RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000001226.9

Sh3bp1-201, Transcript of SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

TSL 5 BASIC

Gene Sh3bp1, Length 2,510 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Or51e2Q8VBV9 320 aa15.72■□□□□ 0.11
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Satb2Q8VI24 733 aa15.72■□□□□ 0.11
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Vmn1r45Q8VIC7 318 aa15.72■□□□□ 0.11
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Thumpd1Q99J36 350 aaKnown RBP15.72■□□□□ 0.11
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 GpnmbQ99P91 574 aa15.72■□□□□ 0.11
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Hcfc1r1Q9CYQ5 120 aa15.72■□□□□ 0.11
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 PtgfrnQ9WV91 879 aa15.72■□□□□ 0.11
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Saxo1B1AXP3 476 aa15.72■□□□□ 0.11
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 CatsperdE9Q9F6 805 aa15.72■□□□□ 0.11
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Esp36G3UZD8 160 aa15.72■□□□□ 0.11
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Plscr5J3QM92 274 aa15.72■□□□□ 0.11
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Dsg2O55111 1122 aa15.72■□□□□ 0.11
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Ier3P46694 153 aa15.72■□□□□ 0.11
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Pou3f4P62515 361 aa15.72■□□□□ 0.11
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Glycam1Q02596 151 aa15.72■□□□□ 0.11
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Shisa3Q3UPR0 238 aa15.72■□□□□ 0.11
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Grxcr1Q50H32 290 aa15.72■□□□□ 0.11
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Tnfaip3Q60769 775 aa15.72■□□□□ 0.11
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Scgb2b2Q6UGQ3 114 aa15.72■□□□□ 0.11
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Zfp189Q8BKP2 608 aa15.72■□□□□ 0.11
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Hist1h2aaQ8CGP4 129 aa15.72■□□□□ 0.11
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 NifkQ91VE6 317 aaKnown RBP15.72■□□□□ 0.11
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Otud1Q9CUB6 454 aa15.72■□□□□ 0.11
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Adck1Q9D0L4 525 aa15.72■□□□□ 0.11
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 TrioQ0KL02 3102 aa15.72■□□□□ 0.11
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Zdbf2Q5SS00 2493 aaKnown RBP15.71■□□□□ 0.11
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Slc16a5G5E8K6 468 aa15.71■□□□□ 0.11
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Brd7O88665 651 aaKnown RBP15.71■□□□□ 0.11
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Tmco2P0C1V4 183 aa15.71■□□□□ 0.11
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Gnb5P62881 395 aa15.71■□□□□ 0.11
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 ptchd1Q14B62 888 aa15.71■□□□□ 0.11
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Gm45902Q3UDN3 361 aa15.71■□□□□ 0.11
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Lrrn1Q61809 716 aa15.71■□□□□ 0.11
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 B430306N03RikQ6QX36 289 aa15.71■□□□□ 0.11
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Tmem185bQ8R3R5 350 aa15.71■□□□□ 0.11
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Olfr514Q8VFZ6 310 aa15.71■□□□□ 0.11
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Slc7a13Q91WN3 478 aa15.71■□□□□ 0.11
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Mrgpra1Q91WW5 304 aa15.71■□□□□ 0.11
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 HnrnpdlQ9Z130 301 aaKnown RBP15.71■□□□□ 0.11
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Col4a2P08122 1707 aa15.71■□□□□ 0.11
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Nlgn4lB0F2B4 945 aa15.71■□□□□ 0.11
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Gm15446D3Z5Y8 553 aa15.71■□□□□ 0.11
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Dll3O88516 592 aa15.71■□□□□ 0.11
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Fcgr3P08508 261 aa15.71■□□□□ 0.11
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 UoxP25688 303 aa15.71■□□□□ 0.11
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Sult2a1P52843 285 aa15.71■□□□□ 0.11
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Tas2r40Q7TQB8 319 aa15.71■□□□□ 0.11
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Olfr657Q7TRP7 319 aa15.71■□□□□ 0.11
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Q8BPC6 396 aa15.71■□□□□ 0.11
