RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000535976.1

CLIP1-AS1-201, CLIP1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene CLIP1-AS1, Length 1,745 nt, Biotype lincRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 CDH2P19022 906 aaPredicted RBP5.13□□□□□ -1.59
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 TBXA2RP21731 343 aa5.13□□□□□ -1.59
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 ABCD3P28288 659 aa5.13□□□□□ -1.59
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 IFNGR2P38484 337 aa5.13□□□□□ -1.59
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 CASRP41180 1078 aa5.13□□□□□ -1.59
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 OR1E2P47887 323 aa5.13□□□□□ -1.59
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 FOXL2P58012 376 aa5.13□□□□□ -1.59
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 FUT5Q11128 374 aa5.13□□□□□ -1.59
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 AIMP2Q13155 320 aaKnown RBP5.13□□□□□ -1.59
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 ZNF141Q15928 474 aa5.13□□□□□ -1.59
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 MEP1AQ16819 746 aa5.13□□□□□ -1.59
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 LRRC36Q1X8D7 754 aa5.13□□□□□ -1.59
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 C2orf76Q3KRA6 126 aa5.13□□□□□ -1.59
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 FAM76BQ5HYJ3 339 aa5.13□□□□□ -1.59
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 SAPCD1Q5SSQ6 148 aa5.13□□□□□ -1.59
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 THEM4Q5T1C6 240 aa5.13□□□□□ -1.59
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 PDZK1Q5T2W1 519 aa5.13□□□□□ -1.59
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 KIRREL2Q6UWL6 708 aa5.13□□□□□ -1.59
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 ZNF836Q6ZNA1 936 aa5.13□□□□□ -1.59
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 PPP1R32Q7Z5V6 425 aa5.13□□□□□ -1.59
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 RPS19BP1Q86WX3 136 aaKnown RBP5.13□□□□□ -1.59
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 MISPQ8IVT2 679 aa5.13□□□□□ -1.59
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 PM20D2Q8IYS1 436 aa5.13□□□□□ -1.59
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 PRR22Q8IZ63 422 aa5.13□□□□□ -1.59
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 APCDD1LQ8NCL9 501 aa5.13□□□□□ -1.59
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 SLC24A4Q8NFF2 622 aa5.13□□□□□ -1.59
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 OR4N2Q8NGD1 307 aa5.13□□□□□ -1.59
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 PHOSPHO1Q8TCT1 267 aa5.13□□□□□ -1.59
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 PHF10Q8WUB8 498 aaKnown RBP5.13□□□□□ -1.59
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 THAP4Q8WY91 577 aa5.13□□□□□ -1.59
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 FBXW5Q969U6 566 aa5.13□□□□□ -1.59
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 FAM122AQ96E09 287 aa5.13□□□□□ -1.59
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 C1GALT1C1Q96EU7 318 aa5.13□□□□□ -1.59
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 THOC3Q96J01 351 aaKnown RBP5.13□□□□□ -1.59
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 IMMP1LQ96LU5 166 aa5.13□□□□□ -1.59
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 ZNF300Q96RE9 604 aaPredicted RBP5.13□□□□□ -1.59
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 WDR77Q9BQA1 342 aaPredicted RBP5.13□□□□□ -1.59
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 GPR61Q9BZJ8 451 aa5.13□□□□□ -1.59
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 Q9H521 79 aa5.13□□□□□ -1.59
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 CDCP1Q9H5V8 836 aa5.13□□□□□ -1.59
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 ZNF556Q9HAH1 456 aa5.13□□□□□ -1.59
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 VCX3AQ9NNX9 186 aa5.13□□□□□ -1.59
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 AGPAT4Q9NRZ5 378 aa5.13□□□□□ -1.59
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 SNTG1Q9NSN8 517 aa5.13□□□□□ -1.59
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 RHBDL2Q9NX52 303 aa5.13□□□□□ -1.59
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 MYOTQ9UBF9 498 aa5.13□□□□□ -1.59
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 FBXL4Q9UKA2 621 aa5.13□□□□□ -1.59
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 SAMHD1Q9Y3Z3 626 aaKnown RBP5.13□□□□□ -1.59
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 PCNX3Q9H6A9 2034 aa5.13□□□□□ -1.59
