RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000278833.3

ROM1-201, Transcript of retinal outer segment membrane protein 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene ROM1, Length 1,878 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ROM1-201ENST00000278833 LRRC75AQ8NAA5 344 aa22.9■■□□□ 1.26
ROM1-201ENST00000278833 OR5H6Q8NGV6 325 aa22.9■■□□□ 1.26
ROM1-201ENST00000278833 ADAMTS14Q8WXS8 1223 aa22.9■■□□□ 1.26
ROM1-201ENST00000278833 MRI1Q9BV20 369 aa22.9■■□□□ 1.26
ROM1-201ENST00000278833 BEX2Q9BXY8 128 aa22.9■■□□□ 1.26
ROM1-201ENST00000278833 FOXQ1Q9C009 403 aa22.9■■□□□ 1.26
ROM1-201ENST00000278833 PLCL2Q9UPR0 1127 aa22.9■■□□□ 1.26
ROM1-201ENST00000278833 BOLA1Q9Y3E2 137 aa22.9■■□□□ 1.26
ROM1-201ENST00000278833 RPL4P36578 427 aaKnown RBP22.89■■□□□ 1.25
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ROM1-201ENST00000278833 SMAP2Q8WU79 429 aaPredicted RBP22.89■■□□□ 1.25
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ROM1-201ENST00000278833 COPS3Q9UNS2 423 aa22.89■■□□□ 1.25
ROM1-201ENST00000278833 MOKQ9UQ07 419 aa22.89■■□□□ 1.25
ROM1-201ENST00000278833 ADAM18Q9Y3Q7 739 aa22.89■■□□□ 1.25
ROM1-201ENST00000278833 OR10H1Q9Y4A9 318 aa22.89■■□□□ 1.25
ROM1-201ENST00000278833 PCDHGA9Q9Y5G4 932 aaKnown RBP22.89■■□□□ 1.25
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ROM1-201ENST00000278833 B4DGG1 531 aa22.88■■□□□ 1.25
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ROM1-201ENST00000278833 DBPQ10586 325 aaPredicted RBP22.88■■□□□ 1.25
ROM1-201ENST00000278833 DYRK1AQ13627 763 aa22.88■■□□□ 1.25
ROM1-201ENST00000278833 TCTE1Q5JU00 501 aa22.88■■□□□ 1.25
ROM1-201ENST00000278833 UBE2NLQ5JXB2 153 aa22.88■■□□□ 1.25
ROM1-201ENST00000278833 FAM122BQ7Z309 247 aa22.88■■□□□ 1.25
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ROM1-201ENST00000278833 LRRC17Q8N6Y2 441 aa22.88■■□□□ 1.25
ROM1-201ENST00000278833 GHITMQ9H3K2 345 aa22.88■■□□□ 1.25
ROM1-201ENST00000278833 LRRN3Q9H3W5 708 aa22.88■■□□□ 1.25
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ROM1-201ENST00000278833 PTTG3PQ9NZH4 202 aa22.88■■□□□ 1.25
ROM1-201ENST00000278833 TEKT2Q9UIF3 430 aa22.88■■□□□ 1.25
ROM1-201ENST00000278833 TRBV2A0A0J9YWF9 115 aa22.88■■□□□ 1.25
ROM1-201ENST00000278833 SYNDIG1LA6NDD5 238 aa22.88■■□□□ 1.25
ROM1-201ENST00000278833 EDNRAP25101 427 aa22.88■■□□□ 1.25
ROM1-201ENST00000278833 NAA10P41227 235 aaPredicted RBP22.88■■□□□ 1.25
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ROM1-201ENST00000278833 UBXN2BQ14CS0 331 aa22.88■■□□□ 1.25
ROM1-201ENST00000278833 ZNF74Q16587 644 aa22.88■■□□□ 1.25
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ROM1-201ENST00000278833 NMNAT3Q96T66 252 aa22.88■■□□□ 1.25
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ROM1-201ENST00000278833 RNF215Q9Y6U7 377 aa22.88■■□□□ 1.25
ROM1-201ENST00000278833 ARHGEF9O43307 516 aa22.87■■□□□ 1.25
ROM1-201ENST00000278833 IL33O95760 270 aa22.87■■□□□ 1.25
ROM1-201ENST00000278833 PROS1P07225 676 aa22.87■■□□□ 1.25
ROM1-201ENST00000278833 SKP2Q13309 424 aa22.87■■□□□ 1.25
ROM1-201ENST00000278833 C1orf61Q13536 156 aa22.87■■□□□ 1.25
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ROM1-201ENST00000278833 SLC35F3Q8IY50 421 aa22.87■■□□□ 1.25
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ROM1-201ENST00000278833 MMACHCQ9Y4U1 282 aa22.87■■□□□ 1.25
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ROM1-201ENST00000278833 C17orf82Q86X59 251 aaPredicted RBP22.86■■□□□ 1.25
ROM1-201ENST00000278833 ZNRF4Q8WWF5 429 aa22.86■■□□□ 1.25
ROM1-201ENST00000278833 EMC7Q9NPA0 242 aa22.86■■□□□ 1.25
ROM1-201ENST00000278833 EMC3Q9P0I2 261 aa22.86■■□□□ 1.25
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ROM1-201ENST00000278833 GRK6P43250 576 aa22.85■■□□□ 1.25
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ROM1-201ENST00000278833 UQCRC1P31930 480 aa22.85■■□□□ 1.25
ROM1-201ENST00000278833 KLF9Q13886 244 aaPredicted RBP22.85■■□□□ 1.25
ROM1-201ENST00000278833 ELOA3BQ3SY89 546 aa22.85■■□□□ 1.25
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