RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558936.5

RABGGTA-207, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit alpha, humanhuman

TSL 2

Gene RABGGTA, Length 648 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTA-207ENST00000558936 PIN1Q13526 163 aaPredicted RBP11.14□□□□□ -0.63
RABGGTA-207ENST00000558936 FHL1Q13642 323 aa11.14□□□□□ -0.63
RABGGTA-207ENST00000558936 TAB1Q15750 504 aa11.14□□□□□ -0.63
RABGGTA-207ENST00000558936 CYBRD1Q53TN4 286 aa11.14□□□□□ -0.63
RABGGTA-207ENST00000558936 ULK3Q6PHR2 472 aa11.14□□□□□ -0.63
RABGGTA-207ENST00000558936 Q6ZT83 130 aa11.14□□□□□ -0.63
RABGGTA-207ENST00000558936 BEND4Q6ZU67 534 aa11.14□□□□□ -0.63
RABGGTA-207ENST00000558936 SLC46A3Q7Z3Q1 461 aa11.14□□□□□ -0.63
RABGGTA-207ENST00000558936 PATL1Q86TB9 770 aaKnown RBP11.14□□□□□ -0.63
RABGGTA-207ENST00000558936 CARM1Q86X55 608 aa11.14□□□□□ -0.63
RABGGTA-207ENST00000558936 KRT73Q86Y46 540 aa11.14□□□□□ -0.63
RABGGTA-207ENST00000558936 KRTAP1-3Q8IUG1 177 aa11.14□□□□□ -0.63
RABGGTA-207ENST00000558936 RNF148Q8N7C7 305 aa11.14□□□□□ -0.63
RABGGTA-207ENST00000558936 ZNF433Q8N7K0 673 aaPredicted RBP11.14□□□□□ -0.63
RABGGTA-207ENST00000558936 WDR31Q8NA23 367 aa11.14□□□□□ -0.63
RABGGTA-207ENST00000558936 OR2T12Q8NG77 320 aa11.14□□□□□ -0.63
RABGGTA-207ENST00000558936 OR9K2Q8NGE7 335 aa11.14□□□□□ -0.63
RABGGTA-207ENST00000558936 ZNF417Q8TAU3 575 aa11.14□□□□□ -0.63
RABGGTA-207ENST00000558936 ZNF587Q96SQ5 575 aaPredicted RBP11.14□□□□□ -0.63
RABGGTA-207ENST00000558936 SPATA5L1Q9BVQ7 753 aa11.14□□□□□ -0.63
RABGGTA-207ENST00000558936 TRIM2Q9C040 744 aa11.14□□□□□ -0.63
RABGGTA-207ENST00000558936 AMBRA1Q9C0C7 1298 aa11.14□□□□□ -0.63
RABGGTA-207ENST00000558936 ACTR6Q9GZN1 396 aa11.14□□□□□ -0.63
RABGGTA-207ENST00000558936 NELFAQ9H3P2 528 aa11.14□□□□□ -0.63
RABGGTA-207ENST00000558936 DSCAMO60469 2012 aa11.14□□□□□ -0.63
RABGGTA-207ENST00000558936 HIVEP1P15822 2718 aa11.13□□□□□ -0.63
RABGGTA-207ENST00000558936 ELOVL7A1L3X0 281 aa11.13□□□□□ -0.63
RABGGTA-207ENST00000558936 ENO4A6NNW6 628 aa11.13□□□□□ -0.63
RABGGTA-207ENST00000558936 TRAF3IP2O43734 574 aaPredicted RBP11.13□□□□□ -0.63
RABGGTA-207ENST00000558936 UPK3AO75631 287 aa11.13□□□□□ -0.63
RABGGTA-207ENST00000558936 GOSR1O95249 250 aa11.13□□□□□ -0.63
