RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000313173.5

HOXD8-201, Transcript of homeobox D8, humanhuman

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene HOXD8, Length 1,917 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8-201ENST00000313173 OCEL1Q9H607 264 aa24.33■■□□□ 1.49
HOXD8-201ENST00000313173 SIAEQ9HAT2 523 aa24.33■■□□□ 1.49
HOXD8-201ENST00000313173 HS3ST3B1Q9Y662 390 aa24.33■■□□□ 1.49
HOXD8-201ENST00000313173 A8MVM7 634 aa24.32■■□□□ 1.48
HOXD8-201ENST00000313173 J3QRK9 145 aa24.32■■□□□ 1.48
HOXD8-201ENST00000313173 SLC30A4O14863 429 aa24.32■■□□□ 1.48
HOXD8-201ENST00000313173 TXNDC12O95881 172 aa24.32■■□□□ 1.48
HOXD8-201ENST00000313173 SOX6P35712 828 aa24.32■■□□□ 1.48
HOXD8-201ENST00000313173 EXT1Q16394 746 aa24.32■■□□□ 1.48
HOXD8-201ENST00000313173 ZFP41Q8N8Y5 198 aa24.32■■□□□ 1.48
HOXD8-201ENST00000313173 TMEM203Q969S6 136 aa24.32■■□□□ 1.48
HOXD8-201ENST00000313173 IMMP1LQ96LU5 166 aa24.32■■□□□ 1.48
HOXD8-201ENST00000313173 TIMP4Q99727 224 aa24.32■■□□□ 1.48
HOXD8-201ENST00000313173 LRFN3Q9BTN0 628 aa24.32■■□□□ 1.48
HOXD8-201ENST00000313173 TXNL4BQ9NX01 149 aaKnown RBP24.32■■□□□ 1.48
HOXD8-201ENST00000313173 TOR4AQ9NXH8 423 aa24.32■■□□□ 1.48
HOXD8-201ENST00000313173 KLRF1Q9NZS2 232 aa24.32■■□□□ 1.48
HOXD8-201ENST00000313173 YARS2Q9Y2Z4 477 aaKnown RBP24.32■■□□□ 1.48
HOXD8-201ENST00000313173 SDHAP31040 664 aa24.31■■□□□ 1.48
HOXD8-201ENST00000313173 SLC35D3Q5M8T2 416 aa24.31■■□□□ 1.48
HOXD8-201ENST00000313173 C1QL3Q5VWW1 255 aa24.31■■□□□ 1.48
HOXD8-201ENST00000313173 OR5M10Q6IEU7 315 aa24.31■■□□□ 1.48
HOXD8-201ENST00000313173 KLBQ86Z14 1044 aa24.31■■□□□ 1.48
HOXD8-201ENST00000313173 MFSD4AQ8N468 514 aa24.31■■□□□ 1.48
HOXD8-201ENST00000313173 POMGNT2Q8NAT1 580 aa24.31■■□□□ 1.48
HOXD8-201ENST00000313173 STK35Q8TDR2 534 aa24.31■■□□□ 1.48
HOXD8-201ENST00000313173 RASL10BQ96S79 203 aa24.31■■□□□ 1.48
HOXD8-201ENST00000313173 EDEM2Q9BV94 578 aa24.31■■□□□ 1.48
HOXD8-201ENST00000313173 ISG20L2Q9H9L3 353 aaKnown RBP24.31■■□□□ 1.48
HOXD8-201ENST00000313173 C2orf72A6NCS6 295 aa24.31■■□□□ 1.48
HOXD8-201ENST00000313173 OR6C68A6NDL8 312 aa24.31■■□□□ 1.48
HOXD8-201ENST00000313173 DKK1O94907 266 aa24.31■■□□□ 1.48
HOXD8-201ENST00000313173 BMP4P12644 408 aa24.31■■□□□ 1.48
HOXD8-201ENST00000313173 FOLR3P41439 243 aa24.31■■□□□ 1.48
HOXD8-201ENST00000313173 DLX5P56178 289 aa24.31■■□□□ 1.48
HOXD8-201ENST00000313173 IL10RAQ13651 578 aa24.31■■□□□ 1.48
HOXD8-201ENST00000313173 NTRK2Q16620 822 aa24.31■■□□□ 1.48
HOXD8-201ENST00000313173 CCDC157Q569K6 752 aa24.31■■□□□ 1.48
HOXD8-201ENST00000313173 C5orf46Q6UWT4 87 aa24.31■■□□□ 1.48
HOXD8-201ENST00000313173 MAMDC2Q7Z304 686 aaPredicted RBP24.31■■□□□ 1.48
HOXD8-201ENST00000313173 JAZF1Q86VZ6 243 aa24.31■■□□□ 1.48
HOXD8-201ENST00000313173 LSM14AQ8ND56 463 aaKnown RBP24.31■■□□□ 1.48
HOXD8-201ENST00000313173 ATP6V1C2Q8NEY4 427 aa24.31■■□□□ 1.48
HOXD8-201ENST00000313173 ZPLD1Q8TCW7 415 aa24.31■■□□□ 1.48
HOXD8-201ENST00000313173 ZMYND19Q96E35 227 aaPredicted RBP24.31■■□□□ 1.48
HOXD8-201ENST00000313173 SPACA9Q96E40 222 aaPredicted RBP24.31■■□□□ 1.48
HOXD8-201ENST00000313173 B4DXG7 233 aa24.3■■□□□ 1.48
HOXD8-201ENST00000313173 STK17BO94768 372 aa24.3■■□□□ 1.48
HOXD8-201ENST00000313173 PRKCAP17252 672 aa24.3■■□□□ 1.48
