RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000583282.5

GGA3-216, Transcript of golgi associated, gamma adaptin ear containing, ARF binding protein 3, human

TSL 4

Gene GGA3, Length 550 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GGA3-216	ENST00000583282	EEF1E1	O43324	174 aa	Known RBP	12.5	□□□□□ -0.41
GGA3-216	ENST00000583282	OR2T1	O43869	369 aa		12.5	□□□□□ -0.41
GGA3-216	ENST00000583282	EIF1B	O60739	113 aa	Known RBP	12.5	□□□□□ -0.41
GGA3-216	ENST00000583282	CYTIP	O60759	359 aa		12.5	□□□□□ -0.41
GGA3-216	ENST00000583282	LDLR	P01130	860 aa		12.5	□□□□□ -0.41
GGA3-216	ENST00000583282	SAG	P10523	405 aa	Predicted RBP	12.5	□□□□□ -0.41
GGA3-216	ENST00000583282	AGTR1	P30556	359 aa		12.5	□□□□□ -0.41
GGA3-216	ENST00000583282	SMS	P52788	366 aa		12.5	□□□□□ -0.41
GGA3-216	ENST00000583282	IST1	P53990	364 aa		12.5	□□□□□ -0.41
GGA3-216	ENST00000583282	CTBP2	P56545	445 aa		12.5	□□□□□ -0.41
GGA3-216	ENST00000583282	SRSF1	Q07955	248 aa	Known RBP eCLIP	12.5	□□□□□ -0.41
GGA3-216	ENST00000583282	DGCR6	Q14129	220 aa		12.5	□□□□□ -0.41
GGA3-216	ENST00000583282	HSPB2	Q16082	182 aa		12.5	□□□□□ -0.41
GGA3-216	ENST00000583282	OR2T5	Q6IEZ7	315 aa		12.5	□□□□□ -0.41
GGA3-216	ENST00000583282	OR2A2	Q6IF42	318 aa		12.5	□□□□□ -0.41
GGA3-216	ENST00000583282	MBOAT2	Q6ZWT7	520 aa		12.5	□□□□□ -0.41
GGA3-216	ENST00000583282	RRM2B	Q7LG56	351 aa		12.5	□□□□□ -0.41
GGA3-216	ENST00000583282	ZC3HAV1	Q7Z2W4	902 aa	Known RBP	12.5	□□□□□ -0.41
GGA3-216	ENST00000583282	MAMDC2	Q7Z304	686 aa	Predicted RBP	12.5	□□□□□ -0.41
GGA3-216	ENST00000583282	KDM8	Q8N371	416 aa		12.5	□□□□□ -0.41
GGA3-216	ENST00000583282	FAM26E	Q8N5C1	309 aa		12.5	□□□□□ -0.41
GGA3-216	ENST00000583282	LRRC17	Q8N6Y2	441 aa		12.5	□□□□□ -0.41
GGA3-216	ENST00000583282	RELL2	Q8NC24	303 aa	Predicted RBP	12.5	□□□□□ -0.41
GGA3-216	ENST00000583282	OR4K5	Q8NGD3	323 aa		12.5	□□□□□ -0.41
GGA3-216	ENST00000583282	OR9Q2	Q8NGE9	314 aa		12.5	□□□□□ -0.41
GGA3-216	ENST00000583282	OR13C2	Q8NGS9	318 aa		12.5	□□□□□ -0.41
GGA3-216	ENST00000583282	OR2T29	Q8NH02	315 aa		12.5	□□□□□ -0.41
GGA3-216	ENST00000583282	ITLN2	Q8WWU7	325 aa	Predicted RBP	12.5	□□□□□ -0.41
GGA3-216	ENST00000583282	PYDC1	Q8WXC3	89 aa		12.5	□□□□□ -0.41
GGA3-216	ENST00000583282	ZNF775	Q96BV0	537 aa	Predicted RBP	12.5	□□□□□ -0.41
GGA3-216	ENST00000583282	ALPK1	Q96QP1	1244 aa		12.5	□□□□□ -0.41
