RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000472863.5

HOXB3-207, Transcript of homeobox B3, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene HOXB3, Length 1,909 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB3-207ENST00000472863 BBS1Q8NFJ9 593 aa24.78■■□□□ 1.56
HOXB3-207ENST00000472863 OR2M7Q8NG81 312 aa24.78■■□□□ 1.56
HOXB3-207ENST00000472863 OTULINQ96BN8 352 aa24.78■■□□□ 1.56
HOXB3-207ENST00000472863 POTEKPQ9BYX7 375 aa24.78■■□□□ 1.56
HOXB3-207ENST00000472863 RGS10O43665 173 aa24.77■■□□□ 1.56
HOXB3-207ENST00000472863 SLC15A1P46059 708 aa24.77■■□□□ 1.56
HOXB3-207ENST00000472863 OR7A5Q15622 319 aa24.77■■□□□ 1.56
HOXB3-207ENST00000472863 AADACL4Q5VUY2 407 aa24.77■■□□□ 1.56
HOXB3-207ENST00000472863 PLBD1Q6P4A8 553 aa24.77■■□□□ 1.56
HOXB3-207ENST00000472863 MDS2Q8NDY4 140 aa24.77■■□□□ 1.56
HOXB3-207ENST00000472863 OR5J2Q8NH18 312 aa24.77■■□□□ 1.56
HOXB3-207ENST00000472863 GPX7Q96SL4 187 aaPredicted RBP24.77■■□□□ 1.56
HOXB3-207ENST00000472863 FAM173AQ9BQD7 235 aa24.77■■□□□ 1.56
HOXB3-207ENST00000472863 TAPBPLQ9BX59 468 aa24.77■■□□□ 1.56
HOXB3-207ENST00000472863 MED20Q9H944 212 aa24.77■■□□□ 1.56
HOXB3-207ENST00000472863 ZFP64Q9NPA5 681 aa24.77■■□□□ 1.56
HOXB3-207ENST00000472863 M0R082 166 aa24.76■■□□□ 1.55
HOXB3-207ENST00000472863 MT-ND2P03891 347 aa24.76■■□□□ 1.55
HOXB3-207ENST00000472863 STSP08842 583 aa24.76■■□□□ 1.55
HOXB3-207ENST00000472863 HIST1H1CP16403 213 aaKnown RBP24.76■■□□□ 1.55
HOXB3-207ENST00000472863 CTXN1P60606 82 aa24.76■■□□□ 1.55
HOXB3-207ENST00000472863 ST3GAL4Q11206 333 aa24.76■■□□□ 1.55
HOXB3-207ENST00000472863 MYBPHQ13203 477 aa24.76■■□□□ 1.55
HOXB3-207ENST00000472863 NEDD8Q15843 81 aa24.76■■□□□ 1.55
HOXB3-207ENST00000472863 ANKDD1AQ495B1 522 aa24.76■■□□□ 1.55
HOXB3-207ENST00000472863 GLYR1Q49A26 553 aaPredicted RBP24.76■■□□□ 1.55
HOXB3-207ENST00000472863 NADK2Q4G0N4 442 aa24.76■■□□□ 1.55
HOXB3-207ENST00000472863 MFSD8Q8NHS3 518 aa24.76■■□□□ 1.55
HOXB3-207ENST00000472863 ZNF417Q8TAU3 575 aa24.76■■□□□ 1.55
HOXB3-207ENST00000472863 TMIGD2Q96BF3 282 aa24.76■■□□□ 1.55
HOXB3-207ENST00000472863 ZNF587Q96SQ5 575 aaPredicted RBP24.76■■□□□ 1.55
HOXB3-207ENST00000472863 HCAR1Q9BXC0 346 aa24.76■■□□□ 1.55
HOXB3-207ENST00000472863 OR2M5A3KFT3 312 aa24.76■■□□□ 1.55
HOXB3-207ENST00000472863 KDM4EB2RXH2 506 aaPredicted RBP24.76■■□□□ 1.55
HOXB3-207ENST00000472863 DBTP11182 482 aaKnown RBP24.76■■□□□ 1.55
HOXB3-207ENST00000472863 SFTPDP35247 375 aa24.76■■□□□ 1.55
HOXB3-207ENST00000472863 RFC3P40938 356 aa24.76■■□□□ 1.55
HOXB3-207ENST00000472863 ZNF91Q05481 1191 aa24.76■■□□□ 1.55
HOXB3-207ENST00000472863 SGCBQ16585 318 aa24.76■■□□□ 1.55
HOXB3-207ENST00000472863 ZNF800Q2TB10 664 aaPredicted RBP eCLIP24.76■■□□□ 1.55
HOXB3-207ENST00000472863 CXXC5Q7LFL8 322 aaKnown RBP24.76■■□□□ 1.55
HOXB3-207ENST00000472863 YRDCQ86U90 279 aaKnown RBP24.76■■□□□ 1.55
HOXB3-207ENST00000472863 CYB561A3Q8NBI2 242 aa24.76■■□□□ 1.55
HOXB3-207ENST00000472863 OR52E2Q8NGJ4 325 aa24.76■■□□□ 1.55
HOXB3-207ENST00000472863 OR4K13Q8NH42 304 aa24.76■■□□□ 1.55
HOXB3-207ENST00000472863 PTP4A1Q93096 173 aa24.76■■□□□ 1.55
HOXB3-207ENST00000472863 SIGLEC11Q96RL6 698 aa24.76■■□□□ 1.55
HOXB3-207ENST00000472863 CCNB1IP1Q9NPC3 277 aa24.76■■□□□ 1.55