RABGGTA-207ENST00000558936 GPIP06744 558 aa11.13□□□□□ -0.63
RABGGTA-207ENST00000558936 PRDX6P30041 224 aa11.13□□□□□ -0.63
RABGGTA-207ENST00000558936 IST1P53990 364 aa11.13□□□□□ -0.63
RABGGTA-207ENST00000558936 UGT2B15P54855 530 aa11.13□□□□□ -0.63
RABGGTA-207ENST00000558936 COPZ1P61923 177 aa11.13□□□□□ -0.63
RABGGTA-207ENST00000558936 ZNF613Q6PF04 617 aa11.13□□□□□ -0.63
RABGGTA-207ENST00000558936 CPLX4Q7Z7G2 160 aa11.13□□□□□ -0.63
RABGGTA-207ENST00000558936 GALNT5Q7Z7M9 940 aa11.13□□□□□ -0.63
RABGGTA-207ENST00000558936 ANKS4BQ8N8V4 417 aa11.13□□□□□ -0.63
RABGGTA-207ENST00000558936 PCYOX1LQ8NBM8 494 aa11.13□□□□□ -0.63
RABGGTA-207ENST00000558936 NEUROG1Q92886 237 aa11.13□□□□□ -0.63
RABGGTA-207ENST00000558936 TMEM45BQ96B21 275 aa11.13□□□□□ -0.63
RABGGTA-207ENST00000558936 SLC25A36Q96CQ1 311 aa11.13□□□□□ -0.63
RABGGTA-207ENST00000558936 TXNDC15Q96J42 360 aa11.13□□□□□ -0.63
RABGGTA-207ENST00000558936 TACO1Q9BSH4 297 aaKnown RBP11.13□□□□□ -0.63
RABGGTA-207ENST00000558936 TMEM204Q9BSN7 226 aa11.13□□□□□ -0.63
RABGGTA-207ENST00000558936 ARMC7Q9H6L4 198 aa11.13□□□□□ -0.63
RABGGTA-207ENST00000558936 EFCAB1Q9HAE3 211 aa11.13□□□□□ -0.63
RABGGTA-207ENST00000558936 C20orf141Q9NUB4 165 aa11.13□□□□□ -0.63
RABGGTA-207ENST00000558936 GID8Q9NWU2 228 aa11.13□□□□□ -0.63
RABGGTA-207ENST00000558936 ITGB1BP2Q9UKP3 347 aa11.13□□□□□ -0.63
RABGGTA-207ENST00000558936 ARL2BPQ9Y2Y0 163 aa11.13□□□□□ -0.63
RABGGTA-207ENST00000558936 SH3GLB1Q9Y371 365 aa11.13□□□□□ -0.63
RABGGTA-207ENST00000558936 ANK3Q12955 4377 aaKnown RBP11.13□□□□□ -0.63
RABGGTA-207ENST00000558936 MBD3L2BA0A1B0GVZ6 204 aaPredicted RBP11.12□□□□□ -0.63
RABGGTA-207ENST00000558936 A0A1W2PR80 420 aa11.12□□□□□ -0.63
RABGGTA-207ENST00000558936 ZNF503-AS2A6NEH8 195 aa11.12□□□□□ -0.63
RABGGTA-207ENST00000558936 DPRXA6NFQ7 191 aa11.12□□□□□ -0.63
RABGGTA-207ENST00000558936 ELOA3DA6NLF2 546 aaPredicted RBP11.12□□□□□ -0.63
RABGGTA-207ENST00000558936 CXCR6O00574 342 aa11.12□□□□□ -0.63
RABGGTA-207ENST00000558936 CASKO14936 926 aa11.12□□□□□ -0.63
RABGGTA-207ENST00000558936 GGT1P19440 569 aa11.12□□□□□ -0.63
RABGGTA-207ENST00000558936 FUT1P19526 365 aa11.12□□□□□ -0.63
RABGGTA-207ENST00000558936 SELENOWP63302 87 aa11.12□□□□□ -0.63
RABGGTA-207ENST00000558936 ITGADQ13349 1161 aa11.12□□□□□ -0.63
