RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000623495.1

LETMD1-238, Transcript of LETM1 domain containing 1, human

Gene LETMD1, Length 2,948 nt, Biotype TEC.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LETMD1-238	ENST00000623495	LYRM1	O43325	122 aa		6.64	□□□□□ -1.35
LETMD1-238	ENST00000623495	DKK1	O94907	266 aa		6.64	□□□□□ -1.35
LETMD1-238	ENST00000623495	IFNG	P01579	166 aa		6.64	□□□□□ -1.35
LETMD1-238	ENST00000623495	SPP1	P10451	314 aa		6.64	□□□□□ -1.35
LETMD1-238	ENST00000623495	HIST1H1T	P22492	207 aa	Predicted RBP	6.64	□□□□□ -1.35
LETMD1-238	ENST00000623495	GRK5	P34947	590 aa		6.64	□□□□□ -1.35
LETMD1-238	ENST00000623495	CASP6	P55212	293 aa		6.64	□□□□□ -1.35
LETMD1-238	ENST00000623495	OR4D2	P58180	307 aa		6.64	□□□□□ -1.35
LETMD1-238	ENST00000623495	C2orf80	Q0P641	193 aa		6.64	□□□□□ -1.35
LETMD1-238	ENST00000623495	ECH1	Q13011	328 aa		6.64	□□□□□ -1.35
LETMD1-238	ENST00000623495	FCN2	Q15485	313 aa		6.64	□□□□□ -1.35
LETMD1-238	ENST00000623495	ABHD17C	Q6PCB6	329 aa		6.64	□□□□□ -1.35
LETMD1-238	ENST00000623495	RNF44	Q7L0R7	432 aa		6.64	□□□□□ -1.35
LETMD1-238	ENST00000623495	NLRC3	Q7RTR2	1065 aa		6.64	□□□□□ -1.35
LETMD1-238	ENST00000623495	LAX1	Q8IWV1	398 aa		6.64	□□□□□ -1.35
LETMD1-238	ENST00000623495	OR2L5	Q8NG80	312 aa		6.64	□□□□□ -1.35
LETMD1-238	ENST00000623495	ZNF675	Q8TD23	568 aa		6.64	□□□□□ -1.35
LETMD1-238	ENST00000623495	KAT2A	Q92830	837 aa		6.64	□□□□□ -1.35
LETMD1-238	ENST00000623495	UBE2E3	Q969T4	207 aa		6.64	□□□□□ -1.35
LETMD1-238	ENST00000623495	RGMA	Q96B86	450 aa		6.64	□□□□□ -1.35
LETMD1-238	ENST00000623495	MRPS24	Q96EL2	167 aa	Known RBP	6.64	□□□□□ -1.35
LETMD1-238	ENST00000623495	CMTM7	Q96FZ5	175 aa		6.64	□□□□□ -1.35
LETMD1-238	ENST00000623495	YIPF4	Q9BSR8	244 aa		6.64	□□□□□ -1.35
LETMD1-238	ENST00000623495	DDA1	Q9BW61	102 aa		6.64	□□□□□ -1.35
LETMD1-238	ENST00000623495	RAB33B	Q9H082	229 aa		6.64	□□□□□ -1.35
LETMD1-238	ENST00000623495	EML4	Q9HC35	981 aa	Known RBP	6.64	□□□□□ -1.35
LETMD1-238	ENST00000623495	PRTFDC1	Q9NRG1	225 aa		6.64	□□□□□ -1.35
LETMD1-238	ENST00000623495	PADI2	Q9Y2J8	665 aa		6.64	□□□□□ -1.35
LETMD1-238	ENST00000623495	MAGED1	Q9Y5V3	778 aa	Predicted RBP	6.64	□□□□□ -1.35
LETMD1-238	ENST00000623495	SPACA6	W5XKT8	324 aa		6.64	□□□□□ -1.35
LETMD1-238	ENST00000623495	SPTBN1	Q01082	2364 aa	Known RBP	6.64	□□□□□ -1.35
