RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492723.1

TOM1-216, Transcript of target of myb1 membrane trafficking protein, humanhuman

TSL 2

Gene TOM1, Length 2,568 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOM1-216ENST00000492723 AP3S1Q92572 193 aa15.22■□□□□ 0.03
TOM1-216ENST00000492723 HIST1H2ACQ93077 130 aa15.22■□□□□ 0.03
TOM1-216ENST00000492723 TP53INP1Q96A56 240 aa15.22■□□□□ 0.03
TOM1-216ENST00000492723 GTPBP2Q9BX10 602 aaKnown RBP15.22■□□□□ 0.03
TOM1-216ENST00000492723 POLHQ9Y253 713 aa15.22■□□□□ 0.03
TOM1-216ENST00000492723 SHISA3A0PJX4 238 aa15.21■□□□□ 0.03
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TOM1-216ENST00000492723 SLC35F2Q8IXU6 374 aa15.21■□□□□ 0.03
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TOM1-216ENST00000492723 C14orf119Q9NWQ9 140 aa15.21■□□□□ 0.03
TOM1-216ENST00000492723 NOX1Q9Y5S8 564 aa15.21■□□□□ 0.03
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TOM1-216ENST00000492723 SLC25A12O75746 678 aa15.21■□□□□ 0.02
TOM1-216ENST00000492723 HNRNPCP07910 306 aaKnown RBP eCLIP15.21■□□□□ 0.02
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TOM1-216ENST00000492723 CRB3Q9BUF7 120 aa15.21■□□□□ 0.02
TOM1-216ENST00000492723 WDR70Q9NW82 654 aa15.21■□□□□ 0.02
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TOM1-216ENST00000492723 FAM171A2A8MVW0 826 aa15.2■□□□□ 0.02
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TOM1-216ENST00000492723 ZNF354AO60765 605 aaPredicted RBP15.2■□□□□ 0.02
TOM1-216ENST00000492723 SNX4O95219 450 aa15.2■□□□□ 0.02
TOM1-216ENST00000492723 CER1O95813 267 aa15.2■□□□□ 0.02
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TOM1-216ENST00000492723 GRHPRQ9UBQ7 328 aa15.2■□□□□ 0.02
TOM1-216ENST00000492723 A0A0C4DFX4 3053 aa15.2■□□□□ 0.02
TOM1-216ENST00000492723 MEN1O00255 615 aa15.2■□□□□ 0.02
TOM1-216ENST00000492723 GAAP10253 952 aa15.2■□□□□ 0.02
TOM1-216ENST00000492723 ZMAT1Q5H9K5 638 aa15.2■□□□□ 0.02
TOM1-216ENST00000492723 SLC35D3Q5M8T2 416 aa15.2■□□□□ 0.02
TOM1-216ENST00000492723 CEP76Q8TAP6 659 aa15.2■□□□□ 0.02
TOM1-216ENST00000492723 SNX33Q8WV41 574 aa15.2■□□□□ 0.02
TOM1-216ENST00000492723 HTRA1Q92743 480 aa15.2■□□□□ 0.02
TOM1-216ENST00000492723 PPP1R14BQ96C90 147 aa15.2■□□□□ 0.02
TOM1-216ENST00000492723 SPSB2Q99619 263 aa15.2■□□□□ 0.02
TOM1-216ENST00000492723 WDR77Q9BQA1 342 aaPredicted RBP15.2■□□□□ 0.02
TOM1-216ENST00000492723 CCDC32Q9BV29 185 aa15.2■□□□□ 0.02
TOM1-216ENST00000492723 AKIRIN1Q9H9L7 192 aaPredicted RBP15.2■□□□□ 0.02
TOM1-216ENST00000492723 COMMD3Q9UBI1 195 aa15.2■□□□□ 0.02
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TOM1-216ENST00000492723 EFR3AQ14156 821 aa15.19■□□□□ 0.02
TOM1-216ENST00000492723 LPAL2Q16609 132 aa15.19■□□□□ 0.02
TOM1-216ENST00000492723 ZNF800Q2TB10 664 aaPredicted RBP eCLIP15.19■□□□□ 0.02
TOM1-216ENST00000492723 NUP54Q7Z3B4 507 aa15.19■□□□□ 0.02
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TOM1-216ENST00000492723 GPR119Q8TDV5 335 aa15.19■□□□□ 0.02
TOM1-216ENST00000492723 RELTQ969Z4 430 aa15.19■□□□□ 0.02
TOM1-216ENST00000492723 SLC25A36Q96CQ1 311 aa15.19■□□□□ 0.02
TOM1-216ENST00000492723 TSSK2Q96PF2 358 aa15.19■□□□□ 0.02
TOM1-216ENST00000492723 TECTAO75443 2155 aa15.19■□□□□ 0.02
TOM1-216ENST00000492723 TMED7-TICAM2A0A0A6YYA0 188 aa15.19■□□□□ 0.02
TOM1-216ENST00000492723 C2orf72A6NCS6 295 aa15.19■□□□□ 0.02
TOM1-216ENST00000492723 D6RAR5 112 aa15.19■□□□□ 0.02
TOM1-216ENST00000492723 SUSD5O60279 629 aa15.19■□□□□ 0.02
TOM1-216ENST00000492723 CPNE3O75131 537 aaKnown RBP15.19■□□□□ 0.02
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