RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486889.1

CTPS1-210, Transcript of CTP synthase 1, humanhuman

TSL 2

Gene CTPS1, Length 568 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1-210ENST00000486889 CHST11Q9NPF2 352 aa8.75□□□□□ -1.01
CTPS1-210ENST00000486889 KRT84Q9NSB2 600 aa8.75□□□□□ -1.01
CTPS1-210ENST00000486889 SPRR3Q9UBC9 169 aa8.75□□□□□ -1.01
CTPS1-210ENST00000486889 BAIAP2Q9UQB8 552 aa8.75□□□□□ -1.01
CTPS1-210ENST00000486889 IGSF10Q6WRI0 2623 aa8.75□□□□□ -1.01
CTPS1-210ENST00000486889 BAHCC1Q9P281 2608 aa8.75□□□□□ -1.01
CTPS1-210ENST00000486889 ATRXP46100 2492 aa8.75□□□□□ -1.01
CTPS1-210ENST00000486889 A0A1W2PNR3 127 aa8.74□□□□□ -1.01
CTPS1-210ENST00000486889 AQP7P3A6NL99 342 aa8.74□□□□□ -1.01
CTPS1-210ENST00000486889 ZNF726A6NNF4 738 aa8.74□□□□□ -1.01
CTPS1-210ENST00000486889 CLCA1A8K7I4 914 aa8.74□□□□□ -1.01
CTPS1-210ENST00000486889 E9PLN8 166 aa8.74□□□□□ -1.01
CTPS1-210ENST00000486889 XKRYO14609 159 aa8.74□□□□□ -1.01
CTPS1-210ENST00000486889 NPIPB7O75200 414 aa8.74□□□□□ -1.01
CTPS1-210ENST00000486889 KRT33AO76009 404 aa8.74□□□□□ -1.01
CTPS1-210ENST00000486889 NDUFB2O95178 105 aa8.74□□□□□ -1.01
CTPS1-210ENST00000486889 GRPRP30550 384 aa8.74□□□□□ -1.01
CTPS1-210ENST00000486889 SLC6A6P31641 620 aa8.74□□□□□ -1.01
CTPS1-210ENST00000486889 TIMP3P35625 211 aa8.74□□□□□ -1.01
CTPS1-210ENST00000486889 GUCA1AP43080 201 aaPredicted RBP8.74□□□□□ -1.01
CTPS1-210ENST00000486889 HSF1Q00613 529 aa8.74□□□□□ -1.01
CTPS1-210ENST00000486889 RASGEF1BQ0VAM2 473 aa8.74□□□□□ -1.01
CTPS1-210ENST00000486889 PDK3Q15120 406 aa8.74□□□□□ -1.01
CTPS1-210ENST00000486889 ZNF239Q16600 458 aaKnown RBP8.74□□□□□ -1.01
CTPS1-210ENST00000486889 IQCCQ4KMZ1 466 aa8.74□□□□□ -1.01
CTPS1-210ENST00000486889 FAM205BPQ63HN1 556 aa8.74□□□□□ -1.01
CTPS1-210ENST00000486889 SMARCD3Q6STE5 483 aa8.74□□□□□ -1.01
CTPS1-210ENST00000486889 Q6ZPB1 254 aaPredicted RBP8.74□□□□□ -1.01
CTPS1-210ENST00000486889 PXKQ7Z7A4 578 aa8.74□□□□□ -1.01
CTPS1-210ENST00000486889 GGNQ86UU5 652 aa8.74□□□□□ -1.01
CTPS1-210ENST00000486889 PACRGLQ8N7B6 248 aa8.74□□□□□ -1.01
CTPS1-210ENST00000486889 PFN4Q8NHR9 129 aa8.74□□□□□ -1.01
CTPS1-210ENST00000486889 FANK1Q8TC84 345 aa8.74□□□□□ -1.01
CTPS1-210ENST00000486889 RND1Q92730 232 aa8.74□□□□□ -1.01
CTPS1-210ENST00000486889 GMPPAQ96IJ6 420 aaPredicted RBP8.74□□□□□ -1.01
CTPS1-210ENST00000486889 FAM46AQ96IP4 442 aaKnown RBP8.74□□□□□ -1.01
CTPS1-210ENST00000486889 ADAD1Q96M93 576 aaKnown RBP8.74□□□□□ -1.01
CTPS1-210ENST00000486889 OXGR1Q96P68 337 aa8.74□□□□□ -1.01
CTPS1-210ENST00000486889 UCN2Q96RP3 112 aa8.74□□□□□ -1.01
CTPS1-210ENST00000486889 FEVQ99581 238 aa8.74□□□□□ -1.01
CTPS1-210ENST00000486889 PKP2Q99959 881 aa8.74□□□□□ -1.01
CTPS1-210ENST00000486889 VKORC1Q9BQB6 163 aa8.74□□□□□ -1.01
CTPS1-210ENST00000486889 TUBA1CQ9BQE3 449 aa8.74□□□□□ -1.01
CTPS1-210ENST00000486889 DGCR6LQ9BY27 220 aa8.74□□□□□ -1.01
CTPS1-210ENST00000486889 B3GAT2Q9NPZ5 323 aa8.74□□□□□ -1.01
CTPS1-210ENST00000486889 PAPOLBQ9NRJ5 636 aaKnown RBP8.74□□□□□ -1.01
CTPS1-210ENST00000486889 INIPQ9NRY2 104 aa8.74□□□□□ -1.01
CTPS1-210ENST00000486889 PNPLA3Q9NST1 481 aa8.74□□□□□ -1.01
CTPS1-210ENST00000486889 MAN2C1Q9NTJ4 1040 aa8.74□□□□□ -1.01
