RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000293845.7

CCDC42-201, Transcript of coiled-coil domain containing 42, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene CCDC42, Length 1,374 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC42-201ENST00000293845 ZNF716A6NP11 495 aa11.8□□□□□ -0.52
CCDC42-201ENST00000293845 LRRN3E7EW58 273 aa11.8□□□□□ -0.52
CCDC42-201ENST00000293845 PIP5K1CO60331 668 aa11.8□□□□□ -0.52
CCDC42-201ENST00000293845 SS18L1O75177 396 aaPredicted RBP11.8□□□□□ -0.52
CCDC42-201ENST00000293845 AKR7A3O95154 331 aa11.8□□□□□ -0.52
CCDC42-201ENST00000293845 VAMP5O95183 116 aa11.8□□□□□ -0.52
CCDC42-201ENST00000293845 IL18BPO95998 194 aa11.8□□□□□ -0.52
CCDC42-201ENST00000293845 ASAH2BP0C7U1 165 aa11.8□□□□□ -0.52
CCDC42-201ENST00000293845 TMIGD3P0DMS9 266 aaPredicted RBP11.8□□□□□ -0.52
CCDC42-201ENST00000293845 LSM11P83369 360 aaKnown RBP eCLIP11.8□□□□□ -0.52
CCDC42-201ENST00000293845 PRKCDQ05655 676 aa11.8□□□□□ -0.52
CCDC42-201ENST00000293845 SRSF1Q07955 248 aaKnown RBP eCLIP11.8□□□□□ -0.52
CCDC42-201ENST00000293845 KPNB1Q14974 876 aaKnown RBP11.8□□□□□ -0.52
CCDC42-201ENST00000293845 OTUD3Q5T2D3 398 aaPredicted RBP11.8□□□□□ -0.52
CCDC42-201ENST00000293845 ZNF730Q6ZMV8 503 aa11.8□□□□□ -0.52
CCDC42-201ENST00000293845 MAMDC2Q7Z304 686 aaPredicted RBP11.8□□□□□ -0.52
CCDC42-201ENST00000293845 NRMQ8IXM6 262 aa11.8□□□□□ -0.52
CCDC42-201ENST00000293845 TMEM99Q8N816 258 aa11.8□□□□□ -0.52
CCDC42-201ENST00000293845 OR4C15Q8NGM1 316 aa11.8□□□□□ -0.52
CCDC42-201ENST00000293845 OR52J3Q8NH60 311 aa11.8□□□□□ -0.52
CCDC42-201ENST00000293845 SGTBQ96EQ0 304 aa11.8□□□□□ -0.52
CCDC42-201ENST00000293845 ALPK1Q96QP1 1244 aa11.8□□□□□ -0.52
CCDC42-201ENST00000293845 TACO1Q9BSH4 297 aaKnown RBP11.8□□□□□ -0.52
CCDC42-201ENST00000293845 ASPNQ9BXN1 380 aa11.8□□□□□ -0.52
CCDC42-201ENST00000293845 DENND2DQ9H6A0 471 aaPredicted RBP11.8□□□□□ -0.52
CCDC42-201ENST00000293845 REEP1Q9H902 201 aa11.8□□□□□ -0.52
CCDC42-201ENST00000293845 BCO1Q9HAY6 547 aa11.8□□□□□ -0.52
CCDC42-201ENST00000293845 CHST11Q9NPF2 352 aa11.8□□□□□ -0.52
CCDC42-201ENST00000293845 KLHL9Q9P2J3 617 aa11.8□□□□□ -0.52
CCDC42-201ENST00000293845 ZNF229Q9UJW7 825 aa11.8□□□□□ -0.52
CCDC42-201ENST00000293845 ING1Q9UK53 422 aaPredicted RBP11.8□□□□□ -0.52
CCDC42-201ENST00000293845 RNF6Q9Y252 685 aa11.8□□□□□ -0.52
CCDC42-201ENST00000293845 ALPK2Q86TB3 2170 aa11.8□□□□□ -0.52
CCDC42-201ENST00000293845 WIPF3A6NGB9 483 aa11.79□□□□□ -0.52
CCDC42-201ENST00000293845 ERICH4A6NGS2 130 aa11.79□□□□□ -0.52
CCDC42-201ENST00000293845 ZNF724A8MTY0 619 aa11.79□□□□□ -0.52
CCDC42-201ENST00000293845 M0R082 166 aa11.79□□□□□ -0.52
CCDC42-201ENST00000293845 TNFRSF11BO00300 401 aa11.79□□□□□ -0.52
CCDC42-201ENST00000293845 RAMP1O60894 148 aa11.79□□□□□ -0.52
CCDC42-201ENST00000293845 TNFSF13O75888 250 aa11.79□□□□□ -0.52
CCDC42-201ENST00000293845 OR7A10O76100 309 aa11.79□□□□□ -0.52
CCDC42-201ENST00000293845 CH25HO95992 272 aa11.79□□□□□ -0.52
CCDC42-201ENST00000293845 CST1P01037 141 aa11.79□□□□□ -0.52
CCDC42-201ENST00000293845 LDLRP01130 860 aa11.79□□□□□ -0.52
CCDC42-201ENST00000293845 IFI30P13284 250 aa11.79□□□□□ -0.52
CCDC42-201ENST00000293845 AGAP20933 346 aa11.79□□□□□ -0.52
CCDC42-201ENST00000293845 CTSSP25774 331 aa11.79□□□□□ -0.52
CCDC42-201ENST00000293845 SMSP52788 366 aa11.79□□□□□ -0.52
CCDC42-201ENST00000293845 RASGEF1BQ0VAM2 473 aa11.79□□□□□ -0.52
