RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000626061.2

SNAP23-222, Transcript of synaptosome associated protein 23, human

TSL 5 BASIC

Gene SNAP23, Length 237 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SNAP23-222	ENST00000626061	PNLIPRP2	P54317	469 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SNAP23-222	ENST00000626061	GEM	P55040	296 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SNAP23-222	ENST00000626061	DPYSL3	Q14195	570 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SNAP23-222	ENST00000626061	SPARCL1	Q14515	664 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SNAP23-222	ENST00000626061	PDK3	Q15120	406 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SNAP23-222	ENST00000626061	CCNG2	Q16589	344 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SNAP23-222	ENST00000626061	ACSBG2	Q5FVE4	666 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SNAP23-222	ENST00000626061	RGS7BP	Q6MZT1	257 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
SNAP23-222	ENST00000626061	AGTRAP	Q6RW13	159 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SNAP23-222	ENST00000626061	ARMC8	Q8IUR7	673 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SNAP23-222	ENST00000626061	DDIAS	Q8IXT1	998 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SNAP23-222	ENST00000626061	MGARP	Q8TDB4	240 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SNAP23-222	ENST00000626061	EPS8L3	Q8TE67	593 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
SNAP23-222	ENST00000626061	SLC9A6	Q92581	669 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SNAP23-222	ENST00000626061	LRRC39	Q96DD0	335 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SNAP23-222	ENST00000626061	SNF8	Q96H20	258 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SNAP23-222	ENST00000626061	DMRTB1	Q96MA1	342 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SNAP23-222	ENST00000626061	FRG2B	Q96QU4	278 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SNAP23-222	ENST00000626061	PCDHB18P	Q96TA0	734 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SNAP23-222	ENST00000626061	LRRC1	Q9BTT6	524 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SNAP23-222	ENST00000626061	EHD1	Q9H4M9	534 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SNAP23-222	ENST00000626061	MED17	Q9NVC6	651 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SNAP23-222	ENST00000626061	PARVA	Q9NVD7	372 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SNAP23-222	ENST00000626061	IGLV3-32	A0A0A0MS00	114 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SNAP23-222	ENST00000626061	FAM237A	A0A1B0GTK4	181 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SNAP23-222	ENST00000626061	PGRMC2	O15173	223 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SNAP23-222	ENST00000626061	GSC2	O15499	205 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SNAP23-222	ENST00000626061	SKAP2	O75563	359 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SNAP23-222	ENST00000626061	TGFB1	P01137	390 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SNAP23-222	ENST00000626061	IGHV1-46	P01743	117 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SNAP23-222	ENST00000626061	SNRNP70	P08621	437 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SNAP23-222	ENST00000626061	ARSB	P15848	533 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SNAP23-222	ENST00000626061	PRKAR1B	P31321	381 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SNAP23-222	ENST00000626061	STX2	P32856	288 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SNAP23-222	ENST00000626061	RAB13	P51153	203 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SNAP23-222	ENST00000626061	PRKAG1	P54619	331 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SNAP23-222	ENST00000626061	UBASH3A	P57075	661 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SNAP23-222	ENST00000626061	ZP1	P60852	638 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SNAP23-222	ENST00000626061	EWSR1	Q01844	656 aa	Known RBP eCLIP	4.91	□□□□□ -1.62
SNAP23-222	ENST00000626061	C17orf67	Q0P5P2	114 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SNAP23-222	ENST00000626061	PTGR1	Q14914	329 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SNAP23-222	ENST00000626061	FXN	Q16595	210 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SNAP23-222	ENST00000626061	EXOSC6	Q5RKV6	272 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SNAP23-222	ENST00000626061	WDR25	Q64LD2	544 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SNAP23-222	ENST00000626061	AFTPH	Q6ULP2	937 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SNAP23-222	ENST00000626061	C10orf99	Q6UWK7	81 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SNAP23-222	ENST00000626061	RANBP10	Q6VN20	620 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SNAP23-222	ENST00000626061	VMO1	Q7Z5L0	202 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SNAP23-222	ENST00000626061	MARCH3	Q86UD3	253 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SNAP23-222	