RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000521941.1

CTNNA1-231, Transcript of catenin alpha 1, human

TSL 3

Gene CTNNA1, Length 224 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CTNNA1-231	ENST00000521941	TSPYL5	Q86VY4	417 aa	Predicted RBP	7.4	□□□□□ -1.22
CTNNA1-231	ENST00000521941	GABRG1	Q8N1C3	465 aa		7.4	□□□□□ -1.22
CTNNA1-231	ENST00000521941	MFSD8	Q8NHS3	518 aa		7.4	□□□□□ -1.22
CTNNA1-231	ENST00000521941	FAM162A	Q96A26	154 aa		7.4	□□□□□ -1.22
CTNNA1-231	ENST00000521941	LRRC37B	Q96QE4	947 aa		7.4	□□□□□ -1.22
CTNNA1-231	ENST00000521941	CCT8L2	Q96SF2	557 aa		7.4	□□□□□ -1.22
CTNNA1-231	ENST00000521941	EPYC	Q99645	322 aa		7.4	□□□□□ -1.22
CTNNA1-231	ENST00000521941	HOPX	Q9BPY8	73 aa	Predicted RBP	7.4	□□□□□ -1.22
CTNNA1-231	ENST00000521941	EVA1A	Q9H8M9	152 aa		7.4	□□□□□ -1.22
CTNNA1-231	ENST00000521941	C12orf10	Q9HB07	376 aa		7.4	□□□□□ -1.22
CTNNA1-231	ENST00000521941	ARL8B	Q9NVJ2	186 aa		7.4	□□□□□ -1.22
CTNNA1-231	ENST00000521941	EGFL7	Q9UHF1	273 aa		7.4	□□□□□ -1.22
CTNNA1-231	ENST00000521941	BAG5	Q9UL15	447 aa		7.4	□□□□□ -1.22
CTNNA1-231	ENST00000521941	PLEKHA6	Q9Y2H5	1048 aa		7.4	□□□□□ -1.22
CTNNA1-231	ENST00000521941	NOTCH2	Q04721	2471 aa		7.39	□□□□□ -1.23
CTNNA1-231	ENST00000521941	MBD3L2B	A0A1B0GVZ6	204 aa	Predicted RBP	7.39	□□□□□ -1.23
CTNNA1-231	ENST00000521941		A0A1W2PPR1	153 aa		7.39	□□□□□ -1.23
CTNNA1-231	ENST00000521941		A0A1W2PR80	420 aa		7.39	□□□□□ -1.23
CTNNA1-231	ENST00000521941	TRAPPC13	A5PLN9	417 aa		7.39	□□□□□ -1.23
CTNNA1-231	ENST00000521941	FTCDNL1	E5RQL4	147 aa		7.39	□□□□□ -1.23
CTNNA1-231	ENST00000521941	C11orf98	E9PRG8	122 aa		7.39	□□□□□ -1.23
CTNNA1-231	ENST00000521941	OR2T1	O43869	369 aa		7.39	□□□□□ -1.23
CTNNA1-231	ENST00000521941	FMO6P	O60774	539 aa		7.39	□□□□□ -1.23
CTNNA1-231	ENST00000521941	KRT33A	O76009	404 aa		7.39	□□□□□ -1.23
CTNNA1-231	ENST00000521941	SERPINA1	P01009	418 aa		7.39	□□□□□ -1.23
CTNNA1-231	ENST00000521941	THY1	P04216	161 aa		7.39	□□□□□ -1.23
CTNNA1-231	ENST00000521941	THBD	P07204	575 aa		7.39	□□□□□ -1.23
CTNNA1-231	ENST00000521941	UMPS	P11172	480 aa		7.39	□□□□□ -1.23
CTNNA1-231	ENST00000521941	ZNF43	P17038	809 aa		7.39	□□□□□ -1.23
CTNNA1-231	ENST00000521941	CRYGS	P22914	178 aa		7.39	□□□□□ -1.23
CTNNA1-231	ENST00000521941	YAP1	P46937	504 aa	Known RBP	7.39	□□□□□ -1.23
CTNNA1-231	ENST00000521941	SELENOP	P49908	381 aa		7.39	□□□□□ -1.23
