RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000019982.8

Gtf3c6-201, Transcript of General transcription factor 3C polypeptide 6, mousemouse

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene Gtf3c6, Length 887 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Def8Q99J78 448 aa9.94□□□□□ -0.82
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Scd3Q99PL7 359 aa9.94□□□□□ -0.82
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Rnf128Q9D304 428 aa9.94□□□□□ -0.82
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Ethe1Q9DCM0 254 aa9.94□□□□□ -0.82
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Ppp1r1aQ9ERT9 171 aa9.94□□□□□ -0.82
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Aqp9Q9JJJ3 295 aa9.94□□□□□ -0.82
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Nf1Q04690 2841 aa9.93□□□□□ -0.82
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Mpeg1A1L314 713 aa9.93□□□□□ -0.82
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Gm6592A2AHC7 168 aa9.93□□□□□ -0.82
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Zfp442A2AQA0 667 aa9.93□□□□□ -0.82
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Ldlrad3A2AR95 345 aa9.93□□□□□ -0.82
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Gm14418A2ARR6 358 aa9.93□□□□□ -0.82
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Olfr1200A2ATJ4 336 aa9.93□□□□□ -0.82
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Gm14322A2AW66 358 aa9.93□□□□□ -0.82
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Gm5936A2BG95 728 aa9.93□□□□□ -0.82
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Gm5640A3KG49 728 aa9.93□□□□□ -0.82
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Ssxb8B1AY40 170 aa9.93□□□□□ -0.82
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 TagapB2RWW0 714 aa9.93□□□□□ -0.82
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Ifit3bE9PV48 403 aa9.93□□□□□ -0.82
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Adamts17E9Q4D1 1122 aa9.93□□□□□ -0.82
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 H2-M1F7CXU4 344 aa9.93□□□□□ -0.82
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Polr2jO08740 117 aaKnown RBP9.93□□□□□ -0.82
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Tpst1O70281 370 aa9.93□□□□□ -0.82
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 OtcP11725 354 aa9.93□□□□□ -0.82
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Thbs1P35441 1170 aa9.93□□□□□ -0.82
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Cox6a1P43024 111 aa9.93□□□□□ -0.82
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Ctbp2P56546 445 aa9.93□□□□□ -0.82
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Mrps21P58059 87 aa9.93□□□□□ -0.82
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Gata5P97489 404 aa9.93□□□□□ -0.82
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Emx1Q04742 257 aa9.93□□□□□ -0.82
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Slc22a23Q3UHH2 689 aa9.93□□□□□ -0.82
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Tmem40Q4FJU9 225 aa9.93□□□□□ -0.82
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Nkain2Q4PNJ2 208 aa9.93□□□□□ -0.82
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Fbxw20Q5U467 468 aa9.93□□□□□ -0.82
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Zdhhc18Q5Y5T2 380 aa9.93□□□□□ -0.82
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Fzd8Q61091 685 aa9.93□□□□□ -0.82
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Pdcd4Q61823 469 aa9.93□□□□□ -0.82
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 PtafrQ62035 341 aa9.93□□□□□ -0.82
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Serpina12Q7TMF5 413 aa9.93□□□□□ -0.82
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Olfr1167Q7TR26 316 aa9.93□□□□□ -0.82
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Olfr1061Q7TR72 313 aa9.93□□□□□ -0.82
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Olfr297Q7TS07 310 aa9.93□□□□□ -0.82
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Rmnd5aQ80YQ8 391 aa9.93□□□□□ -0.82
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Gm21627Q810R0 219 aa9.93□□□□□ -0.82
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Efr3aQ8BG67 819 aa9.93□□□□□ -0.82
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 QdprQ8BVI4 241 aa9.93□□□□□ -0.82
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Il23rQ8K4B4 644 aa9.93□□□□□ -0.82
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 CcsapQ8QZT2 252 aa9.93□□□□□ -0.82
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Defb10Q8R2I8 73 aa9.93□□□□□ -0.82