CCDC42-201ENST00000293845 FOXF2Q12947 444 aa11.79□□□□□ -0.52
CCDC42-201ENST00000293845 FOXD4Q12950 439 aaPredicted RBP11.79□□□□□ -0.52
CCDC42-201ENST00000293845 POU4F3Q15319 338 aa11.79□□□□□ -0.52
CCDC42-201ENST00000293845 SEC23BQ15437 767 aa11.79□□□□□ -0.52
CCDC42-201ENST00000293845 EEF1A1P5Q5VTE0 462 aa11.79□□□□□ -0.52
CCDC42-201ENST00000293845 TBPL2Q6SJ96 375 aa11.79□□□□□ -0.52
CCDC42-201ENST00000293845 TMPRSS11FQ6ZWK6 438 aa11.79□□□□□ -0.52
CCDC42-201ENST00000293845 H1FNTQ75WM6 255 aaPredicted RBP11.79□□□□□ -0.52
CCDC42-201ENST00000293845 RRM2BQ7LG56 351 aa11.79□□□□□ -0.52
CCDC42-201ENST00000293845 CCDC103Q8IW40 242 aa11.79□□□□□ -0.52
CCDC42-201ENST00000293845 MCEMP1Q8IX19 187 aa11.79□□□□□ -0.52
CCDC42-201ENST00000293845 GCNT2Q8N0V5 402 aa11.79□□□□□ -0.52
CCDC42-201ENST00000293845 OR4K5Q8NGD3 323 aa11.79□□□□□ -0.52
CCDC42-201ENST00000293845 OR5J2Q8NH18 312 aa11.79□□□□□ -0.52
CCDC42-201ENST00000293845 ZNF417Q8TAU3 575 aa11.79□□□□□ -0.52
CCDC42-201ENST00000293845 ASB5Q8WWX0 329 aa11.79□□□□□ -0.52
CCDC42-201ENST00000293845 INTS12Q96CB8 462 aaKnown RBP11.79□□□□□ -0.52
CCDC42-201ENST00000293845 BPIFA2Q96DR5 249 aa11.79□□□□□ -0.52
CCDC42-201ENST00000293845 ZNF587Q96SQ5 575 aaPredicted RBP11.79□□□□□ -0.52
CCDC42-201ENST00000293845 SF3B5Q9BWJ5 86 aaKnown RBP11.79□□□□□ -0.52
CCDC42-201ENST00000293845 SFXN3Q9BWM7 321 aa11.79□□□□□ -0.52
CCDC42-201ENST00000293845 FANCFQ9NPI8 374 aa11.79□□□□□ -0.52
CCDC42-201ENST00000293845 NANSQ9NR45 359 aa11.79□□□□□ -0.52
CCDC42-201ENST00000293845 VNN3Q9NY84 501 aa11.79□□□□□ -0.52
CCDC42-201ENST00000293845 COQ3Q9NZJ6 369 aa11.79□□□□□ -0.52
CCDC42-201ENST00000293845 KLHL13Q9P2N7 655 aa11.79□□□□□ -0.52
CCDC42-201ENST00000293845 DNAJB9Q9UBS3 223 aa11.79□□□□□ -0.52
CCDC42-201ENST00000293845 ZNF629Q9UEG4 869 aaPredicted RBP11.79□□□□□ -0.52
CCDC42-201ENST00000293845 RASD1Q9Y272 281 aa11.79□□□□□ -0.52
CCDC42-201ENST00000293845 TMEM5Q9Y2B1 443 aa11.79□□□□□ -0.52
CCDC42-201ENST00000293845 AP4S1Q9Y587 144 aa11.79□□□□□ -0.52
CCDC42-201ENST00000293845 LOC102725191A0A1B0GVB3 256 aa11.79□□□□□ -0.52
CCDC42-201ENST00000293845 A0A1W2PNV4 684 aa11.79□□□□□ -0.52
CCDC42-201ENST00000293845 ZG16O60844 167 aa11.79□□□□□ -0.52
CCDC42-201ENST00000293845 AGFG2O95081 481 aa11.79□□□□□ -0.52
CCDC42-201ENST00000293845 PLGP00747 810 aaPredicted RBP11.79□□□□□ -0.52
CCDC42-201ENST00000293845 TSPAN19P0C672 248 aa11.79□□□□□ -0.52
CCDC42-201ENST00000293845 FUT1P19526 365 aa11.79□□□□□ -0.52
CCDC42-201ENST00000293845 CBLP22681 906 aa11.79□□□□□ -0.52
CCDC42-201ENST00000293845 AGTR1P30556 359 aa11.79□□□□□ -0.52
CCDC42-201ENST00000293845 CHRNB4P30926 498 aa11.79□□□□□ -0.52
CCDC42-201ENST00000293845 OPRM1P35372 400 aa11.79□□□□□ -0.52
CCDC42-201ENST00000293845 OMPP47874 163 aa11.79□□□□□ -0.52
CCDC42-201ENST00000293845 SLC17A1Q14916 467 aa11.79□□□□□ -0.52
CCDC42-201ENST00000293845 EXOC3L2Q2M3D2 409 aa11.79□□□□□ -0.52
CCDC42-201ENST00000293845 ZFP1Q6P2D0 407 aa11.79□□□□□ -0.52
CCDC42-201ENST00000293845 FAM214BQ7L5A3 538 aa11.79□□□□□ -0.52
CCDC42-201ENST00000293845 C10orf67Q8IYJ2 551 aa11.79□□□□□ -0.52
CCDC42-201ENST00000293845 ZNF808Q8N4W9 903 aaPredicted RBP11.79□□□□□ -0.52
CCDC42-201ENST00000293845 LINC00471Q8N535 108 aa11.79□□□□□ -0.52
CCDC42-201ENST00000293845 FAM26EQ8N5C1 309 aa11.79□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.4 ms