RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000229265.10

CDCA3-201, Transcript of cell division cycle associated 3, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene CDCA3, Length 1,047 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDCA3-201ENST00000229265 BLVRAP53004 296 aa9.71□□□□□ -0.86
CDCA3-201ENST00000229265 PPP5CP53041 499 aa9.71□□□□□ -0.86
CDCA3-201ENST00000229265 TMPRSS3P57727 454 aa9.71□□□□□ -0.86
CDCA3-201ENST00000229265 FXYD6P3P58550 94 aa9.71□□□□□ -0.86
CDCA3-201ENST00000229265 CRYZQ08257 329 aaKnown RBP9.71□□□□□ -0.86
CDCA3-201ENST00000229265 PLCXD2Q0VAA5 305 aa9.71□□□□□ -0.86
CDCA3-201ENST00000229265 MRPL28Q13084 256 aaKnown RBP9.71□□□□□ -0.86
CDCA3-201ENST00000229265 KRR1Q13601 381 aaKnown RBP9.71□□□□□ -0.86
CDCA3-201ENST00000229265 FHL1Q13642 323 aa9.71□□□□□ -0.86
CDCA3-201ENST00000229265 GALEQ14376 348 aa9.71□□□□□ -0.86
CDCA3-201ENST00000229265 GGTLC2Q14390 218 aa9.71□□□□□ -0.86
CDCA3-201ENST00000229265 LCN1P1Q5VSP4 162 aa9.71□□□□□ -0.86
CDCA3-201ENST00000229265 GPR139Q6DWJ6 353 aa9.71□□□□□ -0.86
CDCA3-201ENST00000229265 PWWP2BQ6NUJ5 590 aa9.71□□□□□ -0.86
CDCA3-201ENST00000229265 HIST3H2AQ7L7L0 130 aa9.71□□□□□ -0.86
CDCA3-201ENST00000229265 CPEB2Q7Z5Q1 589 aaKnown RBP9.71□□□□□ -0.86
CDCA3-201ENST00000229265 C9orf40Q8IXQ3 194 aa9.71□□□□□ -0.86
CDCA3-201ENST00000229265 CADM2Q8N3J6 435 aa9.71□□□□□ -0.86
CDCA3-201ENST00000229265 POMGNT2Q8NAT1 580 aa9.71□□□□□ -0.86
CDCA3-201ENST00000229265 SLC37A3Q8NCC5 494 aa9.71□□□□□ -0.86
CDCA3-201ENST00000229265 OR2T27Q8NH04 317 aa9.71□□□□□ -0.86
CDCA3-201ENST00000229265 MCFD2Q8NI22 146 aa9.71□□□□□ -0.86
CDCA3-201ENST00000229265 RNF217Q8TC41 542 aa9.71□□□□□ -0.86
CDCA3-201ENST00000229265 DOK4Q8TEW6 326 aa9.71□□□□□ -0.86
CDCA3-201ENST00000229265 RNF138Q8WVD3 245 aa9.71□□□□□ -0.86
CDCA3-201ENST00000229265 ST8SIA1Q92185 356 aa9.71□□□□□ -0.86
CDCA3-201ENST00000229265 UFD1Q92890 307 aa9.71□□□□□ -0.86
CDCA3-201ENST00000229265 HIST1H2ACQ93077 130 aa9.71□□□□□ -0.86
CDCA3-201ENST00000229265 TSLPQ969D9 159 aa9.71□□□□□ -0.86
CDCA3-201ENST00000229265 OMA1Q96E52 524 aa9.71□□□□□ -0.86
CDCA3-201ENST00000229265 ADOQ96SZ5 270 aa9.71□□□□□ -0.86
CDCA3-201ENST00000229265 SECISBP2Q96T21 854 aaKnown RBP9.71□□□□□ -0.86
CDCA3-201ENST00000229265 DDOQ99489 341 aa9.71□□□□□ -0.86
CDCA3-201ENST00000229265 FKRPQ9H9S5 495 aa9.71□□□□□ -0.86
CDCA3-201ENST00000229265 MCCC2Q9HCC0 563 aa9.71□□□□□ -0.86
CDCA3-201ENST00000229265 ATP13A2Q9NQ11 1180 aa9.71□□□□□ -0.86
CDCA3-201ENST00000229265 HINT3Q9NQE9 182 aaKnown RBP9.71□□□□□ -0.86
CDCA3-201ENST00000229265 ERVK13-1Q9NX77 482 aa9.71□□□□□ -0.86
CDCA3-201ENST00000229265 CHRNA9Q9UGM1 479 aa9.71□□□□□ -0.86
CDCA3-201ENST00000229265 ZNF229Q9UJW7 825 aa9.71□□□□□ -0.86
CDCA3-201ENST00000229265 A0A1W2PQ72 361 aa9.7□□□□□ -0.86
CDCA3-201ENST00000229265 OR2W5A6NFC9 320 aa9.7□□□□□ -0.86
CDCA3-201ENST00000229265 METTL15A6NJ78 407 aa9.7□□□□□ -0.86
CDCA3-201ENST00000229265 IQCJ-SCHIP1C9J366 451 aaPredicted RBP9.7□□□□□ -0.86
CDCA3-201ENST00000229265 MASP2O00187 686 aa9.7□□□□□ -0.86
CDCA3-201ENST00000229265 PIP5K1CO60331 668 aa9.7□□□□□ -0.86
CDCA3-201ENST00000229265 RAD1O60671 282 aa9.7□□□□□ -0.86
CDCA3-201ENST00000229265 ADAM11O75078 769 aa9.7□□□□□ -0.86
CDCA3-201ENST00000229265 ASAH2BP0C7U1 165 aa9.7□□□□□ -0.86