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Tmem106aQ8VC04 261 aa9.93□□□□□ -0.82
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Pex12Q8VC48 359 aa9.93□□□□□ -0.82
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Olfr643Q8VGY1 314 aa9.93□□□□□ -0.82
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Tnfsf13Q9D777 241 aa9.93□□□□□ -0.82
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Sh2d4aQ9D7V1 421 aa9.93□□□□□ -0.82
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Tnfrsf21Q9EPU5 655 aa9.93□□□□□ -0.82
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Gpr45Q9EQQ4 373 aa9.93□□□□□ -0.82
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Paqr4Q9JJE4 273 aa9.93□□□□□ -0.82
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Sh2d3cQ9QZS8 854 aa9.93□□□□□ -0.82
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Mapk11Q9WUI1 364 aa9.93□□□□□ -0.82
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Decr2Q9WV68 292 aa9.93□□□□□ -0.82
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Gm15013V9GWY0 266 aa9.93□□□□□ -0.82
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Gm5565A0A0G2JGB2 317 aa9.92□□□□□ -0.82
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Vmn1r3A2AMT7 306 aa9.92□□□□□ -0.82
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Tceal7A3KGA4 98 aa9.92□□□□□ -0.82
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Tmem229aB9EJI9 371 aa9.92□□□□□ -0.82
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Vmn2r125D3Z3M1 369 aa9.92□□□□□ -0.82
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Olfr640E9Q7P5 314 aa9.92□□□□□ -0.82
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Slc27a6E9Q9W4 619 aa9.92□□□□□ -0.82
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Cldn34aG3UW52 211 aa9.92□□□□□ -0.82
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 3110021N24RikJ3QMN2 152 aa9.92□□□□□ -0.82
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Rgs7O54829 469 aa9.92□□□□□ -0.82
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Cacng1O70578 223 aa9.92□□□□□ -0.82
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 H2-T3P14432 384 aa9.92□□□□□ -0.82
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Stx1bP61264 288 aa9.92□□□□□ -0.82
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 PtnP63089 168 aa9.92□□□□□ -0.82
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Nkpd1Q0VF94 599 aa9.92□□□□□ -0.82
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Tcfl5Q32NY8 489 aa9.92□□□□□ -0.82
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Ankrd33bQ3U0L2 486 aa9.92□□□□□ -0.82
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Q3U1D9 316 aa9.92□□□□□ -0.82
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 OtulinQ3UCV8 352 aa9.92□□□□□ -0.82
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Sorbs2Q3UTJ2 1180 aaKnown RBP9.92□□□□□ -0.82
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Znf511Q6P0X2 227 aa9.92□□□□□ -0.82
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Chst9Q76EC5 413 aa9.92□□□□□ -0.82
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Smap2Q7TN29 428 aa9.92□□□□□ -0.82
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Ppp1r14dQ7TT52 146 aa9.92□□□□□ -0.82
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Fndc11Q80WB0 326 aa9.92□□□□□ -0.82
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 D3Ertd751eQ8BGN2 192 aa9.92□□□□□ -0.82
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Btbd9Q8C726 612 aa9.92□□□□□ -0.82
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Dnajc27Q8CFP6 273 aa9.92□□□□□ -0.82
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Spats2Q8K1N4 545 aaKnown RBP9.92□□□□□ -0.82
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Vmn1r79Q8R285 306 aa9.92□□□□□ -0.82
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Stx18Q8VDS8 334 aa9.92□□□□□ -0.82
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Olfr214Q8VG27 320 aa9.92□□□□□ -0.82
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Olfr821Q8VG45 310 aa9.92□□□□□ -0.82
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Olfr1263Q8VG63 306 aa9.92□□□□□ -0.82
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Olfr1377Q8VGH1 307 aa9.92□□□□□ -0.82
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Timm22Q9CQ85 194 aa9.92□□□□□ -0.82
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 PompQ9CQT5 141 aa9.92□□□□□ -0.82
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Pop4Q9CR08 221 aa9.92□□□□□ -0.82
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 EcdQ9CS74 641 aa9.92□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 45.5 ms