RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000618610.1

PTPRT-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type T, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PTPRT, Length 3,230 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRT-211ENST00000618610 UBE2CO00762 179 aa7.57□□□□□ -1.2
PTPRT-211ENST00000618610 ATP1B2P14415 290 aaPredicted RBP7.57□□□□□ -1.2
PTPRT-211ENST00000618610 CPT2P23786 658 aa7.57□□□□□ -1.2
PTPRT-211ENST00000618610 LAP3P28838 519 aa7.57□□□□□ -1.2
PTPRT-211ENST00000618610 PYCR1P32322 319 aa7.57□□□□□ -1.2
PTPRT-211ENST00000618610 POU3F4P49335 361 aa7.57□□□□□ -1.2
PTPRT-211ENST00000618610 F2RL1P55085 397 aa7.57□□□□□ -1.2
PTPRT-211ENST00000618610 OR12D2P58182 307 aa7.57□□□□□ -1.2
PTPRT-211ENST00000618610 PITPNAQ00169 270 aa7.57□□□□□ -1.2
PTPRT-211ENST00000618610 CHAF1BQ13112 559 aa7.57□□□□□ -1.2
PTPRT-211ENST00000618610 ZNF805Q5CZA5 627 aa7.57□□□□□ -1.2
PTPRT-211ENST00000618610 FCRLAQ7L513 359 aa7.57□□□□□ -1.2
PTPRT-211ENST00000618610 TMED4Q7Z7H5 227 aa7.57□□□□□ -1.2
PTPRT-211ENST00000618610 NPAS4Q8IUM7 802 aa7.57□□□□□ -1.2
PTPRT-211ENST00000618610 SHISA5Q8N114 240 aa7.57□□□□□ -1.2
PTPRT-211ENST00000618610 ARRDC1Q8N5I2 433 aa7.57□□□□□ -1.2
PTPRT-211ENST00000618610 CCDC54Q8NEL0 328 aa7.57□□□□□ -1.2
PTPRT-211ENST00000618610 ZNF461Q8TAF7 563 aa7.57□□□□□ -1.2
PTPRT-211ENST00000618610 C2orf15Q8WU43 125 aaKnown RBP7.57□□□□□ -1.2
PTPRT-211ENST00000618610 SMPDL3BQ92485 455 aa7.57□□□□□ -1.2
PTPRT-211ENST00000618610 RGP1Q92546 391 aaPredicted RBP7.57□□□□□ -1.2
PTPRT-211ENST00000618610 TMEM159Q96B96 161 aa7.57□□□□□ -1.2
PTPRT-211ENST00000618610 ZNF354BQ96LW1 612 aa7.57□□□□□ -1.2
PTPRT-211ENST00000618610 NKX3-1Q99801 234 aaPredicted RBP7.57□□□□□ -1.2
PTPRT-211ENST00000618610 GAL3ST1Q99999 423 aa7.57□□□□□ -1.2
PTPRT-211ENST00000618610 HCAR1Q9BXC0 346 aa7.57□□□□□ -1.2
PTPRT-211ENST00000618610 PIGMQ9H3S5 423 aa7.57□□□□□ -1.2
PTPRT-211ENST00000618610 SUV39H2Q9H5I1 410 aa7.57□□□□□ -1.2
PTPRT-211ENST00000618610 GAREM1Q9H706 876 aa7.57□□□□□ -1.2
PTPRT-211ENST00000618610 GULP1Q9UBP9 304 aa7.57□□□□□ -1.2
PTPRT-211ENST00000618610 ASXL3Q9C0F0 2248 aa7.57□□□□□ -1.2
PTPRT-211ENST00000618610 PATJQ8NI35 1801 aa7.57□□□□□ -1.2
PTPRT-211ENST00000618610 ATMQ13315 3056 aa7.57□□□□□ -1.2
PTPRT-211ENST00000618610 NOTCH4Q99466 2003 aa7.56□□□□□ -1.2
PTPRT-211ENST00000618610 KANTRA0A1W2PQU2 76 aa7.56□□□□□ -1.2
PTPRT-211ENST00000618610 CPED1A4D0V7 1026 aa7.56□□□□□ -1.2
PTPRT-211ENST00000618610 OR14I1A6ND48 311 aa7.56□□□□□ -1.2
PTPRT-211ENST00000618610 RHPN2P1A8MT19 583 aa7.56□□□□□ -1.2
PTPRT-211ENST00000618610 HMSDA8MTL9 139 aa7.56□□□□□ -1.2
PTPRT-211ENST00000618610 C2orf74A8MZ97 194 aa7.56□□□□□ -1.2
PTPRT-211ENST00000618610 CACNB4O00305 520 aaPredicted RBP7.56□□□□□ -1.2
PTPRT-211ENST00000618610 KRT33AO76009 404 aa7.56□□□□□ -1.2
PTPRT-211ENST00000618610 AQP8O94778 261 aa7.56□□□□□ -1.2
PTPRT-211ENST00000618610 GYPBP06028 91 aa7.56□□□□□ -1.2
PTPRT-211ENST00000618610 TMIGD3P0DMS9 266 aaPredicted RBP7.56□□□□□ -1.2
PTPRT-211ENST00000618610 STAT5AP42229 794 aa7.56□□□□□ -1.2
PTPRT-211ENST00000618610 DYRK1AQ13627 763 aa7.56□□□□□ -1.2
PTPRT-211ENST00000618610 CDC73Q6P1J9 531 aa7.56□□□□□ -1.2