CDCA3-201ENST00000229265 CXCR1P25024 350 aa9.7□□□□□ -0.86
CDCA3-201ENST00000229265 APOBEC1P41238 236 aaKnown RBP9.7□□□□□ -0.86
CDCA3-201ENST00000229265 ENTPD1P49961 510 aa9.7□□□□□ -0.86
CDCA3-201ENST00000229265 ETV1P50549 477 aa9.7□□□□□ -0.86
CDCA3-201ENST00000229265 SLC25A1P53007 311 aa9.7□□□□□ -0.86
CDCA3-201ENST00000229265 SNTA1Q13424 505 aa9.7□□□□□ -0.86
CDCA3-201ENST00000229265 PON3Q15166 354 aa9.7□□□□□ -0.86
CDCA3-201ENST00000229265 SSX1Q16384 188 aa9.7□□□□□ -0.86
CDCA3-201ENST00000229265 TSTQ16762 297 aaKnown RBP9.7□□□□□ -0.86
CDCA3-201ENST00000229265 CLEC12AQ5QGZ9 265 aa9.7□□□□□ -0.86
CDCA3-201ENST00000229265 NIPAL3Q6P499 406 aa9.7□□□□□ -0.86
CDCA3-201ENST00000229265 ZNF517Q6ZMY9 492 aaPredicted RBP9.7□□□□□ -0.86
CDCA3-201ENST00000229265 SYS1Q8N2H4 156 aa9.7□□□□□ -0.86
CDCA3-201ENST00000229265 MS4A15Q8N5U1 240 aa9.7□□□□□ -0.86
CDCA3-201ENST00000229265 METTL27Q8N6F8 245 aaPredicted RBP9.7□□□□□ -0.86
CDCA3-201ENST00000229265 APCDD1LQ8NCL9 501 aa9.7□□□□□ -0.86
CDCA3-201ENST00000229265 PFN4Q8NHR9 129 aa9.7□□□□□ -0.86
CDCA3-201ENST00000229265 ZNF563Q8TA94 476 aa9.7□□□□□ -0.86
CDCA3-201ENST00000229265 PHYHIPQ92561 330 aa9.7□□□□□ -0.86
CDCA3-201ENST00000229265 TAAR9Q96RI9 348 aa9.7□□□□□ -0.86
CDCA3-201ENST00000229265 CMKLR1Q99788 373 aa9.7□□□□□ -0.86
CDCA3-201ENST00000229265 ZNF649Q9BS31 505 aa9.7□□□□□ -0.86
CDCA3-201ENST00000229265 TBL1XR1Q9BZK7 514 aa9.7□□□□□ -0.86
CDCA3-201ENST00000229265 STRADBQ9C0K7 418 aa9.7□□□□□ -0.86
CDCA3-201ENST00000229265 AKIP1Q9NQ31 210 aa9.7□□□□□ -0.86
CDCA3-201ENST00000229265 NANSQ9NR45 359 aa9.7□□□□□ -0.86
CDCA3-201ENST00000229265 CLEC2DQ9UHP7 191 aa9.7□□□□□ -0.86
CDCA3-201ENST00000229265 GPN3Q9UHW5 284 aaPredicted RBP9.7□□□□□ -0.86
CDCA3-201ENST00000229265 POLHQ9Y253 713 aa9.7□□□□□ -0.86
CDCA3-201ENST00000229265 SF3B6Q9Y3B4 125 aaKnown RBP9.7□□□□□ -0.86
CDCA3-201ENST00000229265 SETXQ7Z333 2677 aaKnown RBP9.7□□□□□ -0.86
CDCA3-201ENST00000229265 TRAV36DV7A0A075B6V5 113 aa9.69□□□□□ -0.86
CDCA3-201ENST00000229265 IGLV3-32A0A0A0MS00 114 aa9.69□□□□□ -0.86
CDCA3-201ENST00000229265 SLC35F4A4IF30 521 aa9.69□□□□□ -0.86
CDCA3-201ENST00000229265 A8MUA0 341 aa9.69□□□□□ -0.86
CDCA3-201ENST00000229265 CENPBD1B2RD01 187 aa9.69□□□□□ -0.86
CDCA3-201ENST00000229265 ETV2O00321 342 aaPredicted RBP9.69□□□□□ -0.86
CDCA3-201ENST00000229265 CDK2AP1O14519 115 aa9.69□□□□□ -0.86
CDCA3-201ENST00000229265 PLPP2O43688 288 aa9.69□□□□□ -0.86
CDCA3-201ENST00000229265 TRIM3O75382 744 aaPredicted RBP9.69□□□□□ -0.86
CDCA3-201ENST00000229265 PDGFAP04085 211 aa9.69□□□□□ -0.86
CDCA3-201ENST00000229265 CD14P08571 375 aa9.69□□□□□ -0.86
CDCA3-201ENST00000229265 SBK2P0C263 348 aa9.69□□□□□ -0.86
CDCA3-201ENST00000229265 GP1BBP13224 206 aa9.69□□□□□ -0.86
CDCA3-201ENST00000229265 ICAM2P13598 275 aa9.69□□□□□ -0.86
CDCA3-201ENST00000229265 SLC2A5P22732 501 aa9.69□□□□□ -0.86
CDCA3-201ENST00000229265 POLR2HP52434 150 aaKnown RBP9.69□□□□□ -0.86
CDCA3-201ENST00000229265 NCS1P62166 190 aa9.69□□□□□ -0.86
CDCA3-201ENST00000229265 RPS18P62269 152 aaKnown RBP9.69□□□□□ -0.86
CDCA3-201ENST00000229265 RUNX1T1Q06455 604 aa9.69□□□□□ -0.86
CDCA3-201ENST00000229265 EIF3IQ13347 325 aaKnown RBP9.69□□□□□ -0.86
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.8 ms