HOXD8-201ENST00000313173 SPI1P17947 270 aa24.3■■□□□ 1.48
HOXD8-201ENST00000313173 DIO1P49895 249 aa24.3■■□□□ 1.48
HOXD8-201ENST00000313173 PON3Q15166 354 aa24.3■■□□□ 1.48
HOXD8-201ENST00000313173 EMC4Q5J8M3 183 aa24.3■■□□□ 1.48
HOXD8-201ENST00000313173 FAM69AQ5T7M9 428 aa24.3■■□□□ 1.48
HOXD8-201ENST00000313173 C1orf140Q5VVS0 124 aa24.3■■□□□ 1.48
HOXD8-201ENST00000313173 CD200R1LQ6Q8B3 271 aa24.3■■□□□ 1.48
HOXD8-201ENST00000313173 OR10G3Q8NGC4 313 aa24.3■■□□□ 1.48
HOXD8-201ENST00000313173 C1GALT1C1Q96EU7 318 aa24.3■■□□□ 1.48
HOXD8-201ENST00000313173 CNN2Q99439 309 aaKnown RBP24.3■■□□□ 1.48
HOXD8-201ENST00000313173 ZPBPQ9BS86 351 aa24.3■■□□□ 1.48
HOXD8-201ENST00000313173 ASB6Q9NWX5 421 aa24.3■■□□□ 1.48
HOXD8-201ENST00000313173 BABAM2Q9NXR7 383 aa24.3■■□□□ 1.48
HOXD8-201ENST00000313173 F13BP05160 661 aa24.29■■□□□ 1.48
HOXD8-201ENST00000313173 ZNF85Q03923 595 aa24.29■■□□□ 1.48
HOXD8-201ENST00000313173 BICRALQ6AI39 1079 aa24.29■■□□□ 1.48
HOXD8-201ENST00000313173 LEG1Q6P5S2 330 aa24.29■■□□□ 1.48
HOXD8-201ENST00000313173 C16orf87Q6PH81 154 aa24.29■■□□□ 1.48
HOXD8-201ENST00000313173 C6orf62Q9GZU0 229 aaPredicted RBP24.29■■□□□ 1.48
HOXD8-201ENST00000313173 WDR70Q9NW82 654 aa24.29■■□□□ 1.48
HOXD8-201ENST00000313173 MED11Q9P086 117 aa24.29■■□□□ 1.48
HOXD8-201ENST00000313173 IGLV3-32A0A0A0MS00 114 aa24.29■■□□□ 1.48
HOXD8-201ENST00000313173 TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 330 aa24.29■■□□□ 1.48
HOXD8-201ENST00000313173 CBFA2T3O75081 653 aa24.29■■□□□ 1.48
HOXD8-201ENST00000313173 CD63P08962 238 aa24.29■■□□□ 1.48
HOXD8-201ENST00000313173 MSX1P28360 303 aa24.29■■□□□ 1.48
HOXD8-201ENST00000313173 PTGDSP41222 190 aa24.29■■□□□ 1.48
HOXD8-201ENST00000313173 CDKN2AP42771 156 aaKnown RBP24.29■■□□□ 1.48
HOXD8-201ENST00000313173 SLC25A1P53007 311 aa24.29■■□□□ 1.48
HOXD8-201ENST00000313173 E2F1Q01094 437 aa24.29■■□□□ 1.48
HOXD8-201ENST00000313173 INSM1Q01101 510 aaPredicted RBP24.29■■□□□ 1.48
HOXD8-201ENST00000313173 CRTC2Q53ET0 693 aaPredicted RBP24.29■■□□□ 1.48
HOXD8-201ENST00000313173 RAB11FIP2Q7L804 512 aa24.29■■□□□ 1.48
HOXD8-201ENST00000313173 M1APQ8TC57 530 aa24.29■■□□□ 1.48
HOXD8-201ENST00000313173 TM9SF2Q99805 663 aa24.29■■□□□ 1.48
HOXD8-201ENST00000313173 METTL7AQ9H8H3 244 aa24.29■■□□□ 1.48
HOXD8-201ENST00000313173 TMEM9BQ9NQ34 198 aa24.29■■□□□ 1.48
HOXD8-201ENST00000313173 SDHAF3Q9NRP4 125 aa24.29■■□□□ 1.48
HOXD8-201ENST00000313173 PPP4R1LQ9P1A2 415 aa24.29■■□□□ 1.48
HOXD8-201ENST00000313173 LRRTM2O43300 516 aa24.28■■□□□ 1.48
HOXD8-201ENST00000313173 SERPINI2O75830 405 aa24.28■■□□□ 1.48
HOXD8-201ENST00000313173 IGHEP01854 428 aa24.28■■□□□ 1.48
HOXD8-201ENST00000313173 MT-ND5P03915 603 aa24.28■■□□□ 1.48
HOXD8-201ENST00000313173 CELP19835 753 aa24.28■■□□□ 1.48
HOXD8-201ENST00000313173 RPS19P39019 145 aaKnown RBP24.28■■□□□ 1.48
HOXD8-201ENST00000313173 GPR50Q13585 617 aa24.28■■□□□ 1.48
HOXD8-201ENST00000313173 SGCBQ16585 318 aa24.28■■□□□ 1.48
HOXD8-201ENST00000313173 GPR139Q6DWJ6 353 aa24.28■■□□□ 1.48
HOXD8-201ENST00000313173 C22orf42Q6IC83 251 aa24.28■■□□□ 1.48
HOXD8-201ENST00000313173 GHDCQ8N2G8 530 aa24.28■■□□□ 1.48
HOXD8-201ENST00000313173 OR51L1Q8NGJ5 315 aa24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.2 ms