RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000075430.11

CTDP1-201, Transcript of CTD phosphatase subunit 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CTDP1, Length 3,538 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDP1-201ENST00000075430 TSEN15Q8WW01 171 aaKnown RBP15.38■□□□□ 0.05
CTDP1-201ENST00000075430 NRIP3Q9NQ35 241 aa15.38■□□□□ 0.05
CTDP1-201ENST00000075430 MRPS2Q9Y399 296 aaKnown RBP15.38■□□□□ 0.05
CTDP1-201ENST00000075430 IFITM5A6NNB3 132 aa15.37■□□□□ 0.05
CTDP1-201ENST00000075430 NFATC1O95644 943 aa15.37■□□□□ 0.05
CTDP1-201ENST00000075430 LUMP51884 338 aaPredicted RBP15.37■□□□□ 0.05
CTDP1-201ENST00000075430 MC2RQ01718 297 aa15.37■□□□□ 0.05
CTDP1-201ENST00000075430 RIN1Q13671 783 aa15.37■□□□□ 0.05
CTDP1-201ENST00000075430 DMKNQ6E0U4 476 aaPredicted RBP15.37■□□□□ 0.05
CTDP1-201ENST00000075430 LEG1Q6P5S2 330 aa15.37■□□□□ 0.05
CTDP1-201ENST00000075430 SLC35D2Q76EJ3 337 aa15.37■□□□□ 0.05
CTDP1-201ENST00000075430 CD163Q86VB7 1156 aa15.37■□□□□ 0.05
CTDP1-201ENST00000075430 LNX2Q8N448 690 aa15.37■□□□□ 0.05
CTDP1-201ENST00000075430 OR2L3Q8NG85 312 aa15.37■□□□□ 0.05
CTDP1-201ENST00000075430 OR6N2Q8NGY6 317 aa15.37■□□□□ 0.05
CTDP1-201ENST00000075430 HAVCR2Q8TDQ0 301 aa15.37■□□□□ 0.05
CTDP1-201ENST00000075430 SLC25A38Q96DW6 304 aa15.37■□□□□ 0.05
CTDP1-201ENST00000075430 AHCYL2Q96HN2 611 aaKnown RBP15.37■□□□□ 0.05
CTDP1-201ENST00000075430 KXD1Q9BQD3 176 aa15.37■□□□□ 0.05
CTDP1-201ENST00000075430 EVA1AQ9H8M9 152 aa15.37■□□□□ 0.05
CTDP1-201ENST00000075430 NCDNQ9UBB6 729 aa15.37■□□□□ 0.05
CTDP1-201ENST00000075430 OR5V1Q9UGF6 321 aa15.37■□□□□ 0.05
CTDP1-201ENST00000075430 ZNF879B4DU55 563 aa15.37■□□□□ 0.05
CTDP1-201ENST00000075430 ATG12O94817 140 aa15.37■□□□□ 0.05
CTDP1-201ENST00000075430 PLGP00747 810 aaPredicted RBP15.37■□□□□ 0.05
CTDP1-201ENST00000075430 EMDP50402 254 aa15.37■□□□□ 0.05
CTDP1-201ENST00000075430 GK2Q14410 553 aaPredicted RBP15.37■□□□□ 0.05
CTDP1-201ENST00000075430 LRRC69Q6ZNQ3 347 aa15.37■□□□□ 0.05
CTDP1-201ENST00000075430 KCTD9Q7L273 389 aa15.37■□□□□ 0.05
CTDP1-201ENST00000075430 LMAN2LQ9H0V9 348 aa15.37■□□□□ 0.05
CTDP1-201ENST00000075430 NPFFR2Q9Y5X5 522 aa15.37■□□□□ 0.05
CTDP1-201ENST00000075430 DENND4CQ5VZ89 1909 aa15.37■□□□□ 0.05
CTDP1-201ENST00000075430 RP1P56715 2156 aa15.37■□□□□ 0.05
CTDP1-201ENST00000075430 F5H5P2 479 aa15.37■□□□□ 0.05
CTDP1-201ENST00000075430 SYT5O00445 386 aa15.37■□□□□ 0.05
CTDP1-201ENST00000075430 PRKAR1BP31321 381 aa15.37■□□□□ 0.05
CTDP1-201ENST00000075430 EFNB2P52799 333 aa15.37■□□□□ 0.05
CTDP1-201ENST00000075430 ART1P52961 327 aa15.37■□□□□ 0.05
CTDP1-201ENST00000075430 TDGQ13569 410 aa15.37■□□□□ 0.05
CTDP1-201ENST00000075430 ZCCHC12Q6PEW1 402 aa15.37■□□□□ 0.05
CTDP1-201ENST00000075430 SFTPA2Q8IWL1 248 aa15.37■□□□□ 0.05
CTDP1-201ENST00000075430 OR52H1Q8NGJ2 320 aa15.37■□□□□ 0.05
CTDP1-201ENST00000075430 OR4C16Q8NGL9 310 aa15.37■□□□□ 0.05
CTDP1-201ENST00000075430 SARGQ9BW04 601 aa15.37■□□□□ 0.05
CTDP1-201ENST00000075430 ZNF416Q9BWM5 594 aa15.37■□□□□ 0.05
CTDP1-201ENST00000075430 RSPH9Q9H1X1 276 aaPredicted RBP15.37■□□□□ 0.05
CTDP1-201ENST00000075430 ABRACLQ9P1F3 81 aa15.37■□□□□ 0.05
CTDP1-201ENST00000075430 SERPINA3P01011 423 aa15.36■□□□□ 0.05