CTPS1-210ENST00000486889 GRHPRQ9UBQ7 328 aa8.74□□□□□ -1.01
CTPS1-210ENST00000486889 OAZ3Q9UMX2 235 aa8.74□□□□□ -1.01
CTPS1-210ENST00000486889 ZNF835Q9Y2P0 537 aa8.74□□□□□ -1.01
CTPS1-210ENST00000486889 HEATR5AQ86XA9 2040 aa8.73□□□□□ -1.01
CTPS1-210ENST00000486889 LAMA5O15230 3695 aa8.73□□□□□ -1.01
CTPS1-210ENST00000486889 IGKV1D-42A0A075B6H8 117 aa8.73□□□□□ -1.01
CTPS1-210ENST00000486889 LOC102725191A0A1B0GVB3 256 aa8.73□□□□□ -1.01
CTPS1-210ENST00000486889 ZC3H12DA2A288 527 aaKnown RBP8.73□□□□□ -1.01
CTPS1-210ENST00000486889 A6NIZ1 184 aa8.73□□□□□ -1.01
CTPS1-210ENST00000486889 SAC3D1A6NKF1 404 aa8.73□□□□□ -1.01
CTPS1-210ENST00000486889 M0R082 166 aa8.73□□□□□ -1.01
CTPS1-210ENST00000486889 IDH3BO43837 385 aa8.73□□□□□ -1.01
CTPS1-210ENST00000486889 EFNA2O43921 213 aa8.73□□□□□ -1.01
CTPS1-210ENST00000486889 MGRN1O60291 552 aa8.73□□□□□ -1.01
CTPS1-210ENST00000486889 CYTIPO60759 359 aa8.73□□□□□ -1.01
CTPS1-210ENST00000486889 MRPL33O75394 65 aaKnown RBP8.73□□□□□ -1.01
CTPS1-210ENST00000486889 AKR7A3O95154 331 aa8.73□□□□□ -1.01
CTPS1-210ENST00000486889 BCL10O95999 233 aa8.73□□□□□ -1.01
CTPS1-210ENST00000486889 HPRP00739 348 aa8.73□□□□□ -1.01
CTPS1-210ENST00000486889 IFNGP01579 166 aa8.73□□□□□ -1.01
CTPS1-210ENST00000486889 BGLAPP02818 100 aa8.73□□□□□ -1.01
CTPS1-210ENST00000486889 YES1P07947 543 aa8.73□□□□□ -1.01
CTPS1-210ENST00000486889 IL11P20809 199 aa8.73□□□□□ -1.01
CTPS1-210ENST00000486889 IGFBP5P24593 272 aa8.73□□□□□ -1.01
CTPS1-210ENST00000486889 OPRM1P35372 400 aa8.73□□□□□ -1.01
CTPS1-210ENST00000486889 GPR4P46093 362 aa8.73□□□□□ -1.01
CTPS1-210ENST00000486889 OMPP47874 163 aa8.73□□□□□ -1.01
CTPS1-210ENST00000486889 LIMS1P48059 325 aa8.73□□□□□ -1.01
CTPS1-210ENST00000486889 HSPA13P48723 471 aa8.73□□□□□ -1.01
CTPS1-210ENST00000486889 ALDH3A2P51648 485 aa8.73□□□□□ -1.01
CTPS1-210ENST00000486889 RAP1BP61224 184 aa8.73□□□□□ -1.01
CTPS1-210ENST00000486889 ESRRGP62508 458 aa8.73□□□□□ -1.01
CTPS1-210ENST00000486889 RAP1AP62834 184 aa8.73□□□□□ -1.01
CTPS1-210ENST00000486889 EGR4Q05215 589 aa8.73□□□□□ -1.01
CTPS1-210ENST00000486889 ZP4Q12836 540 aa8.73□□□□□ -1.01
CTPS1-210ENST00000486889 ACSF3Q4G176 576 aaPredicted RBP8.73□□□□□ -1.01
CTPS1-210ENST00000486889 PRR30Q53SZ7 412 aaPredicted RBP8.73□□□□□ -1.01
CTPS1-210ENST00000486889 ALG10Q5BKT4 473 aa8.73□□□□□ -1.01
CTPS1-210ENST00000486889 GPR139Q6DWJ6 353 aa8.73□□□□□ -1.01
CTPS1-210ENST00000486889 TBPL2Q6SJ96 375 aa8.73□□□□□ -1.01
CTPS1-210ENST00000486889 CD300LDQ6UXZ3 194 aa8.73□□□□□ -1.01
CTPS1-210ENST00000486889 RASSF6Q6ZTQ3 369 aa8.73□□□□□ -1.01
CTPS1-210ENST00000486889 CLDN22Q8N7P3 220 aa8.73□□□□□ -1.01
CTPS1-210ENST00000486889 ZNF555Q8NEP9 628 aa8.73□□□□□ -1.01
CTPS1-210ENST00000486889 OR4C15Q8NGM1 316 aa8.73□□□□□ -1.01
CTPS1-210ENST00000486889 ZNF417Q8TAU3 575 aa8.73□□□□□ -1.01
CTPS1-210ENST00000486889 PRR7Q8TB68 274 aa8.73□□□□□ -1.01
CTPS1-210ENST00000486889 MAGEE2Q8TD90 523 aaPredicted RBP8.73□□□□□ -1.01
CTPS1-210ENST00000486889 GTPBP3Q969Y2 492 aaKnown RBP8.73□□□□□ -1.01
CTPS1-210ENST00000486889 PLEKHA8Q96JA3 519 aa8.73□□□□□ -1.01
CTPS1-210ENST00000486889 RDH12Q96NR8 316 aa8.73□□□□□ -1.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.9 ms