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Ankmy1Q8C0W1 906 aa15.71■□□□□ 0.11
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 RfesdQ8K2P6 157 aa15.71■□□□□ 0.11
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Olfr883Q8VF64 309 aa15.71■□□□□ 0.11
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Oasl1Q8VI94 511 aa15.71■□□□□ 0.11
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Ubox5Q925F4 539 aa15.71■□□□□ 0.11
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 NansQ99J77 359 aa15.71■□□□□ 0.11
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Rnf186Q9D241 226 aa15.71■□□□□ 0.11
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Slc35a4Q9D321 324 aa15.71■□□□□ 0.11
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Slc25a18Q9DB41 320 aa15.71■□□□□ 0.11
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 NfkbiaQ9Z1E3 314 aa15.71■□□□□ 0.11
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Wdr90Q6ZPG2 1874 aa15.71■□□□□ 0.1
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Prss47A0A0N4SVQ0 395 aa15.7■□□□□ 0.1
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Igkv6-20A0A140T8P2 115 aa15.7■□□□□ 0.1
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Gm4924A0A1B0GR71 966 aa15.7■□□□□ 0.1
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Actl10A2AKE7 346 aa15.7■□□□□ 0.1
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Calhm1D3Z291 348 aa15.7■□□□□ 0.1
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Zfp599E9PWP1 548 aa15.7■□□□□ 0.1
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Gm20696H3BJN7 74 aa15.7■□□□□ 0.1
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Pcdh12O55134 1180 aa15.7■□□□□ 0.1
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Cer1O55233 272 aa15.7■□□□□ 0.1
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Cops3O88543 423 aa15.7■□□□□ 0.1
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Msx1P13297 303 aa15.7■□□□□ 0.1
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Tbxa2rP30987 341 aa15.7■□□□□ 0.1
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Mmp2P33434 662 aa15.7■□□□□ 0.1
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 S100a11P50543 98 aaKnown RBP15.7■□□□□ 0.1
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Cdk5r1P61809 307 aa15.7■□□□□ 0.1
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Khdc4Q3TCX3 612 aa15.7■□□□□ 0.1
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Eci3Q78JN3 317 aa15.7■□□□□ 0.1
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Olfr374Q7TRY0 313 aa15.7■□□□□ 0.1
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Slc34a3Q80SU6 601 aa15.7■□□□□ 0.1
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Cpt1cQ8BGD5 798 aa15.7■□□□□ 0.1
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Pamr1Q8BU25 720 aa15.7■□□□□ 0.1
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Plcz1Q8K4D7 647 aa15.7■□□□□ 0.1
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Olfr769Q8K501 312 aa15.7■□□□□ 0.1
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Olfr1079Q8VF52 315 aa15.7■□□□□ 0.1
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Mrgpra5Q91ZC7 304 aa15.7■□□□□ 0.1
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Slc25a36Q922G0 311 aa15.7■□□□□ 0.1
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Gm10762Q9CZN6 115 aa15.7■□□□□ 0.1
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 RgccQ9DBX1 137 aa15.7■□□□□ 0.1
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Dmrt1Q9QZ59 374 aa15.7■□□□□ 0.1
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Bpnt1Q9Z0S1 308 aa15.7■□□□□ 0.1
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Xpr1Q9Z0U0 695 aa15.7■□□□□ 0.1
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Zfp345A2AQA1 561 aa15.7■□□□□ 0.1
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Olfr1095A3KPP7 308 aa15.7■□□□□ 0.1
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Zfp13P10754 512 aa15.7■□□□□ 0.1
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Arpc4P59999 168 aaKnown RBP15.7■□□□□ 0.1
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Arf3P61205 181 aa15.7■□□□□ 0.1
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 St3gal3P97325 374 aa15.7■□□□□ 0.1
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Mansc4Q3UU94 337 aa15.7■□□□□ 0.1
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Olfr332Q5NC45 344 aa15.7■□□□□ 0.1
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Tex261Q62302 196 aa15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 39.3 ms