LETMD1-238	ENST00000623495	NSG1	A0A0A6YYJ2	146 aa		6.64	□□□□□ -1.35
LETMD1-238	ENST00000623495	C7orf66	A4D0T2	115 aa		6.64	□□□□□ -1.35
LETMD1-238	ENST00000623495		K7EM74	188 aa		6.64	□□□□□ -1.35
LETMD1-238	ENST00000623495	HRK	O00198	91 aa		6.64	□□□□□ -1.35
LETMD1-238	ENST00000623495	LGALS8	O00214	317 aa		6.64	□□□□□ -1.35
LETMD1-238	ENST00000623495	GNGT2	O14610	69 aa		6.64	□□□□□ -1.35
LETMD1-238	ENST00000623495	ATXN7	O15265	892 aa	Predicted RBP	6.64	□□□□□ -1.35
LETMD1-238	ENST00000623495	GALR3	O60755	368 aa	Predicted RBP	6.64	□□□□□ -1.35
LETMD1-238	ENST00000623495	CST1	P01037	141 aa		6.64	□□□□□ -1.35
LETMD1-238	ENST00000623495	IL3	P08700	152 aa		6.64	□□□□□ -1.35
LETMD1-238	ENST00000623495	TSPAN19	P0C672	248 aa		6.64	□□□□□ -1.35
LETMD1-238	ENST00000623495	EDN3	P14138	238 aa		6.64	□□□□□ -1.35
LETMD1-238	ENST00000623495	NCK1	P16333	377 aa		6.64	□□□□□ -1.35
LETMD1-238	ENST00000623495	HRH2	P25021	359 aa		6.64	□□□□□ -1.35
LETMD1-238	ENST00000623495	KCNJ3	P48549	501 aa		6.64	□□□□□ -1.35
LETMD1-238	ENST00000623495	DIO3	P55073	304 aa		6.64	□□□□□ -1.35
LETMD1-238	ENST00000623495	RAB5B	P61020	215 aa		6.64	□□□□□ -1.35
LETMD1-238	ENST00000623495	DEFA5	Q01523	94 aa		6.64	□□□□□ -1.35
LETMD1-238	ENST00000623495	TGM3	Q08188	693 aa		6.64	□□□□□ -1.35
LETMD1-238	ENST00000623495	MAPKAPK3	Q16644	382 aa		6.64	□□□□□ -1.35
LETMD1-238	ENST00000623495	OR4C11	Q6IEV9	310 aa		6.64	□□□□□ -1.35
LETMD1-238	ENST00000623495	GRHL2	Q6ISB3	625 aa		6.64	□□□□□ -1.35
LETMD1-238	ENST00000623495	FAM198B	Q6UWH4	519 aa		6.64	□□□□□ -1.35
LETMD1-238	ENST00000623495	GDPGP1	Q6ZNW5	385 aa		6.64	□□□□□ -1.35
LETMD1-238	ENST00000623495	AHSA2	Q719I0	299 aa		6.64	□□□□□ -1.35
LETMD1-238	ENST00000623495	ZNF367	Q7RTV3	350 aa		6.64	□□□□□ -1.35
LETMD1-238	ENST00000623495	DPPA2	Q7Z7J5	298 aa		6.64	□□□□□ -1.35
LETMD1-238	ENST00000623495	HMGN2P46	Q86SG4	172 aa		6.64	□□□□□ -1.35
LETMD1-238	ENST00000623495	COMTD1	Q86VU5	262 aa		6.64	□□□□□ -1.35
LETMD1-238	ENST00000623495	ENTHD1	Q8IYW4	607 aa		6.64	□□□□□ -1.35
LETMD1-238	ENST00000623495	PRR22	Q8IZ63	422 aa		6.64	□□□□□ -1.35
LETMD1-238	ENST00000623495	NANOGP1	Q8N7R0	232 aa		6.64	□□□□□ -1.35
LETMD1-238	ENST00000623495	PUM2	Q8TB72	1066 aa	Known RBP eCLIP	6.64	□□□□□ -1.35	1e-7	■■■■■ 28.3
LETMD1-238	ENST00000623495	THOC3	Q96J01	351 aa	Known RBP	6.64	□□□□□ -1.35
LETMD1-238	ENST00000623495	CXorf58	Q96LI9	332 aa		6.64	□□□□□ -1.35
