RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533686.5

PACSIN3-210, Transcript of protein kinase C and casein kinase substrate in neurons 3, humanhuman

TSL 3

Gene PACSIN3, Length 443 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3-210ENST00000533686 YES1P07947 543 aa14.66□□□□□ -0.06
PACSIN3-210ENST00000533686 PTNP21246 168 aa14.66□□□□□ -0.06
PACSIN3-210ENST00000533686 GRPRP30550 384 aa14.66□□□□□ -0.06
PACSIN3-210ENST00000533686 CTBP2P56545 445 aa14.66□□□□□ -0.06
PACSIN3-210ENST00000533686 ZSCAN26Q16670 478 aa14.66□□□□□ -0.06
PACSIN3-210ENST00000533686 SLC25A35Q3KQZ1 300 aa14.66□□□□□ -0.06
PACSIN3-210ENST00000533686 MBOAT2Q6ZWT7 520 aa14.66□□□□□ -0.06
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PACSIN3-210ENST00000533686 MAMDC2Q7Z304 686 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
PACSIN3-210ENST00000533686 LIX1LQ8IVB5 337 aa14.66□□□□□ -0.06
PACSIN3-210ENST00000533686 CCDC103Q8IW40 242 aa14.66□□□□□ -0.06
PACSIN3-210ENST00000533686 C10orf53Q8N6V4 93 aa14.66□□□□□ -0.06
PACSIN3-210ENST00000533686 PAPD5Q8NDF8 572 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
PACSIN3-210ENST00000533686 PFN4Q8NHR9 129 aa14.66□□□□□ -0.06
PACSIN3-210ENST00000533686 LIPHQ8WWY8 451 aa14.66□□□□□ -0.06
PACSIN3-210ENST00000533686 MOGAT1Q96PD6 335 aa14.66□□□□□ -0.06
PACSIN3-210ENST00000533686 FUZQ9BT04 418 aa14.66□□□□□ -0.06
PACSIN3-210ENST00000533686 CHID1Q9BWS9 393 aa14.66□□□□□ -0.06
PACSIN3-210ENST00000533686 ASPNQ9BXN1 380 aa14.66□□□□□ -0.06
PACSIN3-210ENST00000533686 PIGMQ9H3S5 423 aa14.66□□□□□ -0.06
PACSIN3-210ENST00000533686 CCM2LQ9NUG4 571 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
PACSIN3-210ENST00000533686 MRPL39Q9NYK5 338 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
PACSIN3-210ENST00000533686 ZNF229Q9UJW7 825 aa14.66□□□□□ -0.06
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PACSIN3-210ENST00000533686 RASD1Q9Y272 281 aa14.66□□□□□ -0.06
PACSIN3-210ENST00000533686 TESMINQ9Y4I5 508 aa14.66□□□□□ -0.06
PACSIN3-210ENST00000533686 DOCK7Q96N67 2140 aa14.65□□□□□ -0.06
PACSIN3-210ENST00000533686 USP9XQ93008 2570 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
PACSIN3-210ENST00000533686 LOC102725191A0A1B0GVB3 256 aa14.65□□□□□ -0.06
PACSIN3-210ENST00000533686 ENO4A6NNW6 628 aa14.65□□□□□ -0.06
PACSIN3-210ENST00000533686 M0R082 166 aa14.65□□□□□ -0.06
PACSIN3-210ENST00000533686 KPNA4O00629 521 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
PACSIN3-210ENST00000533686 GPR171O14626 319 aa14.65□□□□□ -0.06
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PACSIN3-210ENST00000533686 CH25HO95992 272 aa14.65□□□□□ -0.06
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PACSIN3-210ENST00000533686 SPIBQ01892 262 aa14.65□□□□□ -0.06
PACSIN3-210ENST00000533686 PRKCDQ05655 676 aa14.65□□□□□ -0.06
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PACSIN3-210ENST00000533686 SLC17A1Q14916 467 aa14.65□□□□□ -0.06
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PACSIN3-210ENST00000533686 TMEM201Q5SNT2 666 aa14.65□□□□□ -0.06
PACSIN3-210ENST00000533686 TMEM225Q6GV28 225 aa14.65□□□□□ -0.06
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PACSIN3-210ENST00000533686 ZNF730Q6ZMV8 503 aa14.65□□□□□ -0.06
PACSIN3-210ENST00000533686 TUSC5Q8IXB3 177 aa14.65□□□□□ -0.06
PACSIN3-210ENST00000533686 OR6K3Q8NGY3 331 aa14.65□□□□□ -0.06
PACSIN3-210ENST00000533686 OR5J2Q8NH18 312 aa14.65□□□□□ -0.06
PACSIN3-210ENST00000533686 ZNF417Q8TAU3 575 aa14.65□□□□□ -0.06
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PACSIN3-210ENST00000533686 DUS3LQ96G46 650 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
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PACSIN3-210ENST00000533686 ZNF587Q96SQ5 575 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
PACSIN3-210ENST00000533686 YY1AP1Q9H869 796 aa14.65□□□□□ -0.06
PACSIN3-210ENST00000533686 CHST11Q9NPF2 352 aa14.65□□□□□ -0.06
PACSIN3-210ENST00000533686 NANSQ9NR45 359 aa14.65□□□□□ -0.06
PACSIN3-210ENST00000533686 EMC3Q9P0I2 261 aa14.65□□□□□ -0.06
PACSIN3-210ENST00000533686 CLEC4AQ9UMR7 237 aa14.65□□□□□ -0.06
PACSIN3-210ENST00000533686 PCNX1Q96RV3 2341 aa14.64□□□□□ -0.07
PACSIN3-210ENST00000533686 TRBV4-1A0A0J9YWV2 114 aa14.64□□□□□ -0.07
PACSIN3-210ENST00000533686 LRRN3E7EW58 273 aa14.64□□□□□ -0.07
PACSIN3-210ENST00000533686 OR7A10O76100 309 aa14.64□□□□□ -0.07
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PACSIN3-210ENST00000533686 AGTR1P30556 359 aa14.64□□□□□ -0.07
PACSIN3-210ENST00000533686 CCNIQ14094 377 aa14.64□□□□□ -0.07
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PACSIN3-210ENST00000533686 OR2T5Q6IEZ7 315 aa14.64□□□□□ -0.07
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PACSIN3-210ENST00000533686 RELL2Q8NC24 303 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
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PACSIN3-210ENST00000533686 BPIFA2Q96DR5 249 aa14.64□□□□□ -0.07
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PACSIN3-210ENST00000533686 DOPEY1Q5JWR5 2465 aa14.63□□□□□ -0.07
PACSIN3-210ENST00000533686 MPDZO75970 2070 aa14.63□□□□□ -0.07
PACSIN3-210ENST00000533686 SH3PXD2BA1X283 911 aa14.63□□□□□ -0.07
PACSIN3-210ENST00000533686 PLPP3O14495 311 aa14.63□□□□□ -0.07
PACSIN3-210ENST00000533686 MSTNO14793 375 aa14.63□□□□□ -0.07
PACSIN3-210ENST00000533686 PIP5K1CO60331 668 aa14.63□□□□□ -0.07
PACSIN3-210ENST00000533686 FKBP6O75344 327 aa14.63□□□□□ -0.07
PACSIN3-210ENST00000533686 CGAP01215 116 aa14.63□□□□□ -0.07
PACSIN3-210ENST00000533686 HIST1H2ABP04908 130 aa14.63□□□□□ -0.07
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