RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000359315.6

TPGS1-201, Transcript of tubulin polyglutamylase complex subunit 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TPGS1, Length 1,114 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPGS1-201ENST00000359315 TEX15Q9BXT5 2789 aa23.83■■□□□ 1.41
TPGS1-201ENST00000359315 CXCR6O00574 342 aa23.83■■□□□ 1.41
TPGS1-201ENST00000359315 MRPL33O75394 65 aaKnown RBP23.83■■□□□ 1.41
TPGS1-201ENST00000359315 BGLAPP02818 100 aa23.83■■□□□ 1.41
TPGS1-201ENST00000359315 NCK1P16333 377 aa23.83■■□□□ 1.41
TPGS1-201ENST00000359315 COX5AP20674 150 aa23.83■■□□□ 1.41
TPGS1-201ENST00000359315 LOXP28300 417 aaPredicted RBP23.83■■□□□ 1.41
TPGS1-201ENST00000359315 ITGADQ13349 1161 aa23.83■■□□□ 1.41
TPGS1-201ENST00000359315 FBXW9Q5XUX1 488 aa23.83■■□□□ 1.41
TPGS1-201ENST00000359315 TMEM225Q6GV28 225 aa23.83■■□□□ 1.41
TPGS1-201ENST00000359315 DEF8Q6ZN54 512 aa23.83■■□□□ 1.41
TPGS1-201ENST00000359315 EPHX4Q8IUS5 362 aa23.83■■□□□ 1.41
TPGS1-201ENST00000359315 KISS1RQ969F8 398 aaPredicted RBP23.83■■□□□ 1.41
TPGS1-201ENST00000359315 TPD52L3Q96J77 140 aa23.83■■□□□ 1.41
TPGS1-201ENST00000359315 PRSS27Q9BQR3 290 aa23.83■■□□□ 1.41
TPGS1-201ENST00000359315 FANCFQ9NPI8 374 aa23.83■■□□□ 1.41
TPGS1-201ENST00000359315 ZNF226Q9NYT6 803 aa23.83■■□□□ 1.41
TPGS1-201ENST00000359315 B3GAT1Q9P2W7 334 aa23.83■■□□□ 1.41
TPGS1-201ENST00000359315 TRAPPC13A5PLN9 417 aa23.82■■□□□ 1.4
TPGS1-201ENST00000359315 IL32P24001 234 aa23.82■■□□□ 1.4
TPGS1-201ENST00000359315 P2RY6Q15077 328 aa23.82■■□□□ 1.4
TPGS1-201ENST00000359315 TSPO2Q5TGU0 170 aa23.82■■□□□ 1.4
TPGS1-201ENST00000359315 C5orf46Q6UWT4 87 aa23.82■■□□□ 1.4
TPGS1-201ENST00000359315 VTCN1Q7Z7D3 282 aa23.82■■□□□ 1.4
TPGS1-201ENST00000359315 WFDC8Q8IUA0 241 aa23.82■■□□□ 1.4
TPGS1-201ENST00000359315 UBE2J2Q8N2K1 259 aa23.82■■□□□ 1.4
TPGS1-201ENST00000359315 RNF148Q8N7C7 305 aa23.82■■□□□ 1.4
TPGS1-201ENST00000359315 TMEM45BQ96B21 275 aa23.82■■□□□ 1.4
TPGS1-201ENST00000359315 PIK3IP1Q96FE7 263 aa23.82■■□□□ 1.4
TPGS1-201ENST00000359315 TMEM43Q9BTV4 400 aa23.82■■□□□ 1.4
TPGS1-201ENST00000359315 SLC7A10Q9NS82 523 aa23.82■■□□□ 1.4
TPGS1-201ENST00000359315 TAGLN3Q9UI15 199 aa23.82■■□□□ 1.4
TPGS1-201ENST00000359315 PDZD2O15018 2839 aa23.81■■□□□ 1.4
TPGS1-201ENST00000359315 OR2T1O43869 369 aa23.81■■□□□ 1.4
TPGS1-201ENST00000359315 DCTN3O75935 186 aa23.81■■□□□ 1.4
TPGS1-201ENST00000359315 FAM107AO95990 144 aa23.81■■□□□ 1.4
TPGS1-201ENST00000359315 IFNA14P01570 189 aa23.81■■□□□ 1.4
TPGS1-201ENST00000359315 PPP3CBP16298 524 aa23.81■■□□□ 1.4
TPGS1-201ENST00000359315 FUT4P22083 530 aa23.81■■□□□ 1.4
TPGS1-201ENST00000359315 GTF2E2P29084 291 aaKnown RBP23.81■■□□□ 1.4
TPGS1-201ENST00000359315 ALKBH2Q6NS38 261 aa23.81■■□□□ 1.4
TPGS1-201ENST00000359315 CREB3L2Q70SY1 520 aa23.81■■□□□ 1.4
TPGS1-201ENST00000359315 BHLHA15Q7RTS1 189 aaPredicted RBP23.81■■□□□ 1.4
TPGS1-201ENST00000359315 ANKS4BQ8N8V4 417 aa23.81■■□□□ 1.4
TPGS1-201ENST00000359315 STEAP2Q8NFT2 490 aa23.81■■□□□ 1.4
TPGS1-201ENST00000359315 SLC41A3Q96GZ6 507 aa23.81■■□□□ 1.4
TPGS1-201ENST00000359315 KCTD14Q9BQ13 255 aaPredicted RBP23.81■■□□□ 1.4
TPGS1-201ENST00000359315 OR10A4Q9H209 315 aa23.81■■□□□ 1.4