HOXB3-207ENST00000472863 MSRB2Q9Y3D2 182 aa24.76■■□□□ 1.55
HOXB3-207ENST00000472863 RPL36Q9Y3U8 105 aaKnown RBP24.76■■□□□ 1.55
HOXB3-207ENST00000472863 SNX5Q9Y5X3 404 aa24.76■■□□□ 1.55
HOXB3-207ENST00000472863 SPTBN4Q9H254 2564 aa24.75■■□□□ 1.55
HOXB3-207ENST00000472863 A0A1W2PNR3 127 aa24.75■■□□□ 1.55
HOXB3-207ENST00000472863 C11orf98E9PRG8 122 aa24.75■■□□□ 1.55
HOXB3-207ENST00000472863 SP1P08047 785 aa24.75■■□□□ 1.55
HOXB3-207ENST00000472863 ADRA2AP08913 450 aa24.75■■□□□ 1.55
HOXB3-207ENST00000472863 ADORA3P0DMS8 318 aa24.75■■□□□ 1.55
HOXB3-207ENST00000472863 SRD5A2P31213 254 aa24.75■■□□□ 1.55
HOXB3-207ENST00000472863 IDUAP35475 653 aa24.75■■□□□ 1.55
HOXB3-207ENST00000472863 ALDH3B2P48448 385 aa24.75■■□□□ 1.55
HOXB3-207ENST00000472863 SELENBP1Q13228 472 aa24.75■■□□□ 1.55
HOXB3-207ENST00000472863 ITGADQ13349 1161 aa24.75■■□□□ 1.55
HOXB3-207ENST00000472863 PMS2P3Q13401 168 aa24.75■■□□□ 1.55
HOXB3-207ENST00000472863 CRMP1Q14194 572 aa24.75■■□□□ 1.55
HOXB3-207ENST00000472863 TMEM176BQ3YBM2 270 aaPredicted RBP24.75■■□□□ 1.55
HOXB3-207ENST00000472863 XAF1Q6GPH4 301 aa24.75■■□□□ 1.55
HOXB3-207ENST00000472863 ARHGAP11AQ6P4F7 1023 aa24.75■■□□□ 1.55
HOXB3-207ENST00000472863 OR6S1Q8NH40 331 aa24.75■■□□□ 1.55
HOXB3-207ENST00000472863 HAS2Q92819 552 aa24.75■■□□□ 1.55
HOXB3-207ENST00000472863 MYDGFQ969H8 173 aa24.75■■□□□ 1.55
HOXB3-207ENST00000472863 BOKQ9UMX3 212 aaPredicted RBP24.75■■□□□ 1.55
HOXB3-207ENST00000472863 SPIN1Q9Y657 262 aaPredicted RBP24.75■■□□□ 1.55
HOXB3-207ENST00000472863 KCNMB2Q9Y691 235 aa24.75■■□□□ 1.55
HOXB3-207ENST00000472863 LIPT2A6NK58 231 aa24.74■■□□□ 1.55
HOXB3-207ENST00000472863 RIIAD1A6NNX1 92 aa24.74■■□□□ 1.55
HOXB3-207ENST00000472863 ARPC3O15145 178 aa24.74■■□□□ 1.55
HOXB3-207ENST00000472863 PRODHO43272 600 aa24.74■■□□□ 1.55
HOXB3-207ENST00000472863 CDK1P06493 297 aa24.74■■□□□ 1.55
HOXB3-207ENST00000472863 CD14P08571 375 aa24.74■■□□□ 1.55
HOXB3-207ENST00000472863 AHCYP23526 432 aa24.74■■□□□ 1.55
HOXB3-207ENST00000472863 MAP2K4P45985 399 aa24.74■■□□□ 1.55
HOXB3-207ENST00000472863 ARG2P78540 354 aa24.74■■□□□ 1.55
HOXB3-207ENST00000472863 EMX1Q04741 257 aaPredicted RBP24.74■■□□□ 1.55
HOXB3-207ENST00000472863 PRSS48Q7RTY5 328 aa24.74■■□□□ 1.55
HOXB3-207ENST00000472863 RASD2Q96D21 266 aa24.74■■□□□ 1.55
HOXB3-207ENST00000472863 Q96M85 177 aa24.74■■□□□ 1.55
HOXB3-207ENST00000472863 OR5B2Q96R09 309 aa24.74■■□□□ 1.55
HOXB3-207ENST00000472863 ASPNQ9BXN1 380 aa24.74■■□□□ 1.55
HOXB3-207ENST00000472863 PLPP3O14495 311 aa24.74■■□□□ 1.55
HOXB3-207ENST00000472863 PCMT1P22061 227 aa24.74■■□□□ 1.55
HOXB3-207ENST00000472863 SLC25A25Q6KCM7 469 aa24.74■■□□□ 1.55
HOXB3-207ENST00000472863 FAM122BQ7Z309 247 aa24.74■■□□□ 1.55
HOXB3-207ENST00000472863 GALNTL5Q7Z4T8 443 aa24.74■■□□□ 1.55
HOXB3-207ENST00000472863 STX19Q8N4C7 294 aa24.74■■□□□ 1.55
HOXB3-207ENST00000472863 SDR9C7Q8NEX9 313 aa24.74■■□□□ 1.55
HOXB3-207ENST00000472863 CSTF2TQ9H0L4 616 aaKnown RBP eCLIP24.74■■□□□ 1.553e-6■■■□□ 15.8
HOXB3-207ENST00000472863 FN3KQ9H479 309 aa24.74■■□□□ 1.55
HOXB3-207ENST00000472863 MRPL39Q9NYK5 338 aaKnown RBP24.74■■□□□ 1.55
HOXB3-207ENST00000472863 CNOT2Q9NZN8 540 aaKnown RBP24.74■■□□□ 1.55
HOXB3-207ENST00000472863 LAMA5O15230 3695 aa24.73■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.2 ms