RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000284073.6

MSI2-201, Transcript of musashi RNA binding protein 2, humanhuman

APPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC

Gene MSI2, Length 6,364 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSI2-201ENST00000284073 HBE1P02100 147 aa14.72□□□□□ -0.05
MSI2-201ENST00000284073 IMPA1P29218 277 aa14.72□□□□□ -0.05
MSI2-201ENST00000284073 MFGE8Q08431 387 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
MSI2-201ENST00000284073 SNTB1Q13884 538 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
MSI2-201ENST00000284073 PRAMEF9Q5VWM5 478 aa14.72□□□□□ -0.05
MSI2-201ENST00000284073 TRNP1Q6NT89 227 aa14.72□□□□□ -0.05
MSI2-201ENST00000284073 FAAP20Q6NZ36 180 aa14.72□□□□□ -0.05
MSI2-201ENST00000284073 AMIGO3Q86WK7 504 aa14.72□□□□□ -0.05
MSI2-201ENST00000284073 TSACCQ96A04 125 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
MSI2-201ENST00000284073 RAB3CQ96E17 227 aa14.72□□□□□ -0.05
MSI2-201ENST00000284073 SLC39A9Q9NUM3 307 aa14.72□□□□□ -0.05
MSI2-201ENST00000284073 AKR1C3P42330 323 aa14.72□□□□□ -0.05
MSI2-201ENST00000284073 CPEB2Q7Z5Q1 589 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
MSI2-201ENST00000284073 ZNF761Q86XN6 746 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
MSI2-201ENST00000284073 OR5M8Q8NGP6 311 aa14.72□□□□□ -0.05
MSI2-201ENST00000284073 DDIT4LQ96D03 193 aa14.72□□□□□ -0.05
MSI2-201ENST00000284073 C19orf25Q9UFG5 118 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
MSI2-201ENST00000284073 MYH1P12882 1939 aa14.72□□□□□ -0.05
MSI2-201ENST00000284073 MYH4Q9Y623 1939 aa14.72□□□□□ -0.05
MSI2-201ENST00000284073 LAP3P28838 519 aa14.71□□□□□ -0.05
MSI2-201ENST00000284073 PER3P56645 1201 aa14.71□□□□□ -0.05
MSI2-201ENST00000284073 TAS2R46P59540 309 aa14.71□□□□□ -0.05
MSI2-201ENST00000284073 SLX4IPQ5VYV7 408 aa14.71□□□□□ -0.05
MSI2-201ENST00000284073 OR52I2Q8NH67 350 aa14.71□□□□□ -0.05
MSI2-201ENST00000284073 PGAP3Q96FM1 320 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
MSI2-201ENST00000284073 SELENOIQ9C0D9 397 aa14.71□□□□□ -0.05
MSI2-201ENST00000284073 SPNS1Q9H2V7 528 aa14.71□□□□□ -0.05
MSI2-201ENST00000284073 SLC23A1Q9UHI7 598 aa14.71□□□□□ -0.05
MSI2-201ENST00000284073 SYNGR4O95473 234 aa14.71□□□□□ -0.05
MSI2-201ENST00000284073 PNPP00491 289 aa14.71□□□□□ -0.05
MSI2-201ENST00000284073 OPN1LWP04000 364 aa14.71□□□□□ -0.05
MSI2-201ENST00000284073 KLK3P07288 261 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
MSI2-201ENST00000284073 RAB11AP62491 216 aa14.71□□□□□ -0.05
MSI2-201ENST00000284073 FKBP1BP68106 108 aa14.71□□□□□ -0.05
MSI2-201ENST00000284073 MRPL49Q13405 166 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
MSI2-201ENST00000284073 C1orf87Q8N0U7 546 aa14.71□□□□□ -0.05
MSI2-201ENST00000284073 TTC9BQ8N6N2 239 aa14.71□□□□□ -0.05
MSI2-201ENST00000284073 DEFB126Q9BYW3 111 aa14.71□□□□□ -0.05
MSI2-201ENST00000284073 TP53I11O14683 189 aa14.71□□□□□ -0.05
MSI2-201ENST00000284073 OPRD1P41143 372 aa14.71□□□□□ -0.05
MSI2-201ENST00000284073 RBMS3Q6XE24 437 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
MSI2-201ENST00000284073 SUMF1Q8NBK3 374 aa14.71□□□□□ -0.05
MSI2-201ENST00000284073 SFT2D1Q8WV19 159 aa14.71□□□□□ -0.05
MSI2-201ENST00000284073 SPTSSAQ969W0 71 aa14.71□□□□□ -0.05
MSI2-201ENST00000284073 TNFRSF13CQ96RJ3 184 aa14.71□□□□□ -0.05
MSI2-201ENST00000284073 FKRPQ9H9S5 495 aa14.71□□□□□ -0.05
