RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000574205.5

CTDNEP1-209, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

TSL 5

Gene CTDNEP1, Length 1,506 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1-209ENST00000574205 C6orf203Q9P0P8 240 aaPredicted RBP29.49■■■□□ 2.31
CTDNEP1-209ENST00000574205 CORINQ9Y5Q5 1042 aa29.49■■■□□ 2.31
CTDNEP1-209ENST00000574205 NKX2-6A6NCS4 301 aa29.48■■■□□ 2.31
CTDNEP1-209ENST00000574205 ZNF716A6NP11 495 aa29.48■■■□□ 2.31
CTDNEP1-209ENST00000574205 ZNF724A8MTY0 619 aa29.48■■■□□ 2.31
CTDNEP1-209ENST00000574205 IGF2P01344 180 aa29.48■■■□□ 2.31
CTDNEP1-209ENST00000574205 MT-ND1P03886 318 aa29.48■■■□□ 2.31
CTDNEP1-209ENST00000574205 FUT4P22083 530 aa29.48■■■□□ 2.31
CTDNEP1-209ENST00000574205 P2RY4P51582 365 aa29.48■■■□□ 2.31
CTDNEP1-209ENST00000574205 SLC16A1P53985 500 aa29.48■■■□□ 2.31
CTDNEP1-209ENST00000574205 UGT2B15P54855 530 aa29.48■■■□□ 2.31
CTDNEP1-209ENST00000574205 C10orf53Q8N6V4 93 aa29.48■■■□□ 2.31
CTDNEP1-209ENST00000574205 MOGAT1Q96PD6 335 aa29.48■■■□□ 2.31
CTDNEP1-209ENST00000574205 EMC3Q9P0I2 261 aa29.48■■■□□ 2.31
CTDNEP1-209ENST00000574205 B3GALT5Q9Y2C3 310 aa29.48■■■□□ 2.31
CTDNEP1-209ENST00000574205 MED31Q9Y3C7 131 aa29.48■■■□□ 2.31
CTDNEP1-209ENST00000574205 DIRAS1O95057 198 aa29.47■■■□□ 2.31
CTDNEP1-209ENST00000574205 VAMP5O95183 116 aa29.47■■■□□ 2.31
CTDNEP1-209ENST00000574205 GRPRP30550 384 aa29.47■■■□□ 2.31
CTDNEP1-209ENST00000574205 LTBQ06643 244 aa29.47■■■□□ 2.31
CTDNEP1-209ENST00000574205 FAM98BQ52LJ0 330 aaKnown RBP29.47■■■□□ 2.31
CTDNEP1-209ENST00000574205 TMEM225Q6GV28 225 aa29.47■■■□□ 2.31
CTDNEP1-209ENST00000574205 PIWIL3Q7Z3Z3 882 aaKnown RBP29.47■■■□□ 2.31
CTDNEP1-209ENST00000574205 BTLAQ7Z6A9 289 aa29.47■■■□□ 2.31
CTDNEP1-209ENST00000574205 SF3B5Q9BWJ5 86 aaKnown RBP29.47■■■□□ 2.31
CTDNEP1-209ENST00000574205 JKAMPQ9P055 326 aa29.47■■■□□ 2.31
CTDNEP1-209ENST00000574205 A0A1W2PRQ8 180 aa29.46■■■□□ 2.31
CTDNEP1-209ENST00000574205 A1L4Q6 167 aa29.46■■■□□ 2.31
CTDNEP1-209ENST00000574205 EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 151 aa29.46■■■□□ 2.31
CTDNEP1-209ENST00000574205 M0R082 166 aa29.46■■■□□ 2.31
CTDNEP1-209ENST00000574205 EEF1E1O43324 174 aaKnown RBP29.46■■■□□ 2.31
