RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000602861.5

HCG18-248, Transcript of HLA complex group 18, humanhuman

TSL 3

Gene HCG18, Length 372 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCG18-248ENST00000602861 DRD3P35462 400 aa7.3□□□□□ -1.24
HCG18-248ENST00000602861 TSFMP43897 325 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
HCG18-248ENST00000602861 PITPNBP48739 271 aa7.3□□□□□ -1.24
HCG18-248ENST00000602861 PER3P56645 1201 aa7.3□□□□□ -1.24
HCG18-248ENST00000602861 OR10A3P58181 314 aa7.3□□□□□ -1.24
HCG18-248ENST00000602861 EGR3Q06889 387 aa7.3□□□□□ -1.24
HCG18-248ENST00000602861 TRAM1Q15629 374 aa7.3□□□□□ -1.24
HCG18-248ENST00000602861 NTRK2Q16620 822 aa7.3□□□□□ -1.24
HCG18-248ENST00000602861 ESCO2Q56NI9 601 aa7.3□□□□□ -1.24
HCG18-248ENST00000602861 FAM27D1Q5T7N8 215 aa7.3□□□□□ -1.24
HCG18-248ENST00000602861 BCL2L15Q5TBC7 163 aa7.3□□□□□ -1.24
HCG18-248ENST00000602861 GARNL3Q5VVW2 1013 aa7.3□□□□□ -1.24
HCG18-248ENST00000602861 CD276Q5ZPR3 534 aa7.3□□□□□ -1.24
HCG18-248ENST00000602861 BICRALQ6AI39 1079 aa7.3□□□□□ -1.24
HCG18-248ENST00000602861 DMKNQ6E0U4 476 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
HCG18-248ENST00000602861 PYHIN1Q6K0P9 492 aa7.3□□□□□ -1.24
HCG18-248ENST00000602861 SFXN4Q6P4A7 337 aa7.3□□□□□ -1.24
HCG18-248ENST00000602861 ARL9Q6T311 187 aa7.3□□□□□ -1.24
HCG18-248ENST00000602861 DHRS13Q6UX07 377 aa7.3□□□□□ -1.24
HCG18-248ENST00000602861 ASB18Q6ZVZ8 466 aa7.3□□□□□ -1.24
HCG18-248ENST00000602861 RFPL4BQ6ZWI9 263 aa7.3□□□□□ -1.24
HCG18-248ENST00000602861 CMIPQ8IY22 773 aa7.3□□□□□ -1.24
HCG18-248ENST00000602861 LNX2Q8N448 690 aa7.3□□□□□ -1.24
HCG18-248ENST00000602861 RAB42Q8N4Z0 105 aa7.3□□□□□ -1.24
HCG18-248ENST00000602861 SAMD12Q8N8I0 201 aa7.3□□□□□ -1.24
HCG18-248ENST00000602861 SLC16A11Q8NCK7 471 aa7.3□□□□□ -1.24
HCG18-248ENST00000602861 OR2L3Q8NG85 312 aa7.3□□□□□ -1.24
HCG18-248ENST00000602861 OR11H4Q8NGC9 324 aa7.3□□□□□ -1.24
HCG18-248ENST00000602861 OR52E1Q8NGJ3 308 aa7.3□□□□□ -1.24
HCG18-248ENST00000602861 PFN4Q8NHR9 129 aa7.3□□□□□ -1.24
HCG18-248ENST00000602861 ABHD4Q8TB40 342 aa7.3□□□□□ -1.24
HCG18-248ENST00000602861 FANK1Q8TC84 345 aa7.3□□□□□ -1.24
HCG18-248ENST00000602861 HGDQ93099 445 aa7.3□□□□□ -1.24
HCG18-248ENST00000602861 YIPF5Q969M3 257 aa7.3□□□□□ -1.24
HCG18-248ENST00000602861 PGLYRP3Q96LB9 341 aa7.3□□□□□ -1.24
HCG18-248ENST00000602861 HS6ST2Q96MM7 605 aa7.3□□□□□ -1.24
HCG18-248ENST00000602861 MS4A4EQ96PG1 132 aa7.3□□□□□ -1.24
HCG18-248ENST00000602861 TIMM29Q9BSF4 260 aa7.3□□□□□ -1.24
HCG18-248ENST00000602861 RAB11FIP5Q9BXF6 653 aa7.3□□□□□ -1.24
HCG18-248ENST00000602861 DPH1Q9BZG8 443 aa7.3□□□□□ -1.24
HCG18-248ENST00000602861 MED28Q9H204 178 aa7.3□□□□□ -1.24
HCG18-248ENST00000602861 ABCG5Q9H222 651 aa7.3□□□□□ -1.24
HCG18-248ENST00000602861 KCNN2Q9H2S1 579 aa7.3□□□□□ -1.24
HCG18-248ENST00000602861 DPAGT1Q9H3H5 408 aa7.3□□□□□ -1.24
HCG18-248ENST00000602861 ZCCHC4Q9H5U6 513 aa7.3□□□□□ -1.24
HCG18-248ENST00000602861 MTHFD2LQ9H903 347 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
HCG18-248ENST00000602861 PRSS16Q9NQE7 514 aa7.3□□□□□ -1.24
HCG18-248ENST00000602861 SPHK1Q9NYA1 384 aa7.3□□□□□ -1.24
HCG18-248ENST00000602861 NLGN3Q9NZ94 848 aa7.3□□□□□ -1.24
HCG18-248ENST00000602861 PTTG3PQ9NZH4 202 aa7.3□□□□□ -1.24
