RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000400053.8

PTPRM-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene PTPRM, Length 5,292 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-202ENST00000400053 BTBD17A6NE02 478 aa8.26□□□□□ -1.09
PTPRM-202ENST00000400053 ACOD1A6NK06 481 aa8.26□□□□□ -1.09
PTPRM-202ENST00000400053 MED6O75586 246 aa8.26□□□□□ -1.09
PTPRM-202ENST00000400053 SIX6O95475 246 aa8.26□□□□□ -1.09
PTPRM-202ENST00000400053 RAB40ALP0C0E4 278 aa8.26□□□□□ -1.09
PTPRM-202ENST00000400053 CBR1P16152 277 aa8.26□□□□□ -1.09
PTPRM-202ENST00000400053 BCKDHBP21953 392 aa8.26□□□□□ -1.09
PTPRM-202ENST00000400053 SERPINF1P36955 418 aa8.26□□□□□ -1.09
PTPRM-202ENST00000400053 CSNK1A1P48729 337 aa8.26□□□□□ -1.09
PTPRM-202ENST00000400053 TAS2R19P59542 299 aa8.26□□□□□ -1.09
PTPRM-202ENST00000400053 C1orf61Q13536 156 aa8.26□□□□□ -1.09
PTPRM-202ENST00000400053 C4orf17Q53FE4 359 aa8.26□□□□□ -1.09
PTPRM-202ENST00000400053 CTSL3PQ5NE16 218 aa8.26□□□□□ -1.09
PTPRM-202ENST00000400053 EXOSC6Q5RKV6 272 aaKnown RBP8.26□□□□□ -1.09
PTPRM-202ENST00000400053 LPCAT3Q6P1A2 487 aa8.26□□□□□ -1.09
PTPRM-202ENST00000400053 RAB40AQ8WXH6 277 aa8.26□□□□□ -1.09
PTPRM-202ENST00000400053 SLAMF9Q96A28 289 aa8.26□□□□□ -1.09
PTPRM-202ENST00000400053 OPA3Q9H6K4 179 aa8.26□□□□□ -1.09
PTPRM-202ENST00000400053 SPATA6Q9NWH7 488 aaPredicted RBP8.26□□□□□ -1.09
PTPRM-202ENST00000400053 RHBDD3Q9Y3P4 386 aa8.26□□□□□ -1.09
PTPRM-202ENST00000400053 E9PI62 339 aa8.26□□□□□ -1.09
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PTPRM-202ENST00000400053 CSF2RAP15509 400 aa8.26□□□□□ -1.09
PTPRM-202ENST00000400053 SLC1A3P43003 542 aa8.26□□□□□ -1.09
PTPRM-202ENST00000400053 GP2P55259 537 aaKnown RBP8.26□□□□□ -1.09
PTPRM-202ENST00000400053 HBG1P69891 147 aa8.26□□□□□ -1.09
PTPRM-202ENST00000400053 HBG2P69892 147 aa8.26□□□□□ -1.09
PTPRM-202ENST00000400053 LCTLQ6UWM7 567 aa8.26□□□□□ -1.09
PTPRM-202ENST00000400053 MEPCEQ7L2J0 689 aaKnown RBP8.26□□□□□ -1.09
PTPRM-202ENST00000400053 VRK2Q86Y07 508 aa8.26□□□□□ -1.09
PTPRM-202ENST00000400053 CLDN22Q8N7P3 220 aa8.26□□□□□ -1.09
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PTPRM-202ENST00000400053 FAM71F1Q96KD3 344 aaPredicted RBP8.26□□□□□ -1.09
PTPRM-202ENST00000400053 PKMYT1Q99640 499 aa8.26□□□□□ -1.09
PTPRM-202ENST00000400053 C1QTNF2Q9BXJ5 285 aa8.26□□□□□ -1.09
PTPRM-202ENST00000400053 ANKRD19PQ9H560 264 aa8.26□□□□□ -1.09
PTPRM-202ENST00000400053 KCMF1Q9P0J7 381 aa8.26□□□□□ -1.09
PTPRM-202ENST00000400053 FTSJ1Q9UET6 329 aa8.26□□□□□ -1.09
PTPRM-202ENST00000400053 K7EQM0 130 aa8.26□□□□□ -1.09
PTPRM-202ENST00000400053 MSTNO14793 375 aa8.26□□□□□ -1.09
PTPRM-202ENST00000400053 CTSAP10619 480 aa8.26□□□□□ -1.09
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PTPRM-202ENST00000400053 LTB4RQ15722 352 aa8.26□□□□□ -1.09
PTPRM-202ENST00000400053 TAS1R1Q7RTX1 841 aa8.26□□□□□ -1.09
PTPRM-202ENST00000400053 GPR78Q96P69 363 aa8.26□□□□□ -1.09
PTPRM-202ENST00000400053 ZFYVE21Q9BQ24 234 aa8.26□□□□□ -1.09
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PTPRM-202ENST00000400053 SNX11Q9Y5W9 270 aa8.26□□□□□ -1.09
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PTPRM-202ENST00000400053 TCRBV21S2A2A0A5A6 115 aa8.26□□□□□ -1.09
PTPRM-202ENST00000400053 CDHR4A6H8M9 788 aa8.26□□□□□ -1.09
PTPRM-202ENST00000400053 TRAPPC2LH3BP13 241 aa8.26□□□□□ -1.09
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PTPRM-202ENST00000400053 FAM26DQ5JW98 314 aa8.26□□□□□ -1.09
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PTPRM-202ENST00000400053 RFPL4BQ6ZWI9 263 aa8.26□□□□□ -1.09
PTPRM-202ENST00000400053 HTR3DQ70Z44 454 aa8.26□□□□□ -1.09
PTPRM-202ENST00000400053 GPR155Q7Z3F1 870 aa8.26□□□□□ -1.09
PTPRM-202ENST00000400053 SPNS2Q8IVW8 549 aa8.26□□□□□ -1.09
PTPRM-202ENST00000400053 SIAH3Q8IW03 269 aa8.26□□□□□ -1.09
PTPRM-202ENST00000400053 BPIFB2Q8N4F0 458 aa8.26□□□□□ -1.09
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PTPRM-202ENST00000400053 ASB17Q8WXJ9 295 aa8.26□□□□□ -1.09
PTPRM-202ENST00000400053 TANKQ92844 425 aa8.26□□□□□ -1.09
PTPRM-202ENST00000400053 PEX11GQ96HA9 241 aa8.26□□□□□ -1.09
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PTPRM-202ENST00000400053 ENKD1Q9H0I2 346 aa8.26□□□□□ -1.09
PTPRM-202ENST00000400053 LHX3Q9UBR4 397 aa8.26□□□□□ -1.09
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PTPRM-202ENST00000400053 CTSCP53634 463 aa8.25□□□□□ -1.09
PTPRM-202ENST00000400053 SLC35A2P78381 396 aa8.25□□□□□ -1.09
PTPRM-202ENST00000400053 CTU2Q2VPK5 515 aaKnown RBP8.25□□□□□ -1.09
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PTPRM-202ENST00000400053 KLHDC9Q8NEP7 349 aa8.25□□□□□ -1.09
PTPRM-202ENST00000400053 FOXN4Q96NZ1 517 aa8.25□□□□□ -1.09
PTPRM-202ENST00000400053 BTBD2Q9BX70 525 aa8.25□□□□□ -1.09
PTPRM-202ENST00000400053 CPEB1Q9BZB8 566 aaKnown RBP8.25□□□□□ -1.09
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