RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000556355.5

SRP54-AS1-203, Transcript of SRP54 antisense RNA 1 (head to head), humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene SRP54-AS1, Length 603 nt, Biotype processed transcript.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRP54-AS1-203ENST00000556355 RNLSQ5VYX0 342 aa3.36□□□□□ -1.87
SRP54-AS1-203ENST00000556355 WDR74Q6RFH5 385 aaPredicted RBP3.36□□□□□ -1.87
SRP54-AS1-203ENST00000556355 ACOT7LQ6ZUV0 252 aa3.36□□□□□ -1.87
SRP54-AS1-203ENST00000556355 BZW1Q7L1Q6 419 aaKnown RBP3.36□□□□□ -1.87
SRP54-AS1-203ENST00000556355 FTMTQ8N4E7 242 aa3.36□□□□□ -1.87
SRP54-AS1-203ENST00000556355 KIRREL3-AS3Q8N7Y1 241 aaPredicted RBP3.36□□□□□ -1.87
SRP54-AS1-203ENST00000556355 OR2L3Q8NG85 312 aa3.36□□□□□ -1.87
SRP54-AS1-203ENST00000556355 OR4C5Q8NGB2 326 aa3.36□□□□□ -1.87
SRP54-AS1-203ENST00000556355 OR56B4Q8NH76 319 aa3.36□□□□□ -1.87
SRP54-AS1-203ENST00000556355 RHOXF1Q8NHV9 184 aa3.36□□□□□ -1.87
SRP54-AS1-203ENST00000556355 FAM81AQ8TBF8 368 aa3.36□□□□□ -1.87
SRP54-AS1-203ENST00000556355 SLC22A8Q8TCC7 542 aa3.36□□□□□ -1.87
SRP54-AS1-203ENST00000556355 UFD1Q92890 307 aa3.36□□□□□ -1.87
SRP54-AS1-203ENST00000556355 TBRG4Q969Z0 631 aaKnown RBP eCLIP3.36□□□□□ -1.875e-7■■■■□ 23.5
SRP54-AS1-203ENST00000556355 GAL3ST1Q99999 423 aa3.36□□□□□ -1.87
SRP54-AS1-203ENST00000556355 ILKAPQ9H0C8 392 aaPredicted RBP3.36□□□□□ -1.87
SRP54-AS1-203ENST00000556355 NARFLQ9H6Q4 476 aa3.36□□□□□ -1.87
SRP54-AS1-203ENST00000556355 THUMPD1Q9NXG2 353 aaKnown RBP3.36□□□□□ -1.87
SRP54-AS1-203ENST00000556355 SH3TC1Q8TE82 1336 aa3.36□□□□□ -1.87
SRP54-AS1-203ENST00000556355 PLCH2O75038 1416 aa3.36□□□□□ -1.87
SRP54-AS1-203ENST00000556355 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP3.35□□□□□ -1.87
SRP54-AS1-203ENST00000556355 KDM5CP41229 1560 aa3.35□□□□□ -1.87
SRP54-AS1-203ENST00000556355 NEURL4Q96JN8 1562 aa3.35□□□□□ -1.87
SRP54-AS1-203ENST00000556355 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP3.35□□□□□ -1.87
SRP54-AS1-203ENST00000556355 PREX2Q70Z35 1606 aa3.35□□□□□ -1.87
SRP54-AS1-203ENST00000556355 IGLV8-61A0A075B6I0 122 aa3.35□□□□□ -1.87
SRP54-AS1-203ENST00000556355 A0A087WWV3 80 aa3.35□□□□□ -1.87
SRP54-AS1-203ENST00000556355 OR5B21A6NL26 309 aa3.35□□□□□ -1.87
SRP54-AS1-203ENST00000556355 KRTAP16-1A8MUX0 517 aa3.35□□□□□ -1.87
SRP54-AS1-203ENST00000556355 WRBO00258 174 aa3.35□□□□□ -1.87
