RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000262963.10

PTPRS-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type S, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PTPRS, Length 4,766 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRS-201ENST00000262963 SLC6A17Q9H1V8 727 aa11.23□□□□□ -0.61
PTPRS-201ENST00000262963 UNKLQ9H9P5 680 aaKnown RBP11.23□□□□□ -0.61
PTPRS-201ENST00000262963 LYRM4Q9HD34 91 aa11.23□□□□□ -0.61
PTPRS-201ENST00000262963 DVL2O14641 736 aa11.22□□□□□ -0.61
PTPRS-201ENST00000262963 CD46P15529 392 aa11.22□□□□□ -0.61
PTPRS-201ENST00000262963 AQP2P41181 271 aa11.22□□□□□ -0.61
PTPRS-201ENST00000262963 DUSP6Q16828 381 aa11.22□□□□□ -0.61
PTPRS-201ENST00000262963 ASTLQ6HA08 431 aaPredicted RBP11.22□□□□□ -0.61
PTPRS-201ENST00000262963 SLC16A11Q8NCK7 471 aa11.22□□□□□ -0.61
PTPRS-201ENST00000262963 MAFIPQ8WZ33 124 aa11.22□□□□□ -0.61
PTPRS-201ENST00000262963 RSC1A1Q92681 617 aa11.22□□□□□ -0.61
PTPRS-201ENST00000262963 PDXPQ96GD0 296 aa11.22□□□□□ -0.61
PTPRS-201ENST00000262963 VN1R3Q9BXE9 311 aa11.22□□□□□ -0.61
PTPRS-201ENST00000262963 C1orf198Q9H425 327 aa11.22□□□□□ -0.61
PTPRS-201ENST00000262963 FOCADQ5VW36 1801 aa11.22□□□□□ -0.61
PTPRS-201ENST00000262963 TRAV36DV7A0A075B6V5 113 aa11.22□□□□□ -0.61
PTPRS-201ENST00000262963 ZNF705EA8MWA4 302 aaPredicted RBP11.22□□□□□ -0.61
PTPRS-201ENST00000262963 SCGB2A1O75556 95 aa11.22□□□□□ -0.61
PTPRS-201ENST00000262963 CAMLGP49069 296 aa11.22□□□□□ -0.61
PTPRS-201ENST00000262963 HSD17B7P56937 341 aa11.22□□□□□ -0.61
PTPRS-201ENST00000262963 TAS2R19P59542 299 aa11.22□□□□□ -0.61
PTPRS-201ENST00000262963 SNRPD2P62316 118 aaKnown RBP11.22□□□□□ -0.61
PTPRS-201ENST00000262963 SPOCK1Q08629 439 aa11.22□□□□□ -0.61
PTPRS-201ENST00000262963 MZT1Q08AG7 82 aa11.22□□□□□ -0.61
PTPRS-201ENST00000262963 GPR19Q15760 415 aa11.22□□□□□ -0.61
PTPRS-201ENST00000262963 PARM1Q6UWI2 310 aa11.22□□□□□ -0.61
PTPRS-201ENST00000262963 MED25Q71SY5 747 aa11.22□□□□□ -0.61
PTPRS-201ENST00000262963 TRAPPC6BQ86SZ2 158 aa11.22□□□□□ -0.61
PTPRS-201ENST00000262963 ZNF695Q8IW36 515 aa11.22□□□□□ -0.61
PTPRS-201ENST00000262963 FAM83FQ8NEG4 500 aaPredicted RBP11.22□□□□□ -0.61
PTPRS-201ENST00000262963 OR7G1Q8NGA0 311 aa11.22□□□□□ -0.61
PTPRS-201ENST00000262963 GLYATL2Q8WU03 294 aa11.22□□□□□ -0.61
PTPRS-201ENST00000262963 COQ10AQ96MF6 247 aa11.22□□□□□ -0.61
PTPRS-201ENST00000262963 NIPSNAP1Q9BPW8 284 aa11.22□□□□□ -0.61
PTPRS-201ENST00000262963 NICN1Q9BSH3 213 aa11.22□□□□□ -0.61
PTPRS-201ENST00000262963 AMBRA1Q9C0C7 1298 aa11.22□□□□□ -0.61
PTPRS-201ENST00000262963 PRDM9Q9NQV7 894 aa11.22□□□□□ -0.61
PTPRS-201ENST00000262963 SPHK1Q9NYA1 384 aa11.22□□□□□ -0.61
PTPRS-201ENST00000262963 DIMT1Q9UNQ2 313 aaKnown RBP11.22□□□□□ -0.61
PTPRS-201ENST00000262963 PLEKHM1Q9Y4G2 1056 aa11.22□□□□□ -0.61
PTPRS-201ENST00000262963 WIF1Q9Y5W5 379 aa11.22□□□□□ -0.61
PTPRS-201ENST00000262963 TMEM72A0PK05 275 aa11.22□□□□□ -0.61
PTPRS-201ENST00000262963 LRIT2A6NDA9 550 aa11.22□□□□□ -0.61
PTPRS-201ENST00000262963 MRPL33O75394 65 aaKnown RBP11.22□□□□□ -0.61
PTPRS-201ENST00000262963 HTR2BP41595 481 aa11.22□□□□□ -0.61
PTPRS-201ENST00000262963 NKX2-5P52952 324 aaPredicted RBP11.22□□□□□ -0.61
PTPRS-201ENST00000262963 ADPRHP54922 357 aa11.22□□□□□ -0.61
PTPRS-201ENST00000262963 SIRPAP78324 504 aa11.22□□□□□ -0.61
