RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000342084.8

PTPRR-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type R, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC

Gene PTPRR, Length 2,037 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRR-202ENST00000342084 MKKSQ9NPJ1 570 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
PTPRR-202ENST00000342084 NRIP3Q9NQ35 241 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRR-202ENST00000342084 STMN3Q9NZ72 180 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRR-202ENST00000342084 KLK11Q9UBX7 282 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRR-202ENST00000342084 ERVK-19Q9WJR5 959 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRR-202ENST00000342084 NPFFR2Q9Y5X5 522 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRR-202ENST00000342084 TRIOO75962 3097 aa6.65□□□□□ -1.34
PTPRR-202ENST00000342084 IGKV1D-42A0A075B6H8 117 aa6.65□□□□□ -1.35
PTPRR-202ENST00000342084 TVP23AA6NH52 213 aa6.65□□□□□ -1.35
PTPRR-202ENST00000342084 ICMTO60725 284 aa6.65□□□□□ -1.35
PTPRR-202ENST00000342084 PEX14O75381 377 aa6.65□□□□□ -1.35
PTPRR-202ENST00000342084 ARL6IP5O75915 188 aa6.65□□□□□ -1.35
PTPRR-202ENST00000342084 ZFPL1O95159 310 aa6.65□□□□□ -1.35
PTPRR-202ENST00000342084 MPC2O95563 127 aa6.65□□□□□ -1.35
PTPRR-202ENST00000342084 APBB3O95704 486 aa6.65□□□□□ -1.35
PTPRR-202ENST00000342084 AK1P00568 194 aa6.65□□□□□ -1.35
PTPRR-202ENST00000342084 SERPINA3P01011 423 aa6.65□□□□□ -1.35
PTPRR-202ENST00000342084 CSTAP01040 98 aa6.65□□□□□ -1.35
PTPRR-202ENST00000342084 F13BP05160 661 aa6.65□□□□□ -1.35
PTPRR-202ENST00000342084 SLC35E2P0CK97 266 aa6.65□□□□□ -1.35
PTPRR-202ENST00000342084 SRMP19623 302 aa6.65□□□□□ -1.35
PTPRR-202ENST00000342084 AQP2P41181 271 aa6.65□□□□□ -1.35
PTPRR-202ENST00000342084 CDKN2AP42771 156 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.35
PTPRR-202ENST00000342084 DIO1P49895 249 aa6.65□□□□□ -1.35
PTPRR-202ENST00000342084 ZNF81P51508 661 aa6.65□□□□□ -1.35
PTPRR-202ENST00000342084 TPMTP51580 245 aa6.65□□□□□ -1.35
PTPRR-202ENST00000342084 ACTA2P62736 377 aa6.65□□□□□ -1.35
PTPRR-202ENST00000342084 ACTG2P63267 376 aa6.65□□□□□ -1.35
PTPRR-202ENST00000342084 PITPNAQ00169 270 aa6.65□□□□□ -1.35
PTPRR-202ENST00000342084 POU4F2Q12837 409 aa6.65□□□□□ -1.35
PTPRR-202ENST00000342084 STX4Q12846 297 aa6.65□□□□□ -1.35
PTPRR-202ENST00000342084 ILF3Q12906 894 aaKnown RBP eCLIP6.65□□□□□ -1.35
PTPRR-202ENST00000342084 SNTB2Q13425 540 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.35
PTPRR-202ENST00000342084 FGFBP1Q14512 234 aa6.65□□□□□ -1.35
PTPRR-202ENST00000342084 PON3Q15166 354 aa6.65□□□□□ -1.35
PTPRR-202ENST00000342084 ZNHIT3Q15649 155 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.35
PTPRR-202ENST00000342084 HYAL4Q2M3T9 481 aa6.65□□□□□ -1.35
PTPRR-202ENST00000342084 LGALSLQ3ZCW2 172 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.35
PTPRR-202ENST00000342084 UBE2NLQ5JXB2 153 aa6.65□□□□□ -1.35
PTPRR-202ENST00000342084 ZBTB37Q5TC79 503 aa6.65□□□□□ -1.35
PTPRR-202ENST00000342084 CD276Q5ZPR3 534 aa6.65□□□□□ -1.35
PTPRR-202ENST00000342084 ZCCHC12Q6PEW1 402 aa6.65□□□□□ -1.35
PTPRR-202ENST00000342084 ULK3Q6PHR2 472 aa6.65□□□□□ -1.35
PTPRR-202ENST00000342084 TEX261Q6UWH6 196 aa6.65□□□□□ -1.35
PTPRR-202ENST00000342084 LINC00114Q6XXX2 140 aa6.65□□□□□ -1.35
PTPRR-202ENST00000342084 LUZP2Q86TE4 346 aa6.65□□□□□ -1.35
PTPRR-202ENST00000342084 ELMOD2Q8IZ81 293 aa6.65□□□□□ -1.35
PTPRR-202ENST00000342084 ZNF321PQ8N8H1 164 aa6.65□□□□□ -1.35
PTPRR-202ENST00000342084 TEX19Q8NA77 164 aa6.65□□□□□ -1.35
PTPRR-202ENST00000342084 OR8K3Q8NH51 312 aa6.65□□□□□ -1.35
PTPRR-202ENST00000342084 OR14A16Q8NHC5 309 aa6.65□□□□□ -1.35
PTPRR-202ENST00000342084 SLC2A12Q8TD20 617 aa6.65□□□□□ -1.35
PTPRR-202ENST00000342084 RNF166Q96A37 237 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.35
PTPRR-202ENST00000342084 FOXN4Q96NZ1 517 aa6.65□□□□□ -1.35
PTPRR-202ENST00000342084 OR2M2Q96R28 347 aa6.65□□□□□ -1.35