CTDP1-201ENST00000075430 CD3DP04234 171 aa15.36■□□□□ 0.05
CTDP1-201ENST00000075430 NGFRP08138 427 aa15.36■□□□□ 0.05
CTDP1-201ENST00000075430 PRMT2P55345 433 aa15.36■□□□□ 0.05
CTDP1-201ENST00000075430 AP3S2P59780 193 aa15.36■□□□□ 0.05
CTDP1-201ENST00000075430 ZNF542PQ5EBM4 170 aa15.36■□□□□ 0.05
CTDP1-201ENST00000075430 NHLRC3Q5JS37 347 aa15.36■□□□□ 0.05
CTDP1-201ENST00000075430 UBE2NLQ5JXB2 153 aa15.36■□□□□ 0.05
CTDP1-201ENST00000075430 HGDQ93099 445 aa15.36■□□□□ 0.05
CTDP1-201ENST00000075430 SMIM19Q96E16 107 aa15.36■□□□□ 0.05
CTDP1-201ENST00000075430 SLC6A5Q9Y345 797 aa15.36■□□□□ 0.05
CTDP1-201ENST00000075430 LAMA1P25391 3075 aa15.36■□□□□ 0.05
CTDP1-201ENST00000075430 CTNSO60931 367 aa15.36■□□□□ 0.05
CTDP1-201ENST00000075430 TAS2R43P59537 309 aa15.36■□□□□ 0.05
CTDP1-201ENST00000075430 ETFDHQ16134 617 aa15.36■□□□□ 0.05
CTDP1-201ENST00000075430 NRSN1Q8IZ57 195 aa15.36■□□□□ 0.05
CTDP1-201ENST00000075430 PATE1Q8WXA2 126 aa15.36■□□□□ 0.05
CTDP1-201ENST00000075430 FGF13Q92913 245 aa15.36■□□□□ 0.05
CTDP1-201ENST00000075430 SLITRK2Q9H156 845 aa15.36■□□□□ 0.05
CTDP1-201ENST00000075430 WASH6PQ9NQA3 447 aa15.36■□□□□ 0.05
CTDP1-201ENST00000075430 MED17Q9NVC6 651 aa15.36■□□□□ 0.05
CTDP1-201ENST00000075430 NOP16Q9Y3C1 178 aaKnown RBP15.36■□□□□ 0.05
CTDP1-201ENST00000075430 HEATR5AQ86XA9 2040 aa15.36■□□□□ 0.05
CTDP1-201ENST00000075430 C11orf98E9PRG8 122 aa15.35■□□□□ 0.05
CTDP1-201ENST00000075430 VEGFDO43915 354 aa15.35■□□□□ 0.05
CTDP1-201ENST00000075430 EML2O95834 649 aa15.35■□□□□ 0.05
CTDP1-201ENST00000075430 CBR1P16152 277 aa15.35■□□□□ 0.05
CTDP1-201ENST00000075430 ZP3P21754 424 aa15.35■□□□□ 0.05
CTDP1-201ENST00000075430 FRKP42685 505 aaPredicted RBP15.35■□□□□ 0.05
CTDP1-201ENST00000075430 TAS2R20P59543 309 aa15.35■□□□□ 0.05
CTDP1-201ENST00000075430 GMFBP60983 142 aa15.35■□□□□ 0.05
CTDP1-201ENST00000075430 GLDNQ6ZMI3 551 aaPredicted RBP15.35■□□□□ 0.05
CTDP1-201ENST00000075430 ZNF546Q86UE3 836 aa15.35■□□□□ 0.05
CTDP1-201ENST00000075430 PLPP7Q8NBV4 271 aa15.35■□□□□ 0.05
CTDP1-201ENST00000075430 MS4A4EQ96PG1 132 aa15.35■□□□□ 0.05
CTDP1-201ENST00000075430 PCBD2Q9H0N5 130 aa15.35■□□□□ 0.05
CTDP1-201ENST00000075430 C14orf105Q9NVL8 296 aa15.35■□□□□ 0.05
CTDP1-201ENST00000075430 ASF1BQ9NVP2 202 aa15.35■□□□□ 0.05
CTDP1-201ENST00000075430 HPF1Q9NWY4 346 aa15.35■□□□□ 0.05
CTDP1-201ENST00000075430 ST6GALNAC2Q9UJ37 374 aa15.35■□□□□ 0.05
CTDP1-201ENST00000075430 GPR34Q9UPC5 381 aa15.35■□□□□ 0.05
CTDP1-201ENST00000075430 COL4A6Q14031 1691 aa15.35■□□□□ 0.05
CTDP1-201ENST00000075430 FRMPD3Q5JV73 1810 aa15.35■□□□□ 0.05
CTDP1-201ENST00000075430 C13orf42A0A1B0GVH6 325 aa15.35■□□□□ 0.05
CTDP1-201ENST00000075430 DISC1C4P0D8 188 aa15.35■□□□□ 0.05
CTDP1-201ENST00000075430 VAMP1P23763 118 aa15.35■□□□□ 0.05
CTDP1-201ENST00000075430 SLC6A6P31641 620 aa15.35■□□□□ 0.05
CTDP1-201ENST00000075430 RUNX2Q13950 521 aa15.35■□□□□ 0.05
CTDP1-201ENST00000075430 OR7A5Q15622 319 aa15.35■□□□□ 0.05
CTDP1-201ENST00000075430 FAM199XQ6PEV8 388 aaPredicted RBP15.35■□□□□ 0.05
CTDP1-201ENST00000075430 RHOUQ7L0Q8 258 aa15.35■□□□□ 0.05
CTDP1-201ENST00000075430 FOXRED2Q8IWF2 684 aa15.35■□□□□ 0.05
CTDP1-201ENST00000075430 TSNAXQ99598 290 aaKnown RBP15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 78.5 ms