CTDNEP1-209ENST00000574205 CLDN1O95832 211 aa29.46■■■□□ 2.31
CTDNEP1-209ENST00000574205 H1F0P07305 194 aaKnown RBP29.46■■■□□ 2.31
CTDNEP1-209ENST00000574205 CD8BP10966 210 aa29.46■■■□□ 2.31
CTDNEP1-209ENST00000574205 CBLP22681 906 aa29.46■■■□□ 2.31
CTDNEP1-209ENST00000574205 MAGEA2P43356 314 aa29.46■■■□□ 2.31
CTDNEP1-209ENST00000574205 CHRNB3Q05901 458 aa29.46■■■□□ 2.31
CTDNEP1-209ENST00000574205 DGCR6Q14129 220 aa29.46■■■□□ 2.31
CTDNEP1-209ENST00000574205 SLC17A1Q14916 467 aa29.46■■■□□ 2.31
CTDNEP1-209ENST00000574205 ZNF74Q16587 644 aa29.46■■■□□ 2.31
CTDNEP1-209ENST00000574205 ZNF417Q8TAU3 575 aa29.46■■■□□ 2.31
CTDNEP1-209ENST00000574205 ZNF347Q96SE7 839 aa29.46■■■□□ 2.31
CTDNEP1-209ENST00000574205 ZNF587Q96SQ5 575 aaPredicted RBP29.46■■■□□ 2.31
CTDNEP1-209ENST00000574205 ASPNQ9BXN1 380 aa29.46■■■□□ 2.31
CTDNEP1-209ENST00000574205 PTPN13Q12923 2485 aa29.46■■■□□ 2.31
CTDNEP1-209ENST00000574205 LRRN3E7EW58 273 aa29.45■■■□□ 2.31
CTDNEP1-209ENST00000574205 GPR171O14626 319 aa29.45■■■□□ 2.31
CTDNEP1-209ENST00000574205 ASCL1P50553 236 aa29.45■■■□□ 2.31
CTDNEP1-209ENST00000574205 H1FNTQ75WM6 255 aaPredicted RBP29.45■■■□□ 2.31
CTDNEP1-209ENST00000574205 MAMDC2Q7Z304 686 aaPredicted RBP29.45■■■□□ 2.31
CTDNEP1-209ENST00000574205 SCAIQ8N9R8 606 aa29.45■■■□□ 2.31
CTDNEP1-209ENST00000574205 PFN4Q8NHR9 129 aa29.45■■■□□ 2.31
CTDNEP1-209ENST00000574205 ACOT11Q8WXI4 607 aaPredicted RBP29.45■■■□□ 2.31
CTDNEP1-209ENST00000574205 DHRS1Q96LJ7 313 aa29.45■■■□□ 2.31
CTDNEP1-209ENST00000574205 FKRPQ9H9S5 495 aa29.45■■■□□ 2.31
CTDNEP1-209ENST00000574205 CHST11Q9NPF2 352 aa29.45■■■□□ 2.31
CTDNEP1-209ENST00000574205 PLSCR4Q9NRQ2 329 aa29.45■■■□□ 2.31
CTDNEP1-209ENST00000574205 PROCRQ9UNN8 238 aa29.45■■■□□ 2.31
CTDNEP1-209ENST00000574205 RASD1Q9Y272 281 aa29.45■■■□□ 2.31
CTDNEP1-209ENST00000574205 ENO4A6NNW6 628 aa29.45■■■□□ 2.3
CTDNEP1-209ENST00000574205 MSTNO14793 375 aa29.45■■■□□ 2.3
CTDNEP1-209ENST00000574205 SMNDC1O75940 238 aaKnown RBP eCLIP29.45■■■□□ 2.3
CTDNEP1-209ENST00000574205 CH25HO95992 272 aa29.45■■■□□ 2.3
CTDNEP1-209ENST00000574205 CGAP01215 116 aa29.45■■■□□ 2.3
CTDNEP1-209ENST00000574205 ADPRHL1Q8NDY3 354 aa29.45■■■□□ 2.3
CTDNEP1-209ENST00000574205 NANSQ9NR45 359 aa29.45■■■□□ 2.3