GGA3-216	ENST00000583282	PSD2	Q9BQI7	771 aa		12.5	□□□□□ -0.41
GGA3-216	ENST00000583282	DENND2D	Q9H6A0	471 aa	Predicted RBP	12.5	□□□□□ -0.41
GGA3-216	ENST00000583282	C12orf49	Q9H741	205 aa		12.5	□□□□□ -0.41
GGA3-216	ENST00000583282	YY1AP1	Q9H869	796 aa		12.5	□□□□□ -0.41
GGA3-216	ENST00000583282	FKRP	Q9H9S5	495 aa		12.5	□□□□□ -0.41
GGA3-216	ENST00000583282	NANS	Q9NR45	359 aa		12.5	□□□□□ -0.41
GGA3-216	ENST00000583282	KLHL9	Q9P2J3	617 aa		12.5	□□□□□ -0.41
GGA3-216	ENST00000583282	EMC9	Q9Y3B6	208 aa		12.5	□□□□□ -0.41
GGA3-216	ENST00000583282	DIDO1	Q9BTC0	2240 aa	Known RBP	12.5	□□□□□ -0.41
GGA3-216	ENST00000583282	SH3PXD2B	A1X283	911 aa		12.49	□□□□□ -0.41
GGA3-216	ENST00000583282	GNGT2	O14610	69 aa		12.49	□□□□□ -0.41
GGA3-216	ENST00000583282	OR10H3	O60404	316 aa		12.49	□□□□□ -0.41
GGA3-216	ENST00000583282	SS18L1	O75177	396 aa	Predicted RBP	12.49	□□□□□ -0.41
GGA3-216	ENST00000583282	E2F6	O75461	281 aa		12.49	□□□□□ -0.41
GGA3-216	ENST00000583282	SMNDC1	O75940	238 aa	Known RBP eCLIP	12.49	□□□□□ -0.41
GGA3-216	ENST00000583282	RCBTB2	O95199	551 aa		12.49	□□□□□ -0.41
GGA3-216	ENST00000583282	MT-ATP6	P00846	226 aa		12.49	□□□□□ -0.41
GGA3-216	ENST00000583282	MAK	P20794	623 aa		12.49	□□□□□ -0.41
GGA3-216	ENST00000583282	CTSS	P25774	331 aa		12.49	□□□□□ -0.41
GGA3-216	ENST00000583282	CEACAM8	P31997	349 aa	Predicted RBP	12.49	□□□□□ -0.41
GGA3-216	ENST00000583282	SMIM11A	P58511	58 aa		12.49	□□□□□ -0.41
GGA3-216	ENST00000583282	ACTR3	P61158	418 aa		12.49	□□□□□ -0.41
GGA3-216	ENST00000583282	PMS2P3	Q13401	168 aa		12.49	□□□□□ -0.41
GGA3-216	ENST00000583282	MFSD13A	Q14CX5	517 aa		12.49	□□□□□ -0.41
GGA3-216	ENST00000583282	RNPS1	Q15287	305 aa	Known RBP	12.49	□□□□□ -0.41
GGA3-216	ENST00000583282	CDSN	Q15517	529 aa		12.49	□□□□□ -0.41
GGA3-216	ENST00000583282	TMEM201	Q5SNT2	666 aa		12.49	□□□□□ -0.41
GGA3-216	ENST00000583282	EEF1A1P5	Q5VTE0	462 aa		12.49	□□□□□ -0.41
GGA3-216	ENST00000583282	MRGPRG	Q86SM5	289 aa		12.49	□□□□□ -0.41
GGA3-216	ENST00000583282	TUSC5	Q8IXB3	177 aa		12.49	□□□□□ -0.41
GGA3-216	ENST00000583282	SLC43A2	Q8N370	569 aa		12.49	□□□□□ -0.41
GGA3-216	ENST00000583282	OR5J2	Q8NH18	312 aa		12.49	□□□□□ -0.41
GGA3-216	ENST00000583282	BPIFA2	Q96DR5	249 aa		12.49	□□□□□ -0.41
GGA3-216	ENST00000583282	GMPPA	Q96IJ6	420 aa	Predicted RBP	12.49	□□□□□ -0.41
GGA3-216	ENST00000583282	ZFP3	Q96NJ6	502 aa		12.49	□□□□□ -0.41