CTNNA1-231	ENST00000521941	FOXG1	P55316	489 aa	Predicted RBP	7.39	□□□□□ -1.23
CTNNA1-231	ENST00000521941	CLDN17	P56750	224 aa		7.39	□□□□□ -1.23
CTNNA1-231	ENST00000521941	LGALS3BP	Q08380	585 aa		7.39	□□□□□ -1.23
CTNNA1-231	ENST00000521941	ITGAD	Q13349	1161 aa		7.39	□□□□□ -1.23
CTNNA1-231	ENST00000521941	C1D	Q13901	141 aa	Known RBP	7.39	□□□□□ -1.23
CTNNA1-231	ENST00000521941	DAZAP2	Q15038	168 aa	Predicted RBP	7.39	□□□□□ -1.23
CTNNA1-231	ENST00000521941	TSPO2	Q5TGU0	170 aa		7.39	□□□□□ -1.23
CTNNA1-231	ENST00000521941	FBXW9	Q5XUX1	488 aa		7.39	□□□□□ -1.23
CTNNA1-231	ENST00000521941	C8orf82	Q6P1X6	216 aa	Predicted RBP	7.39	□□□□□ -1.23
CTNNA1-231	ENST00000521941	ZNF613	Q6PF04	617 aa		7.39	□□□□□ -1.23
CTNNA1-231	ENST00000521941	TTC33	Q6PID6	262 aa	Predicted RBP	7.39	□□□□□ -1.23
CTNNA1-231	ENST00000521941	C5orf46	Q6UWT4	87 aa		7.39	□□□□□ -1.23
CTNNA1-231	ENST00000521941	HACD2	Q6Y1H2	254 aa		7.39	□□□□□ -1.23
CTNNA1-231	ENST00000521941	PIGW	Q7Z7B1	504 aa		7.39	□□□□□ -1.23
CTNNA1-231	ENST00000521941	VTCN1	Q7Z7D3	282 aa		7.39	□□□□□ -1.23
CTNNA1-231	ENST00000521941	FAM156A	Q8NDB6	213 aa		7.39	□□□□□ -1.23
CTNNA1-231	ENST00000521941	STEAP2	Q8NFT2	490 aa		7.39	□□□□□ -1.23
CTNNA1-231	ENST00000521941	LZIC	Q8WZA0	190 aa		7.39	□□□□□ -1.23
CTNNA1-231	ENST00000521941	SLC41A3	Q96GZ6	507 aa		7.39	□□□□□ -1.23
CTNNA1-231	ENST00000521941	MOGAT1	Q96PD6	335 aa		7.39	□□□□□ -1.23
CTNNA1-231	ENST00000521941	ALKBH3	Q96Q83	286 aa	Predicted RBP	7.39	□□□□□ -1.23
CTNNA1-231	ENST00000521941	HS3ST6	Q96QI5	342 aa		7.39	□□□□□ -1.23
CTNNA1-231	ENST00000521941	ASPN	Q9BXN1	380 aa		7.39	□□□□□ -1.23
CTNNA1-231	ENST00000521941	UBTD1	Q9HAC8	227 aa		7.39	□□□□□ -1.23
CTNNA1-231	ENST00000521941	SPAG4	Q9NPE6	437 aa		7.39	□□□□□ -1.23
CTNNA1-231	ENST00000521941	SLC7A10	Q9NS82	523 aa		7.39	□□□□□ -1.23
CTNNA1-231	ENST00000521941	ASB6	Q9NWX5	421 aa		7.39	□□□□□ -1.23
CTNNA1-231	ENST00000521941	TAGLN3	Q9UI15	199 aa		7.39	□□□□□ -1.23
CTNNA1-231	ENST00000521941	RASD1	Q9Y272	281 aa		7.39	□□□□□ -1.23
CTNNA1-231	ENST00000521941	AP3M1	Q9Y2T2	418 aa		7.39	□□□□□ -1.23
CTNNA1-231	ENST00000521941	GPR52	Q9Y2T5	361 aa		7.39	□□□□□ -1.23
CTNNA1-231	ENST00000521941		V9GYQ6	96 aa		7.39	□□□□□ -1.23
CTNNA1-231	ENST00000521941	CSMD1	Q96PZ7	3565 aa		7.39	□□□□□ -1.23
CTNNA1-231	ENST00000521941	ITPR2	Q14571	2701 aa		7.38	□□□□□ -1.23