MSI2-201ENST00000284073 SPHK1Q9NYA1 384 aa14.71□□□□□ -0.05
MSI2-201ENST00000284073 VDAC3Q9Y277 283 aa14.71□□□□□ -0.05
MSI2-201ENST00000284073 MED16Q9Y2X0 877 aa14.71□□□□□ -0.05
MSI2-201ENST00000284073 ZNF337Q9Y3M9 751 aa14.71□□□□□ -0.05
MSI2-201ENST00000284073 UMAD1C9J7I0 102 aa14.71□□□□□ -0.05
MSI2-201ENST00000284073 PHOX2AO14813 284 aa14.71□□□□□ -0.05
MSI2-201ENST00000284073 DFFBO76075 338 aa14.71□□□□□ -0.05
MSI2-201ENST00000284073 NQO2P16083 231 aa14.71□□□□□ -0.05
MSI2-201ENST00000284073 NPY4RP50391 375 aa14.71□□□□□ -0.05
MSI2-201ENST00000284073 OLIG3Q7RTU3 272 aa14.71□□□□□ -0.05
MSI2-201ENST00000284073 MDGA2Q7Z553 956 aa14.71□□□□□ -0.05
MSI2-201ENST00000284073 FBLP22087 321 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.06
MSI2-201ENST00000284073 ERVK-16P61578 105 aa14.71□□□□□ -0.06
MSI2-201ENST00000284073 ARHGAP19Q14CB8 494 aa14.71□□□□□ -0.06
MSI2-201ENST00000284073 OR7A5Q15622 319 aa14.71□□□□□ -0.06
MSI2-201ENST00000284073 RNF212Q495C1 297 aa14.71□□□□□ -0.06
MSI2-201ENST00000284073 NXNL2Q5VZ03 156 aa14.71□□□□□ -0.06
MSI2-201ENST00000284073 CMSS1Q9BQ75 279 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.06
MSI2-201ENST00000284073 CHRDQ9H2X0 955 aa14.71□□□□□ -0.06
MSI2-201ENST00000284073 SLC35A3Q9Y2D2 325 aa14.71□□□□□ -0.06
MSI2-201ENST00000284073 PAPLNO95428 1278 aa14.7□□□□□ -0.06
MSI2-201ENST00000284073 F2P00734 622 aa14.7□□□□□ -0.06
MSI2-201ENST00000284073 IQCF3P0C7M6 154 aa14.7□□□□□ -0.06
MSI2-201ENST00000284073 Q6ZTK2 550 aa14.7□□□□□ -0.06
MSI2-201ENST00000284073 SYT17Q9BSW7 474 aa14.7□□□□□ -0.06
MSI2-201ENST00000284073 ULBP3Q9BZM4 244 aa14.7□□□□□ -0.06
MSI2-201ENST00000284073 BET1O15155 118 aa14.7□□□□□ -0.06
MSI2-201ENST00000284073 CRMP1Q14194 572 aa14.7□□□□□ -0.06
MSI2-201ENST00000284073 TEX261Q6UWH6 196 aa14.7□□□□□ -0.06
MSI2-201ENST00000284073 NECAP1Q8NC96 275 aa14.7□□□□□ -0.06
MSI2-201ENST00000284073 NAA11Q9BSU3 229 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
MSI2-201ENST00000284073 U3KQ87 197 aa14.7□□□□□ -0.06
MSI2-201ENST00000284073 MLF1P58340 268 aa14.7□□□□□ -0.06
MSI2-201ENST00000284073 UBXN2BQ14CS0 331 aa14.7□□□□□ -0.06
MSI2-201ENST00000284073 C21orf62-AS1Q17RA5 79 aa14.7□□□□□ -0.06
MSI2-201ENST00000284073 ETFRF1Q6IPR1 90 aa14.7□□□□□ -0.06
MSI2-201ENST00000284073 PRSS42Q7Z5A4 293 aa14.7□□□□□ -0.06
MSI2-201ENST00000284073 LRRTM3Q86VH5 581 aa14.7□□□□□ -0.06
MSI2-201ENST00000284073 ANKLE1Q8NAG6 615 aa14.7□□□□□ -0.06
MSI2-201ENST00000284073 TSTD1Q8NFU3 115 aa14.7□□□□□ -0.06
MSI2-201ENST00000284073 OR5D18Q8NGL1 313 aa14.7□□□□□ -0.06
MSI2-201ENST00000284073 MYADMQ96S97 322 aa14.7□□□□□ -0.06
MSI2-201ENST00000284073 RHNO1Q9BSD3 238 aa14.7□□□□□ -0.06
MSI2-201ENST00000284073 ACSS1Q9NUB1 689 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
MSI2-201ENST00000284073 RPH3ALQ9UNE2 315 aa14.7□□□□□ -0.06
MSI2-201ENST00000284073 CSAG2Q9Y5P2 127 aa14.7□□□□□ -0.06
MSI2-201ENST00000284073 DLG5Q8TDM6 1919 aa14.7□□□□□ -0.06
MSI2-201ENST00000284073 SMAD6O43541 496 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
MSI2-201ENST00000284073 SBK2P0C263 348 aa14.7□□□□□ -0.06
MSI2-201ENST00000284073 ACHEP22303 614 aa14.7□□□□□ -0.06
MSI2-201ENST00000284073 AOAHP28039 575 aa14.7□□□□□ -0.06
MSI2-201ENST00000284073 HTR1FP30939 366 aa14.7□□□□□ -0.06
MSI2-201ENST00000284073 EMP3P54852 163 aa14.7□□□□□ -0.06
MSI2-201ENST00000284073 GBX1Q14549 363 aa14.7□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.4 ms