HCG18-248ENST00000602861 EIF3KQ9UBQ5 218 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
HCG18-248ENST00000602861 ST6GALNAC2Q9UJ37 374 aa7.3□□□□□ -1.24
HCG18-248ENST00000602861 SLC7A7Q9UM01 511 aa7.3□□□□□ -1.24
HCG18-248ENST00000602861 RASD1Q9Y272 281 aa7.3□□□□□ -1.24
HCG18-248ENST00000602861 NUBP2Q9Y5Y2 271 aa7.3□□□□□ -1.24
HCG18-248ENST00000602861 DMXL2Q8TDJ6 3036 aa7.29□□□□□ -1.24
HCG18-248ENST00000602861 TBC1D3KA0A087X1G2 549 aa7.29□□□□□ -1.24
HCG18-248ENST00000602861 LOC105371267A0A1B0GV96 52 aa7.29□□□□□ -1.24
HCG18-248ENST00000602861 A0A1B0GVC2 190 aa7.29□□□□□ -1.24
HCG18-248ENST00000602861 A0A1W2PQ72 361 aa7.29□□□□□ -1.24
HCG18-248ENST00000602861 DAPL1A0PJW8 107 aa7.29□□□□□ -1.24
HCG18-248ENST00000602861 TMEM82A0PJX8 343 aa7.29□□□□□ -1.24
HCG18-248ENST00000602861 GSAPA4D1B5 854 aa7.29□□□□□ -1.24
HCG18-248ENST00000602861 CDHR4A6H8M9 788 aa7.29□□□□□ -1.24
HCG18-248ENST00000602861 TBC1D3FA6NER0 549 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
HCG18-248ENST00000602861 TRABD2BA6NFA1 517 aa7.29□□□□□ -1.24
HCG18-248ENST00000602861 ANKRD61A6NGH8 418 aa7.29□□□□□ -1.24
HCG18-248ENST00000602861 A6NIN4 97 aa7.29□□□□□ -1.24
HCG18-248ENST00000602861 ZNF891A8MT65 544 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
HCG18-248ENST00000602861 GPR89AB7ZAQ6 455 aa7.29□□□□□ -1.24
HCG18-248ENST00000602861 C1QTNF3-AMACRE9PGA6 284 aa7.29□□□□□ -1.24
HCG18-248ENST00000602861 GSTZ1O43708 216 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
HCG18-248ENST00000602861 NOS1APO75052 506 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
HCG18-248ENST00000602861 FZD7O75084 574 aa7.29□□□□□ -1.24
HCG18-248ENST00000602861 PTP4A3O75365 173 aa7.29□□□□□ -1.24
HCG18-248ENST00000602861 REM1O75628 298 aa7.29□□□□□ -1.24
HCG18-248ENST00000602861 SLC22A5O76082 557 aa7.29□□□□□ -1.24
HCG18-248ENST00000602861 MT-ND5P03915 603 aa7.29□□□□□ -1.24
HCG18-248ENST00000602861 RAF1P04049 648 aa7.29□□□□□ -1.24
HCG18-248ENST00000602861 TCRBP04435 133 aa7.29□□□□□ -1.24
HCG18-248ENST00000602861 TPOP07202 933 aa7.29□□□□□ -1.24
HCG18-248ENST00000602861 GPR89BP0CG08 455 aa7.29□□□□□ -1.24
HCG18-248ENST00000602861 SMIM10L1P0DMW3 83 aa7.29□□□□□ -1.24
HCG18-248ENST00000602861 FUT1P19526 365 aa7.29□□□□□ -1.24
HCG18-248ENST00000602861 PTNP21246 168 aa7.29□□□□□ -1.24
HCG18-248ENST00000602861 F8A1P23610 371 aa7.29□□□□□ -1.24
HCG18-248ENST00000602861 STOMP27105 288 aa7.29□□□□□ -1.24
HCG18-248ENST00000602861 NDUFS1P28331 727 aa7.29□□□□□ -1.24
HCG18-248ENST00000602861 MPIP34949 423 aa7.29□□□□□ -1.24
HCG18-248ENST00000602861 ATP6V1E1P36543 226 aa7.29□□□□□ -1.24
HCG18-248ENST00000602861 AP2S1P53680 142 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
HCG18-248ENST00000602861 RAB8AP61006 207 aa7.29□□□□□ -1.24
HCG18-248ENST00000602861 DUSP8Q13202 625 aa7.29□□□□□ -1.24
HCG18-248ENST00000602861 FGL2Q14314 439 aa7.29□□□□□ -1.24
HCG18-248ENST00000602861 IRF4Q15306 451 aa7.29□□□□□ -1.24
HCG18-248ENST00000602861 MAPK14Q16539 360 aa7.29□□□□□ -1.24
HCG18-248ENST00000602861 DUSP5Q16690 384 aa7.29□□□□□ -1.24
HCG18-248ENST00000602861 HSD17B12Q53GQ0 312 aa7.29□□□□□ -1.24
HCG18-248ENST00000602861 EIPR1Q53HC9 387 aa7.29□□□□□ -1.24
HCG18-248ENST00000602861 FHL5Q5TD97 284 aa7.29□□□□□ -1.24
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 54.9 ms