PTPRT-211ENST00000618610 Q6ZVL8 140 aa7.56□□□□□ -1.2
PTPRT-211ENST00000618610 CXXC5Q7LFL8 322 aaKnown RBP7.56□□□□□ -1.2
PTPRT-211ENST00000618610 PPP1R3BQ86XI6 285 aa7.56□□□□□ -1.2
PTPRT-211ENST00000618610 C1orf216Q8TAB5 229 aa7.56□□□□□ -1.2
PTPRT-211ENST00000618610 PMM1Q92871 262 aa7.56□□□□□ -1.2
PTPRT-211ENST00000618610 CLP1Q92989 425 aaKnown RBP7.56□□□□□ -1.2
PTPRT-211ENST00000618610 SLC25A38Q96DW6 304 aa7.56□□□□□ -1.2
PTPRT-211ENST00000618610 TMEM169Q96HH4 297 aa7.56□□□□□ -1.2
PTPRT-211ENST00000618610 HRH4Q9H3N8 390 aa7.56□□□□□ -1.2
PTPRT-211ENST00000618610 FN3KQ9H479 309 aa7.56□□□□□ -1.2
PTPRT-211ENST00000618610 ATG4BQ9Y4P1 393 aa7.56□□□□□ -1.2
PTPRT-211ENST00000618610 LOC100509620A0A075B734 347 aa7.56□□□□□ -1.2
PTPRT-211ENST00000618610 A0A087WUU8 490 aa7.56□□□□□ -1.2
PTPRT-211ENST00000618610 TRBV5-4A0A0C4DH59 114 aa7.56□□□□□ -1.2
PTPRT-211ENST00000618610 ZNF197O14709 1029 aa7.56□□□□□ -1.2
PTPRT-211ENST00000618610 EIF4E2O60573 245 aaKnown RBP7.56□□□□□ -1.2
PTPRT-211ENST00000618610 SC5DO75845 299 aa7.56□□□□□ -1.2
PTPRT-211ENST00000618610 NFATC1O95644 943 aa7.56□□□□□ -1.2
PTPRT-211ENST00000618610 ALPPL2P10696 532 aa7.56□□□□□ -1.2
PTPRT-211ENST00000618610 SELPP16109 830 aa7.56□□□□□ -1.2
PTPRT-211ENST00000618610 SPI1P17947 270 aa7.56□□□□□ -1.2
PTPRT-211ENST00000618610 AVPR2P30518 371 aa7.56□□□□□ -1.2
PTPRT-211ENST00000618610 MAPK8P45983 427 aa7.56□□□□□ -1.2
PTPRT-211ENST00000618610 GPR143P51810 404 aa7.56□□□□□ -1.2
PTPRT-211ENST00000618610 EPHB3P54753 998 aa7.56□□□□□ -1.2
PTPRT-211ENST00000618610 PYY3Q5JQD4 70 aa7.56□□□□□ -1.2
PTPRT-211ENST00000618610 PIP5KL1Q5T9C9 394 aa7.56□□□□□ -1.2
PTPRT-211ENST00000618610 AGTRAPQ6RW13 159 aa7.56□□□□□ -1.2
PTPRT-211ENST00000618610 TPRA1Q86W33 373 aa7.56□□□□□ -1.2
PTPRT-211ENST00000618610 ETFBKMTQ8IXQ9 262 aa7.56□□□□□ -1.2
PTPRT-211ENST00000618610 RFLNBQ8N5W9 214 aa7.56□□□□□ -1.2
PTPRT-211ENST00000618610 OR4A4PQ8NGN8 299 aa7.56□□□□□ -1.2
PTPRT-211ENST00000618610 APOBEC4Q8WW27 367 aaKnown RBP7.56□□□□□ -1.2
PTPRT-211ENST00000618610 GHSRQ92847 366 aa7.56□□□□□ -1.2
PTPRT-211ENST00000618610 HIST1H2BAQ96A08 127 aa7.56□□□□□ -1.2
PTPRT-211ENST00000618610 C4orf36Q96KX1 117 aa7.56□□□□□ -1.2
PTPRT-211ENST00000618610 CNTNAP3BQ96NU0 1288 aa7.56□□□□□ -1.2
PTPRT-211ENST00000618610 TGM7Q96PF1 710 aa7.56□□□□□ -1.2
PTPRT-211ENST00000618610 MAN2C1Q9NTJ4 1040 aa7.56□□□□□ -1.2
PTPRT-211ENST00000618610 TRPC4Q9UBN4 977 aa7.56□□□□□ -1.2
PTPRT-211ENST00000618610 FBXO4Q9UKT5 387 aa7.56□□□□□ -1.2
PTPRT-211ENST00000618610 CAMK2AQ9UQM7 478 aa7.56□□□□□ -1.2
PTPRT-211ENST00000618610 ZNF337Q9Y3M9 751 aa7.56□□□□□ -1.2
PTPRT-211ENST00000618610 OR51B4Q9Y5P0 310 aa7.56□□□□□ -1.2
PTPRT-211ENST00000618610 CFAP47Q6ZTR5 3102 aa7.56□□□□□ -1.2
PTPRT-211ENST00000618610 OR2AT4A6NND4 320 aa7.56□□□□□ -1.2
PTPRT-211ENST00000618610 PCDH8O95206 1070 aa7.56□□□□□ -1.2
PTPRT-211ENST00000618610 PMP2P02689 132 aa7.56□□□□□ -1.2
PTPRT-211ENST00000618610 ATP1B1P05026 303 aa7.56□□□□□ -1.2
PTPRT-211ENST00000618610 KLK1P06870 262 aa7.56□□□□□ -1.2
PTPRT-211ENST00000618610 UBBP0CG47 229 aa7.56□□□□□ -1.2
PTPRT-211ENST00000618610 UBCP0CG48 685 aaKnown RBP7.56□□□□□ -1.2
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 77.6 ms