RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000408919.7

SH3BP5-203, Transcript of SH3 domain binding protein 5, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BP5, Length 1,880 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP5-203ENST00000408919 PMS2P2O95744 297 aa15.99■□□□□ 0.15
SH3BP5-203ENST00000408919 GSTM3P21266 225 aa15.99■□□□□ 0.15
SH3BP5-203ENST00000408919 TDGF1P3P51864 188 aa15.99■□□□□ 0.15
SH3BP5-203ENST00000408919 COX10Q12887 443 aa15.99■□□□□ 0.15
SH3BP5-203ENST00000408919 PLXDC2Q6UX71 529 aa15.99■□□□□ 0.15
SH3BP5-203ENST00000408919 THSD4Q6ZMP0 1018 aa15.99■□□□□ 0.15
SH3BP5-203ENST00000408919 RASSF6Q6ZTQ3 369 aa15.99■□□□□ 0.15
SH3BP5-203ENST00000408919 MAMDC2Q7Z304 686 aaPredicted RBP15.99■□□□□ 0.15
SH3BP5-203ENST00000408919 PARP8Q8N3A8 854 aa15.99■□□□□ 0.15
SH3BP5-203ENST00000408919 OR10D3Q8NH80 312 aa15.99■□□□□ 0.15
SH3BP5-203ENST00000408919 OR2V1Q8NHB1 315 aa15.99■□□□□ 0.15
SH3BP5-203ENST00000408919 ZNF845Q96IR2 970 aaPredicted RBP15.99■□□□□ 0.15
SH3BP5-203ENST00000408919 TAPBPLQ9BX59 468 aa15.99■□□□□ 0.15
SH3BP5-203ENST00000408919 VCX3BQ9H321 246 aa15.99■□□□□ 0.15
SH3BP5-203ENST00000408919 ZFYVE26Q68DK2 2539 aa15.99■□□□□ 0.15
SH3BP5-203ENST00000408919 NPIPA2E9PIF3 369 aa15.99■□□□□ 0.15
SH3BP5-203ENST00000408919 NPIPA3F8WFD2 350 aa15.99■□□□□ 0.15
SH3BP5-203ENST00000408919 CXCL13O43927 109 aa15.99■□□□□ 0.15
SH3BP5-203ENST00000408919 RAMP1O60894 148 aa15.99■□□□□ 0.15
SH3BP5-203ENST00000408919 OSMP13725 252 aa15.99■□□□□ 0.15
SH3BP5-203ENST00000408919 UQCRC1P31930 480 aa15.99■□□□□ 0.15
SH3BP5-203ENST00000408919 EIF1AXP47813 144 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
SH3BP5-203ENST00000408919 BCL2A1Q16548 175 aa15.99■□□□□ 0.15
SH3BP5-203ENST00000408919 ZBED5Q49AG3 693 aa15.99■□□□□ 0.15
SH3BP5-203ENST00000408919 HBMQ6B0K9 141 aa15.99■□□□□ 0.15
SH3BP5-203ENST00000408919 TMEM99Q8N816 258 aa15.99■□□□□ 0.15
SH3BP5-203ENST00000408919 MOSPD2Q8NHP6 518 aa15.99■□□□□ 0.15
SH3BP5-203ENST00000408919 DNAJC9Q8WXX5 260 aa15.99■□□□□ 0.15
SH3BP5-203ENST00000408919 OSTF1Q92882 214 aa15.99■□□□□ 0.15
SH3BP5-203ENST00000408919 WBP1Q96G27 269 aa15.99■□□□□ 0.15
SH3BP5-203ENST00000408919 VCXQ9H320 206 aa15.99■□□□□ 0.15
