RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000608263.5

CTCFL-216, Transcript of CCCTC-binding factor like, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTCFL, Length 4,040 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTCFL-216ENST00000608263 ZFAND1Q8TCF1 268 aa9.58□□□□□ -0.88
CTCFL-216ENST00000608263 CHAC2Q8WUX2 184 aa9.58□□□□□ -0.88
CTCFL-216ENST00000608263 EDAQ92838 391 aa9.58□□□□□ -0.88
CTCFL-216ENST00000608263 RASD2Q96D21 266 aa9.58□□□□□ -0.88
CTCFL-216ENST00000608263 SDF2Q99470 211 aa9.58□□□□□ -0.88
CTCFL-216ENST00000608263 SEMA4CQ9C0C4 833 aa9.58□□□□□ -0.88
CTCFL-216ENST00000608263 NOX3Q9HBY0 568 aa9.58□□□□□ -0.88
CTCFL-216ENST00000608263 C20orf141Q9NUB4 165 aa9.58□□□□□ -0.88
CTCFL-216ENST00000608263 SERGEFQ9UGK8 458 aa9.58□□□□□ -0.88
CTCFL-216ENST00000608263 ROS1P08922 2347 aa9.58□□□□□ -0.88
CTCFL-216ENST00000608263 TRABD2BA6NFA1 517 aa9.58□□□□□ -0.88
CTCFL-216ENST00000608263 CDC42EP2O14613 210 aa9.58□□□□□ -0.88
CTCFL-216ENST00000608263 SURF4O15260 269 aa9.58□□□□□ -0.88
CTCFL-216ENST00000608263 SBK2P0C263 348 aa9.58□□□□□ -0.88
CTCFL-216ENST00000608263 DECR1Q16698 335 aa9.58□□□□□ -0.88
CTCFL-216ENST00000608263 ARTNQ5T4W7 220 aa9.58□□□□□ -0.88
CTCFL-216ENST00000608263 OR5M10Q6IEU7 315 aa9.58□□□□□ -0.88
CTCFL-216ENST00000608263 RNF165Q6ZSG1 346 aa9.58□□□□□ -0.88
CTCFL-216ENST00000608263 DERL3Q96Q80 235 aa9.58□□□□□ -0.88
CTCFL-216ENST00000608263 ORAI3Q9BRQ5 295 aa9.58□□□□□ -0.88
CTCFL-216ENST00000608263 KLHL21Q9UJP4 597 aa9.58□□□□□ -0.88
CTCFL-216ENST00000608263 SCML1Q9UN30 329 aa9.58□□□□□ -0.88
CTCFL-216ENST00000608263 SCN10AQ9Y5Y9 1956 aa9.58□□□□□ -0.88
CTCFL-216ENST00000608263 A0A1B0GVI7 797 aa9.58□□□□□ -0.88
CTCFL-216ENST00000608263 GOSR2O14653 212 aa9.58□□□□□ -0.88
CTCFL-216ENST00000608263 GABRB1P18505 474 aa9.58□□□□□ -0.88
CTCFL-216ENST00000608263 KIAA1024LP59773 190 aa9.58□□□□□ -0.88
CTCFL-216ENST00000608263 NKAIN2Q5VXU1 208 aa9.58□□□□□ -0.88
CTCFL-216ENST00000608263 SLC22A10Q63ZE4 541 aa9.58□□□□□ -0.88
CTCFL-216ENST00000608263 PLXDC1Q8IUK5 500 aa9.58□□□□□ -0.88
CTCFL-216ENST00000608263 RDH10Q8IZV5 341 aa9.58□□□□□ -0.88
CTCFL-216ENST00000608263 OR2L8Q8NGY9 312 aa9.58□□□□□ -0.88
CTCFL-216ENST00000608263 GAREM1Q9H706 876 aa9.58□□□□□ -0.88
CTCFL-216ENST00000608263 SLC25A19Q9HC21 320 aa9.58□□□□□ -0.88
CTCFL-216ENST00000608263 B3GAT2Q9NPZ5 323 aa9.58□□□□□ -0.88
CTCFL-216ENST00000608263 OR2AT4A6NND4 320 aa9.57□□□□□ -0.88
CTCFL-216ENST00000608263 PRICKLE3O43900 615 aaPredicted RBP9.57□□□□□ -0.88
CTCFL-216ENST00000608263 GREM1O60565 184 aa9.57□□□□□ -0.88
CTCFL-216ENST00000608263 RP2O75695 350 aa9.57□□□□□ -0.88
CTCFL-216ENST00000608263 ADRA2AP08913 450 aa9.57□□□□□ -0.88
CTCFL-216ENST00000608263 MSL3P1P0C860 447 aa9.57□□□□□ -0.88
CTCFL-216ENST00000608263 AQP2P41181 271 aa9.57□□□□□ -0.88
CTCFL-216ENST00000608263 OR1D4P47884 311 aa9.57□□□□□ -0.88
CTCFL-216ENST00000608263 PPP2CBP62714 309 aa9.57□□□□□ -0.88
CTCFL-216ENST00000608263 TRA2BP62995 288 aaKnown RBP9.57□□□□□ -0.88
CTCFL-216ENST00000608263 PPP2CAP67775 309 aa9.57□□□□□ -0.88
CTCFL-216ENST00000608263 SIRPAP78324 504 aa9.57□□□□□ -0.88
CTCFL-216ENST00000608263 HTRA4P83105 476 aaPredicted RBP9.57□□□□□ -0.88
CTCFL-216ENST00000608263 BCL2A1Q16548 175 aa9.57□□□□□ -0.88