GGA3-216	ENST00000583282	SFXN3	Q9BWM7	321 aa		12.49	□□□□□ -0.41
GGA3-216	ENST00000583282	KRCC1	Q9NPI7	259 aa	Predicted RBP	12.49	□□□□□ -0.41
GGA3-216	ENST00000583282	CCM2L	Q9NUG4	571 aa	Predicted RBP	12.49	□□□□□ -0.41
GGA3-216	ENST00000583282	TMCC3	Q9ULS5	477 aa		12.49	□□□□□ -0.41
GGA3-216	ENST00000583282	CORIN	Q9Y5Q5	1042 aa		12.49	□□□□□ -0.41
GGA3-216	ENST00000583282	PRRC2C	Q9Y520	2896 aa	Known RBP	12.48	□□□□□ -0.41
GGA3-216	ENST00000583282	INTS1	Q8N201	2190 aa	Known RBP	12.48	□□□□□ -0.41
GGA3-216	ENST00000583282	TRAV27	A0A087WT01	109 aa		12.48	□□□□□ -0.41
GGA3-216	ENST00000583282	ZNF716	A6NP11	495 aa		12.48	□□□□□ -0.41
GGA3-216	ENST00000583282	EFCAB9	A8MZ26	197 aa		12.48	□□□□□ -0.41
GGA3-216	ENST00000583282	DVL2	O14641	736 aa		12.48	□□□□□ -0.41
GGA3-216	ENST00000583282	TNFSF13	O75888	250 aa		12.48	□□□□□ -0.41
GGA3-216	ENST00000583282	CCNB2	O95067	398 aa		12.48	□□□□□ -0.41
GGA3-216	ENST00000583282	ADORA3	P0DMS8	318 aa		12.48	□□□□□ -0.41
GGA3-216	ENST00000583282	AHCY	P23526	432 aa		12.48	□□□□□ -0.41
GGA3-216	ENST00000583282	CHRNB4	P30926	498 aa		12.48	□□□□□ -0.41
GGA3-216	ENST00000583282	P2RY4	P51582	365 aa		12.48	□□□□□ -0.41
GGA3-216	ENST00000583282	H3F3A	P84243	136 aa		12.48	□□□□□ -0.41
GGA3-216	ENST00000583282	TMEM225	Q6GV28	225 aa		12.48	□□□□□ -0.41
GGA3-216	ENST00000583282	CASP12	Q6UXS9	341 aa		12.48	□□□□□ -0.41
GGA3-216	ENST00000583282	LUZP2	Q86TE4	346 aa		12.48	□□□□□ -0.41
GGA3-216	ENST00000583282	LIX1L	Q8IVB5	337 aa		12.48	□□□□□ -0.41
GGA3-216	ENST00000583282	SCAI	Q8N9R8	606 aa		12.48	□□□□□ -0.41
GGA3-216	ENST00000583282	OR9K2	Q8NGE7	335 aa		12.48	□□□□□ -0.41
GGA3-216	ENST00000583282	OR4C15	Q8NGM1	316 aa		12.48	□□□□□ -0.41
GGA3-216	ENST00000583282	OR6S1	Q8NH40	331 aa		12.48	□□□□□ -0.41
GGA3-216	ENST00000583282	SSC4D	Q8WTU2	575 aa		12.48	□□□□□ -0.41
GGA3-216	ENST00000583282	CA5BP1	Q8WTZ4	195 aa		12.48	□□□□□ -0.41
GGA3-216	ENST00000583282	FUZ	Q9BT04	418 aa		12.48	□□□□□ -0.41
GGA3-216	ENST00000583282	MRPL39	Q9NYK5	338 aa	Known RBP	12.48	□□□□□ -0.41
GGA3-216	ENST00000583282	EMC3	Q9P0I2	261 aa		12.48	□□□□□ -0.41
GGA3-216	ENST00000583282	ZNF229	Q9UJW7	825 aa		12.48	□□□□□ -0.41
GGA3-216	ENST00000583282	ING1	Q9UK53	422 aa	Predicted RBP	12.48	□□□□□ -0.41
GGA3-216	ENST00000583282	TMEM5	Q9Y2B1	443 aa		12.48	□□□□□ -0.41

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.8 ms