RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000391970.3

PTPRC-205, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PTPRC, Length 408 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-205ENST00000391970 RANBP1P43487 201 aa2.26□□□□□ -2.05
PTPRC-205ENST00000391970 CBX5P45973 191 aa2.26□□□□□ -2.05
PTPRC-205ENST00000391970 OR3A4PP47883 348 aa2.26□□□□□ -2.05
PTPRC-205ENST00000391970 XRCC4Q13426 336 aa2.26□□□□□ -2.05
PTPRC-205ENST00000391970 C1orf61Q13536 156 aa2.26□□□□□ -2.05
PTPRC-205ENST00000391970 LRRC36Q1X8D7 754 aa2.26□□□□□ -2.05
PTPRC-205ENST00000391970 RGS21Q2M5E4 152 aa2.26□□□□□ -2.05
PTPRC-205ENST00000391970 ZCWPW2Q504Y3 356 aa2.26□□□□□ -2.05
PTPRC-205ENST00000391970 C9orf129Q5T035 196 aaKnown RBP2.26□□□□□ -2.05
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PTPRC-205ENST00000391970 MTURNQ8N3F0 131 aa2.26□□□□□ -2.05
PTPRC-205ENST00000391970 SVOPLQ8N434 492 aa2.26□□□□□ -2.05
PTPRC-205ENST00000391970 FBXL16Q8N461 479 aa2.26□□□□□ -2.05
PTPRC-205ENST00000391970 LIX1Q8N485 282 aa2.26□□□□□ -2.05
PTPRC-205ENST00000391970 C11orf42Q8N5U0 333 aa2.26□□□□□ -2.05
PTPRC-205ENST00000391970 CATSPER1Q8NEC5 780 aa2.26□□□□□ -2.05
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PTPRC-205ENST00000391970 MAIP1Q8WWC4 291 aa2.26□□□□□ -2.05
PTPRC-205ENST00000391970 MRPS31Q92665 395 aaKnown RBP2.26□□□□□ -2.05
PTPRC-205ENST00000391970 EFHD2Q96C19 240 aaPredicted RBP2.26□□□□□ -2.05
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PTPRC-205ENST00000391970 IL4I1Q96RQ9 567 aa2.26□□□□□ -2.05
PTPRC-205ENST00000391970 ZNF184Q99676 751 aaPredicted RBP2.26□□□□□ -2.05
PTPRC-205ENST00000391970 ZNF670Q9BS34 389 aa2.26□□□□□ -2.05
PTPRC-205ENST00000391970 RNF126Q9BV68 326 aa2.26□□□□□ -2.05
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PTPRC-205ENST00000391970 CENPHQ9H3R5 247 aa2.26□□□□□ -2.05
PTPRC-205ENST00000391970 LRRN3Q9H3W5 708 aa2.26□□□□□ -2.05
PTPRC-205ENST00000391970 SMYD3Q9H7B4 428 aa2.26□□□□□ -2.05
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PTPRC-205ENST00000391970 SLC39A1Q9NY26 324 aa2.26□□□□□ -2.05
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PTPRC-205ENST00000391970 C15orf41Q9Y2V0 281 aa2.26□□□□□ -2.05
PTPRC-205ENST00000391970 MEMO1Q9Y316 297 aa2.26□□□□□ -2.05
PTPRC-205ENST00000391970 PLLPQ9Y342 182 aa2.26□□□□□ -2.05
PTPRC-205ENST00000391970 PTPN23Q9H3S7 1636 aa2.26□□□□□ -2.05
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PTPRC-205ENST00000391970 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP2.26□□□□□ -2.05
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PTPRC-205ENST00000391970 PDS5BQ9NTI5 1447 aa2.25□□□□□ -2.05
PTPRC-205ENST00000391970 MROH7Q68CQ1 1323 aa2.25□□□□□ -2.05
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PTPRC-205ENST00000391970 BET1O15155 118 aa2.25□□□□□ -2.05
PTPRC-205ENST00000391970 CETN3O15182 167 aa2.25□□□□□ -2.05
PTPRC-205ENST00000391970 SPOPO43791 374 aa2.25□□□□□ -2.05
PTPRC-205ENST00000391970 CXCL13O43927 109 aa2.25□□□□□ -2.05
PTPRC-205ENST00000391970 HCN1O60741 890 aa2.25□□□□□ -2.05
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PTPRC-205ENST00000391970 SERPINB7O75635 380 aa2.25□□□□□ -2.05
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PTPRC-205ENST00000391970 LALBAP00709 142 aa2.25□□□□□ -2.05
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PTPRC-205ENST00000391970 CHRNB3Q05901 458 aa2.25□□□□□ -2.05
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PTPRC-205ENST00000391970 SLC10A7Q0GE19 358 aa2.25□□□□□ -2.05
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PTPRC-205ENST00000391970 WHAMMP3Q1A5X7 153 aa2.25□□□□□ -2.05
PTPRC-205ENST00000391970 ISXQ2M1V0 245 aa2.25□□□□□ -2.05
PTPRC-205ENST00000391970 EXOC3L2Q2M3D2 409 aa2.25□□□□□ -2.05
PTPRC-205ENST00000391970 TRIM16LQ309B1 348 aa2.25□□□□□ -2.05
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