PTPRS-201ENST00000262963 B4GALNT1Q00973 533 aa11.22□□□□□ -0.61
PTPRS-201ENST00000262963 LTBQ06643 244 aa11.22□□□□□ -0.61
PTPRS-201ENST00000262963 CRMP1Q14194 572 aa11.22□□□□□ -0.61
PTPRS-201ENST00000262963 PARP16Q8N5Y8 322 aa11.22□□□□□ -0.61
PTPRS-201ENST00000262963 ZNF454Q8N9F8 522 aa11.22□□□□□ -0.61
PTPRS-201ENST00000262963 ZNF566Q969W8 418 aa11.22□□□□□ -0.61
PTPRS-201ENST00000262963 C19orf43Q9BQ61 176 aa11.22□□□□□ -0.61
PTPRS-201ENST00000262963 MCOLN1Q9GZU1 580 aa11.22□□□□□ -0.61
PTPRS-201ENST00000262963 MBNL1Q9NR56 388 aaKnown RBP11.22□□□□□ -0.61
PTPRS-201ENST00000262963 MEIOCA2RUB1 952 aa11.21□□□□□ -0.61
PTPRS-201ENST00000262963 OR5K3A6NET4 321 aa11.21□□□□□ -0.61
PTPRS-201ENST00000262963 TMEM212A6NML5 194 aa11.21□□□□□ -0.61
PTPRS-201ENST00000262963 SLC43A1O75387 559 aa11.21□□□□□ -0.61
PTPRS-201ENST00000262963 UTS2O95399 124 aa11.21□□□□□ -0.61
PTPRS-201ENST00000262963 GAAP10253 952 aa11.21□□□□□ -0.61
PTPRS-201ENST00000262963 SLX4IPQ5VYV7 408 aa11.21□□□□□ -0.61
PTPRS-201ENST00000262963 EID2BQ96D98 161 aa11.21□□□□□ -0.61
PTPRS-201ENST00000262963 SORCS2Q96PQ0 1159 aa11.21□□□□□ -0.61
PTPRS-201ENST00000262963 DUSP22Q9NRW4 184 aa11.21□□□□□ -0.61
PTPRS-201ENST00000262963 P2RX6O15547 441 aa11.21□□□□□ -0.61
PTPRS-201ENST00000262963 CD14P08571 375 aa11.21□□□□□ -0.61
PTPRS-201ENST00000262963 S100PP25815 95 aa11.21□□□□□ -0.61
PTPRS-201ENST00000262963 MSX1P28360 303 aa11.21□□□□□ -0.61
PTPRS-201ENST00000262963 CAV2P51636 162 aa11.21□□□□□ -0.61
PTPRS-201ENST00000262963 DUSP7Q16829 419 aa11.21□□□□□ -0.61
PTPRS-201ENST00000262963 PYCR3Q53H96 274 aa11.21□□□□□ -0.61
PTPRS-201ENST00000262963 FOXB2Q5VYV0 432 aa11.21□□□□□ -0.61
PTPRS-201ENST00000262963 NOXA1Q86UR1 476 aa11.21□□□□□ -0.61
PTPRS-201ENST00000262963 IL17RDQ8NFM7 739 aa11.21□□□□□ -0.61
PTPRS-201ENST00000262963 GCDHQ92947 438 aaPredicted RBP11.21□□□□□ -0.61
PTPRS-201ENST00000262963 SLC6A18Q96N87 628 aa11.21□□□□□ -0.61
PTPRS-201ENST00000262963 ZNF582Q96NG8 517 aaPredicted RBP11.21□□□□□ -0.61
PTPRS-201ENST00000262963 ZNF285Q96NJ3 590 aa11.21□□□□□ -0.61
PTPRS-201ENST00000262963 OR6C1Q96RD1 312 aa11.21□□□□□ -0.61
PTPRS-201ENST00000262963 DNAJB11Q9UBS4 358 aa11.21□□□□□ -0.61
PTPRS-201ENST00000262963 OR51B4Q9Y5P0 310 aa11.21□□□□□ -0.61
PTPRS-201ENST00000262963 WDPCPO95876 746 aa11.21□□□□□ -0.62
PTPRS-201ENST00000262963 PTHP01270 115 aa11.21□□□□□ -0.62
PTPRS-201ENST00000262963 SCG5P05408 212 aa11.21□□□□□ -0.62
PTPRS-201ENST00000262963 SLC35A1P78382 337 aa11.21□□□□□ -0.62
PTPRS-201ENST00000262963 MPEG1Q2M385 716 aa11.21□□□□□ -0.62
PTPRS-201ENST00000262963 ZNF750Q32MQ0 723 aa11.21□□□□□ -0.62
PTPRS-201ENST00000262963 AGAP6Q5VW22 663 aa11.21□□□□□ -0.62
PTPRS-201ENST00000262963 SLC46A3Q7Z3Q1 461 aa11.21□□□□□ -0.62
PTPRS-201ENST00000262963 CLDN22Q8N7P3 220 aa11.21□□□□□ -0.62
PTPRS-201ENST00000262963 FNDC9Q8TBE3 224 aa11.21□□□□□ -0.62
PTPRS-201ENST00000262963 DUS3LQ96G46 650 aaKnown RBP11.21□□□□□ -0.62
PTPRS-201ENST00000262963 SENP5Q96HI0 755 aaPredicted RBP11.21□□□□□ -0.62
PTPRS-201ENST00000262963 AGAP4Q96P64 663 aa11.21□□□□□ -0.62
PTPRS-201ENST00000262963 MFFQ9GZY8 342 aa11.21□□□□□ -0.62
PTPRS-201ENST00000262963 MMP17Q9ULZ9 603 aa11.21□□□□□ -0.62
PTPRS-201ENST00000262963 TMED7-TICAM2A0A0A6YYA0 188 aa11.21□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.2 ms