SRP54-AS1-203ENST00000556355 TOM1O60784 492 aa3.35□□□□□ -1.87
SRP54-AS1-203ENST00000556355 LGI1O95970 557 aa3.35□□□□□ -1.87
SRP54-AS1-203ENST00000556355 MMP1P03956 469 aa3.35□□□□□ -1.87
SRP54-AS1-203ENST00000556355 IGLL1P15814 213 aa3.35□□□□□ -1.87
SRP54-AS1-203ENST00000556355 GDF1P27539 372 aa3.35□□□□□ -1.87
SRP54-AS1-203ENST00000556355 HTR1FP30939 366 aa3.35□□□□□ -1.87
SRP54-AS1-203ENST00000556355 PRKAR2BP31323 418 aa3.35□□□□□ -1.87
SRP54-AS1-203ENST00000556355 HSD17B2P37059 387 aa3.35□□□□□ -1.87
SRP54-AS1-203ENST00000556355 DDOSTP39656 456 aa3.35□□□□□ -1.87
SRP54-AS1-203ENST00000556355 PTGDSP41222 190 aa3.35□□□□□ -1.87
SRP54-AS1-203ENST00000556355 C21orf59P57076 290 aa3.35□□□□□ -1.87
SRP54-AS1-203ENST00000556355 RGS8P57771 180 aaPredicted RBP3.35□□□□□ -1.87
SRP54-AS1-203ENST00000556355 LMO4P61968 165 aa3.35□□□□□ -1.87
SRP54-AS1-203ENST00000556355 TLE4Q04727 773 aa3.35□□□□□ -1.87
SRP54-AS1-203ENST00000556355 ENPEPQ07075 957 aa3.35□□□□□ -1.87
SRP54-AS1-203ENST00000556355 BCL2L1Q07817 233 aa3.35□□□□□ -1.87
SRP54-AS1-203ENST00000556355 TGM3Q08188 693 aa3.35□□□□□ -1.87
SRP54-AS1-203ENST00000556355 SCRN3Q0VDG4 424 aa3.35□□□□□ -1.87
SRP54-AS1-203ENST00000556355 OR5I1Q13606 314 aa3.35□□□□□ -1.87
SRP54-AS1-203ENST00000556355 IL18Q14116 193 aa3.35□□□□□ -1.87
SRP54-AS1-203ENST00000556355 GRB7Q14451 532 aa3.35□□□□□ -1.87
SRP54-AS1-203ENST00000556355 ZNF77Q15935 545 aa3.35□□□□□ -1.87
SRP54-AS1-203ENST00000556355 LPAL2Q16609 132 aa3.35□□□□□ -1.87
SRP54-AS1-203ENST00000556355 AANATQ16613 207 aa3.35□□□□□ -1.87
SRP54-AS1-203ENST00000556355 Q1RN00 199 aa3.35□□□□□ -1.87
SRP54-AS1-203ENST00000556355 MICBQ29980 383 aa3.35□□□□□ -1.87
SRP54-AS1-203ENST00000556355 GSG1Q2KHT4 349 aa3.35□□□□□ -1.87
SRP54-AS1-203ENST00000556355 SBK1Q52WX2 424 aa3.35□□□□□ -1.87
SRP54-AS1-203ENST00000556355 OR2B11Q5JQS5 317 aa3.35□□□□□ -1.87
SRP54-AS1-203ENST00000556355 LRRC66Q68CR7 880 aa3.35□□□□□ -1.87
SRP54-AS1-203ENST00000556355 OR52E8Q6IFG1 317 aa3.35□□□□□ -1.87
SRP54-AS1-203ENST00000556355 FRA10AC1Q70Z53 315 aa3.35□□□□□ -1.87
SRP54-AS1-203ENST00000556355 PGAP1Q75T13 922 aa3.35□□□□□ -1.87
SRP54-AS1-203ENST00000556355 GTSCR1Q86UQ5 136 aa3.35□□□□□ -1.87
SRP54-AS1-203ENST00000556355 C17orf82Q86X59 251 aaPredicted RBP3.35□□□□□ -1.87
SRP54-AS1-203ENST00000556355 ERI1Q8IV48 349 aaKnown RBP3.35□□□□□ -1.87
