RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000380828.6

RABGEF1-202, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene RABGEF1, Length 3,864 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-202ENST00000380828 PNMA8CA0A1B0GUJ8 204 aa6.27□□□□□ -1.41
RABGEF1-202ENST00000380828 IFNL4K9M1U5 179 aa6.27□□□□□ -1.41
RABGEF1-202ENST00000380828 KDELR3O43731 214 aa6.27□□□□□ -1.41
RABGEF1-202ENST00000380828 RCBTB2O95199 551 aa6.27□□□□□ -1.41
RABGEF1-202ENST00000380828 SYPP08247 313 aa6.27□□□□□ -1.41
RABGEF1-202ENST00000380828 ANKRD34CP0C6C1 535 aa6.27□□□□□ -1.41
RABGEF1-202ENST00000380828 GPR12P47775 334 aa6.27□□□□□ -1.41
RABGEF1-202ENST00000380828 FASLGP48023 281 aa6.27□□□□□ -1.41
RABGEF1-202ENST00000380828 CLDN18P56856 261 aa6.27□□□□□ -1.41
RABGEF1-202ENST00000380828 EMX2Q04743 252 aa6.27□□□□□ -1.41
RABGEF1-202ENST00000380828 IL18Q14116 193 aa6.27□□□□□ -1.41
RABGEF1-202ENST00000380828 HERPUD1Q15011 391 aa6.27□□□□□ -1.41
RABGEF1-202ENST00000380828 XKR6Q5GH73 641 aa6.27□□□□□ -1.41
RABGEF1-202ENST00000380828 CYP2R1Q6VVX0 501 aa6.27□□□□□ -1.41
RABGEF1-202ENST00000380828 CRLF3Q8IUI8 442 aa6.27□□□□□ -1.41
RABGEF1-202ENST00000380828 OR11H7Q8NGC8 314 aa6.27□□□□□ -1.41
RABGEF1-202ENST00000380828 OR10AD1Q8NGE0 317 aa6.27□□□□□ -1.41
RABGEF1-202ENST00000380828 TERB2Q8NHR7 220 aa6.27□□□□□ -1.41
RABGEF1-202ENST00000380828 SLC2A12Q8TD20 617 aa6.27□□□□□ -1.41
RABGEF1-202ENST00000380828 C11orf40Q8WZ69 217 aa6.27□□□□□ -1.41
RABGEF1-202ENST00000380828 DNAJC19Q96DA6 116 aa6.27□□□□□ -1.41
RABGEF1-202ENST00000380828 MOCOSQ96EN8 888 aa6.27□□□□□ -1.41
RABGEF1-202ENST00000380828 OR2V2Q96R30 315 aa6.27□□□□□ -1.41
RABGEF1-202ENST00000380828 COMMD4Q9H0A8 199 aa6.27□□□□□ -1.41
RABGEF1-202ENST00000380828 RNF167Q9H6Y7 350 aa6.27□□□□□ -1.41
RABGEF1-202ENST00000380828 TMEM248Q9NWD8 314 aa6.27□□□□□ -1.41
RABGEF1-202ENST00000380828 ZNF222Q9UK12 451 aa6.27□□□□□ -1.41
RABGEF1-202ENST00000380828 RASD1Q9Y272 281 aa6.27□□□□□ -1.41
RABGEF1-202ENST00000380828 TRDCB7Z8K6 153 aa6.26□□□□□ -1.41
RABGEF1-202ENST00000380828 AGPAT2O15120 278 aa6.26□□□□□ -1.41
RABGEF1-202ENST00000380828 FAM189A1O60320 539 aa6.26□□□□□ -1.41
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RABGEF1-202ENST00000380828 CXCL3P19876 107 aa6.26□□□□□ -1.41
RABGEF1-202ENST00000380828 DCTDP32321 178 aa6.26□□□□□ -1.41
RABGEF1-202ENST00000380828 FLT3LGP49771 235 aa6.26□□□□□ -1.41