CTNNA1-231	ENST00000521941	PRR14L	Q5THK1	2151 aa		7.38	□□□□□ -1.23
CTNNA1-231	ENST00000521941	FAM221A	A4D161	298 aa		7.38	□□□□□ -1.23
CTNNA1-231	ENST00000521941	ENO4	A6NNW6	628 aa		7.38	□□□□□ -1.23
CTNNA1-231	ENST00000521941	DEFB108A	A8MXU0	73 aa		7.38	□□□□□ -1.23
CTNNA1-231	ENST00000521941		J3KTA2	159 aa		7.38	□□□□□ -1.23
CTNNA1-231	ENST00000521941	CH25H	O95992	272 aa		7.38	□□□□□ -1.23
CTNNA1-231	ENST00000521941	BGLAP	P02818	100 aa		7.38	□□□□□ -1.23
CTNNA1-231	ENST00000521941	ITGA5	P08648	1049 aa		7.38	□□□□□ -1.23
CTNNA1-231	ENST00000521941	PPP3CB	P16298	524 aa		7.38	□□□□□ -1.23
CTNNA1-231	ENST00000521941	GGT1	P19440	569 aa		7.38	□□□□□ -1.23
CTNNA1-231	ENST00000521941	COX5A	P20674	150 aa		7.38	□□□□□ -1.23
CTNNA1-231	ENST00000521941	AHCY	P23526	432 aa		7.38	□□□□□ -1.23
CTNNA1-231	ENST00000521941	P2RY4	P51582	365 aa		7.38	□□□□□ -1.23
CTNNA1-231	ENST00000521941	SLC25A3	Q00325	362 aa		7.38	□□□□□ -1.23
CTNNA1-231	ENST00000521941	POU3F1	Q03052	451 aa	Predicted RBP	7.38	□□□□□ -1.23
CTNNA1-231	ENST00000521941	LTB	Q06643	244 aa		7.38	□□□□□ -1.23
CTNNA1-231	ENST00000521941	PMS2P3	Q13401	168 aa		7.38	□□□□□ -1.23
CTNNA1-231	ENST00000521941	PIN1	Q13526	163 aa	Predicted RBP	7.38	□□□□□ -1.23
CTNNA1-231	ENST00000521941	TAB1	Q15750	504 aa		7.38	□□□□□ -1.23
CTNNA1-231	ENST00000521941	SWT1	Q5T5J6	900 aa	Known RBP	7.38	□□□□□ -1.23
CTNNA1-231	ENST00000521941	GKAP1	Q5VSY0	366 aa	Predicted RBP	7.38	□□□□□ -1.23
CTNNA1-231	ENST00000521941	CARD17	Q5XLA6	110 aa		7.38	□□□□□ -1.23
CTNNA1-231	ENST00000521941	CREB3L2	Q70SY1	520 aa		7.38	□□□□□ -1.23
CTNNA1-231	ENST00000521941	FKBP9P1	Q75LS8	142 aa		7.38	□□□□□ -1.23
CTNNA1-231	ENST00000521941	NKAIN4	Q8IVV8	208 aa		7.38	□□□□□ -1.23
CTNNA1-231	ENST00000521941	ZNF433	Q8N7K0	673 aa	Predicted RBP	7.38	□□□□□ -1.23
CTNNA1-231	ENST00000521941	CCDC197	Q8NCU1	140 aa		7.38	□□□□□ -1.23
CTNNA1-231	ENST00000521941	RBM15B	Q8NDT2	890 aa	Known RBP	7.38	□□□□□ -1.23
CTNNA1-231	ENST00000521941	OR52N5	Q8NH56	324 aa		7.38	□□□□□ -1.23
CTNNA1-231	ENST00000521941	PFN4	Q8NHR9	129 aa		7.38	□□□□□ -1.23
CTNNA1-231	ENST00000521941	TMEM255B	Q8WV15	326 aa		7.38	□□□□□ -1.23
CTNNA1-231	ENST00000521941	PLPPR2	Q96GM1	343 aa		7.38	□□□□□ -1.23
CTNNA1-231	ENST00000521941	HSH2D	Q96JZ2	352 aa		7.38	□□□□□ -1.23
CTNNA1-231	ENST00000521941	TMEM43	Q9BTV4	400 aa		7.38	□□□□□ -1.23

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