LETMD1-238	ENST00000623495	TRMO	Q9BU70	441 aa		6.64	□□□□□ -1.35
LETMD1-238	ENST00000623495	MS4A8	Q9BY19	250 aa		6.64	□□□□□ -1.35
LETMD1-238	ENST00000623495	EVA1A	Q9H8M9	152 aa		6.64	□□□□□ -1.35
LETMD1-238	ENST00000623495	IL1RL2	Q9HB29	575 aa		6.64	□□□□□ -1.35
LETMD1-238	ENST00000623495	ADAP2	Q9NPF8	381 aa		6.64	□□□□□ -1.35
LETMD1-238	ENST00000623495	RASSF1	Q9NS23	344 aa		6.64	□□□□□ -1.35
LETMD1-238	ENST00000623495	C19orf12	Q9NSK7	152 aa		6.64	□□□□□ -1.35
LETMD1-238	ENST00000623495	PLCXD1	Q9NUJ7	323 aa		6.64	□□□□□ -1.35
LETMD1-238	ENST00000623495	VSX1	Q9NZR4	365 aa	Predicted RBP	6.64	□□□□□ -1.35
LETMD1-238	ENST00000623495	ASH2L	Q9UBL3	628 aa		6.64	□□□□□ -1.35
LETMD1-238	ENST00000623495	SEC14L3	Q9UDX4	400 aa		6.64	□□□□□ -1.35
LETMD1-238	ENST00000623495	SH3BGRL2	Q9UJC5	107 aa		6.64	□□□□□ -1.35
LETMD1-238	ENST00000623495	SCP2D1	Q9UJQ7	156 aa		6.64	□□□□□ -1.35
LETMD1-238	ENST00000623495	ZNF222	Q9UK12	451 aa		6.64	□□□□□ -1.35
LETMD1-238	ENST00000623495	FBXL4	Q9UKA2	621 aa		6.64	□□□□□ -1.35
LETMD1-238	ENST00000623495	FBXL2	Q9UKC9	423 aa		6.64	□□□□□ -1.35
LETMD1-238	ENST00000623495	PCDHB10	Q9UN67	800 aa		6.64	□□□□□ -1.35
LETMD1-238	ENST00000623495		A8MVJ9	347 aa		6.63	□□□□□ -1.35
LETMD1-238	ENST00000623495	GSTA4	O15217	222 aa		6.63	□□□□□ -1.35
LETMD1-238	ENST00000623495	TCAP	O15273	167 aa		6.63	□□□□□ -1.35
LETMD1-238	ENST00000623495	ATG12	O94817	140 aa		6.63	□□□□□ -1.35
LETMD1-238	ENST00000623495	TBX6	O95947	436 aa	Predicted RBP	6.63	□□□□□ -1.35
LETMD1-238	ENST00000623495	LGI1	O95970	557 aa		6.63	□□□□□ -1.35
LETMD1-238	ENST00000623495	IFNA10	P01566	189 aa		6.63	□□□□□ -1.35
LETMD1-238	ENST00000623495	MB	P02144	154 aa		6.63	□□□□□ -1.35
LETMD1-238	ENST00000623495	LPL	P06858	475 aa		6.63	□□□□□ -1.35
LETMD1-238	ENST00000623495	FH	P07954	510 aa		6.63	□□□□□ -1.35
LETMD1-238	ENST00000623495	RNH1	P13489	461 aa	Known RBP	6.63	□□□□□ -1.35
LETMD1-238	ENST00000623495	ACPP	P15309	386 aa		6.63	□□□□□ -1.35
LETMD1-238	ENST00000623495	TMEM11	P17152	192 aa		6.63	□□□□□ -1.35
LETMD1-238	ENST00000623495	NDUFB7	P17568	137 aa		6.63	□□□□□ -1.35
LETMD1-238	ENST00000623495	ZNF10	P21506	573 aa	Predicted RBP	6.63	□□□□□ -1.35
LETMD1-238	ENST00000623495	DNASE1	P24855	282 aa		6.63	□□□□□ -1.35
LETMD1-238	ENST00000623495	SOAT1	P35610	550 aa		6.63	□□□□□ -1.35

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