CTDNEP1-209ENST00000574205 SEC14L4Q9UDX3 406 aa29.45■■■□□ 2.3
CTDNEP1-209ENST00000574205 HTR3EA5X5Y0 456 aa29.44■■■□□ 2.3
CTDNEP1-209ENST00000574205 UMPSP11172 480 aa29.44■■■□□ 2.3
CTDNEP1-209ENST00000574205 TFF3Q07654 80 aa29.44■■■□□ 2.3
CTDNEP1-209ENST00000574205 FBXL19-AS1Q494R0 122 aa29.44■■■□□ 2.3
CTDNEP1-209ENST00000574205 GPAT4Q86UL3 456 aa29.44■■■□□ 2.3
CTDNEP1-209ENST00000574205 SPATA24Q86W54 205 aa29.44■■■□□ 2.3
CTDNEP1-209ENST00000574205 RNF113BQ8IZP6 322 aaKnown RBP29.44■■■□□ 2.3
CTDNEP1-209ENST00000574205 MRPL39Q9NYK5 338 aaKnown RBP29.44■■■□□ 2.3
CTDNEP1-209ENST00000574205 HCFC1P51610 2035 aa29.43■■■□□ 2.3
CTDNEP1-209ENST00000574205 A0A087WUU8 490 aa29.43■■■□□ 2.3
CTDNEP1-209ENST00000574205 NQO1P15559 274 aaKnown RBP29.43■■■□□ 2.3
CTDNEP1-209ENST00000574205 SMIM11AP58511 58 aa29.43■■■□□ 2.3
CTDNEP1-209ENST00000574205 GALNT5Q7Z7M9 940 aa29.43■■■□□ 2.3
CTDNEP1-209ENST00000574205 LUZP2Q86TE4 346 aa29.43■■■□□ 2.3
CTDNEP1-209ENST00000574205 SLC7A13Q8TCU3 470 aa29.43■■■□□ 2.3
CTDNEP1-209ENST00000574205 C20orf141Q9NUB4 165 aa29.43■■■□□ 2.3
CTDNEP1-209ENST00000574205 ZNF229Q9UJW7 825 aa29.43■■■□□ 2.3
CTDNEP1-209ENST00000574205 TESMINQ9Y4I5 508 aa29.43■■■□□ 2.3
CTDNEP1-209ENST00000574205 DHRS12A0PJE2 317 aa29.42■■■□□ 2.3
CTDNEP1-209ENST00000574205 A8MXE2 369 aa29.42■■■□□ 2.3
CTDNEP1-209ENST00000574205 RAP2AP10114 183 aa29.42■■■□□ 2.3
CTDNEP1-209ENST00000574205 HOXB6P17509 224 aaKnown RBP29.42■■■□□ 2.3
CTDNEP1-209ENST00000574205 POU4F3Q15319 338 aa29.42■■■□□ 2.3
CTDNEP1-209ENST00000574205 FGD3Q5JSP0 725 aa29.42■■■□□ 2.3
CTDNEP1-209ENST00000574205 ZNF730Q6ZMV8 503 aa29.42■■■□□ 2.3
CTDNEP1-209ENST00000574205 NUFIP2Q7Z417 695 aaKnown RBP29.42■■■□□ 2.3
CTDNEP1-209ENST00000574205 ADGRG5Q8IZF4 528 aa29.42■■■□□ 2.3
CTDNEP1-209ENST00000574205 ZNF775Q96BV0 537 aaPredicted RBP29.42■■■□□ 2.3
CTDNEP1-209ENST00000574205 SGTBQ96EQ0 304 aa29.42■■■□□ 2.3
CTDNEP1-209ENST00000574205 LRRC46Q96FV0 321 aa29.42■■■□□ 2.3
CTDNEP1-209ENST00000574205 C12orf49Q9H741 205 aa29.42■■■□□ 2.3
CTDNEP1-209ENST00000574205 FLVCR1Q9Y5Y0 555 aa29.42■■■□□ 2.3
CTDNEP1-209ENST00000574205 PRSS44E7EML9 344 aa29.41■■■□□ 2.3
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.1 ms