SH3BP5-203ENST00000408919 OR52D1Q9H346 318 aa15.99■□□□□ 0.15
SH3BP5-203ENST00000408919 RIBC2Q9H4K1 309 aa15.99■□□□□ 0.15
SH3BP5-203ENST00000408919 ALKBH4Q9NXW9 302 aa15.99■□□□□ 0.15
SH3BP5-203ENST00000408919 IL20Q9NYY1 176 aa15.99■□□□□ 0.15
SH3BP5-203ENST00000408919 MED12LQ86YW9 2145 aa15.99■□□□□ 0.15
SH3BP5-203ENST00000408919 IGHV3-15A0A0B4J1V0 119 aa15.98■□□□□ 0.15
SH3BP5-203ENST00000408919 BLOC1S5-TXNDC5H3BN57 136 aa15.98■□□□□ 0.15
SH3BP5-203ENST00000408919 TSPAN19P0C672 248 aa15.98■□□□□ 0.15
SH3BP5-203ENST00000408919 AQP2P41181 271 aa15.98■□□□□ 0.15
SH3BP5-203ENST00000408919 SLC9A3P48764 834 aa15.98■□□□□ 0.15
SH3BP5-203ENST00000408919 RAD23AP54725 363 aa15.98■□□□□ 0.15
SH3BP5-203ENST00000408919 KDM8Q8N371 416 aa15.98■□□□□ 0.15
SH3BP5-203ENST00000408919 OR5J2Q8NH18 312 aa15.98■□□□□ 0.15
SH3BP5-203ENST00000408919 FANK1Q8TC84 345 aa15.98■□□□□ 0.15
SH3BP5-203ENST00000408919 UCN2Q96RP3 112 aa15.98■□□□□ 0.15
SH3BP5-203ENST00000408919 SLX1AQ9BQ83 275 aa15.98■□□□□ 0.15
SH3BP5-203ENST00000408919 GABARAPL3Q9BY60 117 aa15.98■□□□□ 0.15
SH3BP5-203ENST00000408919 MRPL39Q9NYK5 338 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
SH3BP5-203ENST00000408919 TAS2R5Q9NYW4 299 aa15.98■□□□□ 0.15
SH3BP5-203ENST00000408919 HIF3AQ9Y2N7 669 aa15.98■□□□□ 0.15
SH3BP5-203ENST00000408919 RP1L1Q8IWN7 2480 aaPredicted RBP15.97■□□□□ 0.15
SH3BP5-203ENST00000408919 CPN1P15169 458 aa15.97■□□□□ 0.15
SH3BP5-203ENST00000408919 ENPP1P22413 925 aa15.97■□□□□ 0.15
SH3BP5-203ENST00000408919 POU1F1P28069 291 aa15.97■□□□□ 0.15
SH3BP5-203ENST00000408919 P2RY4P51582 365 aa15.97■□□□□ 0.15
SH3BP5-203ENST00000408919 CARD18P57730 90 aa15.97■□□□□ 0.15
SH3BP5-203ENST00000408919 NUP107P57740 925 aa15.97■□□□□ 0.15
SH3BP5-203ENST00000408919 H3F3AP84243 136 aa15.97■□□□□ 0.15
SH3BP5-203ENST00000408919 RPL18Q07020 188 aaKnown RBP15.97■□□□□ 0.15
SH3BP5-203ENST00000408919 NPRL3Q12980 569 aa15.97■□□□□ 0.15
SH3BP5-203ENST00000408919 SGCBQ16585 318 aa15.97■□□□□ 0.15
SH3BP5-203ENST00000408919 TMEM236Q5W0B7 351 aa15.97■□□□□ 0.15
SH3BP5-203ENST00000408919 ARHGAP11AQ6P4F7 1023 aa15.97■□□□□ 0.15
SH3BP5-203ENST00000408919 NANOGNBQ7Z5D8 188 aa15.97■□□□□ 0.15
SH3BP5-203ENST00000408919 IGFN1Q86VF2 1251 aa15.97■□□□□ 0.15