ENST00000626061	KRTAP19-1	Q8IUB9	90 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SNAP23-222	ENST00000626061	ZBED8	Q8IZ13	594 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SNAP23-222	ENST00000626061		Q8N1Y9	231 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SNAP23-222	ENST00000626061	PQLC3	Q8N755	202 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SNAP23-222	ENST00000626061	PNLDC1	Q8NA58	520 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SNAP23-222	ENST00000626061	ATP6V1C2	Q8NEY4	427 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SNAP23-222	ENST00000626061	TTL	Q8NG68	377 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SNAP23-222	ENST00000626061	POC1B	Q8TC44	478 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SNAP23-222	ENST00000626061	SLC5A11	Q8WWX8	675 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SNAP23-222	ENST00000626061	GEMIN6	Q8WXD5	167 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SNAP23-222	ENST00000626061	RORB	Q92753	470 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SNAP23-222	ENST00000626061	FAM136A	Q96C01	138 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SNAP23-222	ENST00000626061	RAX2	Q96IS3	184 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SNAP23-222	ENST00000626061	RTN4R	Q9BZR6	473 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SNAP23-222	ENST00000626061	ISYNA1	Q9NPH2	558 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SNAP23-222	ENST00000626061	ZKSCAN7	Q9P0L1	754 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SNAP23-222	ENST00000626061	IGLV3-9	A0A075B6K5	115 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SNAP23-222	ENST00000626061		A0A1W2PR48	441 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SNAP23-222	ENST00000626061	HTR3E	A5X5Y0	456 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SNAP23-222	ENST00000626061	ZNF195	O14628	629 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SNAP23-222	ENST00000626061	FADS1	O60427	444 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SNAP23-222	ENST00000626061	ANXA9	O76027	345 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SNAP23-222	ENST00000626061	LGI1	O95970	557 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SNAP23-222	ENST00000626061	TNFRSF1A	P19438	455 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SNAP23-222	ENST00000626061	MAPK1	P28482	360 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SNAP23-222	ENST00000626061	XG	P55808	180 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SNAP23-222	ENST00000626061	ARF6	P62330	175 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SNAP23-222	ENST00000626061	GLO1	Q04760	184 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SNAP23-222	ENST00000626061	MOG	Q16653	247 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SNAP23-222	ENST00000626061	ARHGAP11B	Q3KRB8	267 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SNAP23-222	ENST00000626061	C1orf134	Q5TEV5	83 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SNAP23-222	ENST00000626061	ARMC3	Q5W041	872 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SNAP23-222	ENST00000626061	CD276	Q5ZPR3	534 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SNAP23-222	ENST00000626061	FAM53A	Q6NSI3	398 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
SNAP23-222	ENST00000626061	NPSR1	Q6W5P4	371 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SNAP23-222	ENST00000626061	PID1	Q7Z2X4	250 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SNAP23-222	ENST00000626061	TMPRSS11B	Q86T26	416 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SNAP23-222	ENST00000626061	ZNF429	Q86V71	674 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SNAP23-222	ENST00000626061	ZDHHC13	Q8IUH4	622 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SNAP23-222	ENST00000626061	ZNF283	Q8N7M2	679 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SNAP23-222	ENST00000626061	ACOT4	Q8N9L9	421 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SNAP23-222	ENST00000626061	SYNPR	Q8TBG9	265 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SNAP23-222	ENST00000626061	MAGEE2	Q8TD90	523 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
SNAP23-222	ENST00000626061	DEFB104A	Q8WTQ1	72 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SNAP23-222	ENST00000626061	BCL2L2	Q92843	193 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
SNAP23-222	ENST00000626061	NEIL2	Q969S2	332 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SNAP23-222	ENST00000626061	LYZL4	Q96KX0	146 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SNAP23-222	ENST00000626061	TSNARE1	Q96NA8	513 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SNAP23-222	ENST00000626061	KCNC2	Q96PR1	638 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SNAP23-222	ENST00000626061	PELI2	Q9HAT8	420 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SNAP23-222	ENST00000626061	GCM1	Q9NP62	436 aa		4.9	□□□□□ -1.63

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