RABGGTA-207ENST00000558936 GABRA6Q16445 453 aa11.12□□□□□ -0.63
RABGGTA-207ENST00000558936 ELOA3BQ3SY89 546 aa11.12□□□□□ -0.63
RABGGTA-207ENST00000558936 FBXW9Q5XUX1 488 aa11.12□□□□□ -0.63
RABGGTA-207ENST00000558936 CBLL1Q75N03 491 aa11.12□□□□□ -0.63
RABGGTA-207ENST00000558936 STK32CQ86UX6 486 aa11.12□□□□□ -0.63
RABGGTA-207ENST00000558936 MEX3DQ86XN8 651 aaKnown RBP11.12□□□□□ -0.63
RABGGTA-207ENST00000558936 SLC30A8Q8IWU4 369 aa11.12□□□□□ -0.63
RABGGTA-207ENST00000558936 ELOA3Q8NG57 546 aa11.12□□□□□ -0.63
RABGGTA-207ENST00000558936 PFN4Q8NHR9 129 aa11.12□□□□□ -0.63
RABGGTA-207ENST00000558936 PIGXQ8TBF5 258 aa11.12□□□□□ -0.63
RABGGTA-207ENST00000558936 DNAJA4Q8WW22 397 aaPredicted RBP11.12□□□□□ -0.63
RABGGTA-207ENST00000558936 SLC47A1Q96FL8 570 aa11.12□□□□□ -0.63
RABGGTA-207ENST00000558936 SH3GL1Q99961 368 aa11.12□□□□□ -0.63
RABGGTA-207ENST00000558936 HOPXQ9BPY8 73 aaPredicted RBP11.12□□□□□ -0.63
RABGGTA-207ENST00000558936 TMEM43Q9BTV4 400 aa11.12□□□□□ -0.63
RABGGTA-207ENST00000558936 MED18Q9BUE0 208 aa11.12□□□□□ -0.63
RABGGTA-207ENST00000558936 ALG2Q9H553 416 aa11.12□□□□□ -0.63
RABGGTA-207ENST00000558936 CACYBPQ9HB71 228 aaKnown RBP11.12□□□□□ -0.63
RABGGTA-207ENST00000558936 TAS2R5Q9NYW4 299 aa11.12□□□□□ -0.63
RABGGTA-207ENST00000558936 MALT1Q9UDY8 824 aa11.12□□□□□ -0.63
RABGGTA-207ENST00000558936 EGFL7Q9UHF1 273 aa11.12□□□□□ -0.63
RABGGTA-207ENST00000558936 ADAM21Q9UKJ8 722 aa11.12□□□□□ -0.63
RABGGTA-207ENST00000558936 SLC7A7Q9UM01 511 aa11.12□□□□□ -0.63
RABGGTA-207ENST00000558936 GPR52Q9Y2T5 361 aa11.12□□□□□ -0.63
RABGGTA-207ENST00000558936 NOSIPQ9Y314 301 aaKnown RBP11.12□□□□□ -0.63
RABGGTA-207ENST00000558936 TRAV36DV7A0A075B6V5 113 aa11.11□□□□□ -0.63
RABGGTA-207ENST00000558936 CHP2O43745 196 aa11.11□□□□□ -0.63
RABGGTA-207ENST00000558936 PIP5K1CO60331 668 aa11.11□□□□□ -0.63
RABGGTA-207ENST00000558936 EIF1BO60739 113 aaKnown RBP11.11□□□□□ -0.63
RABGGTA-207ENST00000558936 SEMG1P04279 462 aa11.11□□□□□ -0.63
RABGGTA-207ENST00000558936 TSPAN19P0C672 248 aa11.11□□□□□ -0.63
RABGGTA-207ENST00000558936 PPP3CBP16298 524 aa11.11□□□□□ -0.63
RABGGTA-207ENST00000558936 YAP1P46937 504 aaKnown RBP11.11□□□□□ -0.63
RABGGTA-207ENST00000558936 ZNF74Q16587 644 aa11.11□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.9 ms