SRP54-AS1-203ENST00000556355 SKA3Q8IX90 412 aa3.35□□□□□ -1.87
SRP54-AS1-203ENST00000556355 GPR65Q8IYL9 337 aa3.35□□□□□ -1.87
SRP54-AS1-203ENST00000556355 OR9A1PQ8NGU1 263 aa3.35□□□□□ -1.87
SRP54-AS1-203ENST00000556355 ANKRD49Q8WVL7 239 aa3.35□□□□□ -1.87
SRP54-AS1-203ENST00000556355 HAVCR1Q96D42 359 aa3.35□□□□□ -1.87
SRP54-AS1-203ENST00000556355 PAGE5Q96GU1 130 aa3.35□□□□□ -1.87
SRP54-AS1-203ENST00000556355 PLEKHA8Q96JA3 519 aa3.35□□□□□ -1.87
SRP54-AS1-203ENST00000556355 C1orf147Q96MC9 270 aaPredicted RBP3.35□□□□□ -1.87
SRP54-AS1-203ENST00000556355 SIGLEC12Q96PQ1 595 aa3.35□□□□□ -1.87
SRP54-AS1-203ENST00000556355 PANX2Q96RD6 677 aa3.35□□□□□ -1.87
SRP54-AS1-203ENST00000556355 RANBP9Q96S59 729 aa3.35□□□□□ -1.87
SRP54-AS1-203ENST00000556355 TBX15Q96SF7 602 aa3.35□□□□□ -1.87
SRP54-AS1-203ENST00000556355 PYGO2Q9BRQ0 406 aa3.35□□□□□ -1.87
SRP54-AS1-203ENST00000556355 FOLH1BQ9HBA9 442 aa3.35□□□□□ -1.87
SRP54-AS1-203ENST00000556355 PAK5Q9P286 719 aa3.35□□□□□ -1.87
SRP54-AS1-203ENST00000556355 ABCC1P33527 1531 aa3.34□□□□□ -1.87
SRP54-AS1-203ENST00000556355 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa3.34□□□□□ -1.87
SRP54-AS1-203ENST00000556355 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP3.34□□□□□ -1.87
SRP54-AS1-203ENST00000556355 MROH2AA6NES4 1674 aa3.34□□□□□ -1.87
SRP54-AS1-203ENST00000556355 IGHV7-81A0A0B4J1V7 117 aa3.34□□□□□ -1.87
SRP54-AS1-203ENST00000556355 H0YIV9 168 aa3.34□□□□□ -1.87
SRP54-AS1-203ENST00000556355 DCTN6O00399 190 aa3.34□□□□□ -1.87
SRP54-AS1-203ENST00000556355 CDX4O14627 284 aaPredicted RBP3.34□□□□□ -1.87
SRP54-AS1-203ENST00000556355 DNALI1O14645 258 aaPredicted RBP3.34□□□□□ -1.87
SRP54-AS1-203ENST00000556355 HSD17B6O14756 317 aa3.34□□□□□ -1.87
SRP54-AS1-203ENST00000556355 LSM1O15116 133 aaKnown RBP3.34□□□□□ -1.87
SRP54-AS1-203ENST00000556355 PSTPIP1O43586 416 aa3.34□□□□□ -1.87
SRP54-AS1-203ENST00000556355 ZNF354AO60765 605 aaPredicted RBP3.34□□□□□ -1.87
SRP54-AS1-203ENST00000556355 CDH16O75309 829 aa3.34□□□□□ -1.87
SRP54-AS1-203ENST00000556355 LYPLA1O75608 230 aaPredicted RBP3.34□□□□□ -1.87
SRP54-AS1-203ENST00000556355 TMEM50AO95807 157 aa3.34□□□□□ -1.87
SRP54-AS1-203ENST00000556355 KRT6AP02538 564 aa3.34□□□□□ -1.87
SRP54-AS1-203ENST00000556355 FTH1P02794 183 aa3.34□□□□□ -1.87
SRP54-AS1-203ENST00000556355 P04436 131 aa3.34□□□□□ -1.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37 ms