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 DSPPQ9NZW4 1301 aa5.13□□□□□ -1.59
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 AHCTF1Q8WYP5 2266 aa5.12□□□□□ -1.59
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 NPIPA5A0A0B4J1W7 369 aa5.12□□□□□ -1.59
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 A0A1W2PPW3 197 aa5.12□□□□□ -1.59
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 A0A1W2PQD3 144 aa5.12□□□□□ -1.59
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 SAC3D1A6NKF1 404 aa5.12□□□□□ -1.59
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 NPIPA7E9PJI5 369 aa5.12□□□□□ -1.59
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 EIF4E2O60573 245 aaKnown RBP5.12□□□□□ -1.59
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 TSPAN2O60636 221 aa5.12□□□□□ -1.59
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 DPM1O60762 260 aa5.12□□□□□ -1.59
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 SEMA7AO75326 666 aa5.12□□□□□ -1.59
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 ITGA10O75578 1167 aa5.12□□□□□ -1.59
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 NUDT14O95848 222 aa5.12□□□□□ -1.59
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 SERPINA7P05543 415 aa5.12□□□□□ -1.59
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 H1F0P07305 194 aaKnown RBP5.12□□□□□ -1.59
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 FREM3P0C091 2139 aa5.12□□□□□ -1.59
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 HSMCR30P0CW71 290 aa5.12□□□□□ -1.59
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 NPIPA8P0DM63 369 aa5.12□□□□□ -1.59
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 GAAP10253 952 aa5.12□□□□□ -1.59
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 CYP4B1P13584 511 aa5.12□□□□□ -1.59
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 LIFP15018 202 aa5.12□□□□□ -1.59
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 FPR1P21462 350 aa5.12□□□□□ -1.59
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 RPS4Y1P22090 263 aaKnown RBP5.12□□□□□ -1.59
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 CTSSP25774 331 aa5.12□□□□□ -1.59
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 ITGA3P26006 1051 aa5.12□□□□□ -1.59
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 MAGEA2P43356 314 aa5.12□□□□□ -1.59
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 YAP1P46937 504 aaKnown RBP5.12□□□□□ -1.59
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 SLC6A8P48029 635 aa5.12□□□□□ -1.59
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 EFNA3P52797 238 aa5.12□□□□□ -1.59
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 CDH12P55289 794 aa5.12□□□□□ -1.59
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 GMFBP60983 142 aa5.12□□□□□ -1.59
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 VLDLRP98155 873 aa5.12□□□□□ -1.59
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 MVKQ03426 396 aa5.12□□□□□ -1.59
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 ST3GAL3Q11203 375 aa5.12□□□□□ -1.59
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 FGFBP1Q14512 234 aa5.12□□□□□ -1.59
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 MAPK11Q15759 364 aa5.12□□□□□ -1.59
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 NRF1Q16656 503 aa5.12□□□□□ -1.59
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 FGD3Q5JSP0 725 aa5.12□□□□□ -1.59
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 COLEC12Q5KU26 742 aa5.12□□□□□ -1.59
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 DCST1Q5T197 706 aa5.12□□□□□ -1.59
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 MRPL2Q5T653 305 aaKnown RBP5.12□□□□□ -1.59
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 LPCAT4Q643R3 524 aa5.12□□□□□ -1.59
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 TCTN3Q6NUS6 607 aa5.12□□□□□ -1.59
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 ISLR2Q6UXK2 745 aa5.12□□□□□ -1.59
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 OLIG3Q7RTU3 272 aa5.12□□□□□ -1.59
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 HMGN2P46Q86SG4 172 aa5.12□□□□□ -1.59
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 MRGPREQ86SM8 312 aa5.12□□□□□ -1.59
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 TPRA1Q86W33 373 aa5.12□□□□□ -1.59
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 MARCH9Q86YJ5 346 aa5.12□□□□□ -1.59
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 GPALPP1Q8IXQ4 340 aa5.12□□□□□ -1.59
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 CDK20Q8IZL9 346 aa5.12□□□□□ -1.59
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 62.1 ms