SH3BP5-203ENST00000408919 CCDC103Q8IW40 242 aa15.97■□□□□ 0.15
SH3BP5-203ENST00000408919 SAMD8Q96LT4 415 aa15.97■□□□□ 0.15
SH3BP5-203ENST00000408919 CAMK2AQ9UQM7 478 aa15.97■□□□□ 0.15
SH3BP5-203ENST00000408919 ORC6Q9Y5N6 252 aa15.97■□□□□ 0.15
SH3BP5-203ENST00000408919 CDH10Q9Y6N8 788 aa15.97■□□□□ 0.15
SH3BP5-203ENST00000408919 TTLL8A6PVC2 850 aa15.97■□□□□ 0.15
SH3BP5-203ENST00000408919 H3BN98 237 aa15.97■□□□□ 0.15
SH3BP5-203ENST00000408919 PLPP3O14495 311 aa15.97■□□□□ 0.15
SH3BP5-203ENST00000408919 GTF2E2P29084 291 aaKnown RBP15.97■□□□□ 0.15
SH3BP5-203ENST00000408919 CRISP1P54107 249 aa15.97■□□□□ 0.15
SH3BP5-203ENST00000408919 RAC3P60763 192 aa15.97■□□□□ 0.15
SH3BP5-203ENST00000408919 SLC35A1P78382 337 aa15.97■□□□□ 0.15
SH3BP5-203ENST00000408919 PMS2P3Q13401 168 aa15.97■□□□□ 0.15
SH3BP5-203ENST00000408919 MFSD13AQ14CX5 517 aa15.97■□□□□ 0.15
SH3BP5-203ENST00000408919 CLEC12AQ5QGZ9 265 aa15.97■□□□□ 0.15
SH3BP5-203ENST00000408919 SMARCD3Q6STE5 483 aa15.97■□□□□ 0.15
SH3BP5-203ENST00000408919 MEIOBQ8N635 442 aa15.97■□□□□ 0.15
SH3BP5-203ENST00000408919 IQCF1Q8N6M8 205 aa15.97■□□□□ 0.15
SH3BP5-203ENST00000408919 ASPNQ9BXN1 380 aa15.97■□□□□ 0.15
SH3BP5-203ENST00000408919 PRDM14Q9GZV8 571 aa15.97■□□□□ 0.15
SH3BP5-203ENST00000408919 CHST11Q9NPF2 352 aa15.97■□□□□ 0.15
SH3BP5-203ENST00000408919 CORINQ9Y5Q5 1042 aa15.97■□□□□ 0.15
SH3BP5-203ENST00000408919 MCIDASD6RGH6 385 aa15.96■□□□□ 0.15
SH3BP5-203ENST00000408919 C11orf98E9PRG8 122 aa15.96■□□□□ 0.15
SH3BP5-203ENST00000408919 MS4A18H0YCH9 400 aa15.96■□□□□ 0.15
SH3BP5-203ENST00000408919 SMAD9O15198 467 aaKnown RBP15.96■□□□□ 0.15
SH3BP5-203ENST00000408919 HIST1H2ABP04908 130 aa15.96■□□□□ 0.15
SH3BP5-203ENST00000408919 ADORA3P0DMS8 318 aa15.96■□□□□ 0.15
SH3BP5-203ENST00000408919 MLLT10P55197 1068 aa15.96■□□□□ 0.15
SH3BP5-203ENST00000408919 CSNK2A1P68400 391 aaPredicted RBP15.96■□□□□ 0.15
SH3BP5-203ENST00000408919 NFATC3Q12968 1075 aa15.96■□□□□ 0.15
SH3BP5-203ENST00000408919 PTGES3Q15185 160 aaKnown RBP15.96■□□□□ 0.15
SH3BP5-203ENST00000408919 RFX4Q33E94 735 aa15.96■□□□□ 0.15
SH3BP5-203ENST00000408919 MS4A18Q3C1V0 323 aa15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24 ms