0.95
RABGGTB-201ENST00000319942 MND1Q9BWT6 205 aa9.15□□□□□ -0.95
RABGGTB-201ENST00000319942 TAPBPLQ9BX59 468 aa9.15□□□□□ -0.95
RABGGTB-201ENST00000319942 CXorf56Q9H5V9 222 aa9.15□□□□□ -0.95
RABGGTB-201ENST00000319942 FGF20Q9NP95 211 aaPredicted RBP9.15□□□□□ -0.95
RABGGTB-201ENST00000319942 HINT3Q9NQE9 182 aaKnown RBP9.15□□□□□ -0.95
RABGGTB-201ENST00000319942 PTTG2Q9NZH5 202 aa9.15□□□□□ -0.95
RABGGTB-201ENST00000319942 GRHPRQ9UBQ7 328 aa9.15□□□□□ -0.95
RABGGTB-201ENST00000319942 VDAC3Q9Y277 283 aa9.15□□□□□ -0.95
RABGGTB-201ENST00000319942 CORINQ9Y5Q5 1042 aa9.15□□□□□ -0.95
RABGGTB-201ENST00000319942 A0A0C4DFX4 3053 aa9.14□□□□□ -0.95
RABGGTB-201ENST00000319942 AHCTF1Q8WYP5 2266 aa9.14□□□□□ -0.95
RABGGTB-201ENST00000319942 C17orf51A8MQB3 221 aa9.14□□□□□ -0.95
RABGGTB-201ENST00000319942 CDRT15L2A8MXV6 281 aa9.14□□□□□ -0.95
RABGGTB-201ENST00000319942 MCIDASD6RGH6 385 aa9.14□□□□□ -0.95
RABGGTB-201ENST00000319942 TM4SF5O14894 197 aa9.14□□□□□ -0.95
RABGGTB-201ENST00000319942 MYL12BO14950 172 aa9.14□□□□□ -0.95
RABGGTB-201ENST00000319942 LCKP06239 509 aa9.14□□□□□ -0.95
RABGGTB-201ENST00000319942 HSMCR30P0CW71 290 aa9.14□□□□□ -0.95
RABGGTB-201ENST00000319942 TFPIP10646 304 aa9.14□□□□□ -0.95
RABGGTB-201ENST00000319942 HIST1H1CP16403 213 aaKnown RBP9.14□□□□□ -0.95
RABGGTB-201ENST00000319942 GTF2E2P29084 291 aaKnown RBP9.14□□□□□ -0.95
RABGGTB-201ENST00000319942 NOVA1P51513 510 aaKnown RBP9.14□□□□□ -0.95
RABGGTB-201ENST00000319942 SLC16A1P53985 500 aa9.14□□□□□ -0.95
RABGGTB-201ENST00000319942 ERVK-25P63136 954 aa9.14□□□□□ -0.95
RABGGTB-201ENST00000319942 LTBQ06643 244 aa9.14□□□□□ -0.95
RABGGTB-201ENST00000319942 Q0VFX4 171 aa9.14□□□□□ -0.95
RABGGTB-201ENST00000319942 ATP1A4Q13733 1029 aa9.14□□□□□ -0.95
RABGGTB-201ENST00000319942 MED22Q15528 200 aa9.14□□□□□ -0.95
RABGGTB-201ENST00000319942 SGCBQ16585 318 aa9.14□□□□□ -0.95
RABGGTB-201ENST00000319942 TIMM50Q3ZCQ8 353 aa9.14□□□□□ -0.95
RABGGTB-201ENST00000319942 ARMCX4Q5H9R4 360 aa9.14□□□□□ -0.95
RABGGTB-201ENST00000319942 DCAF10Q5QP82 559 aa9.14□□□□□ -0.95
RABGGTB-201ENST00000319942 ZNF362Q5T0B9 420 aaPredicted RBP9.14□□□□□ -0.95
RABGGTB-201ENST00000319942 P2RY8Q86VZ1 359 aa9.14□□□□□ -0.95
RABGGTB-201ENST00000319942 JAZF1Q86VZ6 243 aa9.14□□□□□ -0.95
RABGGTB-201ENST00000319942 DTX1Q86Y01 620 aa9.14□□□□□ -0.95
RABGGTB-201ENST00000319942 SIRT6Q8N6T7 355 aa9.14□□□□□ -0.95
RABGGTB-201ENST00000319942 FADS6Q8N9I5 356 aa9.14□□□□□ -0.95
RABGGTB-201ENST00000319942 WDSUB1Q8N9V3 476 aa9.14□□□□□ -0.95
RABGGTB-201ENST00000319942 CLEC1AQ8NC01 280 aa9.14□□□□□ -0.95
RABGGTB-201ENST00000319942 OR9Q1Q8NGQ5 310 aa9.14□□□□□ -0.95
RABGGTB-201ENST00000319942 OR4K13Q8NH42 304 aa9.14□□□□□ -0.95
RABGGTB-201ENST00000319942 MFSD8Q8NHS3 518 aa9.14□□□□□ -0.95
RABGGTB-201ENST00000319942 ADAMTS14Q8WXS8 1223 aa9.14□□□□□ -0.95
RABGGTB-201ENST00000319942 MYCBPQ99417 103 aaPredicted RBP9.14□□□□□ -0.95
RABGGTB-201ENST00000319942 MGLLQ99685 303 aa9.14□□□□□ -0.95
RABGGTB-201ENST00000319942 KLHDC3Q9BQ90 382 aa9.14□□□□□ -0.95
RABGGTB-201ENST00000319942 KATNB1Q9BVA0 655 aa9.14□□□□□ -0.95
RABGGTB-201ENST00000319942 OR51V1Q9H2C8 321 aa9.14□□□□□ -0.95
RABGGTB-201ENST00000319942 EXOGQ9Y2C4 368 aaKnown RBP9.14□□□□□ -0.95
RABGGTB-201ENST00000319942 PCDHGB7Q9Y5F8 929 aa9.14□□□□□ -0.95
RABGGTB-201ENST00000319942 KIF26BQ2KJY2 2108 aa9.13□□□□□ -0.95
RABGGTB-201ENST00000319942 LAMA1P25391 3075 aa9.13□□□□□ -0.95
RABGGTB-201ENST00000319942 FAM183AA6NL82 134 aa9.13□□□□□ -0.95
RABGGTB-201ENST00000319942 RNF13O43567 381 aa9.13□□□□□ -0.95
RABGGTB-201ENST00000319942 TRIM3O75382 744 aaPredicted RBP9.13□□□□□ -0.95
RABGGTB-201ENST00000319942 TXNDC12O95881 172 aa9.13□□□□□ -0.95
RABGGTB-201ENST00000319942 TSPAN19P0C672 248 aa9.13□□□□□ -0.95
RABGGTB-201ENST00000319942 ADORA3P0DMS8 318 aa9.13□□□□□ -0.95
RABGGTB-201ENST00000319942 CCL3P10147 92 aa9.13□□□□□ -0.95
RABGGTB-201ENST00000319942 CD36P16671 472 aa9.13□□□□□ -0.95
RABGGTB-201ENST00000319942 AHCYP23526 432 aa9.13□□□□□ -0.95
RABGGTB-201ENST00000319942 ITGA3P26006 1051 aa9.13□□□□□ -0.95
RABGGTB-201ENST00000319942 DPP4P27487 766 aa9.13□□□□□ -0.95
RABGGTB-201ENST00000319942 GRPRP30550 384 aa9.13□□□□□ -0.95
RABGGTB-201ENST00000319942 UQCRC1P31930 480 aa9.13□□□□□ -0.95
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 74.6 ms