RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462125.5

C9orf3-210, Transcript of chromosome 9 open reading frame 3, humanhuman

TSL 3

Gene C9orf3, Length 961 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf3-210ENST00000462125 FRS3O43559 492 aa11.63□□□□□ -0.55
C9orf3-210ENST00000462125 TPST1O60507 370 aa11.63□□□□□ -0.55
C9orf3-210ENST00000462125 ITGA5P08648 1049 aa11.63□□□□□ -0.55
C9orf3-210ENST00000462125 DANCRP0C864 163 aa11.63□□□□□ -0.55
C9orf3-210ENST00000462125 SLC6A2P23975 617 aa11.63□□□□□ -0.55
C9orf3-210ENST00000462125 PTH2RP49190 550 aa11.63□□□□□ -0.55
C9orf3-210ENST00000462125 FOXG1P55316 489 aaPredicted RBP11.63□□□□□ -0.55
C9orf3-210ENST00000462125 HOXC5Q00444 222 aa11.63□□□□□ -0.55
C9orf3-210ENST00000462125 EGR4Q05215 589 aa11.63□□□□□ -0.55
C9orf3-210ENST00000462125 BSPH1Q075Z2 132 aa11.63□□□□□ -0.55
C9orf3-210ENST00000462125 FAPQ12884 760 aa11.63□□□□□ -0.55
C9orf3-210ENST00000462125 SCARB2Q14108 478 aa11.63□□□□□ -0.55
C9orf3-210ENST00000462125 Q5PR19 223 aa11.63□□□□□ -0.55
C9orf3-210ENST00000462125 TSPO2Q5TGU0 170 aa11.63□□□□□ -0.55
C9orf3-210ENST00000462125 TMEM225Q6GV28 225 aa11.63□□□□□ -0.55
C9orf3-210ENST00000462125 RETREG3Q86VR2 466 aa11.63□□□□□ -0.55
C9orf3-210ENST00000462125 COMTD1Q86VU5 262 aa11.63□□□□□ -0.55
C9orf3-210ENST00000462125 KRT73Q86Y46 540 aa11.63□□□□□ -0.55
C9orf3-210ENST00000462125 OR9K2Q8NGE7 335 aa11.63□□□□□ -0.55
C9orf3-210ENST00000462125 OR52E4Q8NGH9 312 aa11.63□□□□□ -0.55
C9orf3-210ENST00000462125 TMEM171Q8WVE6 324 aa11.63□□□□□ -0.55
C9orf3-210ENST00000462125 ANKRD27Q96NW4 1050 aa11.63□□□□□ -0.55
C9orf3-210ENST00000462125 ZNF385AQ96PM9 386 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
C9orf3-210ENST00000462125 CPPED1Q9BRF8 314 aaPredicted RBP11.63□□□□□ -0.55
C9orf3-210ENST00000462125 PTDSS2Q9BVG9 487 aa11.63□□□□□ -0.55
C9orf3-210ENST00000462125 TAPBPLQ9BX59 468 aa11.63□□□□□ -0.55
C9orf3-210ENST00000462125 TRIM2Q9C040 744 aa11.63□□□□□ -0.55
C9orf3-210ENST00000462125 GSX1Q9H4S2 264 aaPredicted RBP11.63□□□□□ -0.55
C9orf3-210ENST00000462125 TAGLN3Q9UI15 199 aa11.63□□□□□ -0.55
C9orf3-210ENST00000462125 SLC25A15Q9Y619 301 aa11.63□□□□□ -0.55
C9orf3-210ENST00000462125 CIB4A0PJX0 185 aa11.62□□□□□ -0.55
C9orf3-210ENST00000462125 PRORSD1PA6NEY8 169 aa11.62□□□□□ -0.55
C9orf3-210ENST00000462125 SERPINB7O75635 380 aa11.62□□□□□ -0.55
C9orf3-210ENST00000462125 RAD51DO75771 328 aa11.62□□□□□ -0.55
C9orf3-210ENST00000462125 MFN2O95140 757 aa11.62□□□□□ -0.55
C9orf3-210ENST00000462125 RBBP4Q09028 425 aa11.62□□□□□ -0.55
C9orf3-210ENST00000462125 STK11Q15831 433 aa11.62□□□□□ -0.55
C9orf3-210ENST00000462125 ZNF672Q499Z4 452 aaPredicted RBP11.62□□□□□ -0.55
C9orf3-210ENST00000462125 DNAL1Q4LDG9 190 aa11.62□□□□□ -0.55
C9orf3-210ENST00000462125 CASP12Q6UXS9 341 aa11.62□□□□□ -0.55
C9orf3-210ENST00000462125 CREB3L2Q70SY1 520 aa11.62□□□□□ -0.55
C9orf3-210ENST00000462125 AAED1Q7RTV5 226 aa11.62□□□□□ -0.55
C9orf3-210ENST00000462125 BIVMQ86UB2 503 aa11.62□□□□□ -0.55
C9orf3-210ENST00000462125 PTOV1Q86YD1 416 aa11.62□□□□□ -0.55
C9orf3-210ENST00000462125 WDR31Q8NA23 367 aa11.62□□□□□ -0.55
C9orf3-210ENST00000462125 HIPK4Q8NE63 616 aa11.62□□□□□ -0.55
C9orf3-210ENST00000462125 C1orf162Q8NEQ5 155 aaPredicted RBP11.62□□□□□ -0.55
C9orf3-210ENST00000462125 BHLHE22Q8NFJ8 381 aaPredicted RBP11.62□□□□□ -0.55