CTCFL-216ENST00000608263 ALG11Q2TAA5 492 aa9.57□□□□□ -0.88
CTCFL-216ENST00000608263 LRRN1Q6UXK5 716 aa9.57□□□□□ -0.88
CTCFL-216ENST00000608263 SLC29A4Q7RTT9 530 aa9.57□□□□□ -0.88
CTCFL-216ENST00000608263 ZNF550Q7Z398 422 aa9.57□□□□□ -0.88
CTCFL-216ENST00000608263 ZNF101Q8IZC7 436 aa9.57□□□□□ -0.88
CTCFL-216ENST00000608263 OR5AK2Q8NH90 309 aa9.57□□□□□ -0.88
CTCFL-216ENST00000608263 DVL3Q92997 716 aaPredicted RBP9.57□□□□□ -0.88
CTCFL-216ENST00000608263 MRGPRX1Q96LB2 322 aa9.57□□□□□ -0.88
CTCFL-216ENST00000608263 DCLRE1CQ96SD1 692 aaKnown RBP9.57□□□□□ -0.88
CTCFL-216ENST00000608263 S100A13Q99584 98 aa9.57□□□□□ -0.88
CTCFL-216ENST00000608263 NT5DC2Q9H857 520 aa9.57□□□□□ -0.88
CTCFL-216ENST00000608263 ACOXLQ9NUZ1 547 aa9.57□□□□□ -0.88
CTCFL-216ENST00000608263 RARRES3Q9UL19 164 aa9.57□□□□□ -0.88
CTCFL-216ENST00000608263 COPS3Q9UNS2 423 aa9.57□□□□□ -0.88
CTCFL-216ENST00000608263 POLHQ9Y253 713 aa9.57□□□□□ -0.88
CTCFL-216ENST00000608263 CHD5Q8TDI0 1954 aa9.57□□□□□ -0.88
CTCFL-216ENST00000608263 ANXA7P20073 488 aaKnown RBP9.57□□□□□ -0.88
CTCFL-216ENST00000608263 ITGA3P26006 1051 aa9.57□□□□□ -0.88
CTCFL-216ENST00000608263 MTNR1BP49286 362 aa9.57□□□□□ -0.88
CTCFL-216ENST00000608263 ACTA2P62736 377 aa9.57□□□□□ -0.88
CTCFL-216ENST00000608263 ACTG2P63267 376 aa9.57□□□□□ -0.88
CTCFL-216ENST00000608263 TEKQ02763 1124 aa9.57□□□□□ -0.88
CTCFL-216ENST00000608263 DUSP2Q05923 314 aa9.57□□□□□ -0.88
CTCFL-216ENST00000608263 GARNL3Q5VVW2 1013 aa9.57□□□□□ -0.88
CTCFL-216ENST00000608263 METAP1DQ6UB28 335 aaPredicted RBP9.57□□□□□ -0.88
CTCFL-216ENST00000608263 OR52N1Q8NH53 320 aa9.57□□□□□ -0.88
CTCFL-216ENST00000608263 SFXN5Q8TD22 340 aa9.57□□□□□ -0.88
CTCFL-216ENST00000608263 ELSPBP1Q96BH3 223 aa9.57□□□□□ -0.88
CTCFL-216ENST00000608263 Q96M85 177 aa9.57□□□□□ -0.88
CTCFL-216ENST00000608263 CDX2Q99626 313 aaPredicted RBP9.57□□□□□ -0.88
CTCFL-216ENST00000608263 BTBD2Q9BX70 525 aa9.57□□□□□ -0.88
CTCFL-216ENST00000608263 GLTPQ9NZD2 209 aa9.57□□□□□ -0.88
CTCFL-216ENST00000608263 PISDQ9UG56 409 aa9.57□□□□□ -0.88
CTCFL-216ENST00000608263 ADAM29Q9UKF5 820 aa9.57□□□□□ -0.88
CTCFL-216ENST00000608263 ICKQ9UPZ9 632 aa9.57□□□□□ -0.88
CTCFL-216ENST00000608263 OPN1LWP04000 364 aa9.57□□□□□ -0.88
CTCFL-216ENST00000608263 PDGFAP04085 211 aa9.57□□□□□ -0.88
CTCFL-216ENST00000608263 GIMD1P0DJR0 217 aa9.57□□□□□ -0.88
CTCFL-216ENST00000608263 NRG3P56975 720 aa9.57□□□□□ -0.88
CTCFL-216ENST00000608263 GALK2Q01415 458 aa9.57□□□□□ -0.88
CTCFL-216ENST00000608263 SRSF5Q13243 272 aaKnown RBP9.57□□□□□ -0.88
CTCFL-216ENST00000608263 TRAM1Q15629 374 aa9.57□□□□□ -0.88
CTCFL-216ENST00000608263 RPL13AP3Q6NVV1 102 aa9.57□□□□□ -0.88
CTCFL-216ENST00000608263 IL17RCQ8NAC3 791 aa9.57□□□□□ -0.88
CTCFL-216ENST00000608263 C17orf47Q8NEP4 570 aa9.57□□□□□ -0.88
CTCFL-216ENST00000608263 MAP6Q96JE9 813 aa9.57□□□□□ -0.88
CTCFL-216ENST00000608263 SERINC2Q96SA4 455 aa9.57□□□□□ -0.88
CTCFL-216ENST00000608263 NIPAL2Q9H841 368 aa9.57□□□□□ -0.88
CTCFL-216ENST00000608263 CD93Q9NPY3 652 aa9.57□□□□□ -0.88
CTCFL-216ENST00000608263 OR2S2Q9NQN1 319 aa9.57□□□□□ -0.88
CTCFL-216ENST00000608263 TAS2R3Q9NYW6 316 aa9.57□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.9 ms