PTPRR-202ENST00000342084 ELF4Q99607 663 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.35
PTPRR-202ENST00000342084 LMF2Q9BU23 707 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.35
PTPRR-202ENST00000342084 SEMA4CQ9C0C4 833 aa6.65□□□□□ -1.35
PTPRR-202ENST00000342084 LMAN2LQ9H0V9 348 aa6.65□□□□□ -1.35
PTPRR-202ENST00000342084 HEXA-AS1Q9H8Q6 139 aa6.65□□□□□ -1.35
PTPRR-202ENST00000342084 COQ3Q9NZJ6 369 aa6.65□□□□□ -1.35
PTPRR-202ENST00000342084 ABRACLQ9P1F3 81 aa6.65□□□□□ -1.35
PTPRR-202ENST00000342084 EIF3KQ9UBQ5 218 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.35
PTPRR-202ENST00000342084 ING1Q9UK53 422 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.35
PTPRR-202ENST00000342084 SPATA2Q9UM82 520 aa6.65□□□□□ -1.35
PTPRR-202ENST00000342084 BAIAP2Q9UQB8 552 aa6.65□□□□□ -1.35
PTPRR-202ENST00000342084 CAMK2AQ9UQM7 478 aa6.65□□□□□ -1.35
PTPRR-202ENST00000342084 U3KQ87 197 aa6.65□□□□□ -1.35
PTPRR-202ENST00000342084 MEIKINA0A087WXM9 373 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRR-202ENST00000342084 TCRBV21S2A2A0A5A6 115 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRR-202ENST00000342084 CIB4A0PJX0 185 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRR-202ENST00000342084 TMEM72A0PK05 275 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRR-202ENST00000342084 B4DGG1 531 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRR-202ENST00000342084 G3V3Q6 166 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRR-202ENST00000342084 DCTN6O00399 190 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRR-202ENST00000342084 ARPC1BO15143 372 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
PTPRR-202ENST00000342084 KHDRBS3O75525 346 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
PTPRR-202ENST00000342084 SLC22A5O76082 557 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRR-202ENST00000342084 OR7A10O76100 309 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRR-202ENST00000342084 CRYZL1O95825 349 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRR-202ENST00000342084 CFDP00746 253 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
PTPRR-202ENST00000342084 RAF1P04049 648 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRR-202ENST00000342084 HRGP04196 525 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRR-202ENST00000342084 SULT1A3P0DMM9 295 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRR-202ENST00000342084 SULT1A4P0DMN0 295 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRR-202ENST00000342084 CTHP32929 405 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRR-202ENST00000342084 RBM34P42696 430 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
PTPRR-202ENST00000342084 RAD52P43351 418 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRR-202ENST00000342084 CCR9P51686 369 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRR-202ENST00000342084 UBE2IP63279 158 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
PTPRR-202ENST00000342084 DLX2Q07687 328 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
PTPRR-202ENST00000342084 C19orf57Q0VDD7 668 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRR-202ENST00000342084 CAMK2DQ13557 499 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRR-202ENST00000342084 GGTLC2Q14390 218 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRR-202ENST00000342084 CD226Q15762 336 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRR-202ENST00000342084 TOR2AQ5JU69 321 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRR-202ENST00000342084 LINC01590Q5TEZ4 76 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRR-202ENST00000342084 RPL22L1Q6P5R6 122 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
PTPRR-202ENST00000342084 CBLN3Q6UW01 205 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRR-202ENST00000342084 BTN2A1Q7KYR7 527 aa6.64□□□□□ -1.35
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