RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588618.5

ACTN4-210, Transcript of actinin alpha 4, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene ACTN4, Length 1,729 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN4-210ENST00000588618 RPL13AP3Q6NVV1 102 aa20.31■□□□□ 0.84
ACTN4-210ENST00000588618 Q6ZPB1 254 aaPredicted RBP20.31■□□□□ 0.84
ACTN4-210ENST00000588618 RASSF6Q6ZTQ3 369 aa20.31■□□□□ 0.84
ACTN4-210ENST00000588618 PARP8Q8N3A8 854 aa20.31■□□□□ 0.84
ACTN4-210ENST00000588618 OR5J2Q8NH18 312 aa20.31■□□□□ 0.84
ACTN4-210ENST00000588618 LIPHQ8WWY8 451 aa20.31■□□□□ 0.84
ACTN4-210ENST00000588618 TIMP4Q99727 224 aa20.31■□□□□ 0.84
ACTN4-210ENST00000588618 TNFRSF10DQ9UBN6 386 aa20.31■□□□□ 0.84
ACTN4-210ENST00000588618 RCBTB2O95199 551 aa20.3■□□□□ 0.84
ACTN4-210ENST00000588618 ASAH2BP0C7U1 165 aa20.3■□□□□ 0.84
ACTN4-210ENST00000588618 POU1F1P28069 291 aa20.3■□□□□ 0.84
ACTN4-210ENST00000588618 SUCLG1P53597 346 aaKnown RBP20.3■□□□□ 0.84
ACTN4-210ENST00000588618 CLDN18P56856 261 aa20.3■□□□□ 0.84
ACTN4-210ENST00000588618 PMS2P3Q13401 168 aa20.3■□□□□ 0.84
ACTN4-210ENST00000588618 ANKDD1AQ495B1 522 aa20.3■□□□□ 0.84
ACTN4-210ENST00000588618 SLC36A3Q495N2 470 aa20.3■□□□□ 0.84
ACTN4-210ENST00000588618 ZBED5Q49AG3 693 aa20.3■□□□□ 0.84
ACTN4-210ENST00000588618 OR52L1Q8NGH7 329 aa20.3■□□□□ 0.84
ACTN4-210ENST00000588618 TEX47Q8TBZ9 253 aa20.3■□□□□ 0.84
ACTN4-210ENST00000588618 SNRNP40Q96DI7 357 aaKnown RBP20.3■□□□□ 0.84
ACTN4-210ENST00000588618 PLA2G12AQ9BZM1 189 aa20.3■□□□□ 0.84
ACTN4-210ENST00000588618 EGLN3Q9H6Z9 239 aa20.3■□□□□ 0.84
ACTN4-210ENST00000588618 PLSCR2Q9NRY7 297 aa20.3■□□□□ 0.84
ACTN4-210ENST00000588618 PAQR5Q9NXK6 330 aaPredicted RBP20.3■□□□□ 0.84
ACTN4-210ENST00000588618 CAMK2AQ9UQM7 478 aa20.3■□□□□ 0.84
ACTN4-210ENST00000588618 A0A1B0GTH9 108 aa20.3■□□□□ 0.84
ACTN4-210ENST00000588618 H0YJX3 145 aa20.3■□□□□ 0.84
ACTN4-210ENST00000588618 M0R082 166 aa20.3■□□□□ 0.84
ACTN4-210ENST00000588618 EIF1BO60739 113 aaKnown RBP20.3■□□□□ 0.84
ACTN4-210ENST00000588618 CLDN15P56746 228 aa20.3■□□□□ 0.84
ACTN4-210ENST00000588618 PRPS1P60891 318 aa20.3■□□□□ 0.84
ACTN4-210ENST00000588618 ESRRGP62508 458 aa20.3■□□□□ 0.84
ACTN4-210ENST00000588618 CTU2Q2VPK5 515 aaKnown RBP20.3■□□□□ 0.84
ACTN4-210ENST00000588618 ZNF620Q6ZNG0 422 aa20.3■□□□□ 0.84
ACTN4-210ENST00000588618 SCAIQ8N9R8 606 aa20.3■□□□□ 0.84
ACTN4-210ENST00000588618 OR8D4Q8NGM9 314 aa20.3■□□□□ 0.84
ACTN4-210ENST00000588618 OR10D3Q8NH80 312 aa20.3■□□□□ 0.84
ACTN4-210ENST00000588618 ZNF417Q8TAU3 575 aa20.3■□□□□ 0.84
ACTN4-210ENST00000588618 OSTF1Q92882 214 aa20.3■□□□□ 0.84
ACTN4-210ENST00000588618 ZNF587Q96SQ5 575 aaPredicted RBP20.3■□□□□ 0.84
ACTN4-210ENST00000588618 ZNF184Q99676 751 aaPredicted RBP20.3■□□□□ 0.84
ACTN4-210ENST00000588618 GABARAPL3Q9BY60 117 aa20.3■□□□□ 0.84
ACTN4-210ENST00000588618 ENKD1Q9H0I2 346 aa20.3■□□□□ 0.84
ACTN4-210ENST00000588618 MRPL39Q9NYK5 338 aaKnown RBP20.3■□□□□ 0.84
ACTN4-210ENST00000588618 CDH10Q9Y6N8 788 aa20.3■□□□□ 0.84
ACTN4-210ENST00000588618 OR14I1A6ND48 311 aa20.29■□□□□ 0.84
ACTN4-210ENST00000588618 NPIPA2E9PIF3 369 aa20.29■□□□□ 0.84
ACTN4-210ENST00000588618 E9PQ18 207 aa20.29■□□□□ 0.84
ACTN4-210ENST00000588618 NPIPA3F8WFD2 350 aa20.29■□□□□ 0.84