TPGS1-201ENST00000359315 SPAG4Q9NPE6 437 aa23.81■■□□□ 1.4
TPGS1-201ENST00000359315 MALT1Q9UDY8 824 aa23.81■■□□□ 1.4
TPGS1-201ENST00000359315 RASD1Q9Y272 281 aa23.81■■□□□ 1.4
TPGS1-201ENST00000359315 POLQO75417 2590 aa23.8■■□□□ 1.4
TPGS1-201ENST00000359315 KLF4O43474 513 aa23.8■■□□□ 1.4
TPGS1-201ENST00000359315 SELENOWP63302 87 aa23.8■■□□□ 1.4
TPGS1-201ENST00000359315 LGALS3BPQ08380 585 aa23.8■■□□□ 1.4
TPGS1-201ENST00000359315 FAPQ12884 760 aa23.8■■□□□ 1.4
TPGS1-201ENST00000359315 PIN1Q13526 163 aaPredicted RBP23.8■■□□□ 1.4
TPGS1-201ENST00000359315 TAB1Q15750 504 aa23.8■■□□□ 1.4
TPGS1-201ENST00000359315 SEZ6L2Q6UXD5 910 aa23.8■■□□□ 1.4
TPGS1-201ENST00000359315 AAED1Q7RTV5 226 aa23.8■■□□□ 1.4
TPGS1-201ENST00000359315 FITM2Q8N6M3 262 aa23.8■■□□□ 1.4
TPGS1-201ENST00000359315 FAM156AQ8NDB6 213 aa23.8■■□□□ 1.4
TPGS1-201ENST00000359315 ZNF426Q9BUY5 554 aa23.8■■□□□ 1.4
TPGS1-201ENST00000359315 PLEKHF2Q9H8W4 249 aa23.8■■□□□ 1.4
TPGS1-201ENST00000359315 ADA2Q9NZK5 511 aa23.8■■□□□ 1.4
TPGS1-201ENST00000359315 EGFL7Q9UHF1 273 aa23.8■■□□□ 1.4
TPGS1-201ENST00000359315 MBD3L2BA0A1B0GVZ6 204 aaPredicted RBP23.79■■□□□ 1.4
TPGS1-201ENST00000359315 KPNA4O00629 521 aaPredicted RBP23.79■■□□□ 1.4
TPGS1-201ENST00000359315 GSTA4O15217 222 aa23.79■■□□□ 1.4
TPGS1-201ENST00000359315 CNOT4O95628 575 aaKnown RBP23.79■■□□□ 1.4
TPGS1-201ENST00000359315 HPRP00739 348 aa23.79■■□□□ 1.4
TPGS1-201ENST00000359315 ITGA5P08648 1049 aa23.79■■□□□ 1.4
TPGS1-201ENST00000359315 DNAJA1P31689 397 aaKnown RBP23.79■■□□□ 1.4
TPGS1-201ENST00000359315 SELENOPP49908 381 aa23.79■■□□□ 1.4
TPGS1-201ENST00000359315 SLC25A3Q00325 362 aa23.79■■□□□ 1.4
TPGS1-201ENST00000359315 C9orf135Q5VTT2 229 aa23.79■■□□□ 1.4
TPGS1-201ENST00000359315 NKAIN4Q8IVV8 208 aa23.79■■□□□ 1.4
TPGS1-201ENST00000359315 ZNF433Q8N7K0 673 aaPredicted RBP23.79■■□□□ 1.4
TPGS1-201ENST00000359315 RBM15BQ8NDT2 890 aaKnown RBP23.79■■□□□ 1.4
TPGS1-201ENST00000359315 EPYCQ99645 322 aa23.79■■□□□ 1.4
TPGS1-201ENST00000359315 HDHD5Q9BXW7 423 aa23.79■■□□□ 1.4
TPGS1-201ENST00000359315 SNX13Q9Y5W8 968 aa23.79■■□□□ 1.4
TPGS1-201ENST00000359315 FREM1Q5H8C1 2179 aa23.78■■□□□ 1.4
TPGS1-201ENST00000359315 PDLIM1O00151 329 aa23.78■■□□□ 1.4
TPGS1-201ENST00000359315 RAD51DO75771 328 aa23.78■■□□□ 1.4
TPGS1-201ENST00000359315 VAMP5O95183 116 aa23.78■■□□□ 1.4
TPGS1-201ENST00000359315 GOSR1O95249 250 aa23.78■■□□□ 1.4
TPGS1-201ENST00000359315 ZNF682O95780 498 aa23.78■■□□□ 1.4
TPGS1-201ENST00000359315 SERPINA1P01009 418 aa23.78■■□□□ 1.4
TPGS1-201ENST00000359315 GGT1P19440 569 aa23.78■■□□□ 1.4
TPGS1-201ENST00000359315 FOXD4Q12950 439 aaPredicted RBP23.78■■□□□ 1.4
TPGS1-201ENST00000359315 C10orf53Q8N6V4 93 aa23.78■■□□□ 1.4
TPGS1-201ENST00000359315 OR6S1Q8NH40 331 aa23.78■■□□□ 1.4
TPGS1-201ENST00000359315 ASB6Q9NWX5 421 aa23.78■■□□□ 1.4
TPGS1-201ENST00000359315 MPDZO75970 2070 aa23.78■■□□□ 1.4
TPGS1-201ENST00000359315 LRBAP50851 2863 aa23.77■■□□□ 1.4
TPGS1-201ENST00000359315 HLA-DOBP13765 273 aa23.77■■□□□ 1.4
TPGS1-201ENST00000359315 YAP1P46937 504 aaKnown RBP23.77■■□□□ 1.4
TPGS1-201ENST00000359315 TAS2R41P59536 307 aa23.77■■□□□ 1.4
TPGS1-201ENST00000359315 STK11Q15831 433 aa23.77■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 103.8 ms