RABGEF1-202ENST00000380828 FAM3AP98173 230 aa6.26□□□□□ -1.41
RABGEF1-202ENST00000380828 ST3GAL4Q11206 333 aa6.26□□□□□ -1.41
RABGEF1-202ENST00000380828 GNMTQ14749 295 aa6.26□□□□□ -1.41
RABGEF1-202ENST00000380828 TIGD5Q53EQ6 642 aa6.26□□□□□ -1.41
RABGEF1-202ENST00000380828 KHDC3LQ587J8 217 aa6.26□□□□□ -1.41
RABGEF1-202ENST00000380828 CBWD2Q8IUF1 395 aa6.26□□□□□ -1.41
RABGEF1-202ENST00000380828 DIO2Q92813 273 aa6.26□□□□□ -1.41
RABGEF1-202ENST00000380828 UPRTQ96BW1 309 aa6.26□□□□□ -1.41
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RABGEF1-202ENST00000380828 OR2M4Q96R27 311 aa6.26□□□□□ -1.41
RABGEF1-202ENST00000380828 PCDHB18PQ96TA0 734 aa6.26□□□□□ -1.41
RABGEF1-202ENST00000380828 ARV1Q9H2C2 271 aa6.26□□□□□ -1.41
RABGEF1-202ENST00000380828 UBE2ZQ9H832 354 aaPredicted RBP6.26□□□□□ -1.41
RABGEF1-202ENST00000380828 ZNF160Q9HCG1 818 aa6.26□□□□□ -1.41
RABGEF1-202ENST00000380828 OR2S2Q9NQN1 319 aa6.26□□□□□ -1.41
RABGEF1-202ENST00000380828 ZNF701Q9NV72 531 aaPredicted RBP6.26□□□□□ -1.41
RABGEF1-202ENST00000380828 PILRBQ9UKJ0 227 aa6.26□□□□□ -1.41
RABGEF1-202ENST00000380828 ANKRD20A5PA0PJZ0 165 aa6.26□□□□□ -1.41
RABGEF1-202ENST00000380828 MAGEB17A8MXT2 336 aa6.26□□□□□ -1.41
RABGEF1-202ENST00000380828 SOX1O00570 391 aaPredicted RBP6.26□□□□□ -1.41
RABGEF1-202ENST00000380828 CRHBPP24387 322 aa6.26□□□□□ -1.41
RABGEF1-202ENST00000380828 MATKP42679 507 aa6.26□□□□□ -1.41
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RABGEF1-202ENST00000380828 FOXN4Q96NZ1 517 aa6.26□□□□□ -1.41
RABGEF1-202ENST00000380828 CLCC1Q96S66 551 aa6.26□□□□□ -1.41
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RABGEF1-202ENST00000380828 SUSD2Q9UGT4 822 aa6.26□□□□□ -1.41
RABGEF1-202ENST00000380828 GPR25O00155 361 aa6.26□□□□□ -1.41
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RABGEF1-202ENST00000380828 LMO3Q8TAP4 145 aa6.26□□□□□ -1.41
RABGEF1-202ENST00000380828 CNOT9Q92600 299 aaKnown RBP6.26□□□□□ -1.41
RABGEF1-202ENST00000380828 SLC35C1Q96A29 364 aa6.26□□□□□ -1.41
RABGEF1-202ENST00000380828 YIPF6Q96EC8 236 aa6.26□□□□□ -1.41
RABGEF1-202ENST00000380828 P2RY11Q96G91 374 aa6.26□□□□□ -1.41
RABGEF1-202ENST00000380828 SEPT5Q99719 369 aaPredicted RBP6.26□□□□□ -1.41
RABGEF1-202ENST00000380828 XYLT2Q9H1B5 865 aa6.26□□□□□ -1.41
RABGEF1-202ENST00000380828 TLNRD1Q9H1K6 362 aa6.26□□□□□ -1.41
RABGEF1-202ENST00000380828 B3GAT2Q9NPZ5 323 aa6.26□□□□□ -1.41
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