C9orf3-210ENST00000462125 DNAJA4Q8WW22 397 aaPredicted RBP11.62□□□□□ -0.55
C9orf3-210ENST00000462125 FBXW5Q969U6 566 aa11.62□□□□□ -0.55
C9orf3-210ENST00000462125 PERPQ96FX8 193 aa11.62□□□□□ -0.55
C9orf3-210ENST00000462125 RADILQ96JH8 1075 aa11.62□□□□□ -0.55
C9orf3-210ENST00000462125 ZNF607Q96SK3 696 aa11.62□□□□□ -0.55
C9orf3-210ENST00000462125 CGREF1Q99674 301 aa11.62□□□□□ -0.55
C9orf3-210ENST00000462125 GRIP2Q9C0E4 1043 aa11.62□□□□□ -0.55
C9orf3-210ENST00000462125 CXorf56Q9H5V9 222 aa11.62□□□□□ -0.55
C9orf3-210ENST00000462125 EVA1AQ9H8M9 152 aa11.62□□□□□ -0.55
C9orf3-210ENST00000462125 ADPRHL2Q9NX46 363 aa11.62□□□□□ -0.55
C9orf3-210ENST00000462125 NPAP1Q9NZP6 1156 aa11.62□□□□□ -0.55
C9orf3-210ENST00000462125 UPB1Q9UBR1 384 aa11.62□□□□□ -0.55
C9orf3-210ENST00000462125 NIPSNAP3AQ9UFN0 247 aaPredicted RBP11.62□□□□□ -0.55
C9orf3-210ENST00000462125 RASD1Q9Y272 281 aa11.62□□□□□ -0.55
C9orf3-210ENST00000462125 LOC102725191A0A1B0GVB3 256 aa11.61□□□□□ -0.55
C9orf3-210ENST00000462125 A0A1B0GWA3 101 aa11.61□□□□□ -0.55
C9orf3-210ENST00000462125 SHISA9B4DS77 424 aa11.61□□□□□ -0.55
C9orf3-210ENST00000462125 CLOCKO15516 846 aa11.61□□□□□ -0.55
C9orf3-210ENST00000462125 OR2T1O43869 369 aa11.61□□□□□ -0.55
C9orf3-210ENST00000462125 TPST2O60704 377 aa11.61□□□□□ -0.55
C9orf3-210ENST00000462125 INHBBP09529 407 aa11.61□□□□□ -0.55
C9orf3-210ENST00000462125 PNMTP11086 282 aa11.61□□□□□ -0.55
C9orf3-210ENST00000462125 HTR2AP28223 471 aa11.61□□□□□ -0.55
C9orf3-210ENST00000462125 MPGP29372 298 aa11.61□□□□□ -0.55
C9orf3-210ENST00000462125 PCBP3P57721 371 aaKnown RBP11.61□□□□□ -0.55
C9orf3-210ENST00000462125 TGFBR3Q03167 851 aa11.61□□□□□ -0.55
C9orf3-210ENST00000462125 RIPK1Q13546 671 aa11.61□□□□□ -0.55
C9orf3-210ENST00000462125 ULK3Q6PHR2 472 aa11.61□□□□□ -0.55
C9orf3-210ENST00000462125 C5orf46Q6UWT4 87 aa11.61□□□□□ -0.55
C9orf3-210ENST00000462125 NET1Q7Z628 596 aaPredicted RBP11.61□□□□□ -0.55
C9orf3-210ENST00000462125 DHDDSQ86SQ9 333 aa11.61□□□□□ -0.55
C9orf3-210ENST00000462125 EPHX4Q8IUS5 362 aa11.61□□□□□ -0.55
C9orf3-210ENST00000462125 C17orf78Q8N4C9 275 aa11.61□□□□□ -0.55
C9orf3-210ENST00000462125 POMGNT2Q8NAT1 580 aa11.61□□□□□ -0.55
C9orf3-210ENST00000462125 SMAP2Q8WU79 429 aaPredicted RBP11.61□□□□□ -0.55
C9orf3-210ENST00000462125 NEUROG1Q92886 237 aa11.61□□□□□ -0.55
C9orf3-210ENST00000462125 SLC38A4Q969I6 547 aa11.61□□□□□ -0.55
C9orf3-210ENST00000462125 CMTM5Q96DZ9 223 aa11.61□□□□□ -0.55
C9orf3-210ENST00000462125 KTI12Q96EK9 354 aaPredicted RBP11.61□□□□□ -0.55
C9orf3-210ENST00000462125 BTBD10Q9BSF8 475 aa11.61□□□□□ -0.55
C9orf3-210ENST00000462125 BDH2Q9BUT1 245 aa11.61□□□□□ -0.55
C9orf3-210ENST00000462125 MMADHCQ9H3L0 296 aaPredicted RBP11.61□□□□□ -0.55
C9orf3-210ENST00000462125 KAT8Q9H7Z6 458 aaKnown RBP11.61□□□□□ -0.55
C9orf3-210ENST00000462125 LAMP3Q9UQV4 416 aa11.61□□□□□ -0.55
C9orf3-210ENST00000462125 CADP27708 2225 aa11.6□□□□□ -0.55
C9orf3-210ENST00000462125 IGKV1D-42A0A075B6H8 117 aa11.6□□□□□ -0.55
C9orf3-210ENST00000462125 A0A087WUJ7 227 aa11.6□□□□□ -0.55
C9orf3-210ENST00000462125 ELOA3DA6NLF2 546 aaPredicted RBP11.6□□□□□ -0.55
C9orf3-210ENST00000462125 ANGPT2O15123 496 aa11.6□□□□□ -0.55
C9orf3-210ENST00000462125 AHSA1O95433 338 aa11.6□□□□□ -0.55
C9orf3-210ENST00000462125 SOD3P08294 240 aa11.6□□□□□ -0.55
C9orf3-210ENST00000462125 T-ENOLP0DO92 83 aa11.6□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.3 ms