ACTN4-210ENST00000588618 DNPH1O43598 174 aa20.29■□□□□ 0.84
ACTN4-210ENST00000588618 PTP4A3O75365 173 aa20.29■□□□□ 0.84
ACTN4-210ENST00000588618 AHCYP23526 432 aa20.29■□□□□ 0.84
ACTN4-210ENST00000588618 RAC3P60763 192 aa20.29■□□□□ 0.84
ACTN4-210ENST00000588618 HSF1Q00613 529 aa20.29■□□□□ 0.84
ACTN4-210ENST00000588618 SMARCD3Q6STE5 483 aa20.29■□□□□ 0.84
ACTN4-210ENST00000588618 PCSK4Q6UW60 755 aa20.29■□□□□ 0.84
ACTN4-210ENST00000588618 PM20D2Q8IYS1 436 aa20.29■□□□□ 0.84
ACTN4-210ENST00000588618 CPNE4Q96A23 557 aaPredicted RBP20.29■□□□□ 0.84
ACTN4-210ENST00000588618 TNFRSF13CQ96RJ3 184 aa20.29■□□□□ 0.84
ACTN4-210ENST00000588618 NAA11Q9BSU3 229 aaPredicted RBP20.29■□□□□ 0.84
ACTN4-210ENST00000588618 OR52D1Q9H346 318 aa20.29■□□□□ 0.84
ACTN4-210ENST00000588618 TBC1D23Q9NUY8 699 aa20.29■□□□□ 0.84
ACTN4-210ENST00000588618 SIGLEC7Q9Y286 467 aa20.29■□□□□ 0.84
ACTN4-210ENST00000588618 B3GALT5Q9Y2C3 310 aa20.29■□□□□ 0.84
ACTN4-210ENST00000588618 SMG1Q96Q15 3661 aaKnown RBP20.29■□□□□ 0.84
ACTN4-210ENST00000588618 CXCL13O43927 109 aa20.28■□□□□ 0.84
ACTN4-210ENST00000588618 AKR7A3O95154 331 aa20.28■□□□□ 0.84
ACTN4-210ENST00000588618 ADORA3P0DMS8 318 aa20.28■□□□□ 0.84
ACTN4-210ENST00000588618 CPN1P15169 458 aa20.28■□□□□ 0.84
ACTN4-210ENST00000588618 HSPA13P48723 471 aa20.28■□□□□ 0.84
ACTN4-210ENST00000588618 RPS4XP62701 263 aaKnown RBP20.28■□□□□ 0.84
ACTN4-210ENST00000588618 NPRL3Q12980 569 aa20.28■□□□□ 0.84
ACTN4-210ENST00000588618 C6orf52Q5T4I8 152 aa20.28■□□□□ 0.84
ACTN4-210ENST00000588618 WLSQ5T9L3 541 aa20.28■□□□□ 0.84
ACTN4-210ENST00000588618 THSD4Q6ZMP0 1018 aa20.28■□□□□ 0.84
ACTN4-210ENST00000588618 H1FNTQ75WM6 255 aaPredicted RBP20.28■□□□□ 0.84
ACTN4-210ENST00000588618 ZNF555Q8NEP9 628 aa20.28■□□□□ 0.84
ACTN4-210ENST00000588618 ADGRG7Q96K78 797 aa20.28■□□□□ 0.84
ACTN4-210ENST00000588618 MCCC2Q9HCC0 563 aa20.28■□□□□ 0.84
ACTN4-210ENST00000588618 CHST11Q9NPF2 352 aa20.28■□□□□ 0.84
ACTN4-210ENST00000588618 IL20RAQ9UHF4 553 aa20.28■□□□□ 0.84
ACTN4-210ENST00000588618 HIF3AQ9Y2N7 669 aa20.28■□□□□ 0.84
ACTN4-210ENST00000588618 ALPK2Q86TB3 2170 aa20.28■□□□□ 0.84
ACTN4-210ENST00000588618 EPG5Q9HCE0 2579 aa20.28■□□□□ 0.84
ACTN4-210ENST00000588618 FZD7O75084 574 aa20.27■□□□□ 0.84
ACTN4-210ENST00000588618 NDUFB2O95178 105 aa20.27■□□□□ 0.84
ACTN4-210ENST00000588618 KLK2P20151 261 aa20.27■□□□□ 0.84
ACTN4-210ENST00000588618 ENPP1P22413 925 aa20.27■□□□□ 0.84
ACTN4-210ENST00000588618 RPL4P36578 427 aaKnown RBP20.27■□□□□ 0.84
ACTN4-210ENST00000588618 ZNF324BQ6AW86 544 aaPredicted RBP20.27■□□□□ 0.84
ACTN4-210ENST00000588618 PAQR6Q6TCH4 344 aa20.27■□□□□ 0.84
ACTN4-210ENST00000588618 CLDN22Q8N7P3 220 aa20.27■□□□□ 0.84
ACTN4-210ENST00000588618 ADI1Q9BV57 179 aa20.27■□□□□ 0.84
ACTN4-210ENST00000588618 TEX12Q9BXU0 123 aa20.27■□□□□ 0.84
ACTN4-210ENST00000588618 GRIP2Q9C0E4 1043 aa20.27■□□□□ 0.84
ACTN4-210ENST00000588618 ASF1BQ9NVP2 202 aa20.27■□□□□ 0.84
ACTN4-210ENST00000588618 IL20Q9NYY1 176 aa20.27■□□□□ 0.84
ACTN4-210ENST00000588618 RNF13O43567 381 aa20.27■□□□□ 0.83
ACTN4-210ENST00000588618 SYNGR4O95473 234 aa20.27■□□□□ 0.83
ACTN4-210ENST00000588618 CRISP1P54107 249 aa20.27■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 54.9 ms